Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000248 T 0.35 0.09 0.23 G 0.65 0.91 0.77 0.46 0.17 0.35 000996 A 0.31 0.47 0.38 T 0.69 0.53 0.62 0.43 0.50 0.47 001241 T 0.00 0.40 0.19 C 1.00 0.60 0.81 0.00 0.48 0.31 001283 C 0.35 0.10 0.24 T 0.65 0.90 0.76 0.46 0.18 0.36 001303 A 0.35 0.10 0.24 C 0.65 0.90 0.76 0.46 0.18 0.36 002122 C 0.35 0.43 0.39 T 0.65 0.57 0.61 0.45 0.49 0.48 002228 G 0.39 0.11 0.25 T 0.61 0.89 0.75 0.48 0.19 0.38 002246 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002337 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002379 G 0.09 0.07 0.08 C 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 002563 G 0.14 0.05 0.09 A 0.86 0.95 0.91 0.24 0.10 0.17 002569 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 002631 A 0.53 0.42 0.47 G 0.47 0.58 0.53 0.50 0.49 0.50 002660 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 002915 C 0.03 0.34 0.19 T 0.97 0.66 0.81 0.05 0.45 0.31 002953 C 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 002954 T 0.03 0.34 0.19 C 0.97 0.66 0.81 0.05 0.45 0.31 002955 G 0.03 0.34 0.19 A 0.97 0.66 0.81 0.05 0.45 0.31 003037 + 0.00 0.23 0.11 - 1.00 0.77 0.89 0.00 0.36 0.19 003093 A 0.03 0.00 0.02 G 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 003215 G 0.03 0.00 0.02 A 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 003278 C 0.03 0.00 0.02 A 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 003284 C 0.03 0.00 0.02 T 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 003552 G 0.00 0.33 0.16 A 1.00 0.68 0.84 0.00 0.44 0.27 003659 C 0.11 0.11 0.11 G 0.89 0.89 0.89 0.20 0.20 0.20 003682 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003686 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003954 C 0.11 0.00 0.06 A 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 004000 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004001 A 0.11 0.09 0.10 G 0.89 0.91 0.90 0.20 0.17 0.18 004015 T 0.29 0.00 0.14 C 0.71 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 004255 T 0.05 0.43 0.24 C 0.95 0.57 0.76 0.09 0.49 0.36 004581 A 0.13 0.11 0.12 G 0.87 0.89 0.88 0.23 0.19 0.21 004590 T 0.09 0.07 0.08 C 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 004606 C 0.41 0.54 0.48 A 0.59 0.46 0.52 0.48 0.50 0.50 004649 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004734 G 0.22 0.46 0.34 A 0.78 0.54 0.66 0.34 0.50 0.45 004758 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004870 A 0.09 0.07 0.08 T 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 004890 A 0.37 0.00 0.18 G 0.63 1.00 0.82 0.47 0.00 0.30 005273 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005392 A 0.00 0.31 0.14 T 1.00 0.69 0.86 0.00 0.43 0.25 005406 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 005438 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 005678 C 0.15 0.12 0.13 T 0.85 0.88 0.87 0.25 0.21 0.23 005865 G 0.16 0.47 0.30 A 0.84 0.53 0.70 0.27 0.50 0.42 005951 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 005996 G 0.21 0.05 0.14 A 0.79 0.95 0.86 0.33 0.10 0.24 006025 T 0.07 0.43 0.24 G 0.93 0.57 0.76 0.12 0.49 0.36 006074 T 0.12 0.00 0.07 G 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 006137 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006213 T 0.28 0.00 0.14 C 0.72 1.00 0.86 0.41 0.00 0.25 006329 T 0.35 0.11 0.24 C 0.65 0.89 0.76 0.46 0.20 0.36 006357 T 0.23 0.45 0.34 G 0.77 0.55 0.66 0.35 0.50 0.45 006368 T 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 006844 A 0.26 0.63 0.45 G 0.74 0.37 0.55 0.39 0.47 0.49 007082 C 0.61 0.11 0.36 T 0.39 0.89 0.64 0.48 0.19 0.46 007096 T 0.58 0.11 0.35 C 0.42 0.89 0.65 0.49 0.19 0.46 007115 T 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 007744 A 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 007781 G 0.11 0.00 0.06 A 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 007799 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008228 T 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 008280 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008289 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008306 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008468 T 0.44 0.41 0.43 C 0.56 0.59 0.57 0.49 0.48 0.49 008489 C 0.27 0.33 0.30 A 0.73 0.67 0.70 0.39 0.44 0.42 008637 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008684 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009137 T 0.10 0.26 0.18 C 0.90 0.74 0.82 0.19 0.39 0.29 009184 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009278 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009396 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009423 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009475 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009498 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009503 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009611 C 0.06 0.02 0.04 T 0.94 0.98 0.96 0.12 0.05 0.08 009995 C 0.19 0.04 0.11 T 0.81 0.96 0.89 0.31 0.08 0.20 010186 C 0.22 0.07 0.14 T 0.78 0.93 0.86 0.34 0.12 0.24 010326 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010590 G 0.44 0.41 0.43 C 0.56 0.59 0.57 0.49 0.48 0.49 010687 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 010895 T 0.17 0.09 0.13 C 0.83 0.91 0.87 0.28 0.17 0.22 010976 A 0.45 0.41 0.43 C 0.55 0.59 0.57 0.50 0.48 0.49 010991 G 0.45 0.41 0.43 A 0.55 0.59 0.57 0.50 0.48 0.49 011041 T 0.45 0.41 0.43 C 0.55 0.59 0.57 0.50 0.48 0.49 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003037: a