Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000198 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000288 A 0.13 0.28 0.20 G 0.87 0.72 0.80 0.23 0.40 0.32 000518 G 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 000559 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000628 T 0.12 0.24 0.18 C 0.88 0.76 0.82 0.22 0.36 0.29 000673 C 0.20 0.34 0.27 T 0.80 0.66 0.73 0.31 0.45 0.39 001723 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001807 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002103 T 0.21 0.00 0.12 C 0.79 1.00 0.88 0.34 0.00 0.20 002143 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 002264 C 0.46 0.38 0.42 T 0.54 0.62 0.58 0.50 0.47 0.49 002420 A 0.46 0.41 0.43 G 0.54 0.59 0.57 0.50 0.48 0.49 002913 C 0.18 0.33 0.26 T 0.82 0.67 0.74 0.30 0.44 0.38 003272 T 0.39 0.32 0.36 C 0.61 0.68 0.64 0.48 0.43 0.46 003543 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003631 G 0.42 0.33 0.37 A 0.58 0.67 0.63 0.49 0.44 0.47 003664 C 0.42 0.34 0.38 T 0.58 0.66 0.62 0.49 0.45 0.47 003755 - 0.06 0.00 0.03 + 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 003759 A 0.12 0.33 0.22 G 0.88 0.67 0.78 0.22 0.44 0.35 004091 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004521 T 0.11 0.26 0.18 C 0.89 0.74 0.82 0.19 0.39 0.30 004825 T 0.02 0.32 0.17 C 0.98 0.68 0.83 0.04 0.43 0.28 004876 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005138 T 0.39 0.30 0.34 C 0.61 0.70 0.66 0.48 0.42 0.45 006173 T 0.21 0.33 0.27 C 0.79 0.67 0.73 0.33 0.44 0.39 006279 A 0.11 0.26 0.18 T 0.89 0.74 0.82 0.19 0.39 0.30 006291 A 0.09 0.26 0.17 G 0.91 0.74 0.83 0.16 0.39 0.29 006716 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 007685 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007893 C 0.11 0.27 0.19 A 0.89 0.73 0.81 0.20 0.40 0.31 007921 A 0.41 0.32 0.36 G 0.59 0.68 0.64 0.48 0.43 0.46 007954 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 008014 C 0.11 0.27 0.19 T 0.89 0.73 0.81 0.19 0.40 0.31 008126 T 0.46 0.41 0.43 C 0.54 0.59 0.57 0.50 0.48 0.49 008225 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008389 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008852 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009289 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009316 C 0.10 0.26 0.18 T 0.90 0.74 0.82 0.19 0.39 0.30 009319 C 0.12 0.26 0.19 T 0.88 0.74 0.81 0.22 0.39 0.31 009432 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009545 A 0.19 0.30 0.24 G 0.81 0.70 0.76 0.30 0.42 0.36 009548 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009593 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009608 T 0.12 0.27 0.20 C 0.88 0.73 0.80 0.22 0.40 0.31 009769 + 0.12 0.27 0.20 - 0.88 0.73 0.80 0.22 0.40 0.31 009903 C 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 010519 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010520 A 0.10 0.24 0.16 G 0.90 0.76 0.84 0.19 0.36 0.27 010747 C 0.35 0.30 0.33 A 0.65 0.70 0.67 0.46 0.42 0.44 010760 C 0.10 0.31 0.20 T 0.90 0.69 0.80 0.19 0.43 0.32 010876 T 0.19 0.33 0.26 G 0.81 0.67 0.74 0.30 0.44 0.38 010948 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011271 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011323 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011448 T 0.11 0.30 0.20 C 0.89 0.70 0.80 0.19 0.42 0.32 011579 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012091 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012662 A 0.19 0.32 0.25 G 0.81 0.68 0.75 0.30 0.43 0.38 012687 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012705 C 0.12 0.25 0.18 A 0.88 0.75 0.82 0.22 0.38 0.30 013270 C 0.06 0.14 0.10 G 0.94 0.86 0.90 0.10 0.24 0.18 014416 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.06 014761 C 0.50 0.43 0.47 T 0.50 0.57 0.53 0.50 0.49 0.50 014767 C 0.04 0.07 0.06 T 0.96 0.93 0.94 0.08 0.13 0.11 014837 - 0.12 0.24 0.17 + 0.88 0.76 0.82 0.21 0.36 0.29 015216 C 0.13 0.25 0.19 A 0.87 0.75 0.81 0.23 0.38 0.31 015454 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015865 G 0.40 0.33 0.36 A 0.60 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 016018 C 0.17 0.33 0.25 T 0.83 0.67 0.75 0.29 0.44 0.38 016146 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016376 A 0.23 0.00 0.14 T 0.77 1.00 0.86 0.35 0.00 0.23 016386 - 0.13 0.41 0.23 + 0.87 0.59 0.77 0.23 0.48 0.36 016591 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 016616 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016814 T 0.38 0.33 0.35 C 0.62 0.67 0.65 0.47 0.44 0.46 017012 G 0.38 0.31 0.34 A 0.62 0.69 0.66 0.47 0.43 0.45 017081 A 0.40 0.34 0.36 G 0.60 0.66 0.64 0.48 0.45 0.46 017393 A 0.02 0.35 0.18 G 0.98 0.65 0.82 0.04 0.45 0.29 018006 A 0.20 0.28 0.23 G 0.80 0.72 0.77 0.31 0.40 0.36 018268 C 0.35 0.29 0.32 T 0.65 0.71 0.68 0.46 0.41 0.44 018311 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000559: C 003755: g 009769: GAT 011271: c 011579: C 014837: C 016386: TTCA 016616: tagt