Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000357 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000423 T 0.00 0.17 0.09 C 1.00 0.83 0.91 0.00 0.29 0.16 000424 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 000521 T 0.41 0.41 0.41 C 0.59 0.59 0.59 0.48 0.48 0.48 000702 C 0.00 0.11 0.06 T 1.00 0.89 0.94 0.00 0.19 0.10 000723 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000808 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 000810 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000980 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 001007 - 0.03 0.05 0.04 + 0.97 0.95 0.96 0.05 0.10 0.08 001386 C 0.02 0.24 0.13 G 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 001544 C 0.17 0.18 0.17 A 0.83 0.82 0.83 0.28 0.30 0.29 001899 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001985 A 0.04 0.23 0.13 C 0.96 0.78 0.87 0.08 0.35 0.22 002090 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002215 A 0.20 0.30 0.24 T 0.80 0.70 0.76 0.31 0.42 0.37 002408 C 0.07 0.00 0.04 T 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 003017 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003179 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003411 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003453 C 0.31 0.26 0.29 T 0.69 0.74 0.71 0.43 0.39 0.41 003557 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003906 A 0.19 0.21 0.20 G 0.81 0.79 0.80 0.31 0.33 0.32 003959 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 004106 G 0.17 0.05 0.11 C 0.83 0.95 0.89 0.28 0.10 0.20 004288 G 0.17 0.05 0.12 C 0.83 0.95 0.88 0.29 0.10 0.21 004663 - 0.13 0.21 0.17 + 0.87 0.79 0.83 0.23 0.33 0.28 004954 T 0.20 0.00 0.11 C 0.80 1.00 0.89 0.33 0.00 0.20 005122 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005233 C 0.17 0.07 0.12 G 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 005723 T 0.15 0.07 0.11 C 0.85 0.93 0.89 0.25 0.13 0.20 006097 A 0.15 0.09 0.12 G 0.85 0.91 0.88 0.25 0.17 0.21 006791 A 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 006842 T 0.17 0.00 0.09 C 0.82 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 007260 G 0.33 0.24 0.28 A 0.68 0.76 0.72 0.44 0.36 0.40 007435 + 0.17 0.07 0.12 - 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.22 007725 A 0.17 0.23 0.20 G 0.83 0.77 0.80 0.29 0.35 0.32 008583 C 0.17 0.26 0.22 T 0.83 0.74 0.78 0.28 0.39 0.34 009173 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009264 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009323 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009496 T 0.17 0.24 0.21 G 0.83 0.76 0.79 0.29 0.36 0.33 010860 T 0.10 0.20 0.15 C 0.90 0.80 0.85 0.19 0.31 0.25 011012 T 0.15 0.05 0.10 C 0.85 0.95 0.90 0.25 0.09 0.18 011022 C 0.31 0.24 0.28 T 0.69 0.76 0.72 0.43 0.36 0.40 011050 T 0.48 0.50 0.49 G 0.52 0.50 0.51 0.50 0.50 0.50 011069 - 0.15 0.03 0.09 + 0.85 0.97 0.91 0.25 0.05 0.17 011107 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 011359 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011436 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011527 C 0.17 0.18 0.17 T 0.83 0.82 0.83 0.28 0.30 0.29 011859 G 0.22 0.07 0.15 A 0.78 0.93 0.85 0.34 0.14 0.26 012252 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012570 T 0.21 0.07 0.14 C 0.79 0.93 0.86 0.33 0.13 0.24 012685 A 0.19 0.07 0.13 C 0.81 0.93 0.87 0.30 0.13 0.23 012698 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012729 G 0.19 0.07 0.13 T 0.81 0.93 0.87 0.30 0.13 0.23 012876 A 0.19 0.07 0.13 G 0.81 0.93 0.87 0.30 0.13 0.23 013053 C 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 013400 A 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 013507 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013754 A 0.18 0.07 0.12 C 0.82 0.93 0.88 0.30 0.12 0.21 013815 G 0.22 0.07 0.14 C 0.78 0.93 0.86 0.34 0.12 0.24 013903 G 0.20 0.07 0.13 A 0.80 0.93 0.87 0.31 0.12 0.23 014089 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 014251 C 0.20 0.07 0.13 G 0.80 0.93 0.87 0.31 0.12 0.23 014266 T 0.15 0.07 0.11 C 0.85 0.93 0.89 0.26 0.12 0.19 014480 T 0.16 0.08 0.12 C 0.84 0.92 0.88 0.27 0.15 0.21 014515 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 014574 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014682 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014911 G 0.02 0.07 0.05 T 0.98 0.93 0.95 0.05 0.14 0.09 014965 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014970 T 0.02 0.23 0.12 A 0.98 0.78 0.88 0.05 0.35 0.21 014985 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 015004 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015033 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015223 T 0.00 0.07 0.04 C 1.00 0.93 0.96 0.00 0.14 0.07 015417 T 0.15 0.22 0.18 G 0.85 0.78 0.82 0.26 0.35 0.30 015800 T 0.24 0.24 0.24 G 0.76 0.76 0.76 0.36 0.36 0.36 016205 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016242 C 0.25 0.41 0.33 T 0.75 0.59 0.67 0.38 0.48 0.44 016468 T 0.07 0.17 0.12 C 0.93 0.83 0.88 0.14 0.28 0.21 016607 A 0.04 0.19 0.11 G 0.96 0.81 0.89 0.08 0.31 0.20 017859 T 0.06 0.20 0.13 C 0.94 0.80 0.87 0.12 0.31 0.22 018169 G 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 018400 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018564 C 0.21 0.45 0.31 T 0.79 0.55 0.69 0.33 0.49 0.43 018591 G 0.19 0.05 0.13 A 0.81 0.95 0.87 0.30 0.10 0.22 018753 T 0.20 0.25 0.22 A 0.80 0.75 0.78 0.31 0.38 0.35 018803 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018848 T 0.43 0.52 0.48 C 0.57 0.48 0.52 0.49 0.50 0.50 018849 T 0.43 0.52 0.48 C 0.57 0.48 0.52 0.49 0.50 0.50 018985 G 0.20 0.00 0.10 A 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 019200 G 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 019331 T 0.46 0.52 0.49 C 0.54 0.48 0.51 0.50 0.50 0.50 019458 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019676 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019938 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 020001 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 020450 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 020640 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020804 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000723: A 001007: A 004663: a 007435: GT 011069: C 013507: a 019676: a