Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 001102 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.700 0.000 0.304 001182 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 001486 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 001684 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 22 21 43 0.000 0.012 0.006 001822 AA 0 0 0 AG 1 10 11 GG 20 8 28 0.012 2.663 1.051 002026 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002027 CC 1 3 4 CT 12 15 27 TT 11 5 16 1.059 2.272 2.466 002559 AA 1 2 3 AC 10 16 26 CC 13 5 18 0.296 3.969 2.527 003093 -- 1 1 2 +- 10 16 26 ++ 13 5 18 0.296 5.594 3.763 003334 AA 1 1 2 AG 11 16 27 GG 12 5 17 0.618 5.594 4.524 003336 CC 0 0 0 CT 1 4 5 TT 23 18 41 0.011 0.220 0.152 003714 AA 11 5 16 AC 12 15 27 CC 1 3 4 1.059 2.272 2.466 003772 GG 17 22 39 GT 7 0 7 TT 0 0 0 0.700 0.000 0.312 003990 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 004463 AA 23 18 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 004486 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 19 42 0.011 0.000 0.006 005032 -- 1 1 2 +- 13 3 16 ++ 10 17 27 1.630 2.136 0.037 005036 AA 10 17 27 AG 12 3 15 GG 1 1 2 1.239 2.136 0.002 005510 CC 17 22 39 CT 7 0 7 TT 0 0 0 0.700 0.000 0.312 005529 AA 18 22 40 AT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.224 005941 AA 0 1 1 AC 9 9 18 CC 14 8 22 1.361 0.571 1.485 006028 CC 0 0 0 CT 1 3 4 TT 22 18 40 0.011 0.124 0.100 006248 AA 0 1 1 AG 10 14 24 GG 10 4 14 2.222 4.968 5.769 006478 CC 21 18 39 CT 3 4 7 TT 0 0 0 0.107 0.220 0.312 006572 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 006868 AA 20 17 37 AG 4 4 8 GG 0 0 0 0.198 0.233 0.428 006909 AA 23 21 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 006927 AA 0 0 0 AG 3 3 6 GG 21 18 39 0.107 0.124 0.230 006955 CC 24 18 42 CT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.124 0.054 007031 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 007049 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 22 42 0.198 0.000 0.095 007237 CC 13 6 19 CG 10 13 23 GG 1 4 5 0.296 0.445 0.258 007358 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 007405 CC 17 23 40 CG 7 0 7 GG 0 0 0 0.700 0.000 0.304 007480 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 007584 AA 8 14 22 AG 15 7 22 GG 1 2 3 3.219 0.616 0.666 007586 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.700 0.000 0.304 007636 AA 8 14 22 AG 15 7 22 GG 1 2 3 3.219 0.616 0.666 007655 AA 1 1 2 AG 13 3 16 GG 10 19 29 1.630 2.457 0.012 007763 AA 4 13 17 AG 14 7 21 GG 1 2 3 4.968 0.505 1.044 007786 AA 1 1 2 AG 13 3 16 GG 9 19 28 1.882 2.457 0.023 007909 AA 20 16 36 AG 3 5 8 GG 0 0 0 0.112 0.383 0.440 008161 CC 22 21 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 008528 AA 21 18 39 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.026 008705 AA 7 12 19 AT 14 4 18 TT 1 2 3 3.094 2.296 0.204 008802 AA 21 17 38 AG 1 3 4 GG 0 0 0 0.012 0.131 0.105 008877 CC 20 14 34 CT 2 5 7 TT 0 0 0 0.050 0.436 0.357 008888 CC 22 18 40 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.014 0.006 008897 CC 1 2 3 CT 14 5 19 TT 7 12 19 3.094 1.406 0.357 008927 CC 1 2 3 CT 14 5 19 TT 7 12 19 3.094 1.406 0.357 009204 AA 1 2 3 AG 15 6 21 GG 8 14 22 3.219 1.099 0.468 009335 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 009590 AA 0 1 1 AG 8 11 19 GG 16 10 26 0.960 0.889 1.367 009653 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 009714 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 17 22 39 0.517 0.000 0.230 010301 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 010345 CC 16 11 27 CT 8 11 19 TT 0 1 1 0.960 0.741 1.280 010630 GG 0 0 0 GT 7 0 7 TT 16 23 39 0.741 0.000 0.312 010646 CC 21 23 44 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 010890 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 010911 AA 16 22 38 AT 7 0 7 TT 0 0 0 0.741 0.000 0.320 011040 CC 21 18 39 CT 2 4 6 TT 0 0 0 0.048 0.220 0.230 011182 CC 23 21 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 011369 AA 15 7 22 AC 8 11 19 CC 0 3 3 1.019 0.159 0.167 011450 CC 13 22 35 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.468 0.011 0.256 011522 CC 10 19 29 CT 13 3 16 TT 1 1 2 1.630 2.457 0.012 011542 CC 24 21 45 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.022 011572 AA 17 23 40 AC 7 0 7 CC 0 0 0 0.700 0.000 0.304 011608 CC 5 4 9 CT 8 15 23 TT 11 4 15 2.003 2.130 0.001 011671 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011702 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.700 0.000 0.304 011716 AA 0 0 0 AG 3 5 8 GG 21 18 39 0.107 0.342 0.407 011724 AA 17 23 40 AG 7 0 7 GG 0 0 0 0.700 0.000 0.304 012062 CC 8 6 14 CT 15 12 27 TT 1 4 5 3.219 0.220 2.239 012138 CC 1 5 6 CT 15 11 26 TT 8 6 14 3.219 0.000 1.263 012267 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 012435 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 012548 -- 12 17 29 +- 11 3 14 ++ 1 2 3 0.618 5.290 0.513 012555 AA 12 17 29 AC 11 3 14 CC 1 2 3 0.618 5.290 0.513 012711 GG 23 22 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 012723 GG 1 2 3 GT 11 4 15 TT 12 16 28 0.618 3.327 0.255 012826 AA 9 17 26 AT 13 4 17 TT 2 2 4 0.813 3.584 0.255 012827 AA 9 17 26 AC 13 4 17 CC 2 2 4 0.813 3.584 0.255 012863 CC 8 15 23 CT 13 6 19 TT 3 2 5 0.421 1.252 0.130 013014 AA 9 17 26 AG 13 4 17 GG 2 2 4 0.813 3.584 0.255 013020 CC 0 0 0 CG 2 4 6 GG 22 19 41 0.045 0.209 0.218 013139 AA 7 17 24 AG 10 4 14 GG 2 2 4 0.326 3.584 0.798 013454 AA 2 1 3 AG 11 3 14 GG 7 17 24 0.601 2.136 0.226 013720 AA 8 6 14 AG 15 12 27 GG 1 5 6 3.219 0.048 1.578 013811 -- 9 17 26 +- 13 4 17 ++ 2 2 4 0.813 3.584 0.255 013816 CC 9 17 26 CT 0 0 0 TT 2 2 4 11.000 19.000 30.000 013829 CC 1 0 1 CT 1 2 3 TT 10 17 27 4.599 0.059 3.741 013839 GG 2 4 6 GT 5 12 17 TT 5 5 10 0.148 0.444 0.069 013964 AA 9 17 26 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.028 0.059 0.086 013980 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 9 17 26 0.028 0.059 0.086 013982 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 9 17 26 0.028 0.059 0.086 013998 -- 10 19 29 +- 13 4 17 ++ 0 0 0 3.569 0.209 2.363 014417 AA 9 15 24 AG 12 3 15 GG 1 1 2 1.455 1.815 0.031 014435 AA 9 15 24 AG 13 3 16 GG 2 2 4 0.813 4.618 0.306 014535 CC 13 18 31 CG 11 3 14 GG 0 0 0 2.121 0.124 1.527 014553 AA 2 2 4 AT 13 3 16 TT 9 16 25 0.813 4.954 0.372 014569 CC 2 2 4 CT 13 3 16 TT 9 16 25 0.813 4.954 0.372 014638 CC 2 6 8 CT 15 10 25 TT 7 5 12 2.258 0.043 0.648 014671 AA 2 2 4 AC 13 3 16 CC 9 16 25 0.813 4.954 0.372 015014 CC 22 20 42 CG 2 2 4 GG 0 0 0 0.045 0.050 0.095 015093 CC 9 5 14 CT 13 13 26 TT 2 4 6 0.813 0.747 1.263 015225 AA 20 17 37 AG 3 4 7 GG 0 0 0 0.112 0.233 0.329 015234 AA 0 0 0 AG 2 3 5 GG 21 18 39 0.048 0.124 0.160 015329 AA 0 0 0 AG 2 3 5 GG 21 18 39 0.048 0.124 0.160 015378 CC 5 10 15 CG 11 9 20 GG 7 2 9 0.030 0.000 0.239 015387 CC 23 16 39 CG 0 4 4 GG 0 1 1 0.000 1.037 3.563 015419 AA 19 20 39 AG 4 1 5 GG 0 0 0 0.209 0.012 0.160 015639 CC 6 6 12 CT 10 11 21 TT 7 4 11 0.381 0.069 0.089 015892 AA 22 21 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016012 AA 0 0 0 AG 8 8 16 GG 15 15 30 1.019 1.019 2.039 016022 CC 22 21 43 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.052 016165 AA 0 0 0 AC 15 8 23 CC 8 15 23 5.385 1.019 5.111 016171 AA 0 0 0 AG 4 6 10 GG 19 17 36 0.209 0.517 0.684 016176 CC 9 15 24 CG 14 8 22 GG 0 0 0 4.402 1.019 4.544 016266 AA 22 21 43 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.052 016274 CC 22 21 43 CG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.052 016297 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 22 21 43 0.011 0.048 0.052 016310 AA 22 21 43 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.052 016419 AA 13 12 25 AG 10 9 19 GG 0 2 2 1.775 0.028 0.473 016625 AA 15 8 23 AG 7 13 20 GG 1 1 2 0.025 2.182 0.837 016711 CC 0 2 2 CT 11 9 20 TT 12 12 24 2.272 0.028 0.747 016713 AA 5 2 7 AC 9 8 17 CC 9 13 22 0.857 0.221 1.376 016715 AA 0 2 2 AG 11 9 20 GG 12 12 24 2.272 0.028 0.747 016753 AA 0 2 2 AG 11 9 20 GG 12 12 24 2.272 0.028 0.747 016756 CC 12 12 24 CG 11 9 20 GG 0 2 2 2.272 0.028 0.747 016910 CC 12 5 17 CT 10 15 25 TT 1 3 4 0.374 2.272 1.512 016914 CC 8 12 20 CT 10 9 19 TT 5 2 7 0.306 0.028 0.481 016976 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 017027 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 017044 AA 11 12 23 AG 12 9 21 GG 0 2 2 2.865 0.028 1.083 017138 AA 0 0 0 AG 4 3 7 GG 20 20 40 0.198 0.112 0.304 017379 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 18 23 41 0.342 0.000 0.152 017776 AA 21 22 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 017790 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 017825 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 017904 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 22 43 0.048 0.000 0.023 018086 CC 1 7 8 CT 8 10 18 TT 15 5 20 0.003 0.153 1.181 018115 CC 21 22 43 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.052 018176 CC 4 10 14 CT 5 8 13 TT 13 3 16 4.536 0.429 6.676 018212 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 21 45 0.000 0.012 0.006 018319 AA 0 5 5 AT 6 9 15 TT 17 8 25 0.517 0.609 1.289 018469 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 18 22 40 0.055 0.011 0.056 018480 CC 18 22 40 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.055 0.011 0.056 018564 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 018572 AA 12 14 26 AG 7 8 15 GG 3 1 4 1.223 0.011 0.691 018702 GG 22 22 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 018781 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 17 22 39 0.362 0.000 0.160 019112 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 22 44 0.000 0.011 0.006 019147 AA 0 0 0 AC 5 0 5 CC 17 23 40 0.362 0.000 0.156 019219 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 17 23 40 0.362 0.000 0.156 019356 CC 6 15 21 CT 9 5 14 TT 9 1 10 1.361 0.429 5.148 019365 AA 0 0 0 AT 5 0 5 TT 19 21 40 0.324 0.000 0.156 019512 AA 18 22 40 AC 6 0 6 CC 0 0 0 0.490 0.000 0.224 019567 AA 19 22 41 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.152 019612 CC 14 3 17 CT 8 10 18 TT 2 9 11 0.296 0.007 1.911 019874 CC 6 16 22 CT 9 5 14 TT 9 1 10 1.361 0.499 5.534 019880 AA 19 22 41 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.152 019947 AA 0 1 1 AG 7 7 14 GG 17 14 31 0.700 0.011 0.161 020322 CC 19 22 41 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.152 020323 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 020342 AA 14 15 29 AT 8 6 14 TT 2 1 3 0.296 0.153 0.513 020613 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 020844 AA 2 1 3 AC 8 6 14 CC 14 15 29 0.296 0.153 0.513 020891 AA 23 20 43 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.050 0.052 020952 AA 18 22 40 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.124 0.000 0.056 021036 GG 0 0 0 GT 7 0 7 TT 17 23 40 0.700 0.000 0.304 021077 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 021171 CC 7 1 8 CG 10 6 16 GG 7 15 22 0.667 0.153 2.504 021292 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.490 0.000 0.218 021324 AA 17 7 24 AC 5 11 16 CC 2 5 7 2.400 0.030 2.206 021466 CC 3 9 12 CT 12 9 21 TT 9 5 14 0.107 0.857 0.516 021501 AA 1 9 10 AC 10 9 19 CC 12 5 17 0.374 0.857 1.096 021639 CC 23 21 44 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 022045 CC 20 20 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 022050 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 20 40 0.012 0.000 0.006 022051 CC 20 20 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 022076 CC 13 6 19 CT 6 9 15 TT 2 5 7 0.948 0.191 1.636 022079 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 21 20 41 0.012 0.000 0.006 022157 AA 0 0 0 AG 0 5 5 GG 23 15 38 0.000 0.408 0.164 022234 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 20 42 0.011 0.000 0.006 022286 AA 0 2 2 AT 1 7 8 TT 21 12 33 0.012 0.399 2.181 022563 AA 2 9 11 AT 9 7 16 TT 9 5 14 0.013 1.995 1.901 022661 AA 2 9 11 AG 8 8 16 GG 14 5 19 0.296 1.352 3.675 022751 AA 23 22 45 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 022877 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 022920 AA 22 16 38 AG 2 6 8 GG 0 0 0 0.045 0.548 0.417 022977 AA 4 15 19 AT 8 5 13 TT 12 2 14 1.500 2.001 8.427 023001 CC 19 22 41 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.152 023222 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 023350 CC 13 5 18 CT 8 8 16 TT 2 9 11 0.221 1.352 3.311 023519 AA 20 22 42 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.095 023532 CC 2 8 10 CT 8 9 17 TT 14 5 19 0.296 0.609 2.464 023539 -- 21 22 43 +- 3 0 3 ++ 0 0 0 0.107 0.000 0.052 023677 GG 20 22 42 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 023863 CC 22 19 41 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.053 0.055 023925 AA 6 1 7 AG 11 6 17 GG 6 15 21 0.043 0.153 1.203 024026 -- 0 0 0 +- 5 0 5 ++ 15 22 37 0.408 0.000 0.168 024126 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 21 40 0.013 0.000 0.006 024180 CC 21 22 43 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 024213 CC 19 16 35 CT 3 4 7 TT 0 0 0 0.118 0.247 0.347 024503 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 20 44 0.000 0.112 0.051 024655 GG 17 7 24 GT 5 11 16 TT 2 5 7 2.400 0.030 2.206 024772 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 1 0 1 4.959 0.000 10.729 024916 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 024932 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 025075 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 22 41 0.324 0.000 0.152 025450 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 025559 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 21 45 0.000 0.012 0.006 025599 GG 6 14 20 GT 9 6 15 TT 9 2 11 1.361 1.099 4.766 025800 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 22 45 0.011 0.000 0.006 026573 CC 0 0 0 CT 2 5 7 TT 21 17 38 0.048 0.362 0.320 026625 AA 3 3 6 AG 6 10 16 GG 14 9 23 2.407 0.007 1.308 026770 CC 2 1 3 CG 8 6 14 GG 14 16 30 0.296 0.195 0.577 026909 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.490 0.000 0.218 026917 AA 23 21 44 AT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 026933 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 027145 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 027279 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 027338 AA 18 23 41 AT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.218 027479 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 027537 CC 4 15 19 CT 7 5 12 TT 13 2 15 2.476 2.001 10.348 027682 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 027847 AA 19 17 36 AG 0 6 6 GG 0 0 0 0.000 0.517 0.249 027944 AA 18 22 40 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.006 028020 AA 0 1 1 AG 1 7 8 GG 18 15 33 0.014 0.025 0.355 028414 AA 22 23 45 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 028465 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 23 42 0.209 0.000 0.095 028725 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 029019 CC 20 21 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 029206 CC 20 20 40 CT 4 3 7 TT 0 0 0 0.198 0.112 0.304 029410 -- 20 23 43 +- 2 0 2 ++ 1 0 1 4.707 0.000 10.478 029434 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 21 22 43 0.000 0.011 0.006 029506 CC 20 23 43 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.052 029725 AA 7 6 13 AG 5 12 17 GG 11 5 16 6.999 0.048 3.055 029831 CC 9 7 16 CT 12 14 26 TT 2 1 3 0.517 3.094 3.060 029892 GG 21 22 43 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.052 030341 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 030350 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 030383 CC 2 3 5 CT 8 10 18 TT 14 10 24 0.296 0.040 0.335 030479 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 030500 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 030778 CC 0 0 0 CG 3 5 8 GG 21 18 39 0.107 0.342 0.407 030986 AA 2 1 3 AG 14 12 26 GG 7 8 15 1.775 1.714 3.371 031079 AA 2 1 3 AG 13 12 25 GG 7 7 14 1.333 2.031 3.249 031404 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 031460 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 031587 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031685 CC 23 22 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 032153 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 032290 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 20 21 41 0.000 0.048 0.024 032520 CC 4 5 9 CT 7 16 23 TT 9 2 11 1.284 3.969 0.223 032819 CC 22 16 38 CT 2 6 8 TT 0 0 0 0.045 0.548 0.417 032933 AA 2 0 2 AG 7 4 11 GG 15 18 33 0.730 0.220 0.705 033036 CC 15 18 33 CT 7 4 11 TT 2 0 2 0.730 0.220 0.705 033064 AA 15 18 33 AT 6 4 10 TT 2 0 2 1.252 0.220 1.069 033085 CC 14 18 32 CG 6 4 10 GG 2 0 2 1.099 0.220 0.998 033528 CC 22 23 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 033588 AA 14 15 29 AG 9 8 17 GG 0 0 0 1.361 1.019 2.363 033631 AA 22 23 45 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 033750 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 033800 GG 14 13 27 GT 9 10 19 TT 0 0 0 1.361 1.775 3.116 033945 -- 22 23 45 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 033953 AA 2 5 7 AG 11 16 27 GG 10 2 12 0.179 3.969 1.625 034023 GG 7 8 15 GT 14 14 28 TT 2 1 3 1.775 2.685 4.315 034307 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 21 42 0.012 0.000 0.006 034525 CC 21 19 40 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.012 0.053 0.056 034954 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 035035 AA 20 23 43 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.023 035084 CC 2 0 2 CT 6 4 10 TT 14 19 33 1.099 0.209 1.069 036029 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 036034 AA 0 0 0 AG 8 3 11 GG 16 19 35 0.960 0.118 0.848 036233 CC 11 2 13 CG 11 15 26 GG 2 5 7 0.107 3.337 1.035 036281 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 036502 -- 3 1 4 +- 15 8 23 ++ 6 12 18 1.748 0.053 0.781 036555 AA 9 12 21 AG 12 7 19 GG 2 1 3 0.517 0.000 0.220 036593 CC 3 1 4 CT 14 8 22 TT 6 12 18 1.308 0.053 0.558 036698 AA 23 21 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 036715 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 21 44 0.011 0.000 0.006 036857 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 036882 AA 2 1 3 AC 15 10 25 CC 7 11 18 2.258 0.468 2.152 037122 AA 0 0 0 AC 7 0 7 CC 17 23 40 0.700 0.000 0.304 037280 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 037961 -- 3 1 4 +- 14 10 24 ++ 7 12 19 0.960 0.374 0.883 037983 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 038150 AA 0 0 0 AG 1 6 7 GG 23 17 40 0.011 0.517 0.304 038522 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 22 41 0.209 0.000 0.097 038635 -- 19 22 41 +- 4 0 4 ++ 0 0 0 0.209 0.000 0.097 038658 CC 19 22 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.006 038696 AA 21 21 42 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 038701 CC 20 22 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 038925 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 038969 AA 20 23 43 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.012 0.000 0.006 039167 CC 0 0 0 CT 0 3 3 TT 18 20 38 0.000 0.112 0.059 039281 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 039334 AA 15 14 29 AG 8 7 15 GG 1 0 1 0.003 0.840 0.347 039377 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 039409 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 20 21 41 0.198 0.000 0.097 039498 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 039600 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 21 41 0.198 0.000 0.097 039622 CC 24 13 37 CT 0 7 7 TT 0 1 1 0.000 0.002 0.830 039822 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 039828 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 21 44 0.011 0.000 0.006 039831 AA 3 1 4 AG 14 9 23 GG 7 11 18 0.960 0.247 0.781 040023 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 18 40 0.045 0.000 0.025 040034 CC 11 1 12 CT 11 13 24 TT 2 4 6 0.107 4.247 1.167 040107 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 21 44 0.011 0.000 0.006 040163 AA 0 0 0 AC 10 6 16 CC 14 15 29 1.662 0.583 2.104 040258 CC 24 20 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 040310 AA 24 20 44 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 040339 CC 1 0 1 CT 8 7 15 TT 15 14 29 0.003 0.840 0.347 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003093: ta 005032: c 012548: CCCAG 013811: AATA 013998: t 018212: a 023539: T 024026: AATAA 025559: aggactccta 029410: a 031460: tgg 033945: a 034307: tt 036502: CTAT 037961: a 037983: ctt 038635: G 039409: ggt