Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000751 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 000935 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.14 0.00 0.07 001114 A 0.29 0.07 0.17 G 0.71 0.93 0.83 0.41 0.12 0.28 001359 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 001453 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002196 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 002216 G 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.13 0.12 0.13 002251 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002609 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002689 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003642 T 0.11 0.02 0.07 C 0.89 0.98 0.93 0.20 0.04 0.13 003876 G 0.11 0.02 0.07 T 0.89 0.98 0.93 0.20 0.04 0.13 004072 T 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 004611 C 0.28 0.07 0.17 G 0.72 0.93 0.83 0.41 0.12 0.29 004787 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004809 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005072 T 0.09 0.00 0.05 A 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 005130 C 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 005244 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 005585 A 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 005686 T 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 005931 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006006 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006156 C 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006217 C 0.39 0.07 0.23 G 0.61 0.93 0.77 0.48 0.12 0.35 006695 C 0.03 0.05 0.04 T 0.97 0.95 0.96 0.05 0.09 0.07 006722 A 0.09 0.05 0.07 G 0.91 0.95 0.93 0.17 0.09 0.13 006747 G 0.25 0.50 0.38 C 0.75 0.50 0.62 0.38 0.50 0.47 006785 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006831 T 0.34 0.39 0.37 C 0.66 0.61 0.63 0.45 0.48 0.46 006935 T 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 007021 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007100 C 0.35 0.07 0.21 T 0.65 0.93 0.79 0.45 0.12 0.33 007605 C 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.07 007628 C 0.24 0.07 0.14 T 0.76 0.93 0.86 0.36 0.12 0.24 007661 - 0.11 0.00 0.06 + 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 007914 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008421 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008663 C 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 008942 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008998 C 0.28 0.05 0.17 T 0.72 0.95 0.83 0.41 0.09 0.28 009000 + 0.28 0.05 0.17 - 0.72 0.95 0.83 0.41 0.09 0.28 009007 + 0.28 0.05 0.17 - 0.72 0.95 0.83 0.41 0.09 0.28 009278 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 009279 + 0.28 0.05 0.16 - 0.72 0.95 0.84 0.40 0.09 0.27 009328 + 0.09 0.00 0.05 - 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 009473 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009787 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010188 G 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 010194 - 0.19 0.52 0.36 + 0.81 0.48 0.64 0.31 0.50 0.46 010392 G 0.11 0.02 0.07 A 0.89 0.98 0.93 0.20 0.04 0.12 010403 T 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 011069 A 0.00 0.09 0.05 G 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 011143 T 0.30 0.05 0.17 G 0.70 0.95 0.83 0.42 0.09 0.28 011460 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011576 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 011915 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012335 G 0.36 0.07 0.21 T 0.64 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 012494 A 0.32 0.07 0.19 G 0.68 0.93 0.81 0.43 0.12 0.31 012806 A 0.20 0.50 0.34 G 0.80 0.50 0.66 0.31 0.50 0.45 012915 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 012931 T 0.09 0.00 0.05 G 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 013177 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 013238 T 0.18 0.47 0.32 C 0.82 0.53 0.68 0.30 0.50 0.43 013282 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 013327 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013777 T 0.11 0.02 0.07 C 0.89 0.98 0.93 0.19 0.04 0.12 013849 G 0.28 0.39 0.33 A 0.72 0.61 0.67 0.41 0.47 0.44 014019 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 014541 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014720 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015251 T 0.11 0.00 0.05 A 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 015590 G 0.18 0.07 0.12 T 0.82 0.93 0.88 0.30 0.12 0.21 015707 A 0.18 0.07 0.12 G 0.82 0.93 0.88 0.30 0.12 0.21 015989 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016258 T 0.20 0.50 0.35 C 0.80 0.50 0.65 0.33 0.50 0.45 016372 G 0.16 0.07 0.12 A 0.84 0.93 0.88 0.27 0.13 0.21 016777 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017357 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 017566 G 0.17 0.07 0.12 C 0.82 0.93 0.88 0.29 0.12 0.21 017820 C 0.03 0.02 0.02 T 0.97 0.98 0.98 0.05 0.04 0.05 017921 G 0.32 0.39 0.36 A 0.68 0.61 0.64 0.43 0.48 0.46 018014 T 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 018858 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 019070 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002251: ACA 007661: AA 009000: gTTC 009007: AC 009279: T 009328: T 010194: T