Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 001233 A 0.19 0.43 0.32 G 0.81 0.57 0.68 0.31 0.49 0.44 001239 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001278 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001299 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.21 0.00 0.11 001307 T 0.26 0.20 0.23 G 0.74 0.80 0.77 0.39 0.31 0.35 001398 G 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 001436 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001442 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 001490 T 0.00 0.15 0.08 C 1.00 0.85 0.92 0.00 0.26 0.15 001524 G 0.14 0.04 0.09 A 0.86 0.96 0.91 0.24 0.08 0.17 001561 A 0.47 0.24 0.35 G 0.53 0.76 0.65 0.50 0.36 0.45 001565 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 001884 C 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 002005 A 0.11 0.05 0.07 T 0.89 0.95 0.93 0.19 0.09 0.14 002015 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002018 T 0.24 0.33 0.29 C 0.76 0.67 0.71 0.36 0.44 0.41 002049 T 0.28 0.23 0.25 C 0.72 0.77 0.75 0.40 0.35 0.38 002274 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002449 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 004728 C 0.23 0.18 0.20 T 0.78 0.82 0.80 0.35 0.30 0.32 004788 A 0.06 0.14 0.10 G 0.94 0.86 0.90 0.10 0.24 0.18 006717 - 0.15 0.00 0.08 + 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 006792 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006793 C 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006817 T 0.23 0.07 0.14 C 0.77 0.93 0.86 0.35 0.12 0.25 006829 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 006843 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006862 G 0.31 0.39 0.35 A 0.69 0.61 0.65 0.43 0.48 0.46 006921 A 0.15 0.02 0.09 G 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 006935 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006984 G 0.15 0.02 0.09 C 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 007024 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007059 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007107 A 0.38 0.05 0.21 G 0.62 0.95 0.79 0.47 0.09 0.34 007195 C 0.19 0.05 0.12 T 0.81 0.95 0.88 0.31 0.09 0.21 007426 C 0.23 0.05 0.15 G 0.77 0.95 0.85 0.35 0.10 0.25 007451 G 0.25 0.05 0.15 A 0.75 0.95 0.85 0.38 0.09 0.26 007457 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007458 T 0.06 0.02 0.04 C 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 007459 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 007583 A 0.15 0.07 0.11 G 0.85 0.93 0.89 0.25 0.12 0.19 007732 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008153 G 0.15 0.05 0.10 A 0.85 0.95 0.90 0.26 0.09 0.18 008204 A 0.48 0.17 0.33 G 0.52 0.83 0.67 0.50 0.29 0.44 008228 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008245 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008250 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008266 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008276 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008281 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008284 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008291 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008296 C 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 008314 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008318 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008356 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 009464 G 0.17 0.00 0.09 A 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 010550 G 0.19 0.41 0.31 T 0.81 0.59 0.69 0.31 0.48 0.43 010732 G 0.04 0.08 0.06 A 0.96 0.92 0.94 0.08 0.15 0.11 010796 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 010886 T 0.11 0.31 0.20 C 0.89 0.69 0.80 0.19 0.42 0.31 011175 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011187 C 0.19 0.35 0.27 G 0.81 0.65 0.73 0.31 0.45 0.40 011277 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 011345 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011349 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.03 011397 T 0.05 0.03 0.04 C 0.95 0.97 0.96 0.09 0.05 0.07 011469 A 0.00 0.14 0.08 G 1.00 0.86 0.92 0.00 0.24 0.15 011488 C 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 011554 C 0.26 0.19 0.22 T 0.74 0.81 0.78 0.39 0.31 0.35 011620 T 0.06 0.10 0.08 C 0.94 0.90 0.92 0.10 0.17 0.14 011623 A 0.31 0.19 0.24 G 0.69 0.81 0.76 0.42 0.31 0.37 011630 G 0.26 0.19 0.22 A 0.74 0.81 0.78 0.39 0.31 0.35 011633 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.03 011669 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 011672 C 0.07 0.26 0.17 T 0.93 0.74 0.83 0.13 0.39 0.28 011679 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011808 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011818 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011820 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011903 A 0.58 0.41 0.50 G 0.42 0.59 0.50 0.49 0.48 0.50 012312 + 0.18 0.50 0.36 - 0.82 0.50 0.64 0.29 0.50 0.46 012434 C 0.26 0.53 0.40 T 0.74 0.47 0.60 0.39 0.50 0.48 012480 A 0.13 0.33 0.23 T 0.87 0.67 0.77 0.23 0.44 0.35 012508 A 0.13 0.33 0.23 C 0.87 0.67 0.77 0.23 0.44 0.35 012512 C 0.13 0.32 0.22 T 0.87 0.68 0.78 0.23 0.44 0.35 012514 T 0.08 0.06 0.07 G 0.92 0.94 0.93 0.15 0.11 0.13 012536 A 0.21 0.53 0.36 T 0.79 0.47 0.64 0.33 0.50 0.46 012550 + 0.24 0.52 0.38 - 0.76 0.48 0.62 0.36 0.50 0.47 012561 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 012613 T 0.05 0.07 0.06 G 0.95 0.93 0.94 0.10 0.13 0.11 012614 G 0.17 0.52 0.36 A 0.82 0.48 0.64 0.29 0.50 0.46 012848 G 0.35 0.52 0.43 C 0.65 0.48 0.57 0.45 0.50 0.49 013028 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 013033 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013074 C 0.05 0.17 0.11 T 0.95 0.83 0.89 0.09 0.29 0.20 013149 + 0.03 0.00 0.01 - 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 013168 A 0.21 0.30 0.26 G 0.79 0.70 0.74 0.33 0.42 0.39 013179 C 0.05 0.20 0.13 G 0.95 0.80 0.87 0.10 0.33 0.23 013247 T 0.18 0.14 0.15 C 0.82 0.86 0.85 0.29 0.24 0.26 013253 T 0.00 0.07 0.04 C 1.00 0.93 0.96 0.00 0.13 0.07 013419 G 0.09 0.17 0.14 A 0.91 0.82 0.86 0.16 0.29 0.23 013457 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 013510 T 0.05 0.10 0.07 G 0.95 0.90 0.93 0.10 0.18 0.14 013570 G 0.30 0.00 0.15 A 0.70 1.00 0.85 0.42 0.00 0.26 013588 G 0.42 0.45 0.44 C 0.57 0.55 0.56 0.49 0.50 0.49 013615 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013633 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 013659 C 0.25 0.57 0.41 G 0.75 0.43 0.59 0.38 0.49 0.48 013739 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013773 C 0.13 0.11 0.12 A 0.87 0.89 0.88 0.23 0.19 0.21 014619 T 0.39 0.37 0.38 C 0.61 0.63 0.62 0.47 0.47 0.47 014888 T 0.41 0.33 0.38 G 0.59 0.67 0.62 0.48 0.44 0.47 015037 C 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015086 A 0.02 0.11 0.07 G 0.98 0.89 0.93 0.04 0.20 0.12 015150 C 0.05 0.08 0.06 G 0.95 0.92 0.94 0.09 0.15 0.12 016270 A 0.26 0.28 0.27 G 0.74 0.72 0.73 0.39 0.40 0.39 016348 T 0.23 0.26 0.24 C 0.77 0.74 0.76 0.35 0.39 0.37 016407 T 0.16 0.28 0.21 C 0.84 0.72 0.79 0.27 0.40 0.33 017438 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017445 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017514 G 0.15 0.26 0.21 T 0.85 0.74 0.79 0.26 0.39 0.33 017536 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 017543 T 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 017577 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 017839 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 017918 C 0.16 0.25 0.20 G 0.84 0.75 0.80 0.27 0.38 0.33 017993 C 0.14 0.26 0.20 T 0.86 0.74 0.80 0.24 0.39 0.33 018000 T 0.17 0.27 0.23 G 0.82 0.73 0.77 0.29 0.40 0.35 018009 T 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 018090 C 0.10 0.26 0.19 T 0.90 0.74 0.81 0.18 0.39 0.30 018130 A 0.05 0.13 0.09 G 0.95 0.87 0.91 0.10 0.23 0.17 018159 G 0.14 0.26 0.20 C 0.86 0.74 0.80 0.24 0.39 0.33 018868 C 0.20 0.26 0.23 T 0.80 0.74 0.77 0.33 0.39 0.36 018875 A 0.19 0.25 0.22 T 0.81 0.75 0.78 0.31 0.38 0.34 018879 C 0.16 0.12 0.14 T 0.84 0.88 0.86 0.27 0.22 0.24 018894 G 0.19 0.29 0.24 A 0.81 0.71 0.76 0.31 0.41 0.37 018898 C 0.18 0.23 0.21 T 0.82 0.78 0.79 0.30 0.35 0.33 018904 + 0.19 0.18 0.19 - 0.81 0.82 0.81 0.31 0.30 0.30 019392 C 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019461 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019467 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019587 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019595 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019623 G 0.25 0.29 0.27 A 0.75 0.71 0.73 0.38 0.41 0.39 020925 G 0.15 0.23 0.19 T 0.85 0.77 0.81 0.26 0.35 0.31 021095 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021463 - 0.10 0.15 0.13 + 0.90 0.85 0.87 0.18 0.26 0.22 021677 T 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022054 A 0.54 0.33 0.43 C 0.46 0.67 0.57 0.50 0.44 0.49 022266 A 0.15 0.23 0.18 G 0.85 0.77 0.82 0.25 0.35 0.30 022280 G 0.15 0.23 0.18 A 0.85 0.77 0.82 0.25 0.35 0.30 022579 - 0.02 0.02 0.02 + 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 022860 C 0.22 0.07 0.13 T 0.78 0.93 0.87 0.34 0.13 0.23 022948 G 0.41 0.30 0.34 A 0.59 0.70 0.66 0.48 0.42 0.45 023368 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 023566 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023651 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 023859 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 023910 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 024471 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 027903 C 0.37 0.48 0.42 T 0.63 0.52 0.58 0.47 0.50 0.49 027959 A 0.38 0.48 0.42 G 0.62 0.52 0.58 0.47 0.50 0.49 028062 - 0.48 0.50 0.49 + 0.52 0.50 0.51 0.50 0.50 0.50 028067 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028080 A 0.38 0.50 0.44 G 0.62 0.50 0.56 0.47 0.50 0.49 028112 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 028173 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033400 C 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 033457 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033524 A 0.41 0.55 0.48 G 0.59 0.45 0.52 0.48 0.50 0.50 033595 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 033620 A 0.02 0.07 0.05 G 0.98 0.93 0.95 0.04 0.13 0.09 033621 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 033623 C 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 033664 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 033703 C 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 033742 C 0.03 0.03 0.03 T 0.97 0.97 0.97 0.05 0.05 0.05 043702 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 043716 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 043753 + 0.06 0.00 0.03 - 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 043887 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 043921 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 044035 C 0.06 0.11 0.09 G 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 044078 A 0.06 0.11 0.09 G 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 044209 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 044657 C 0.50 0.14 0.33 G 0.50 0.86 0.67 0.50 0.24 0.44 044772 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044861 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 046161 A 0.15 0.39 0.27 G 0.85 0.61 0.73 0.25 0.48 0.39 046204 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046226 T 0.18 0.39 0.29 C 0.82 0.61 0.71 0.30 0.48 0.41 046269 T 0.15 0.39 0.27 G 0.85 0.61 0.73 0.25 0.48 0.39 046400 C 0.19 0.15 0.17 T 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 046457 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 046528 T 0.21 0.15 0.18 C 0.79 0.85 0.82 0.33 0.26 0.30 046551 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 047862 T 0.22 0.11 0.16 C 0.78 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 048974 C 0.08 0.31 0.20 T 0.92 0.69 0.80 0.15 0.43 0.32 049105 T 0.22 0.15 0.18 C 0.78 0.85 0.82 0.34 0.26 0.30 049759 C 0.39 0.43 0.41 T 0.61 0.57 0.59 0.47 0.49 0.48 049785 T 0.52 0.45 0.49 C 0.48 0.55 0.51 0.50 0.50 0.50 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 006717: aaca 012312: A 012550: A 013149: A 013457: CTT 018904: cc 021463: tcctaaa 022579: att 028062: ATTT 043753: caggtggcctg