Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000123 G 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 000163 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000308 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000699 A 0.00 0.08 0.03 G 1.00 0.92 0.97 0.00 0.15 0.07 001020 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001853 C 0.31 0.00 0.16 A 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 002307 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 002563 A 0.00 0.11 0.05 G 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 002663 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 002999 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 003301 - 0.30 0.37 0.34 + 0.70 0.63 0.66 0.42 0.47 0.45 003306 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003380 T 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 003679 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004055 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004523 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004630 A 0.02 0.14 0.08 C 0.98 0.86 0.92 0.04 0.24 0.14 004649 A 0.19 0.48 0.34 G 0.81 0.52 0.66 0.31 0.50 0.45 004672 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 004726 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005443 T 0.35 0.00 0.18 C 0.65 1.00 0.82 0.46 0.00 0.30 005566 T 0.35 0.00 0.18 A 0.65 1.00 0.82 0.46 0.00 0.30 005769 C 0.27 0.60 0.42 G 0.73 0.40 0.58 0.39 0.48 0.49 005788 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007792 C 0.38 0.00 0.19 A 0.62 1.00 0.81 0.47 0.00 0.31 007957 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007987 G 0.17 0.00 0.09 A 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 008165 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008350 C 0.33 0.61 0.47 T 0.67 0.39 0.53 0.44 0.48 0.50 008399 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008488 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008503 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008820 T 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 008884 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009175 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009535 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009588 A 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 009963 A 0.33 0.61 0.47 G 0.67 0.39 0.53 0.44 0.48 0.50 009971 T 0.33 0.61 0.47 C 0.67 0.39 0.53 0.44 0.48 0.50 010160 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 010221 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010684 C 0.27 0.52 0.39 G 0.73 0.48 0.61 0.39 0.50 0.48 010735 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011027 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011035 T 0.06 0.04 0.05 A 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 011037 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011471 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 011490 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011522 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011561 A 0.34 0.35 0.34 G 0.66 0.65 0.66 0.45 0.45 0.45 012142 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 012234 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012249 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012298 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012350 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012413 T 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 012816 G 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 013077 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013260 G 0.17 0.32 0.24 A 0.83 0.68 0.76 0.28 0.43 0.36 013332 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013636 + 0.07 0.31 0.18 - 0.93 0.69 0.82 0.14 0.42 0.30 013744 + 0.17 0.19 0.18 - 0.82 0.81 0.82 0.29 0.31 0.30 014187 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 014826 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 014942 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014951 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015065 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015242 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 015481 A 0.10 0.00 0.06 G 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 015502 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015717 G 0.12 0.36 0.23 A 0.88 0.64 0.77 0.22 0.46 0.36 015830 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016370 T 0.00 0.14 0.07 C 1.00 0.86 0.93 0.00 0.24 0.13 016877 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017165 A 0.44 0.34 0.40 G 0.56 0.66 0.60 0.49 0.45 0.48 017257 T 0.10 0.31 0.20 C 0.90 0.69 0.80 0.19 0.43 0.32 017272 T 0.38 0.26 0.32 C 0.62 0.74 0.68 0.47 0.39 0.44 017437 T 0.10 0.39 0.24 C 0.90 0.61 0.76 0.19 0.48 0.37 018123 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018642 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001020: a 003301: ct 012350: A 013636: TTGA 013744: TTAA