Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 001199 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 001277 A 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 001306 T 0.15 0.32 0.23 C 0.85 0.68 0.77 0.26 0.43 0.36 001742 C 0.26 0.50 0.38 T 0.74 0.50 0.62 0.39 0.50 0.47 001985 + 0.15 0.00 0.08 - 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 002739 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003330 G 0.00 0.39 0.18 T 1.00 0.61 0.82 0.00 0.47 0.30 003374 C 0.23 0.52 0.37 T 0.77 0.48 0.63 0.35 0.50 0.47 004207 T 0.37 0.28 0.33 A 0.63 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 004526 G 0.37 0.28 0.33 T 0.63 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 004593 + 0.24 0.47 0.35 - 0.76 0.53 0.65 0.36 0.50 0.45 004697 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004880 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005175 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005419 T 0.25 0.52 0.39 G 0.75 0.48 0.61 0.38 0.50 0.48 005886 C 0.25 0.19 0.22 T 0.75 0.81 0.78 0.38 0.31 0.34 006399 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 006448 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006496 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006506 T 0.27 0.22 0.24 G 0.73 0.78 0.76 0.39 0.34 0.37 006530 - 0.25 0.22 0.23 + 0.75 0.78 0.77 0.38 0.34 0.36 006535 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 006540 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006917 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007186 A 0.15 0.37 0.26 G 0.85 0.63 0.74 0.26 0.47 0.39 007227 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007240 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007660 C 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 007715 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 007872 - 0.14 0.00 0.07 + 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 007898 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007984 T 0.25 0.00 0.12 G 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.22 008029 A 0.23 0.33 0.28 G 0.78 0.68 0.72 0.35 0.44 0.40 008487 T 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 008780 C 0.02 0.20 0.11 T 0.98 0.80 0.89 0.04 0.33 0.20 008848 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008873 T 0.22 0.34 0.28 A 0.78 0.66 0.72 0.34 0.45 0.40 009088 T 0.07 0.29 0.17 G 0.93 0.71 0.83 0.12 0.41 0.28 009099 T 0.07 0.29 0.17 C 0.93 0.71 0.83 0.12 0.41 0.28 010019 C 0.00 0.37 0.18 A 1.00 0.63 0.82 0.00 0.47 0.30 010131 A 0.26 0.28 0.27 G 0.74 0.72 0.73 0.39 0.41 0.40 010794 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 010975 C 0.02 0.20 0.11 T 0.98 0.80 0.89 0.04 0.31 0.19 011109 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011231 T 0.00 0.20 0.10 C 1.00 0.80 0.90 0.00 0.31 0.17 011306 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011434 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 011539 G 0.00 0.20 0.10 A 1.00 0.80 0.90 0.00 0.31 0.17 011837 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012100 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012299 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012336 T 0.07 0.15 0.11 C 0.93 0.85 0.89 0.13 0.26 0.20 013763 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 014110 G 0.24 0.38 0.31 C 0.76 0.62 0.69 0.36 0.47 0.43 014143 C 0.00 0.36 0.17 T 1.00 0.64 0.83 0.00 0.46 0.28 014958 T 0.02 0.09 0.06 A 0.98 0.91 0.94 0.04 0.16 0.10 015060 G 0.11 0.00 0.06 A 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 015176 A 0.30 0.15 0.22 G 0.70 0.85 0.78 0.42 0.26 0.35 015370 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 015848 A 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 016394 - 0.03 0.02 0.02 + 0.97 0.98 0.98 0.05 0.04 0.05 016744 C 0.62 0.00 0.34 T 0.38 1.00 0.66 0.47 0.00 0.45 017020 A 0.07 0.62 0.31 T 0.93 0.38 0.69 0.13 0.47 0.43 017693 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 017866 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 017898 - 0.07 0.00 0.03 + 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 018189 G 0.50 0.02 0.26 A 0.50 0.98 0.74 0.50 0.04 0.39 018748 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 018828 A 0.07 0.45 0.26 G 0.93 0.55 0.74 0.12 0.50 0.38 018976 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018990 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001985: t 004593: cac 006530: at 007872: gacaaact 016394: ta 017898: atc