Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000198 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 20 43 0.011 0.000 0.006 000288 AA 0 1 1 AG 6 9 15 GG 17 10 27 0.517 0.330 0.428 000518 CC 18 22 40 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.220 0.000 0.100 000559 -- 23 22 45 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 000628 CC 18 11 29 CT 6 10 16 TT 0 0 0 0.490 2.051 2.104 000673 CC 1 2 3 CT 7 11 18 TT 15 9 24 0.025 0.279 0.023 001723 AA 1 0 1 AG 1 0 1 GG 22 22 44 9.967 0.000 19.761 001807 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 002103 CC 12 18 30 CT 9 0 9 TT 0 0 0 1.562 0.000 0.664 002143 CC 19 19 38 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.105 002264 CC 4 4 8 CT 13 8 21 TT 6 9 15 0.445 0.777 0.019 002420 AA 4 5 9 AG 13 9 22 GG 6 9 15 0.445 0.857 0.033 002913 CC 1 2 3 CT 6 11 17 TT 15 10 25 0.153 0.179 0.002 003272 CC 8 9 17 CT 12 8 20 TT 3 2 5 0.209 0.012 0.058 003543 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 003631 AA 8 10 18 AG 12 11 23 GG 4 2 6 0.020 0.179 0.104 003664 CC 4 2 6 CT 12 11 23 TT 8 9 17 0.020 0.279 0.169 003755 -- 1 0 1 +- 1 0 1 ++ 22 20 42 9.967 0.000 18.871 003759 AA 1 2 3 AG 4 11 15 GG 19 10 29 1.361 0.179 0.303 004091 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 004521 CC 18 12 30 CT 5 10 15 TT 0 1 1 0.342 0.374 0.312 004825 CC 22 10 32 CT 1 10 11 TT 0 2 2 0.011 0.050 0.648 004876 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 005138 CC 9 10 19 CT 10 11 21 TT 4 1 5 0.175 0.889 0.050 006173 CC 15 10 25 CT 8 11 19 TT 1 2 3 0.003 0.179 0.059 006279 AA 0 1 1 AT 5 10 15 TT 18 12 30 0.342 0.374 0.312 006291 AA 0 1 1 AG 4 10 14 GG 19 12 31 0.209 0.374 0.161 006716 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 007685 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 23 43 0.012 0.000 0.006 007893 AA 17 11 28 AC 5 10 15 CC 0 1 1 0.362 0.468 0.386 007921 AA 4 2 6 AG 10 10 20 GG 8 10 18 0.079 0.050 0.014 007954 CC 19 22 41 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.055 008014 CC 0 1 1 CT 5 10 15 TT 18 11 29 0.342 0.468 0.347 008126 CC 6 9 15 CT 13 8 21 TT 4 5 9 0.445 1.352 0.111 008225 AA 1 0 1 AG 1 0 1 GG 22 22 44 9.967 0.000 19.761 008389 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 008852 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 21 21 42 0.000 0.012 0.006 009289 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 009316 CC 0 1 1 CT 5 10 15 TT 19 12 31 0.324 0.374 0.280 009319 CC 0 1 1 CT 6 10 16 TT 18 12 30 0.490 0.374 0.465 009432 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 009545 AA 1 1 2 AG 7 11 18 GG 16 10 26 0.044 0.889 0.261 009548 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 009593 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 21 45 0.000 0.012 0.006 009608 CC 18 11 29 CT 6 10 16 TT 0 1 1 0.490 0.468 0.508 009769 -- 18 11 29 +- 6 10 16 ++ 0 1 1 0.490 0.468 0.508 009903 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 24 20 44 0.000 0.050 0.023 010519 CC 23 19 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 010520 AA 0 1 1 AG 5 7 12 GG 19 11 30 0.324 0.007 0.024 010747 AA 8 12 20 AC 15 7 22 CC 1 3 4 3.219 1.223 0.358 010760 CC 1 2 3 CT 3 9 12 TT 20 10 30 2.617 0.000 1.250 010876 GG 16 10 26 GT 7 11 18 TT 1 2 3 0.044 0.179 0.002 010948 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 011271 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 17 40 0.011 0.000 0.006 011323 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 011448 CC 18 9 27 CT 5 10 15 TT 0 1 1 0.342 0.726 0.428 011579 -- 22 18 40 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 012091 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 012662 AA 1 2 3 AG 7 10 17 GG 16 10 26 0.044 0.050 0.010 012687 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 012705 AA 18 12 30 AC 6 9 15 CC 0 1 1 0.490 0.182 0.312 013270 CC 0 1 1 CG 2 4 6 GG 16 17 33 0.062 1.144 1.111 014416 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 17 14 31 18.000 0.000 32.000 014761 CC 4 5 9 CT 15 8 23 TT 4 8 12 2.130 1.037 0.111 014767 CC 0 0 0 CT 2 3 5 TT 21 18 39 0.048 0.124 0.160 014837 -- 0 1 1 +- 5 7 12 ++ 16 11 27 0.383 0.007 0.061 015216 AA 17 12 29 AC 6 9 15 CC 0 1 1 0.517 0.182 0.347 015454 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 015865 AA 8 10 18 AG 13 11 24 GG 3 2 5 0.421 0.179 0.527 016018 CC 1 2 3 CT 6 10 16 TT 16 9 25 0.195 0.107 0.040 016146 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 016376 AA 0 0 0 AT 10 0 10 TT 12 15 27 1.903 0.000 0.903 016386 -- 0 1 1 +- 5 7 12 ++ 14 3 17 0.436 1.100 0.418 016591 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 19 23 42 0.118 0.000 0.054 016616 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 23 45 0.011 0.000 0.006 016814 CC 9 10 19 CT 12 11 23 TT 3 2 5 0.107 0.179 0.258 017012 AA 9 10 19 AG 12 9 21 GG 3 2 5 0.107 0.000 0.050 017081 AA 1 2 3 AG 2 7 9 GG 2 7 9 0.139 0.015 0.093 017393 AA 0 2 2 AG 1 10 11 GG 21 8 29 0.012 0.196 0.483 018006 AA 1 1 2 AG 7 9 16 GG 15 10 25 0.025 0.330 0.077 018268 CC 3 1 4 CT 11 10 21 TT 10 10 20 0.000 0.583 0.211 018311 AA 24 20 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000559: C 003755: g 009769: GAT 011271: c 011579: C 014837: C 016386: TTCA 016616: tagt