Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000168 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 000235 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 23 45 0.045 0.000 0.022 000237 AA 22 20 42 AG 2 3 5 GG 0 0 0 0.045 0.112 0.148 000240 CC 18 23 41 CT 5 0 5 TT 1 0 1 0.644 0.000 2.448 000305 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 000357 GG 17 8 25 GT 6 13 19 TT 0 2 2 0.517 1.043 0.473 000476 CC 18 23 41 CT 4 0 4 TT 1 0 1 1.252 0.000 3.784 000880 CC 20 22 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 001055 -- 0 2 2 +- 7 13 20 ++ 17 8 25 0.700 1.043 0.666 001344 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 001462 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 002431 AA 0 0 0 AG 3 3 6 GG 21 20 41 0.107 0.112 0.218 002559 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 002692 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 003425 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 20 43 0.011 0.000 0.006 003436 CC 1 2 3 CT 4 11 15 TT 19 8 27 1.361 0.416 0.210 003457 -- 22 16 38 +- 1 5 6 ++ 0 0 0 0.011 0.383 0.236 003469 CC 11 7 18 CT 9 12 21 TT 3 2 5 0.277 0.940 0.092 004182 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 16 21 37 0.016 0.048 0.061 004403 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 22 21 43 0.000 0.048 0.023 004481 AA 18 10 28 AG 4 9 13 GG 1 2 3 1.252 0.000 0.714 004764 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 23 17 40 0.000 0.015 0.006 004784 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 18 40 0.011 0.000 0.006 005021 GG 17 18 35 GT 5 0 5 TT 1 0 1 0.571 0.000 1.967 005065 AA 1 2 3 AT 4 6 10 TT 16 10 26 1.037 0.516 1.781 005469 CC 19 10 29 CT 3 10 13 TT 1 2 3 2.457 0.050 0.792 005723 AA 1 1 2 AG 0 1 1 GG 23 20 43 24.000 9.075 28.600 006055 CC 15 23 38 CT 3 0 3 TT 2 0 2 4.618 0.000 12.237 006307 CC 22 21 43 CT 0 1 1 TT 1 1 2 23.000 9.521 28.600 006308 CC 2 0 2 CG 4 0 4 GG 17 23 40 3.584 0.000 9.414 007070 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 15 22 37 0.066 0.000 0.027 007123 CC 1 0 1 CT 0 0 0 TT 23 23 46 24.000 0.000 47.000 007149 AA 19 18 37 AG 1 5 6 GG 0 0 0 0.013 0.342 0.242 007245 AA 14 5 19 AG 5 13 18 GG 3 5 8 3.414 0.391 1.001 007370 AA 11 5 16 AG 5 11 16 GG 6 5 11 5.965 0.048 2.594 007402 AA 22 22 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 007627 -- 20 23 43 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.012 0.000 0.006 008018 CC 1 1 2 CT 0 1 1 TT 18 18 36 19.000 8.183 24.113 008942 AA 24 20 44 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.112 0.051 009060 AA 11 7 18 AG 6 11 17 GG 7 5 12 5.662 0.030 3.291 009242 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 009302 CC 11 7 18 CT 6 11 17 TT 7 5 12 5.662 0.030 3.291 009378 CC 23 23 46 CT 0 0 0 TT 1 0 1 24.000 0.000 47.000 009416 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 009432 CC 1 0 1 CT 0 0 0 TT 23 23 46 24.000 0.000 47.000 009558 CC 0 0 0 CT 0 3 3 TT 24 20 44 0.000 0.112 0.051 009625 CC 13 5 18 CT 6 11 17 TT 5 7 12 4.594 0.030 3.291 009713 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 21 43 0.045 0.000 0.023 010026 AA 5 5 10 AC 6 11 17 CC 13 5 18 4.594 0.048 2.174 010067 GG 6 6 12 GT 5 10 15 TT 12 5 17 6.546 0.043 4.208 010297 GG 21 20 41 GT 3 1 4 TT 0 1 1 0.107 9.075 3.784 010312 CC 23 22 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 010389 CC 1 1 2 CT 0 1 1 TT 23 20 43 24.000 9.075 28.600 010648 CC 15 7 22 CT 6 11 17 TT 1 3 4 0.153 0.159 0.073 010748 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 010767 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 21 20 41 0.012 0.012 0.024 010792 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 20 42 0.000 0.012 0.006 010815 AA 1 3 4 AT 6 11 17 TT 15 7 22 0.153 0.159 0.073 011372 -- 8 7 15 +- 4 10 14 ++ 9 3 12 8.025 0.035 4.027 011620 -- 1 3 4 +- 11 7 18 ++ 12 7 19 0.618 0.279 0.008 011871 GG 3 0 3 GT 3 3 6 TT 18 20 38 8.347 0.112 8.563 011988 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 012047 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 013085 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 013086 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 19 43 0.000 0.118 0.052 013781 CC 1 1 2 CT 6 14 20 TT 16 8 24 0.195 2.685 0.747 013879 AA 20 6 26 AC 2 14 16 CC 1 3 4 4.707 1.308 0.442 014015 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 21 21 42 0.107 0.048 0.148 014132 AA 1 1 2 AG 6 12 18 GG 17 10 27 0.240 1.239 0.218 014170 AA 1 1 2 AG 6 12 18 GG 17 10 27 0.240 1.239 0.218 014580 CC 18 23 41 CG 3 0 3 GG 3 0 3 8.347 0.000 18.736 014582 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 22 22 44 0.045 0.011 0.051 014650 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 014944 AA 19 5 24 AT 3 15 18 TT 1 3 4 2.457 2.272 0.056 015077 AA 1 4 5 AG 10 10 20 GG 12 9 21 0.374 0.175 0.005 015085 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 015208 AA 17 11 28 AT 5 11 16 TT 1 1 2 0.571 0.741 0.023 015903 AA 0 0 0 AT 3 2 5 TT 21 21 42 0.107 0.048 0.148 015981 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 016114 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 016215 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 016224 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 016384 AA 23 20 43 AC 0 3 3 CC 0 0 0 0.000 0.112 0.052 016444 -- 0 0 0 +- 3 6 9 ++ 20 17 37 0.112 0.517 0.541 016654 CC 10 0 10 CT 7 5 12 TT 5 18 23 2.381 0.342 7.866 016829 GG 22 20 42 GT 2 3 5 TT 0 0 0 0.045 0.112 0.148 016830 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 016883 AA 1 4 5 AC 8 12 20 CC 15 7 22 0.003 0.087 0.020 016933 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 017035 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 017482 AA 0 0 0 AT 0 3 3 TT 22 17 39 0.000 0.131 0.058 017492 AA 20 21 41 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.097 017526 CC 5 4 9 CT 9 11 20 TT 10 6 16 1.119 0.069 0.357 018396 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 018431 CC 20 5 25 CT 3 15 18 TT 1 3 4 2.617 2.272 0.087 018600 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 19 41 0.011 0.000 0.006 018823 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 018859 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 018930 AA 0 3 3 AC 4 10 14 CC 20 10 30 0.198 0.040 0.577 019199 GG 21 21 42 GT 3 2 5 TT 0 0 0 0.107 0.048 0.148 019339 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 019840 AA 14 7 21 AG 8 13 21 GG 2 3 5 0.296 0.631 0.005 019892 CC 19 23 42 CG 4 0 4 GG 1 0 1 1.361 0.000 3.895 019933 AA 0 3 3 AC 5 10 15 CC 19 10 29 0.324 0.040 0.303 020014 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 21 43 0.045 0.048 0.093 020060 AA 21 23 44 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.107 0.000 0.051 020072 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 020132 GG 12 6 18 GT 9 13 22 TT 3 3 6 0.389 0.917 0.032 020585 AA 0 0 0 AT 1 3 4 TT 22 19 41 0.011 0.118 0.097 021617 AA 1 0 1 AG 3 0 3 GG 19 22 41 2.457 0.000 5.985 021716 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 022074 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 022200 CC 6 4 10 CT 11 13 24 TT 6 6 12 0.043 0.445 0.095 022202 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 23 43 0.112 0.000 0.052 022896 AA 0 1 1 AG 5 11 16 GG 17 9 26 0.362 1.068 0.663 022933 CC 0 0 0 CT 3 3 6 TT 19 18 37 0.118 0.124 0.242 022943 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 022986 CC 6 4 10 CT 10 13 23 TT 5 4 9 0.043 1.190 0.386 023272 AA 0 3 3 AC 4 10 14 CC 20 10 30 0.198 0.040 0.577 023666 CC 17 21 38 CT 7 1 8 TT 0 0 0 0.700 0.012 0.417 023667 AA 0 1 1 AG 2 2 4 GG 22 19 41 0.045 4.455 3.784 023713 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 023796 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 023829 GG 0 3 3 GT 4 9 13 TT 20 10 30 0.198 0.177 0.872 024135 CC 1 0 1 CT 4 0 4 TT 19 23 42 1.361 0.000 3.895 024184 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 024290 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 024301 GG 18 20 38 GT 5 3 8 TT 1 0 1 0.644 0.112 0.516 024819 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 024995 GG 21 20 41 GT 3 2 5 TT 0 0 0 0.107 0.050 0.152 025008 CC 0 0 0 CT 0 3 3 TT 24 19 43 0.000 0.118 0.052 025185 AA 15 16 31 AG 8 6 14 GG 1 1 2 0.003 0.195 0.068 025431 CC 3 3 6 CG 9 13 22 GG 12 7 19 0.389 0.631 0.009 025513 AA 19 11 30 AG 5 11 16 GG 0 1 1 0.324 0.741 0.465 025538 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 025588 GG 1 0 1 GT 5 4 9 TT 18 19 37 0.644 0.209 0.253 026379 CC 1 7 8 CT 8 10 18 TT 15 6 21 0.003 0.381 1.368 026576 CC 23 21 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 026730 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 20 21 41 0.012 0.000 0.006 026746 CC 0 2 2 CT 6 13 19 TT 15 6 21 0.583 1.702 0.795 026881 AA 4 5 9 AG 12 12 24 GG 8 6 14 0.020 0.048 0.051 027073 CC 21 17 38 CT 1 3 4 TT 1 0 1 9.521 0.131 3.452 027190 AA 15 16 31 AC 7 4 11 CC 1 0 1 0.025 0.247 0.000 027208 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 20 18 38 0.112 0.055 0.164 027429 CC 20 17 37 CT 2 3 5 TT 1 0 1 4.707 0.131 2.127 027435 -- 0 0 0 +- 6 0 6 ++ 17 20 37 0.517 0.000 0.242 027461 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 20 42 0.011 0.000 0.006 027672 CC 23 19 42 CT 1 3 4 TT 0 0 0 0.011 0.118 0.095 027684 AA 1 0 1 AG 4 0 4 GG 19 22 41 1.361 0.000 3.784 027686 CC 20 10 30 CT 4 9 13 TT 0 3 3 0.198 0.177 0.872 027746 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 20 43 0.011 0.000 0.006 027748 -- 1 0 1 +- 4 0 4 ++ 19 22 41 1.361 0.000 3.784 027821 AA 1 0 1 AG 4 0 4 GG 19 22 41 1.361 0.000 3.784 027835 CC 21 20 41 CT 3 2 5 TT 0 0 0 0.107 0.050 0.152 027888 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 028146 GG 11 17 28 GT 8 6 14 TT 5 0 5 2.003 0.517 2.206 028193 CC 15 18 33 CT 7 5 12 TT 2 0 2 0.730 0.342 0.435 028355 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 22 46 0.000 0.011 0.005 028380 AA 19 10 29 AC 5 11 16 CC 0 2 2 0.324 0.179 0.012 028391 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 028405 CC 22 21 43 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.045 0.048 0.093 028429 AA 0 3 3 AG 8 11 19 GG 16 9 25 0.960 0.016 0.059 028464 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 028465 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 028674 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 028897 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 21 19 40 0.107 0.053 0.156 029034 CC 5 0 5 CG 5 4 9 GG 14 18 32 6.369 0.220 7.472 029393 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 029441 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 20 22 42 0.050 0.011 0.054 029644 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 029714 -- 3 12 15 +- 13 9 22 ++ 7 2 9 0.631 0.028 0.033 029821 -- 18 19 37 +- 5 4 9 ++ 0 0 0 0.342 0.209 0.541 030151 CC 21 21 42 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.048 0.048 0.095 030295 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 030396 AA 8 2 10 AC 13 9 22 CC 3 12 15 0.421 0.028 0.133 030731 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 030834 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 030868 AA 0 0 0 AG 12 3 15 GG 12 20 32 2.667 0.112 1.694 030972 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 23 43 0.112 0.000 0.052 031016 CC 21 20 41 CT 1 3 4 TT 1 0 1 9.521 0.112 3.784 031066 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031079 AA 2 0 2 AG 5 3 8 GG 16 20 36 2.200 0.112 2.504 031593 AA 3 14 17 AG 12 6 18 GG 7 2 9 0.362 1.099 1.041 031761 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031776 CC 1 3 4 CG 9 11 20 GG 13 8 21 0.130 0.065 0.061 031786 CC 19 9 28 CT 4 11 15 TT 0 2 2 0.209 0.279 0.000 031801 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 032026 CC 14 8 22 CT 8 11 19 TT 2 4 6 0.296 0.004 0.344 032108 -- 16 9 25 +- 8 11 19 ++ 0 3 3 0.960 0.016 0.059 032145 CC 16 9 25 CT 8 11 19 TT 0 3 3 0.960 0.016 0.059 032285 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 032298 CC 3 0 3 CT 9 5 14 TT 12 18 30 0.389 0.342 0.577 032839 AA 3 5 8 AC 6 9 15 CC 12 4 16 1.890 0.000 1.513 032853 CC 0 3 3 CT 6 8 14 TT 15 7 22 0.583 0.076 0.134 032902 AA 23 22 45 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 033467 AA 1 0 1 AC 1 3 4 CC 22 18 40 9.967 0.124 3.673 033559 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 033723 CC 0 0 0 CT 7 2 9 TT 17 19 36 0.700 0.053 0.556 033800 CC 5 5 10 CT 9 9 18 TT 10 7 17 1.119 0.383 1.461 033873 AA 7 7 14 AG 9 9 18 GG 8 5 13 1.484 0.383 1.793 033920 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 033934 GG 7 7 14 GT 9 9 18 TT 8 5 13 1.484 0.383 1.793 034134 CC 24 19 43 CG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.118 0.052 034181 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 22 18 40 0.000 0.014 0.006 034419 AA 1 0 1 AG 1 2 3 GG 19 17 36 8.629 0.059 5.184 034774 AA 19 13 32 AG 2 7 9 GG 0 2 2 0.053 0.505 1.462 034848 AA 0 0 0 AG 7 2 9 GG 14 20 34 0.840 0.050 0.587 034880 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 20 19 39 0.012 0.118 0.102 034943 GG 14 20 34 GT 7 2 9 TT 0 0 0 0.840 0.050 0.587 035011 AA 0 4 4 AG 6 10 16 GG 14 8 22 0.623 0.079 0.187 035067 AA 18 22 40 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.124 0.000 0.056 035396 CC 14 8 22 CT 8 11 19 TT 2 4 6 0.296 0.004 0.344 035552 CC 19 21 40 CT 2 1 3 TT 2 0 2 8.746 0.012 12.894 035688 GG 18 20 38 GT 4 3 7 TT 1 0 1 1.252 0.112 0.875 035740 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 035782 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 035819 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 035951 AA 0 0 0 AT 0 3 3 TT 23 20 43 0.000 0.112 0.052 035954 GG 22 21 43 GT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.052 036022 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 036094 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 036330 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 036334 AA 0 0 0 AG 7 2 9 GG 17 21 38 0.700 0.048 0.527 036374 AA 20 22 42 AG 2 1 3 GG 2 0 2 9.197 0.011 13.551 036666 CC 16 17 33 CT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.131 0.068 036884 -- 0 0 0 +- 7 2 9 ++ 17 21 38 0.700 0.048 0.527 037179 CC 22 21 43 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.045 0.048 0.093 037560 CC 23 22 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 037717 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 037725 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 037761 CC 22 22 44 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 037805 CC 22 22 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 037884 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 038219 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 038258 AA 0 0 0 AG 9 1 10 GG 14 22 36 1.361 0.011 0.684 038539 CC 0 3 3 CT 8 8 16 TT 14 6 20 1.086 0.014 0.007 038764 CC 22 16 38 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.016 0.007 038791 AA 22 16 38 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.062 0.059 038924 GG 19 8 27 GT 4 10 14 TT 0 1 1 0.209 0.903 0.275 038994 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 19 41 0.045 0.000 0.024 039040 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 18 42 0.000 0.014 0.006 039611 AA 22 18 40 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.055 0.025 039641 AA 20 21 41 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.024 039659 CC 19 10 29 CT 3 9 12 TT 0 2 2 0.118 0.000 0.265 039765 CC 6 15 21 CT 12 6 18 TT 5 0 5 0.048 0.583 0.144 039766 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 22 20 42 0.011 0.012 0.024 039810 GG 23 19 42 GT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.024 039863 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 22 21 43 0.011 0.000 0.006 040027 CC 0 2 2 CG 4 9 13 GG 19 10 29 0.209 0.000 0.120 040032 AA 16 7 23 AT 7 11 18 TT 0 3 3 0.741 0.159 0.043 040078 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 21 21 42 0.012 0.000 0.006 040310 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 040591 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 040616 CC 5 0 5 CT 12 6 18 TT 7 17 24 0.001 0.517 0.335 040853 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 040856 AA 24 21 45 AT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 041016 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 041386 -- 0 3 3 +- 5 11 16 ++ 17 9 26 0.362 0.016 0.063 041611 -- 7 17 24 +- 11 6 17 ++ 5 0 5 0.030 0.517 0.545 041666 CC 21 21 42 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.048 0.048 0.095 042047 AA 23 15 38 AG 1 8 9 GG 0 0 0 0.011 1.019 0.527 042079 AA 0 2 2 AG 4 11 15 GG 20 10 30 0.198 0.179 0.005 042194 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 042384 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 042444 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 042465 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 042554 AA 1 0 1 AG 11 1 12 GG 12 22 34 0.618 0.011 0.002 042720 CC 21 18 39 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.048 0.014 0.058 042845 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 19 38 0.209 0.000 0.105 042873 CC 15 18 33 CT 8 1 9 TT 0 0 0 1.019 0.014 0.605 042909 AA 3 0 3 AG 7 5 12 GG 13 14 27 1.431 0.436 0.964 042975 CC 0 2 2 CT 4 9 13 TT 18 8 26 0.220 0.052 0.051 043040 AA 21 19 40 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.012 0.000 0.006 043291 CC 20 17 37 CT 1 5 6 TT 0 0 0 0.012 0.362 0.242 043295 -- 3 0 3 +- 5 5 10 ++ 13 17 30 3.099 0.362 2.317 043313 AA 5 3 8 AG 10 13 23 GG 2 5 7 0.781 1.307 1.698 044120 CC 22 17 39 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.045 0.015 0.058 044177 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 17 39 0.045 0.000 0.026 044447 AA 1 0 1 AG 3 3 6 GG 18 14 32 2.296 0.159 1.053 044951 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 17 21 38 0.015 0.000 0.007 045101 AA 0 0 0 AG 4 2 6 GG 15 18 33 0.263 0.055 0.271 045597 CC 14 22 36 CT 9 0 9 TT 0 0 0 1.361 0.000 0.556 045598 AA 3 0 3 AG 7 5 12 GG 13 17 30 1.431 0.362 1.250 045795 AA 3 0 3 AG 7 5 12 GG 14 17 31 1.642 0.362 1.348 045805 GG 0 0 0 GT 0 2 2 TT 24 20 44 0.000 0.050 0.023 045938 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 046171 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 046213 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 046330 GG 20 16 36 GT 4 5 9 TT 0 1 1 0.198 0.499 0.230 046524 CC 1 3 4 CT 14 12 26 TT 9 7 16 2.344 0.362 2.087 046698 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 046753 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 047493 CC 1 0 1 CG 6 2 8 GG 16 20 36 0.195 0.050 0.450 047738 -- 1 0 1 +- 5 2 7 ++ 13 19 32 0.294 0.053 0.611 047809 CC 0 0 0 CG 7 0 7 GG 13 21 34 0.900 0.000 0.357 047813 AA 15 11 26 AG 3 10 13 GG 2 0 2 4.618 2.051 0.051 047837 CC 20 19 39 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.053 0.026 047906 CC 0 2 2 CT 4 9 13 TT 18 10 28 0.220 0.000 0.095 047909 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 20 21 41 0.012 0.000 0.006 047913 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 17 21 38 0.362 0.000 0.164 048118 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 21 21 42 0.048 0.000 0.024 048998 AA 15 10 25 AC 8 11 19 CC 0 2 2 1.019 0.179 0.473 049048 CC 22 21 43 CG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.052 049458 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 19 23 42 0.118 0.000 0.054 049474 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 23 44 0.012 0.000 0.006 049645 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 049813 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 20 43 0.011 0.000 0.006 049935 AA 24 17 41 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.131 0.055 050625 AA 0 2 2 AG 6 8 14 GG 17 9 26 0.517 0.012 0.004 050700 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 19 40 0.048 0.000 0.025 050770 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 19 41 0.011 0.000 0.006 050820 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 19 41 0.011 0.000 0.006 050940 CC 21 17 38 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.048 0.059 0.105 050949 AA 17 19 36 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.517 0.000 0.249 050984 CC 22 19 41 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 051007 AA 20 10 30 AT 3 7 10 TT 0 2 2 0.112 0.207 0.857 051079 AA 23 17 40 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.059 0.025 051105 CC 0 0 0 CG 0 4 4 GG 23 15 38 0.000 0.263 0.105 051187 AA 0 0 0 AG 5 3 8 GG 19 19 38 0.324 0.118 0.417 051278 AA 0 0 0 AG 7 5 12 GG 17 17 34 0.700 0.362 1.035 051316 -- 0 0 0 +- 0 4 4 ++ 23 13 36 0.000 0.302 0.111 051390 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 17 39 0.011 0.000 0.006 051449 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 18 39 0.048 0.000 0.026 051464 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 22 17 39 0.011 0.015 0.026 051501 CC 22 18 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 051717 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 18 40 0.011 0.000 0.006 051838 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 23 17 40 0.000 0.015 0.006 052071 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 20 42 0.045 0.050 0.095 052282 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 052347 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 052363 AA 1 0 1 AG 6 7 13 GG 17 14 31 0.240 0.840 0.072 052418 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 052580 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 052661 AA 3 5 8 AG 9 11 20 GG 12 7 19 0.389 0.030 0.466 052737 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 052855 CC 4 6 10 CT 10 11 21 TT 10 6 16 0.296 0.043 0.394 052943 CC 23 22 45 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.022 053066 AA 20 17 37 AT 4 5 9 TT 0 1 1 0.198 0.571 0.253 053096 CC 19 10 29 CT 5 9 14 TT 0 2 2 0.324 0.000 0.035 053274 CC 23 21 44 CG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.051 053368 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 053388 GG 22 22 44 GT 2 1 3 TT 0 0 0 0.045 0.011 0.051 053585 GG 0 0 0 GT 8 1 9 TT 14 22 36 1.086 0.011 0.556 054057 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 18 19 37 0.000 0.209 0.108 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000235: T 001055: GT 003457: T 007627: T 011372: G 011620: G 016444: TTAT 027435: A 027748: GTTT 029714: T 029821: A 032108: T 036884: TTG 041386: TCCCCCATATCACCCTGCACAGTTATTGGAAGGCTTCAAAGAGGCCAATGCTTGTTGTCCTTTCTCGAAGGCT 041611: T 043295: CTCA 047738: G 047909: cttataa 048118: cctcgc 049474: g 051316: A