Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 chi2 000170 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.005 000806 CC 12 14 26 CT 10 8 18 TT 2 1 3 0.000 0.011 0.002 000884 AA 0 0 0 AG 4 5 9 GG 17 15 32 0.000 0.408 0.623 000951 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 23 43 0.000 0.000 0.006 001263 AA 1 0 1 AG 6 1 7 GG 15 22 37 0.000 0.011 0.830 001773 CC 0 0 0 CT 7 0 7 TT 12 22 34 0.000 0.000 0.357 001995 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 21 20 41 0.000 0.050 0.055 002586 AA 7 0 7 AC 14 6 20 CC 2 17 19 0.000 0.517 0.206 002592 AA 0 4 4 AC 2 9 11 CC 22 10 32 0.000 0.591 3.539 003027 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 003094 ++ 0 5 5 +- 1 12 13 -- 23 4 27 0.000 0.444 2.608 003385 CC 0 0 0 CT 3 4 7 TT 16 18 34 0.000 0.220 0.357 003519 GG 17 23 40 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.056 003772 GG 1 0 1 GT 5 5 10 TT 7 17 24 0.000 0.362 0.001 004021 ++ 13 22 35 +- 7 1 8 -- 0 0 0 0.000 0.011 0.452 004471 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 004510 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 004642 ++ 22 14 36 +- 2 0 2 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.028 004745 AA 2 0 2 AC 9 4 13 CC 13 19 32 0.000 0.209 0.208 005042 CC 1 0 1 CG 9 0 9 GG 14 21 35 0.000 0.000 0.207 005167 AA 6 6 12 AG 10 12 22 GG 1 4 5 0.000 0.220 1.072 005192 CC 16 21 37 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.007 005195 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 16 23 39 0.000 0.000 0.006 005197 CC 15 20 35 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.029 006126 AA 19 5 24 AG 1 12 13 GG 0 4 4 0.000 0.444 1.155 007237 AA 1 0 1 AG 10 4 14 GG 12 19 31 0.000 0.209 0.161 007611 ++ 0 0 0 +- 5 0 5 -- 10 22 32 0.000 0.000 0.194 007793 CC 6 11 17 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.000 0.090 0.131 008418 GG 13 13 26 GT 9 3 12 TT 1 0 1 0.000 0.171 0.078 008726 GG 0 0 0 GT 7 5 12 TT 17 11 28 0.000 0.549 1.246 009296 AA 15 10 25 AG 4 0 4 GG 1 0 1 0.000 0.000 2.016 009457 GG 11 10 21 GT 9 0 9 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.934 009508 AA 0 4 4 AG 1 0 1 GG 19 6 25 0.000 10.000 22.669 009577 ++ 17 10 27 +- 1 13 14 -- 0 0 0 0.000 3.569 1.738 009958 AA 12 19 31 AT 10 1 11 TT 1 0 1 0.000 0.013 0.000 010274 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 21 44 0.000 0.000 0.006 010366 AA 19 16 35 AG 5 5 10 GG 0 0 0 0.000 0.383 0.703 010795 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 22 41 0.000 0.000 0.006 011084 CC 1 0 1 CT 8 4 12 TT 11 19 30 0.000 0.209 0.024 011469 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 21 23 44 0.000 0.000 0.023 011498 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 011520 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.000 0.000 0.006 011731 GG 20 23 43 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.052 011836 AA 0 4 4 AG 2 13 15 GG 21 6 27 0.000 0.445 0.783 011908 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 012016 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 23 44 0.000 0.000 0.006 012041 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.000 0.000 0.006 012364 CC 20 6 26 CG 2 13 15 GG 0 4 4 0.000 0.445 0.691 012436 AA 21 23 44 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.000 0.000 0.006 012470 AA 17 18 35 AC 5 5 10 CC 0 0 0 0.000 0.342 0.703 012473 CC 0 4 4 CT 2 13 15 TT 20 6 26 0.000 0.445 0.691 012562 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 012674 GG 19 21 40 GT 2 2 4 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.100 012791 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 012933 AA 0 4 4 AG 2 12 14 GG 20 6 26 0.000 0.220 1.010 013256 AA 21 6 27 AT 2 13 15 TT 0 4 4 0.000 0.445 0.783 013500 CC 0 4 4 CT 2 13 15 TT 21 6 27 0.000 0.445 0.783 014107 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 014285 AA 0 4 4 AT 1 13 14 TT 23 6 29 0.000 0.445 1.345 014331 CC 1 4 5 CT 8 13 21 TT 15 6 21 0.000 0.445 0.005 014352 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 014580 CC 15 5 20 CT 7 13 20 TT 1 4 5 0.000 0.747 0.000 014660 CC 1 4 5 CT 7 13 20 TT 14 5 19 0.000 0.747 0.006 014690 GG 14 5 19 GT 7 13 20 TT 1 4 5 0.000 0.747 0.006 014698 AA 1 4 5 AC 7 13 20 CC 14 5 19 0.000 0.747 0.006 014812 GG 20 22 42 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 014835 AA 0 0 0 AG 5 1 6 GG 16 21 37 0.000 0.012 0.242 015221 ++ 15 6 21 +- 8 13 21 -- 1 4 5 0.000 0.445 0.005 015253 CC 2 1 3 CT 9 11 20 TT 13 11 24 0.000 0.741 0.189 015301 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 015712 GG 15 10 25 GT 2 7 9 TT 0 0 0 0.000 1.143 0.791 016004 AA 12 6 18 AC 7 13 20 CC 1 4 5 0.000 0.445 0.024 016206 CC 10 19 29 CT 9 4 13 TT 1 0 1 0.000 0.209 0.106 016233 CC 19 22 41 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.024 016391 AA 12 6 18 AG 7 13 20 GG 1 4 5 0.000 0.445 0.024 016420 AA 19 23 42 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 016512 AA 12 6 18 AT 7 13 20 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.024 016901 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 22 40 0.000 0.000 0.224 017007 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.000 0.000 0.006 017104 AA 1 4 5 AC 8 13 21 CC 15 6 21 0.000 0.445 0.005 017295 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.022 017419 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 017568 CC 17 22 39 CT 5 0 5 TT 1 0 1 0.000 0.000 2.288 017607 GG 12 11 23 GT 10 10 20 TT 1 1 2 0.000 0.468 0.837 017742 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 17 22 39 0.000 0.000 0.006 017821 GG 0 0 0 GT 4 5 9 TT 14 17 31 0.000 0.362 0.643 018135 CC 14 19 33 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.121 021979 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.000 0.000 0.006 022044 AA 1 4 5 AC 6 13 19 CC 15 6 21 0.000 0.445 0.050 022056 AA 15 6 21 AC 6 13 19 CC 1 4 5 0.000 0.445 0.050 022089 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 022352 AA 15 6 21 AG 8 13 21 GG 1 4 5 0.000 0.445 0.005 022455 AA 15 6 21 AG 8 13 21 GG 1 4 5 0.000 0.445 0.005 022626 AA 1 4 5 AG 8 12 20 GG 15 6 21 0.000 0.220 0.005 022647 AA 1 4 5 AG 8 11 19 GG 15 6 21 0.000 0.069 0.050 022693 GG 1 4 5 GT 8 11 19 TT 15 6 21 0.000 0.069 0.050 022707 AA 1 3 4 AG 8 12 20 GG 15 6 21 0.000 0.583 0.061 022759 AA 1 3 4 AG 0 4 4 GG 14 6 20 0.000 1.593 9.282 023642 CC 1 4 5 CT 7 13 20 TT 15 6 21 0.000 0.445 0.005 023665 CC 1 4 5 CT 8 13 21 TT 15 6 21 0.000 0.445 0.005 023715 CC 19 22 41 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.218 023747 AA 15 6 21 AC 8 13 21 CC 1 4 5 0.000 0.445 0.005 023755 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 024037 CC 4 0 4 CT 13 11 24 TT 7 12 19 0.000 2.272 0.883 024579 GG 1 4 5 GT 7 13 20 TT 15 6 21 0.000 0.445 0.005 024697 CC 15 6 21 CT 7 13 20 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 024908 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 15 9 24 0.000 0.000 0.010 026004 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 17 22 39 0.000 0.000 0.006 026054 GG 11 6 17 GT 5 12 17 TT 1 3 4 0.000 0.583 0.007 026297 CC 18 17 35 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.059 0.029 027326 CC 1 3 4 CG 8 11 19 GG 13 6 19 0.000 0.314 0.058 027375 AA 2 1 3 AG 8 10 18 GG 13 10 23 0.000 0.583 0.043 027571 AA 0 4 4 AC 10 11 21 CC 6 5 11 0.000 0.211 1.626 027959 CC 9 5 14 CT 5 12 17 TT 1 3 4 0.000 0.900 0.117 028365 CC 19 4 23 CT 1 7 8 TT 0 2 2 0.000 0.138 1.132 028380 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 19 14 33 0.000 0.071 0.068 028703 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 20 19 39 0.000 0.013 0.006 029036 AA 0 0 0 AT 5 6 11 TT 13 14 27 0.000 0.623 1.088 029139 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 17 19 36 0.000 0.000 0.007 030269 CC 6 9 15 CT 3 9 12 TT 0 1 1 0.000 0.436 0.571 030636 CC 20 21 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 030842 CC 18 18 36 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.000 0.014 0.028 031604 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 031623 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 032114 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 032600 AA 1 4 5 AG 8 13 21 GG 15 6 21 0.000 0.445 0.005 032614 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.000 0.000 0.022 032782 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.022 032939 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.000 0.000 0.005 033388 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 033468 AA 24 20 44 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.112 0.051 033526 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 033758 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 033801 AA 1 4 5 AT 8 13 21 TT 15 6 21 0.000 0.445 0.005 033844 CC 0 0 0 CG 5 1 6 GG 19 22 41 0.000 0.011 0.218 034032 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 034264 CC 2 0 2 CT 9 4 13 TT 13 19 32 0.000 0.209 0.208 034369 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 034467 AA 15 23 38 AG 9 0 9 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.527 034485 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 034548 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.000 0.000 0.005 035143 AA 19 22 41 AG 5 1 6 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.218 035223 AA 13 19 32 AT 9 4 13 TT 2 0 2 0.000 0.209 0.208 035327 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.051 035491 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.051 035510 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 035758 ++ 14 6 20 +- 7 12 19 -- 1 4 5 0.000 0.220 0.023 035767 CC 1 0 1 CG 5 0 5 GG 16 23 39 0.000 0.000 2.288 035937 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 20 23 43 0.000 0.000 0.052 035972 AA 12 11 23 AG 10 11 21 GG 1 1 2 0.000 0.741 1.083 036084 AA 15 6 21 AC 7 13 20 CC 1 4 5 0.000 0.445 0.005 036156 CC 22 20 42 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.095 036249 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 036468 CC 2 0 2 CT 9 4 13 TT 13 19 32 0.000 0.209 0.208 036752 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.051 036842 AA 1 4 5 AG 8 13 21 GG 15 6 21 0.000 0.445 0.005 037749 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.000 0.000 0.022 037757 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 037777 CC 0 4 4 CT 1 13 14 TT 23 6 29 0.000 0.445 1.345 037940 CC 0 4 4 CT 2 13 15 TT 22 6 28 0.000 0.445 0.876 037985 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 038014 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 038015 AA 2 0 2 AG 9 4 13 GG 13 19 32 0.000 0.209 0.208 038036 CC 19 18 37 CT 5 5 10 TT 0 0 0 0.000 0.342 0.666 038258 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 038313 CC 1 4 5 CT 8 13 21 TT 15 6 21 0.000 0.445 0.005 038363 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 038397 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.051 038414 AA 2 0 2 AG 9 4 13 GG 13 19 32 0.000 0.209 0.208 038510 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.005 038613 CC 15 6 21 CT 8 13 21 TT 1 4 5 0.000 0.445 0.005 038665 AA 0 0 0 AC 5 1 6 CC 19 22 41 0.000 0.011 0.218 038877 GG 0 0 0 GT 3 5 8 TT 21 18 39 0.000 0.342 0.407 038906 CC 2 0 2 CT 9 4 13 TT 13 19 32 0.000 0.209 0.208 038916 AA 7 4 11 AG 11 13 24 GG 6 6 12 0.000 0.445 0.022 038969 AA 2 0 2 AG 9 4 13 GG 13 19 32 0.000 0.209 0.208 039065 CC 6 6 12 CT 11 13 24 TT 7 4 11 0.000 0.445 0.022 039225 CC 17 16 33 CT 6 7 13 TT 0 0 0 0.000 0.741 1.246 039402 GG 6 5 11 GT 11 13 24 TT 7 4 11 0.000 0.747 0.087 039478 AA 1 3 4 AG 8 12 20 GG 15 6 21 0.000 0.583 0.061 039504 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 039537 CC 6 5 11 CT 11 13 24 TT 7 4 11 0.000 0.747 0.087 039552 AA 7 4 11 AG 11 12 23 GG 6 5 11 0.000 0.444 0.022 039600 CC 13 18 31 CG 9 4 13 GG 2 0 2 0.000 0.220 0.177 039648 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 21 45 0.000 0.012 0.006 039703 CC 6 5 11 CG 11 13 24 GG 7 4 11 0.000 0.747 0.087 039804 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 22 45 0.000 0.000 0.006 039891 AA 24 21 45 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 039905 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 040125 CC 7 4 11 CT 10 11 21 TT 6 6 12 0.000 0.069 0.089 040204 CC 6 6 12 CT 10 11 21 TT 7 4 11 0.000 0.069 0.089 040273 AA 7 4 11 AG 10 11 21 GG 6 6 12 0.000 0.069 0.089 040421 CC 20 21 41 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.055 040470 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 19 42 0.000 0.053 0.024 040487 AA 21 21 42 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.000 0.000 0.024 040505 AA 18 20 38 AG 5 1 6 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.236 040507 AA 7 4 11 AC 10 11 21 CC 6 6 12 0.000 0.069 0.089 040621 CC 21 21 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.024 040650 AA 22 21 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 040682 GG 1 1 2 GT 10 11 21 TT 12 9 21 0.000 1.068 1.322 040809 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 21 43 0.000 0.000 0.006 040978 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 17 23 40 0.000 0.000 1.527 041025 CC 2 0 2 CT 9 3 12 TT 13 19 32 0.000 0.118 0.390 041120 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 041152 CC 21 22 43 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.052 041191 AA 2 0 2 AT 9 3 12 TT 13 19 32 0.000 0.118 0.390 041223 AA 13 19 32 AG 9 3 12 GG 2 0 2 0.000 0.118 0.390 041510 AA 2 0 2 AG 9 3 12 GG 13 19 32 0.000 0.118 0.390 041526 AA 0 0 0 AC 2 2 4 CC 22 20 42 0.000 0.050 0.095 041742 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 041803 ++ 20 23 43 +- 3 0 3 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.052 041843 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 19 23 42 0.000 0.000 0.006 041907 CC 21 22 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.023 042123 ++ 1 0 1 +- 1 0 1 -- 17 22 39 0.000 0.000 17.537 042209 CC 20 22 42 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 042239 CC 20 22 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 042242 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 20 22 42 0.000 0.000 0.006 042324 ++ 2 0 2 +- 4 3 7 -- 17 20 37 0.000 0.112 3.535 042397 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 21 43 0.000 0.048 0.093 042405 CC 2 0 2 CG 9 4 13 GG 13 19 32 0.000 0.209 0.208 042584 CC 8 0 8 CT 8 12 20 TT 7 11 18 0.000 2.865 0.351 042813 AA 0 1 1 AG 1 11 12 GG 22 11 33 0.000 0.741 0.006 042957 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 042994 CC 16 23 39 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.000 0.000 1.467 043076 CC 21 21 42 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.095 043188 ++ 0 0 0 +- 1 0 1 -- 15 23 38 0.000 0.000 0.007 043208 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 043218 CC 14 23 37 CG 6 0 6 GG 1 0 1 0.000 0.000 1.348 044455 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 044514 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 044617 CC 20 22 42 CT 4 1 5 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.148 044749 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 045273 AA 13 17 30 AG 9 4 13 GG 2 0 2 0.000 0.233 0.147 045294 AA 23 21 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 045299 WARNING: more than 2 alleles: A T C 045379 GG 23 21 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 045443 AA 21 21 42 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.054 045474 AA 21 18 39 AG 3 2 5 GG 0 0 0 0.000 0.055 0.160 047258 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.000 0.000 0.005 047634 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 047648 CC 8 0 8 CT 7 7 14 TT 9 16 25 0.000 0.741 4.651 047680 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 047861 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.051 047915 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 21 43 0.000 0.048 0.093 048647 CC 20 20 40 CT 3 1 4 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.100 048692 CC 12 18 30 CT 7 2 9 TT 1 0 1 0.000 0.055 0.106 048829 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 21 20 41 0.000 0.012 0.024 048884 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 20 21 41 0.000 0.000 0.055 049006 AA 7 0 7 AG 7 6 13 GG 8 15 23 0.000 0.583 3.823 049050 CC 20 21 41 CT 3 1 4 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.097 049852 CC 21 22 43 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.023 050063 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 050275 CC 8 0 8 CT 7 7 14 TT 9 16 25 0.000 0.741 4.651 050404 AA 0 0 0 AG 3 4 7 GG 21 19 40 0.000 0.209 0.304 050428 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 21 43 0.000 0.048 0.093 050993 AA 3 0 3 AT 7 2 9 TT 8 13 21 0.000 0.077 1.649 051178 AA 20 17 37 AG 1 0 1 GG 1 0 1 0.000 0.000 16.647 051332 CC 19 5 24 CT 2 6 8 TT 0 4 4 0.000 0.579 4.592 051369 CC 5 6 11 CT 7 9 16 TT 8 3 11 0.000 0.015 0.947 051383 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 20 18 38 0.000 0.014 0.059 051433 GG 10 16 26 GT 8 2 10 TT 3 0 3 0.000 0.062 1.781 051455 AA 0 0 0 AC 1 1 2 CC 21 16 37 0.000 0.016 0.027 051547 CC 18 6 24 CT 1 9 10 TT 0 4 4 0.000 0.034 2.812 051606 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 17 20 37 0.000 0.050 0.061 051732 GG 0 1 1 GT 0 2 2 TT 15 16 31 0.000 3.698 7.471 051775 CC 12 19 31 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.000 0.013 0.032 052121 ++ 16 19 35 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.007 052122 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 21 20 41 0.000 0.000 0.006 052144 AA 19 19 38 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.007 052349 CC 20 21 41 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.024 052350 AA 2 0 2 AG 9 3 12 GG 9 18 27 0.000 0.124 0.191 052405 AA 1 0 1 AG 9 3 12 GG 10 19 29 0.000 0.118 0.034 052525 CC 10 16 26 CT 9 2 11 TT 1 0 1 0.000 0.062 0.016 052621 CC 9 16 25 CT 7 2 9 TT 3 0 3 0.000 0.062 2.266 052622 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 14 20 34 0.000 0.000 1.170 052914 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 053235 CC 23 18 41 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.014 0.006 053332 AA 18 17 35 AG 5 2 7 GG 0 0 0 0.000 0.059 0.347 053449 CC 19 6 25 CT 1 10 11 TT 0 5 5 0.000 0.043 3.589 053632 AA 14 4 18 AG 6 9 15 GG 1 6 7 0.000 0.034 1.423 053808 AA 4 0 4 AG 10 4 14 GG 8 16 24 0.000 0.247 0.798 053997 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 22 42 0.000 0.000 0.006 054132 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.000 0.000 0.005 054247 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 054398 GG 23 21 44 GT 1 2 3 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.051 056139 CC 22 23 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003094: CCA 004021: a 004642: t 007611: TATA 009577: c 015221: t 035758: agag 041803: agaa 042123: TTTGA 042324: G 043188: CTC 052121: a