Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000751 CC 18 18 36 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.124 0.000 0.062 000935 AA 17 23 40 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.131 0.000 0.056 001114 AA 1 0 1 AG 10 3 13 GG 10 20 30 0.583 0.112 0.088 001359 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 21 22 43 0.012 0.011 0.023 001453 CC 22 22 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 002196 CC 17 23 40 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.233 0.000 0.100 002216 CC 18 20 38 CG 3 3 6 GG 0 0 0 0.124 0.112 0.236 002251 -- 21 22 43 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.012 0.000 0.006 002609 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 002689 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 003642 CC 17 21 38 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.362 0.012 0.236 003876 GG 0 0 0 GT 5 1 6 TT 17 21 38 0.362 0.012 0.236 004072 CC 18 23 41 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.152 004611 CC 3 0 3 CG 7 3 10 GG 13 20 33 1.431 0.112 2.726 004787 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 004809 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 005072 AA 18 19 37 AT 4 0 4 TT 0 0 0 0.220 0.000 0.108 005130 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 19 18 37 0.209 0.000 0.108 005244 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 18 20 38 0.342 0.000 0.164 005585 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 18 23 41 0.342 0.000 0.152 005686 GG 19 23 42 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.095 005931 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 19 23 42 0.209 0.000 0.095 006006 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 19 23 42 0.209 0.000 0.095 006156 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 19 23 42 0.209 0.000 0.095 006217 CC 5 0 5 CG 8 3 11 GG 10 20 30 1.675 0.112 4.748 006695 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 19 19 38 0.013 0.053 0.059 006722 AA 1 0 1 AG 2 2 4 GG 19 20 39 4.455 0.050 3.563 006747 CC 14 6 20 CG 5 10 15 GG 3 6 9 3.414 0.182 3.273 006785 CC 21 21 42 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 006831 CC 9 8 17 CT 11 12 23 TT 2 3 5 0.279 0.209 0.454 006935 CC 19 23 42 CT 2 0 2 TT 2 0 2 8.746 0.000 19.043 007021 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 007100 CC 5 0 5 CT 6 3 9 TT 12 20 32 4.154 0.112 7.472 007605 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 15 23 38 6.842 0.000 17.092 007628 CC 2 0 2 CT 4 3 7 TT 11 20 31 2.037 0.112 2.750 007661 -- 0 0 0 +- 5 0 5 ++ 17 23 40 0.362 0.000 0.156 007914 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 23 43 0.012 0.000 0.006 008421 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 22 44 0.000 0.011 0.006 008663 AA 22 20 42 AC 1 1 2 CC 0 0 0 0.011 0.012 0.024 008942 CC 21 21 42 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.024 008998 CC 2 0 2 CT 9 2 11 TT 12 19 31 0.028 0.053 0.592 009000 -- 12 19 31 +- 9 2 11 ++ 2 0 2 0.028 0.053 0.592 009007 -- 12 19 31 +- 9 2 11 ++ 2 0 2 0.028 0.053 0.592 009278 AA 19 21 40 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.053 0.000 0.025 009279 -- 11 19 30 +- 7 2 9 ++ 2 0 2 0.299 0.053 1.288 009328 -- 19 21 40 +- 4 0 4 ++ 0 0 0 0.209 0.000 0.100 009473 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 009787 AA 21 23 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 010188 GG 0 0 0 GT 0 2 2 TT 22 19 41 0.000 0.053 0.024 010194 -- 0 7 7 +- 8 8 16 ++ 13 6 19 1.163 1.173 1.219 010392 AA 17 22 39 AG 5 1 6 GG 0 0 0 0.362 0.011 0.230 010403 GG 22 21 43 GT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 011069 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 20 19 39 0.000 0.209 0.102 011143 GG 11 19 30 GT 6 2 8 TT 3 0 3 1.633 0.053 3.964 011460 GG 20 22 42 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 011576 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 19 22 41 0.053 0.000 0.024 011915 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 23 44 0.012 0.000 0.006 012335 GG 4 0 4 GT 8 3 11 TT 10 20 30 1.010 0.112 3.187 012494 AA 2 0 2 AG 10 3 13 GG 10 20 30 0.050 0.112 0.147 012806 AA 0 6 6 AG 9 9 18 GG 14 6 20 1.361 0.429 0.354 012915 CC 18 20 38 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.164 012931 GG 19 20 39 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.102 013177 CC 20 19 39 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.026 013238 CC 14 6 20 CT 8 8 16 TT 0 5 5 1.086 0.460 0.401 013282 GG 20 19 39 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.026 013327 CC 21 19 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 013777 CC 18 21 39 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.342 0.012 0.230 013849 AA 11 8 19 AG 11 11 22 GG 1 3 4 0.741 0.065 0.450 014019 CC 18 22 40 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.156 014541 CC 19 21 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.006 014720 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 015251 AA 18 23 41 AT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.152 015590 GG 1 0 1 GT 6 3 9 TT 15 20 35 0.153 0.112 0.207 015707 AA 1 0 1 AG 6 3 9 GG 15 20 35 0.153 0.112 0.207 015989 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 016258 CC 13 6 19 CT 9 9 18 TT 0 6 6 1.455 0.429 0.265 016372 AA 16 18 34 AG 5 3 8 GG 1 0 1 0.499 0.124 0.386 016777 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 20 22 42 0.000 0.011 0.006 017357 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 23 42 0.013 0.000 0.006 017566 CC 14 20 34 CG 5 3 8 GG 1 0 1 0.360 0.112 0.386 017820 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 19 22 41 0.013 0.011 0.024 017921 AA 9 8 17 AG 12 12 24 GG 1 3 4 1.455 0.209 1.207 018014 GG 18 21 39 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.124 0.000 0.058 018858 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 17 23 40 0.233 0.000 0.100 019070 CC 18 23 41 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.220 0.000 0.097 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002251: ACA 007661: AA 009000: gTTC 009007: AC 009279: T 009328: T 010194: T