Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000100 G 0.37 0.43 0.40 A 0.63 0.57 0.60 0.47 0.49 0.48 000242 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 000297 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000350 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000364 A 0.31 0.24 0.28 G 0.69 0.76 0.72 0.43 0.36 0.40 000537 A 0.00 0.39 0.19 C 1.00 0.61 0.81 0.00 0.48 0.31 000880 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001215 T 0.23 0.39 0.30 C 0.77 0.61 0.70 0.35 0.47 0.42 001616 G 0.00 0.36 0.17 C 1.00 0.64 0.83 0.00 0.46 0.29 001637 C 0.12 0.00 0.07 T 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 002432 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002771 C 0.35 0.20 0.28 T 0.65 0.80 0.72 0.46 0.33 0.41 002828 - 0.08 0.39 0.23 + 0.92 0.61 0.77 0.15 0.48 0.36 003640 + 0.29 0.50 0.34 - 0.71 0.50 0.66 0.41 0.50 0.45 003645 T 0.29 0.38 0.31 A 0.71 0.62 0.69 0.41 0.47 0.43 004076 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004100 C 0.48 0.46 0.47 T 0.52 0.54 0.53 0.50 0.50 0.50 004193 T 0.00 0.39 0.19 A 1.00 0.61 0.81 0.00 0.48 0.31 004367 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004732 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004742 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005043 G 0.15 0.32 0.23 C 0.85 0.68 0.77 0.25 0.43 0.35 005045 C 0.15 0.32 0.23 A 0.85 0.68 0.77 0.25 0.43 0.35 005124 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005217 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005437 T 0.38 0.00 0.19 C 0.62 1.00 0.81 0.47 0.00 0.31 005505 G 0.17 0.46 0.31 A 0.83 0.54 0.69 0.28 0.50 0.43 005558 C 0.10 0.11 0.11 T 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 005616 T 0.17 0.45 0.30 A 0.83 0.55 0.70 0.28 0.50 0.42 005662 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005669 T 0.15 0.45 0.30 C 0.85 0.55 0.70 0.26 0.50 0.42 005822 + 0.17 0.46 0.31 - 0.83 0.54 0.69 0.28 0.50 0.43 005858 T 0.17 0.46 0.31 C 0.83 0.54 0.69 0.28 0.50 0.43 005868 C 0.17 0.46 0.31 T 0.83 0.54 0.69 0.28 0.50 0.43 006735 G 0.17 0.45 0.31 A 0.83 0.55 0.69 0.29 0.50 0.43 006805 G 0.17 0.45 0.31 C 0.83 0.55 0.69 0.29 0.50 0.43 007110 C 0.14 0.45 0.30 G 0.86 0.55 0.70 0.24 0.50 0.42 007256 - 0.16 0.46 0.31 + 0.84 0.54 0.69 0.27 0.50 0.43 007280 G 0.18 0.46 0.32 A 0.82 0.54 0.68 0.30 0.50 0.44 007320 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 007363 T 0.14 0.46 0.30 C 0.86 0.54 0.70 0.24 0.50 0.42 007439 A 0.14 0.46 0.30 C 0.86 0.54 0.70 0.24 0.50 0.42 007487 C 0.14 0.46 0.30 T 0.86 0.54 0.70 0.24 0.50 0.42 007488 C 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 007524 A 0.14 0.46 0.30 G 0.86 0.54 0.70 0.24 0.50 0.42 007544 G 0.39 0.54 0.47 A 0.61 0.46 0.53 0.47 0.50 0.50 007555 A 0.41 0.00 0.20 G 0.59 1.00 0.80 0.48 0.00 0.32 007556 G 0.14 0.46 0.30 T 0.86 0.54 0.70 0.24 0.50 0.42 007719 T 0.12 0.47 0.31 C 0.88 0.53 0.69 0.21 0.50 0.43 007830 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008260 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008581 T 0.30 0.50 0.40 C 0.70 0.50 0.60 0.42 0.50 0.48 008635 A 0.30 0.48 0.39 G 0.70 0.52 0.61 0.42 0.50 0.47 008685 C 0.29 0.48 0.39 A 0.71 0.52 0.61 0.41 0.50 0.47 008760 * 008777 A 0.31 0.50 0.40 G 0.69 0.50 0.60 0.43 0.50 0.48 008837 T 0.31 0.48 0.39 C 0.69 0.52 0.61 0.43 0.50 0.48 008919 C 0.31 0.48 0.39 G 0.69 0.52 0.61 0.43 0.50 0.48 008940 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009222 C 0.00 0.38 0.17 T 1.00 0.62 0.83 0.00 0.47 0.28 009305 T 0.31 0.45 0.38 C 0.69 0.55 0.62 0.43 0.50 0.47 009441 A 0.35 0.09 0.23 C 0.65 0.91 0.77 0.46 0.17 0.35 009476 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009709 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009758 T 0.31 0.46 0.38 C 0.69 0.54 0.62 0.43 0.50 0.47 009992 T 0.35 0.09 0.23 C 0.65 0.91 0.77 0.46 0.17 0.35 009993 G 0.35 0.09 0.23 A 0.65 0.91 0.77 0.46 0.17 0.35 010240 T 0.35 0.12 0.24 G 0.65 0.88 0.76 0.46 0.21 0.37 010261 C 0.04 0.05 0.04 T 0.96 0.95 0.96 0.08 0.09 0.08 010273 T 0.35 0.12 0.24 C 0.65 0.88 0.76 0.46 0.21 0.37 010346 A 0.35 0.12 0.24 G 0.65 0.88 0.76 0.46 0.21 0.37 010354 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 010553 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.22 010664 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011256 G 0.08 0.07 0.08 T 0.92 0.93 0.92 0.15 0.13 0.14 011470 T 0.35 0.11 0.24 C 0.65 0.89 0.76 0.46 0.20 0.36 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002828: t 003640: a 005822: ct 007256: AT Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 008760 C 0.04 0.00 0.02 A 0.31 0.48 0.39 T 0.65 0.52 0.59