Site      Allele1   AD-pop    ED-pop    Total-pop Allele2   AD-pop    ED-pop    Total-pop AD-hz     ED-hz     Total-hz  
000278    A         0.25      0.18      0.22      G         0.75      0.82      0.78      0.38      0.30      0.34      
000459    A         0.04      0.00      0.02      G         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
000967    T         0.04      0.00      0.02      G         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.05      
000968    T         0.04      0.00      0.02      C         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.05      
001057    T         0.02      0.10      0.06      C         0.98      0.90      0.94      0.04      0.18      0.11      
001942    A         0.03      0.00      0.01      G         0.97      1.00      0.99      0.05      0.00      0.03      
002054    A         0.05      0.00      0.03      T         0.95      1.00      0.97      0.10      0.00      0.05      
002090    G         0.18      0.56      0.36      T         0.82      0.44      0.64      0.30      0.49      0.46      
003384    T         0.31      0.25      0.28      C         0.69      0.75      0.72      0.42      0.38      0.40      
003682    T         0.16      0.53      0.33      G         0.84      0.47      0.68      0.27      0.50      0.44      
003981    C         0.05      0.00      0.03      T         0.95      1.00      0.97      0.09      0.00      0.05      
004106    -         0.00      0.11      0.05      +         1.00      0.89      0.95      0.00      0.20      0.10      
004427    A         0.02      0.10      0.06      G         0.98      0.90      0.94      0.04      0.17      0.11      
004676    C         0.12      0.00      0.06      A         0.88      1.00      0.94      0.22      0.00      0.12      
004715    A         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
005338    G         0.12      0.00      0.06      A         0.88      1.00      0.94      0.22      0.00      0.12      
005343    G         0.17      0.00      0.09      A         0.83      1.00      0.91      0.28      0.00      0.16      
005611    T         0.26      0.09      0.17      C         0.74      0.91      0.83      0.39      0.16      0.29      
005674    C         0.22      0.00      0.11      G         0.78      1.00      0.89      0.34      0.00      0.19      
006022    G         0.04      0.00      0.02      C         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
006369    A         0.00      0.09      0.05      T         1.00      0.91      0.95      0.00      0.17      0.09      
007361    T         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
007400    T         0.02      0.10      0.06      G         0.98      0.90      0.94      0.04      0.18      0.11      
007510    C         0.02      0.00      0.01      T         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
008813    T         0.00      0.02      0.01      C         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
008901    -         0.07      0.02      0.05      +         0.93      0.98      0.95      0.13      0.05      0.09      
009134    -         0.02      0.11      0.06      +         0.98      0.89      0.94      0.04      0.19      0.12      
009639    T         0.04      0.00      0.02      C         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
009718    -         0.06      0.02      0.04      +         0.94      0.98      0.96      0.12      0.04      0.08      
009955    A         0.02      0.11      0.07      G         0.98      0.89      0.93      0.04      0.19      0.12      
010009    C         0.21      0.00      0.11      T         0.79      1.00      0.89      0.33      0.00      0.19      
010392    G         0.04      0.00      0.02      A         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
010411    A         0.02      0.00      0.01      G         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
010770    G         0.03      0.00      0.01      A         0.97      1.00      0.99      0.05      0.00      0.03      

Note:

AD: African_Descent
ED: European_Descent
Total: All_population
pop : population

Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as:

+ : insertion allele
- : deletion allele

The + (inserted) allele for each site is listed below:

004106: a
008901: aga
009134: tattagtactaatactcttccagggtattag
009718: A