Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000175 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000264 + 0.36 0.10 0.23 - 0.64 0.90 0.77 0.46 0.18 0.36 000989 - 0.07 0.12 0.09 + 0.93 0.88 0.91 0.13 0.21 0.17 002167 + 0.15 0.00 0.07 - 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 002202 C 0.31 0.09 0.20 A 0.69 0.91 0.80 0.43 0.16 0.32 002212 C 0.31 0.09 0.20 T 0.69 0.91 0.80 0.43 0.16 0.32 002489 T 0.13 0.59 0.38 C 0.87 0.41 0.62 0.23 0.48 0.47 003911 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003967 C 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 004699 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 004732 A 0.03 0.15 0.09 G 0.97 0.85 0.91 0.05 0.26 0.17 005295 T 0.25 0.09 0.16 C 0.75 0.91 0.84 0.38 0.16 0.27 005953 A 0.23 0.09 0.16 G 0.77 0.91 0.84 0.35 0.16 0.27 005970 A 0.23 0.09 0.16 G 0.77 0.91 0.84 0.35 0.16 0.27 006377 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006398 T 0.22 0.09 0.16 C 0.78 0.91 0.84 0.34 0.17 0.26 007357 G 0.25 0.09 0.17 A 0.75 0.91 0.83 0.38 0.16 0.28 007596 G 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 007818 A 0.30 0.09 0.20 G 0.70 0.91 0.80 0.42 0.16 0.31 007872 T 0.24 0.09 0.17 C 0.76 0.91 0.83 0.36 0.17 0.28 008395 A 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008421 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008853 G 0.25 0.00 0.12 A 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.21 010029 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010542 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011111 A 0.05 0.02 0.03 G 0.95 0.98 0.97 0.09 0.04 0.07 011205 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011238 G 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.05 0.04 0.04 011620 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011684 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011761 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011884 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012095 + 0.02 0.13 0.08 - 0.98 0.87 0.92 0.04 0.23 0.14 012098 + 0.02 0.13 0.08 - 0.98 0.87 0.92 0.04 0.23 0.14 012163 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012446 T 0.43 0.50 0.47 G 0.57 0.50 0.53 0.49 0.50 0.50 013213 T 0.20 0.00 0.10 C 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 013348 A 0.38 0.50 0.43 G 0.62 0.50 0.57 0.47 0.50 0.49 013438 + 0.38 0.50 0.44 - 0.62 0.50 0.56 0.47 0.50 0.49 014075 G 0.15 0.02 0.09 C 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 014093 G 0.19 0.09 0.14 A 0.81 0.91 0.86 0.30 0.16 0.24 014927 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.03 015467 G 0.00 0.10 0.05 A 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 016330 T 0.11 0.47 0.28 C 0.89 0.53 0.72 0.19 0.50 0.41 016476 C 0.39 0.33 0.36 G 0.61 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 016847 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016921 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017435 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017445 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017642 C 0.02 0.13 0.08 G 0.98 0.87 0.92 0.04 0.23 0.14 017691 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018283 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018739 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018983 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019136 A 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 019272 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019693 G 0.07 0.17 0.12 A 0.93 0.83 0.88 0.12 0.29 0.21 019916 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020024 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020489 T 0.35 0.50 0.41 C 0.65 0.50 0.59 0.45 0.50 0.49 021000 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021191 G 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 021681 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022275 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 022982 C 0.07 0.34 0.24 A 0.93 0.66 0.76 0.13 0.45 0.36 023545 C 0.13 0.14 0.13 T 0.87 0.86 0.87 0.23 0.24 0.23 023669 G 0.39 0.55 0.47 A 0.61 0.45 0.53 0.48 0.50 0.50 023958 A 0.39 0.55 0.47 G 0.61 0.45 0.53 0.48 0.50 0.50 023969 - 0.39 0.55 0.47 + 0.61 0.45 0.53 0.48 0.50 0.50 024437 C 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 026001 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 026106 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 026134 C 0.12 0.35 0.24 G 0.88 0.65 0.76 0.21 0.45 0.36 026469 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 026558 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 026634 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 026843 A 0.17 0.05 0.11 G 0.83 0.95 0.89 0.29 0.09 0.20 027656 A 0.12 0.36 0.24 G 0.88 0.64 0.76 0.22 0.46 0.36 028664 T 0.02 0.24 0.12 C 0.98 0.76 0.88 0.04 0.36 0.21 028696 C 0.27 0.28 0.28 T 0.73 0.72 0.72 0.40 0.40 0.40 029349 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 029398 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 029572 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029629 A 0.14 0.35 0.24 C 0.86 0.65 0.76 0.24 0.45 0.36 029734 G 0.18 0.53 0.35 A 0.82 0.47 0.65 0.30 0.50 0.45 030165 T 0.13 0.17 0.15 C 0.87 0.83 0.85 0.23 0.28 0.25 031772 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031985 T 0.39 0.39 0.39 C 0.61 0.61 0.61 0.47 0.47 0.47 032879 A 0.20 0.52 0.37 G 0.80 0.48 0.63 0.33 0.50 0.46 033006 T 0.19 0.52 0.35 C 0.81 0.48 0.65 0.30 0.50 0.46 033076 G 0.19 0.52 0.35 A 0.81 0.48 0.65 0.30 0.50 0.46 033093 G 0.19 0.52 0.35 A 0.81 0.48 0.65 0.30 0.50 0.46 033379 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033904 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034328 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034336 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 034345 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 034441 + 0.19 0.00 0.10 - 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 035065 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035078 A 0.17 0.52 0.34 G 0.83 0.48 0.66 0.29 0.50 0.45 035197 C 0.17 0.52 0.34 T 0.83 0.48 0.66 0.29 0.50 0.45 035582 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035636 T 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 035638 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 035664 G 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.05 035839 T 0.26 0.52 0.39 A 0.74 0.48 0.61 0.39 0.50 0.47 036023 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 036160 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 036277 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036476 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036483 C 0.17 0.52 0.35 T 0.83 0.48 0.65 0.29 0.50 0.45 036797 A 0.14 0.36 0.26 G 0.86 0.64 0.74 0.24 0.46 0.38 036800 A 0.05 0.09 0.07 G 0.95 0.91 0.93 0.09 0.17 0.13 036927 G 0.17 0.00 0.08 A 0.83 1.00 0.92 0.28 0.00 0.15 037012 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 037120 G 0.22 0.52 0.39 A 0.78 0.48 0.61 0.35 0.50 0.48 037728 T 0.20 0.03 0.13 C 0.80 0.97 0.87 0.31 0.06 0.22 038147 G 0.20 0.53 0.35 A 0.80 0.47 0.65 0.31 0.50 0.45 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000264: g 000989: a 002167: g 012095: CA 012098: ACA 013438: GTGTGTTT 017445: ag 023969: tactggcat 034441: c