Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 001145 AA 7 0 7 AG 13 10 23 GG 4 10 14 0.243 2.222 0.232 002844 CC 21 22 43 CG 0 0 0 GG 1 0 1 22.000 0.000 44.000 002922 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 003108 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 003140 GG 1 6 7 GT 7 11 18 TT 14 4 18 0.011 0.069 0.467 003151 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 003219 AA 10 19 29 AT 11 2 13 TT 0 0 0 2.644 0.053 1.408 003377 CC 20 22 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 003620 AA 1 0 1 AG 1 7 8 GG 20 15 35 9.075 0.787 0.418 004277 AA 9 21 30 AG 12 2 14 GG 0 0 0 3.360 0.048 1.575 004460 GG 2 0 2 GT 5 9 14 TT 13 14 27 1.604 1.361 0.011 004906 -- 0 6 6 +- 6 12 18 ++ 15 5 20 0.583 0.048 0.354 004918 CC 18 23 41 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.124 0.000 0.055 005850 CC 18 21 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 005984 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 15 20 35 0.066 0.000 0.029 006358 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 18 23 41 0.220 0.000 0.097 006474 AA 19 18 37 AG 4 5 9 GG 0 0 0 0.209 0.342 0.541 006503 CC 19 23 42 CT 3 0 3 TT 1 0 1 2.457 0.000 6.146 006582 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 23 42 0.209 0.000 0.095 006590 AA 3 1 4 AG 10 7 17 GG 10 15 25 0.040 0.025 0.202 006636 -- 22 23 45 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 006731 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 006775 GG 22 23 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 006792 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 20 23 43 0.112 0.000 0.052 006831 GG 1 9 10 GT 7 11 18 TT 15 3 18 0.025 0.016 1.713 006906 AA 6 0 6 AG 7 8 15 GG 10 15 25 3.188 1.019 2.100 006914 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 006929 CC 23 20 43 CT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.112 0.052 007138 CC 20 16 36 CT 2 4 6 TT 0 2 2 0.050 3.327 4.593 007171 -- 20 22 42 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.050 0.000 0.024 007273 AA 1 0 1 AG 5 4 9 GG 14 18 32 0.360 0.220 0.144 007499 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 007601 AA 20 17 37 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.012 0.000 0.007 007667 * 007738 -- 0 2 2 +- 2 4 6 ++ 21 14 35 0.048 2.812 4.432 008071 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 008306 AA 16 3 19 AG 7 11 18 GG 1 9 10 0.044 0.016 1.973 008402 AA 8 12 20 AG 11 8 19 GG 5 3 8 0.114 0.733 0.858 008727 CC 16 23 39 CG 6 0 6 GG 1 0 1 0.195 0.000 1.467 008738 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 009047 CC 5 3 8 CG 7 7 14 GG 11 12 23 2.767 1.223 4.050 009065 CC 23 20 43 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 009066 AA 3 6 9 AG 9 11 20 GG 11 5 16 0.277 0.000 0.357 009073 CC 23 21 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 009123 AA 22 22 44 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 009154 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 22 21 43 0.000 0.012 0.006 009156 CC 1 5 6 CT 10 12 22 TT 12 5 17 0.374 0.182 0.072 009164 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 18 22 40 0.220 0.000 0.100 009176 AA 11 14 25 AC 10 8 18 CC 2 0 2 0.017 1.086 0.309 009200 CC 5 3 8 CT 9 7 16 TT 8 12 20 0.609 1.223 2.020 009435 AA 6 3 9 AG 10 8 18 GG 7 11 18 0.381 0.577 1.250 009578 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 009608 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 21 22 43 0.048 0.000 0.023 010065 CC 19 23 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.095 010070 CC 20 23 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.023 010416 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 21 42 0.012 0.000 0.006 010457 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 22 20 42 0.000 0.012 0.006 010566 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 010585 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 20 44 0.000 0.012 0.006 010752 -- 1 0 1 +- 2 6 8 ++ 20 16 36 4.707 0.548 0.450 010946 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 17 19 36 0.059 0.000 0.028 011214 CC 1 2 3 CT 6 8 14 TT 10 10 20 0.006 0.045 0.061 011893 -- 23 23 46 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.005 012123 AA 2 0 2 AC 11 6 17 CC 11 17 28 0.107 0.517 0.084 012379 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 20 41 0.048 0.000 0.024 012740 GG 3 8 11 GT 11 4 15 TT 7 1 8 0.159 0.231 0.417 013491 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 013767 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 014113 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 014180 CC 20 23 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.023 015398 AA 10 1 11 AG 6 5 11 GG 8 17 25 5.916 0.571 11.117 016145 CC 5 13 18 CG 6 5 11 GG 4 4 8 0.579 4.536 4.757 016159 AA 3 0 3 AG 1 0 1 GG 11 22 33 9.931 0.000 26.245 016662 CC 6 15 21 CT 13 5 18 TT 1 1 2 2.990 0.429 0.573 016722 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 18 20 38 0.055 0.012 0.059 017623 CC 16 13 29 CT 5 8 13 TT 1 1 2 0.499 0.027 0.120 017649 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 017793 GG 22 22 44 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 017801 AA 0 4 4 AG 5 12 17 GG 16 7 23 0.383 0.087 0.111 017823 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 20 22 42 0.000 0.011 0.006 017875 CC 18 23 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.055 0.000 0.024 017909 CC 15 7 22 CT 5 12 17 TT 0 4 4 0.408 0.087 0.073 017910 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 15 23 38 0.408 0.000 0.164 018184 CC 18 22 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 018199 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 19 22 41 0.053 0.000 0.024 018214 CC 21 20 41 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.024 018288 CC 20 19 39 CT 1 3 4 TT 0 0 0 0.012 0.118 0.102 018497 GG 15 10 25 GT 5 7 12 TT 1 1 2 0.429 0.025 0.124 018606 CC 19 18 37 CT 3 2 5 TT 0 0 0 0.118 0.055 0.168 018645 CC 3 1 4 CG 5 7 12 GG 14 11 25 3.414 0.007 1.748 018707 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 20 19 39 0.012 0.000 0.006 018931 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 21 43 0.011 0.000 0.006 019159 -- 1 1 2 +- 5 9 14 ++ 17 13 30 0.571 0.130 0.050 019518 CC 21 22 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 020065 CC 16 16 32 CT 5 6 11 TT 1 1 2 0.499 0.195 0.648 020089 AA 1 1 2 AC 5 6 11 CC 16 16 32 0.499 0.195 0.648 020138 AA 0 1 1 AG 2 6 8 GG 20 16 36 0.050 0.195 0.450 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 004906: c 006636: C 007171: CTAA 007738: ct 010752: c 010946: a 011893: A 018199: g 019159: CCCTG Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 007667 CC 4 3 7 007667 CG 7 0 7 007667 CT 3 4 7 007667 GG 5 0 5 007667 GT 2 4 6 007667 TT 0 5 5