Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000168 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 000235 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000237 G 0.04 0.07 0.05 A 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 000240 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 000305 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000357 T 0.13 0.37 0.25 G 0.87 0.63 0.75 0.23 0.47 0.38 000476 T 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 000880 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001055 - 0.15 0.37 0.26 + 0.85 0.63 0.74 0.25 0.47 0.38 001344 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001462 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002431 A 0.06 0.07 0.06 G 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 002559 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002692 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 003425 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003436 C 0.12 0.36 0.23 T 0.88 0.64 0.77 0.22 0.46 0.36 003457 + 0.02 0.12 0.07 - 0.98 0.88 0.93 0.04 0.21 0.13 003469 T 0.33 0.38 0.35 C 0.67 0.62 0.65 0.44 0.47 0.46 004182 A 0.03 0.04 0.04 G 0.97 0.96 0.96 0.06 0.08 0.07 004403 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004481 G 0.13 0.31 0.22 A 0.87 0.69 0.78 0.23 0.43 0.34 004764 A 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 004784 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005021 T 0.15 0.00 0.09 G 0.85 1.00 0.91 0.26 0.00 0.16 005065 A 0.14 0.28 0.21 T 0.86 0.72 0.79 0.24 0.40 0.33 005469 T 0.11 0.32 0.21 C 0.89 0.68 0.79 0.19 0.43 0.33 005723 A 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.13 0.10 006055 T 0.17 0.00 0.08 C 0.82 1.00 0.92 0.29 0.00 0.15 006307 T 0.04 0.07 0.05 C 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 006308 C 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 007070 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.11 0.00 0.05 007123 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007149 G 0.03 0.11 0.07 A 0.97 0.89 0.93 0.05 0.19 0.13 007245 G 0.25 0.50 0.38 A 0.75 0.50 0.62 0.38 0.50 0.47 007370 G 0.39 0.50 0.44 A 0.61 0.50 0.56 0.47 0.50 0.49 007402 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007627 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008018 C 0.05 0.07 0.06 T 0.95 0.93 0.94 0.10 0.14 0.12 008942 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 009060 G 0.42 0.46 0.44 A 0.58 0.54 0.56 0.49 0.50 0.49 009242 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009302 T 0.42 0.46 0.44 C 0.58 0.54 0.56 0.49 0.50 0.49 009378 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009416 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009432 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009558 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 009625 T 0.33 0.54 0.44 C 0.67 0.46 0.56 0.44 0.50 0.49 009713 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010026 A 0.33 0.50 0.41 C 0.67 0.50 0.59 0.44 0.50 0.48 010067 G 0.37 0.52 0.44 T 0.63 0.48 0.56 0.47 0.50 0.49 010297 T 0.06 0.07 0.07 G 0.94 0.93 0.93 0.12 0.13 0.12 010312 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010389 C 0.04 0.07 0.05 T 0.96 0.93 0.95 0.08 0.13 0.10 010648 T 0.18 0.40 0.29 C 0.82 0.60 0.71 0.30 0.48 0.41 010748 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010767 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.05 010792 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 010815 A 0.18 0.40 0.29 T 0.82 0.60 0.71 0.30 0.48 0.41 011372 + 0.52 0.40 0.46 - 0.48 0.60 0.54 0.50 0.48 0.50 011620 - 0.27 0.38 0.32 + 0.73 0.62 0.68 0.39 0.47 0.43 011871 G 0.19 0.07 0.13 T 0.81 0.93 0.87 0.30 0.12 0.22 011988 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012047 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013085 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013086 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 013781 C 0.17 0.35 0.26 T 0.83 0.65 0.74 0.29 0.45 0.39 013879 C 0.09 0.43 0.26 A 0.91 0.57 0.74 0.16 0.49 0.39 014015 A 0.06 0.04 0.05 G 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 014132 A 0.17 0.30 0.23 G 0.83 0.70 0.77 0.28 0.42 0.36 014170 A 0.17 0.30 0.23 G 0.83 0.70 0.77 0.28 0.42 0.36 014580 G 0.19 0.00 0.10 C 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 014582 A 0.04 0.02 0.03 G 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 014650 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014944 T 0.11 0.46 0.28 A 0.89 0.54 0.72 0.19 0.50 0.41 015077 A 0.26 0.39 0.33 G 0.74 0.61 0.67 0.39 0.48 0.44 015085 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015208 T 0.15 0.28 0.22 A 0.85 0.72 0.78 0.26 0.41 0.34 015903 A 0.06 0.04 0.05 T 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 015981 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 016114 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016215 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016224 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016384 C 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 016444 - 0.07 0.13 0.10 + 0.93 0.87 0.90 0.12 0.23 0.18 016654 C 0.61 0.11 0.36 T 0.39 0.89 0.64 0.47 0.19 0.46 016829 T 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 016830 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016883 A 0.21 0.43 0.32 C 0.79 0.57 0.68 0.33 0.49 0.43 016933 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 017035 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017482 A 0.00 0.07 0.04 T 1.00 0.93 0.96 0.00 0.14 0.07 017492 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 017526 C 0.40 0.45 0.42 T 0.60 0.55 0.58 0.48 0.50 0.49 018396 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018431 T 0.10 0.46 0.28 C 0.90 0.54 0.72 0.19 0.50 0.40 018600 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018823 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018859 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018930 A 0.08 0.35 0.21 C 0.92 0.65 0.79 0.15 0.45 0.33 019199 T 0.06 0.04 0.05 G 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 019339 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019840 G 0.25 0.41 0.33 A 0.75 0.59 0.67 0.38 0.48 0.44 019892 G 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 019933 A 0.10 0.35 0.22 C 0.90 0.65 0.78 0.19 0.45 0.35 020014 A 0.04 0.04 0.04 G 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 020060 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020072 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020132 T 0.31 0.43 0.37 G 0.69 0.57 0.63 0.43 0.49 0.47 020585 A 0.02 0.07 0.04 T 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 021617 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 021716 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022074 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022200 C 0.50 0.46 0.48 T 0.50 0.54 0.52 0.50 0.50 0.50 022202 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 022896 A 0.11 0.31 0.21 G 0.89 0.69 0.79 0.20 0.43 0.33 022933 C 0.07 0.07 0.07 T 0.93 0.93 0.93 0.13 0.13 0.13 022943 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022986 T 0.48 0.50 0.49 C 0.52 0.50 0.51 0.50 0.50 0.50 023272 A 0.08 0.35 0.21 C 0.92 0.65 0.79 0.15 0.45 0.33 023666 T 0.15 0.02 0.09 C 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 023667 A 0.04 0.09 0.07 G 0.96 0.91 0.93 0.08 0.17 0.12 023713 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023796 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 023829 G 0.08 0.34 0.21 T 0.92 0.66 0.79 0.15 0.45 0.33 024135 C 0.12 0.00 0.06 T 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 024184 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024290 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 024301 T 0.15 0.07 0.11 G 0.85 0.93 0.89 0.25 0.12 0.19 024819 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 024995 T 0.06 0.05 0.05 G 0.94 0.95 0.95 0.12 0.09 0.10 025008 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 025185 G 0.21 0.17 0.19 A 0.79 0.83 0.81 0.33 0.29 0.31 025431 C 0.31 0.41 0.36 G 0.69 0.59 0.64 0.43 0.48 0.46 025513 G 0.10 0.28 0.19 A 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 025538 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 025588 G 0.15 0.09 0.12 T 0.85 0.91 0.88 0.25 0.16 0.21 026379 C 0.21 0.52 0.36 T 0.79 0.48 0.64 0.33 0.50 0.46 026576 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 026730 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 026746 C 0.14 0.40 0.27 T 0.86 0.60 0.73 0.24 0.48 0.40 026881 A 0.42 0.48 0.45 G 0.58 0.52 0.55 0.49 0.50 0.49 027073 T 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.12 0.14 0.13 027190 C 0.20 0.10 0.15 A 0.80 0.90 0.85 0.31 0.18 0.26 027208 A 0.07 0.05 0.06 G 0.93 0.95 0.94 0.12 0.10 0.11 027429 T 0.09 0.07 0.08 C 0.91 0.93 0.92 0.16 0.14 0.15 027435 - 0.13 0.00 0.07 + 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 027461 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027672 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 027684 A 0.12 0.00 0.07 G 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 027686 T 0.08 0.34 0.21 C 0.92 0.66 0.79 0.15 0.45 0.33 027746 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027748 - 0.12 0.00 0.07 + 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 027821 A 0.12 0.00 0.07 G 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 027835 T 0.06 0.05 0.05 C 0.94 0.95 0.95 0.12 0.09 0.10 027888 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028146 T 0.38 0.13 0.26 G 0.62 0.87 0.74 0.47 0.23 0.38 028193 T 0.23 0.11 0.17 C 0.77 0.89 0.83 0.35 0.19 0.28 028355 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 028380 C 0.10 0.33 0.21 A 0.90 0.67 0.79 0.19 0.44 0.33 028391 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 028405 T 0.04 0.04 0.04 C 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 028429 A 0.17 0.37 0.27 G 0.83 0.63 0.73 0.28 0.47 0.39 028464 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 028465 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 028674 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 028897 A 0.06 0.05 0.06 G 0.94 0.95 0.94 0.12 0.09 0.10 029034 C 0.31 0.09 0.21 G 0.69 0.91 0.79 0.43 0.17 0.33 029393 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029441 A 0.05 0.02 0.03 G 0.95 0.98 0.97 0.09 0.04 0.06 029644 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029714 + 0.59 0.28 0.43 - 0.41 0.72 0.57 0.48 0.41 0.49 029821 + 0.11 0.09 0.10 - 0.89 0.91 0.90 0.19 0.16 0.18 030151 T 0.04 0.04 0.04 C 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 030295 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 030396 A 0.60 0.28 0.45 C 0.40 0.72 0.55 0.48 0.41 0.49 030731 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 030834 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030868 A 0.25 0.07 0.16 G 0.75 0.93 0.84 0.38 0.12 0.27 030972 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 031016 T 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.12 0.12 0.12 031066 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031079 A 0.20 0.07 0.13 G 0.80 0.93 0.87 0.31 0.12 0.23 031593 G 0.59 0.23 0.41 A 0.41 0.77 0.59 0.48 0.35 0.48 031761 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031776 C 0.24 0.39 0.31 G 0.76 0.61 0.69 0.36 0.47 0.43 031786 T 0.09 0.34 0.21 C 0.91 0.66 0.79 0.16 0.45 0.33 031801 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032026 T 0.25 0.41 0.33 C 0.75 0.59 0.67 0.38 0.48 0.44 032108 + 0.17 0.37 0.27 - 0.83 0.63 0.73 0.28 0.47 0.39 032145 T 0.17 0.37 0.27 C 0.83 0.63 0.73 0.28 0.47 0.39 032285 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 032298 C 0.31 0.11 0.21 T 0.69 0.89 0.79 0.43 0.19 0.33 032839 A 0.29 0.53 0.40 C 0.71 0.47 0.60 0.41 0.50 0.48 032853 C 0.14 0.39 0.26 T 0.86 0.61 0.74 0.24 0.48 0.38 032902 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033467 A 0.06 0.07 0.07 C 0.94 0.93 0.93 0.12 0.13 0.12 033559 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033723 C 0.15 0.05 0.10 T 0.85 0.95 0.90 0.25 0.09 0.18 033800 C 0.40 0.45 0.42 T 0.60 0.55 0.58 0.48 0.50 0.49 033873 G 0.52 0.45 0.49 A 0.48 0.55 0.51 0.50 0.50 0.50 033920 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033934 T 0.52 0.45 0.49 G 0.48 0.55 0.51 0.50 0.50 0.50 034134 G 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 034181 C 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 034419 A 0.07 0.05 0.06 G 0.93 0.95 0.94 0.13 0.10 0.12 034774 G 0.05 0.25 0.15 A 0.95 0.75 0.85 0.09 0.38 0.26 034848 A 0.17 0.05 0.10 G 0.83 0.95 0.90 0.28 0.09 0.19 034880 A 0.02 0.07 0.05 G 0.98 0.93 0.95 0.05 0.13 0.09 034943 T 0.17 0.05 0.10 G 0.83 0.95 0.90 0.28 0.09 0.19 035011 A 0.15 0.41 0.29 G 0.85 0.59 0.71 0.26 0.48 0.41 035067 C 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 035396 T 0.25 0.41 0.33 C 0.75 0.59 0.67 0.38 0.48 0.44 035552 T 0.13 0.02 0.08 C 0.87 0.98 0.92 0.23 0.04 0.14 035688 T 0.13 0.07 0.10 G 0.87 0.93 0.90 0.23 0.12 0.18 035740 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035782 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035819 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 035951 A 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 035954 T 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 036022 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036094 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 036330 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036334 A 0.15 0.04 0.10 G 0.85 0.96 0.90 0.25 0.08 0.17 036374 G 0.12 0.02 0.07 A 0.88 0.98 0.93 0.22 0.04 0.14 036666 T 0.00 0.07 0.04 C 1.00 0.93 0.96 0.00 0.14 0.08 036884 - 0.15 0.04 0.10 + 0.85 0.96 0.90 0.25 0.08 0.17 037179 T 0.04 0.04 0.04 C 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 037560 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037717 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037725 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 037761 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 037805 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 037884 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038219 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038258 A 0.20 0.02 0.11 G 0.80 0.98 0.89 0.31 0.04 0.19 038539 C 0.18 0.41 0.28 T 0.82 0.59 0.72 0.30 0.48 0.40 038764 G 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 038791 G 0.02 0.06 0.04 A 0.98 0.94 0.96 0.04 0.10 0.07 038924 T 0.09 0.32 0.19 G 0.91 0.68 0.81 0.16 0.43 0.31 038994 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 039040 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 039611 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 039641 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 039659 T 0.07 0.31 0.19 C 0.93 0.69 0.81 0.13 0.43 0.30 039765 T 0.48 0.14 0.32 C 0.52 0.86 0.68 0.50 0.24 0.43 039766 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 039810 T 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 039863 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040027 C 0.09 0.31 0.19 G 0.91 0.69 0.81 0.16 0.43 0.31 040032 T 0.15 0.40 0.27 A 0.85 0.60 0.73 0.26 0.48 0.40 040078 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040310 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 040591 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 040616 C 0.46 0.13 0.30 T 0.54 0.87 0.70 0.50 0.23 0.42 040853 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 040856 T 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 041016 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 041386 - 0.11 0.37 0.24 + 0.89 0.63 0.76 0.20 0.47 0.37 041611 + 0.46 0.13 0.29 - 0.54 0.87 0.71 0.50 0.23 0.41 041666 T 0.04 0.04 0.04 C 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 042047 G 0.02 0.17 0.10 A 0.98 0.83 0.90 0.04 0.29 0.17 042079 A 0.08 0.33 0.20 G 0.92 0.67 0.80 0.15 0.44 0.32 042194 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 042384 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042444 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042465 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042554 A 0.27 0.02 0.15 G 0.73 0.98 0.85 0.39 0.04 0.25 042720 T 0.04 0.03 0.04 C 0.96 0.97 0.96 0.08 0.05 0.07 042845 A 0.09 0.00 0.05 G 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 042873 T 0.17 0.03 0.11 C 0.83 0.97 0.89 0.29 0.05 0.19 042909 A 0.28 0.13 0.21 G 0.72 0.87 0.79 0.41 0.23 0.34 042975 C 0.09 0.34 0.21 T 0.91 0.66 0.79 0.17 0.45 0.33 043040 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043291 T 0.02 0.11 0.07 C 0.98 0.89 0.93 0.05 0.20 0.13 043295 - 0.26 0.11 0.19 + 0.74 0.89 0.81 0.39 0.20 0.30 043313 G 0.41 0.55 0.49 A 0.59 0.45 0.51 0.48 0.50 0.50 044120 T 0.04 0.03 0.04 C 0.96 0.97 0.96 0.08 0.05 0.07 044177 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 044447 A 0.11 0.09 0.10 G 0.89 0.91 0.90 0.20 0.16 0.18 044951 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 045101 A 0.11 0.05 0.08 G 0.89 0.95 0.92 0.19 0.10 0.14 045597 T 0.20 0.00 0.10 C 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 045598 A 0.28 0.11 0.20 G 0.72 0.89 0.80 0.41 0.20 0.32 045795 A 0.27 0.11 0.20 G 0.73 0.89 0.80 0.39 0.20 0.31 045805 G 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 045938 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 046171 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 046213 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046330 T 0.08 0.16 0.12 G 0.92 0.84 0.88 0.15 0.27 0.21 046524 C 0.33 0.41 0.37 T 0.67 0.59 0.63 0.44 0.48 0.47 046698 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 046753 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 047493 C 0.17 0.05 0.11 G 0.83 0.95 0.89 0.29 0.09 0.20 047738 - 0.18 0.05 0.11 + 0.82 0.95 0.89 0.30 0.09 0.20 047809 C 0.17 0.00 0.09 G 0.82 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 047813 G 0.17 0.24 0.21 A 0.82 0.76 0.79 0.29 0.36 0.33 047837 G 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 047906 C 0.09 0.31 0.20 T 0.91 0.69 0.80 0.17 0.43 0.32 047909 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 047913 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 048118 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 048998 C 0.17 0.33 0.25 A 0.83 0.67 0.75 0.29 0.44 0.38 049048 G 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 049458 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 049474 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049645 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049813 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049935 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.14 0.07 050625 A 0.13 0.32 0.21 G 0.87 0.68 0.79 0.23 0.43 0.34 050700 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 050770 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 050820 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 050940 T 0.04 0.05 0.05 C 0.96 0.95 0.95 0.08 0.10 0.09 050949 G 0.13 0.00 0.07 A 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 050984 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 051007 T 0.07 0.29 0.17 A 0.93 0.71 0.83 0.12 0.41 0.28 051079 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 051105 C 0.00 0.11 0.05 G 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.09 051187 A 0.10 0.07 0.09 G 0.90 0.93 0.91 0.19 0.13 0.16 051278 A 0.15 0.11 0.13 G 0.85 0.89 0.87 0.25 0.20 0.23 051316 - 0.00 0.12 0.05 + 1.00 0.88 0.95 0.00 0.21 0.10 051390 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 051449 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 051464 A 0.02 0.03 0.02 G 0.98 0.97 0.98 0.04 0.05 0.05 051501 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 051717 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 051838 A 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 052071 A 0.04 0.05 0.04 G 0.96 0.95 0.96 0.08 0.09 0.08 052282 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 052347 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 052363 A 0.17 0.17 0.17 G 0.83 0.83 0.83 0.28 0.28 0.28 052418 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 052580 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 052661 A 0.31 0.46 0.38 G 0.69 0.54 0.62 0.43 0.50 0.47 052737 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 052855 C 0.38 0.50 0.44 T 0.62 0.50 0.56 0.47 0.50 0.49 052943 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 053066 T 0.08 0.15 0.12 A 0.92 0.85 0.88 0.15 0.26 0.21 053096 T 0.10 0.31 0.20 C 0.90 0.69 0.80 0.19 0.43 0.32 053274 G 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 053368 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 053388 T 0.04 0.02 0.03 G 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 053585 G 0.18 0.02 0.10 T 0.82 0.98 0.90 0.30 0.04 0.18 054057 C 0.00 0.09 0.05 T 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000235: T 001055: GT 003457: T 007627: T 011372: G 011620: G 016444: TTAT 027435: A 027748: GTTT 029714: T 029821: A 032108: T 036884: TTG 041386: TCCCCCATATCACCCTGCACAGTTATTGGAAGGCTTCAAAGAGGCCAATGCTTGTTGTCCTTTCTCGAAGGCT 041611: T 043295: CTCA 047738: G 047909: cttataa 048118: cctcgc 049474: g 051316: A