Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 001102 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 001182 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001486 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001684 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001822 A 0.02 0.28 0.14 G 0.98 0.72 0.86 0.05 0.40 0.24 002026 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002027 C 0.29 0.46 0.37 T 0.71 0.54 0.63 0.41 0.50 0.47 002559 A 0.25 0.43 0.34 C 0.75 0.57 0.66 0.38 0.49 0.45 003093 - 0.25 0.41 0.33 + 0.75 0.59 0.67 0.38 0.48 0.44 003334 A 0.27 0.41 0.34 G 0.73 0.59 0.66 0.39 0.48 0.45 003336 C 0.02 0.09 0.05 T 0.98 0.91 0.95 0.04 0.17 0.10 003714 C 0.29 0.46 0.37 A 0.71 0.54 0.63 0.41 0.50 0.47 003772 T 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 003990 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004463 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004486 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005032 - 0.31 0.12 0.22 + 0.69 0.88 0.78 0.43 0.21 0.35 005036 G 0.30 0.12 0.22 A 0.70 0.88 0.78 0.42 0.21 0.34 005510 T 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 005529 T 0.12 0.00 0.07 A 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 005941 A 0.20 0.31 0.24 C 0.80 0.69 0.76 0.31 0.42 0.37 006028 C 0.02 0.07 0.05 T 0.98 0.93 0.95 0.04 0.13 0.09 006248 A 0.25 0.42 0.33 G 0.75 0.58 0.67 0.38 0.49 0.44 006478 T 0.06 0.09 0.08 C 0.94 0.91 0.92 0.12 0.17 0.14 006572 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006868 G 0.08 0.10 0.09 A 0.92 0.90 0.91 0.15 0.17 0.16 006909 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006927 A 0.06 0.07 0.07 G 0.94 0.93 0.93 0.12 0.13 0.12 006955 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 007031 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007049 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 007237 G 0.25 0.46 0.35 C 0.75 0.54 0.65 0.38 0.50 0.46 007358 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 007405 G 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 007480 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007584 G 0.35 0.24 0.30 A 0.65 0.76 0.70 0.46 0.36 0.42 007586 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 007636 G 0.35 0.24 0.30 A 0.65 0.76 0.70 0.46 0.36 0.42 007655 A 0.31 0.11 0.21 G 0.69 0.89 0.79 0.43 0.19 0.33 007763 G 0.42 0.25 0.33 A 0.58 0.75 0.67 0.49 0.38 0.44 007786 A 0.33 0.11 0.22 G 0.67 0.89 0.78 0.44 0.19 0.34 007909 G 0.07 0.12 0.09 A 0.93 0.88 0.91 0.12 0.21 0.17 008161 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008528 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 008705 T 0.36 0.22 0.30 A 0.64 0.78 0.70 0.46 0.35 0.42 008802 G 0.02 0.07 0.05 A 0.98 0.93 0.95 0.04 0.14 0.09 008877 T 0.05 0.13 0.09 C 0.95 0.87 0.91 0.09 0.23 0.16 008888 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 008897 C 0.36 0.24 0.30 T 0.64 0.76 0.70 0.46 0.36 0.42 008927 C 0.36 0.24 0.30 T 0.64 0.76 0.70 0.46 0.36 0.42 009204 A 0.35 0.23 0.29 G 0.65 0.77 0.71 0.46 0.35 0.41 009335 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009590 A 0.17 0.30 0.23 G 0.83 0.70 0.77 0.28 0.42 0.35 009653 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009714 C 0.13 0.00 0.07 T 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 010301 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010345 T 0.17 0.28 0.22 C 0.83 0.72 0.78 0.28 0.41 0.35 010630 G 0.15 0.00 0.08 T 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 010646 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010890 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010911 T 0.15 0.00 0.08 A 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 011040 T 0.04 0.09 0.07 C 0.96 0.91 0.93 0.08 0.17 0.12 011182 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011369 C 0.17 0.40 0.28 A 0.83 0.60 0.72 0.29 0.48 0.41 011450 T 0.14 0.02 0.07 C 0.86 0.98 0.93 0.24 0.04 0.14 011522 T 0.31 0.11 0.21 C 0.69 0.89 0.79 0.43 0.19 0.33 011542 G 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 011572 C 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 011608 C 0.38 0.50 0.44 T 0.62 0.50 0.56 0.47 0.50 0.49 011671 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011702 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 011716 A 0.06 0.11 0.09 G 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 011724 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 012062 T 0.35 0.45 0.40 C 0.65 0.55 0.60 0.46 0.50 0.48 012138 C 0.35 0.48 0.41 T 0.65 0.52 0.59 0.46 0.50 0.48 012267 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012435 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012548 + 0.27 0.16 0.22 - 0.73 0.84 0.78 0.39 0.27 0.34 012555 C 0.27 0.16 0.22 A 0.73 0.84 0.78 0.39 0.27 0.34 012711 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012723 G 0.27 0.18 0.23 T 0.73 0.82 0.77 0.39 0.30 0.35 012826 T 0.35 0.17 0.27 A 0.65 0.83 0.73 0.46 0.29 0.39 012827 C 0.35 0.17 0.27 A 0.65 0.83 0.73 0.46 0.29 0.39 012863 T 0.40 0.22 0.31 C 0.60 0.78 0.69 0.48 0.34 0.43 013014 G 0.35 0.17 0.27 A 0.65 0.83 0.73 0.46 0.29 0.39 013020 C 0.04 0.09 0.06 G 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 013139 G 0.37 0.17 0.26 A 0.63 0.83 0.74 0.47 0.29 0.39 013454 A 0.38 0.12 0.24 G 0.62 0.88 0.76 0.47 0.21 0.37 013720 G 0.35 0.48 0.41 A 0.65 0.52 0.59 0.46 0.50 0.49 013811 + 0.35 0.17 0.27 - 0.65 0.83 0.73 0.46 0.29 0.39 013816 T 0.18 0.11 0.13 C 0.82 0.89 0.87 0.30 0.19 0.23 013829 C 0.12 0.05 0.08 T 0.88 0.95 0.92 0.22 0.10 0.15 013839 G 0.38 0.48 0.44 T 0.62 0.52 0.56 0.47 0.50 0.49 013964 G 0.05 0.05 0.05 A 0.95 0.95 0.95 0.10 0.10 0.10 013980 A 0.05 0.05 0.05 G 0.95 0.95 0.95 0.10 0.10 0.10 013982 C 0.05 0.05 0.05 T 0.95 0.95 0.95 0.10 0.10 0.10 013998 + 0.28 0.09 0.18 - 0.72 0.91 0.82 0.41 0.16 0.30 014417 G 0.32 0.13 0.23 A 0.68 0.87 0.77 0.43 0.23 0.36 014435 G 0.35 0.17 0.27 A 0.65 0.82 0.73 0.46 0.29 0.40 014535 G 0.23 0.07 0.16 C 0.77 0.93 0.84 0.35 0.13 0.26 014553 A 0.35 0.17 0.27 T 0.65 0.83 0.73 0.46 0.28 0.39 014569 C 0.35 0.17 0.27 T 0.65 0.83 0.73 0.46 0.28 0.39 014638 C 0.40 0.52 0.46 T 0.60 0.48 0.54 0.48 0.50 0.50 014671 A 0.35 0.17 0.27 C 0.65 0.83 0.73 0.46 0.28 0.39 015014 G 0.04 0.05 0.04 C 0.96 0.95 0.96 0.08 0.09 0.08 015093 T 0.35 0.48 0.41 C 0.65 0.52 0.59 0.46 0.50 0.48 015225 G 0.07 0.10 0.08 A 0.93 0.90 0.92 0.12 0.17 0.15 015234 A 0.04 0.07 0.06 G 0.96 0.93 0.94 0.08 0.13 0.11 015329 A 0.04 0.07 0.06 G 0.96 0.93 0.94 0.08 0.13 0.11 015378 G 0.54 0.31 0.43 C 0.46 0.69 0.57 0.50 0.43 0.49 015387 G 0.00 0.14 0.07 C 1.00 0.86 0.93 0.00 0.24 0.13 015419 G 0.09 0.02 0.06 A 0.91 0.98 0.94 0.16 0.05 0.11 015639 T 0.52 0.45 0.49 C 0.48 0.55 0.51 0.50 0.50 0.50 015892 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016012 A 0.17 0.17 0.17 G 0.83 0.83 0.83 0.29 0.29 0.29 016022 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 016165 A 0.33 0.17 0.25 C 0.67 0.83 0.75 0.44 0.29 0.38 016171 A 0.09 0.13 0.11 G 0.91 0.87 0.89 0.16 0.23 0.19 016176 G 0.30 0.17 0.24 C 0.70 0.83 0.76 0.42 0.29 0.36 016266 G 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 016274 G 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 016297 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 016310 G 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 016419 G 0.22 0.28 0.25 A 0.78 0.72 0.75 0.34 0.41 0.38 016625 G 0.20 0.34 0.27 A 0.80 0.66 0.73 0.31 0.45 0.39 016711 C 0.24 0.28 0.26 T 0.76 0.72 0.74 0.36 0.41 0.39 016713 A 0.41 0.26 0.34 C 0.59 0.74 0.66 0.48 0.39 0.45 016715 A 0.24 0.28 0.26 G 0.76 0.72 0.74 0.36 0.41 0.39 016753 A 0.24 0.28 0.26 G 0.76 0.72 0.74 0.36 0.41 0.39 016756 G 0.24 0.28 0.26 C 0.76 0.72 0.74 0.36 0.41 0.39 016910 T 0.26 0.46 0.36 C 0.74 0.54 0.64 0.39 0.50 0.46 016914 T 0.43 0.28 0.36 C 0.57 0.72 0.64 0.49 0.41 0.46 016976 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017027 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017044 G 0.26 0.28 0.27 A 0.74 0.72 0.73 0.39 0.41 0.40 017138 A 0.08 0.07 0.07 G 0.92 0.93 0.93 0.15 0.12 0.14 017379 C 0.11 0.00 0.05 T 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 017776 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017790 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017825 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017904 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018086 C 0.21 0.55 0.37 T 0.79 0.45 0.63 0.33 0.50 0.47 018115 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 018176 C 0.30 0.67 0.48 T 0.70 0.33 0.52 0.42 0.44 0.50 018212 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018319 A 0.13 0.43 0.28 T 0.87 0.57 0.72 0.23 0.49 0.40 018469 A 0.05 0.02 0.03 G 0.95 0.98 0.97 0.10 0.04 0.07 018480 T 0.05 0.02 0.03 C 0.95 0.98 0.97 0.10 0.04 0.07 018564 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018572 G 0.30 0.22 0.26 A 0.70 0.78 0.74 0.42 0.34 0.38 018702 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018781 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 019112 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019147 A 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 019219 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 019356 T 0.56 0.17 0.38 C 0.44 0.83 0.62 0.49 0.28 0.47 019365 A 0.10 0.00 0.06 T 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 019512 C 0.12 0.00 0.07 A 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 019567 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019612 T 0.25 0.64 0.43 C 0.75 0.36 0.57 0.38 0.46 0.49 019874 T 0.56 0.16 0.37 C 0.44 0.84 0.63 0.49 0.27 0.47 019880 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019947 A 0.15 0.20 0.17 G 0.85 0.80 0.83 0.25 0.33 0.29 020322 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 020323 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020342 T 0.25 0.18 0.22 A 0.75 0.82 0.78 0.38 0.30 0.34 020613 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020844 A 0.25 0.18 0.22 C 0.75 0.82 0.78 0.38 0.30 0.34 020891 G 0.02 0.05 0.03 A 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 020952 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 021036 G 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 021077 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021171 C 0.50 0.18 0.35 G 0.50 0.82 0.65 0.50 0.30 0.45 021292 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 021324 C 0.19 0.46 0.32 A 0.81 0.54 0.68 0.30 0.50 0.43 021466 C 0.38 0.59 0.48 T 0.62 0.41 0.52 0.47 0.48 0.50 021501 A 0.26 0.59 0.42 C 0.74 0.41 0.58 0.39 0.48 0.49 021639 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 022045 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022050 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022051 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022076 T 0.24 0.47 0.35 C 0.76 0.53 0.65 0.36 0.50 0.46 022079 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022157 A 0.00 0.12 0.06 G 1.00 0.88 0.94 0.00 0.22 0.11 022234 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022286 A 0.02 0.26 0.14 T 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 022563 A 0.33 0.60 0.46 T 0.68 0.40 0.54 0.44 0.48 0.50 022661 A 0.25 0.59 0.41 G 0.75 0.41 0.59 0.38 0.48 0.48 022751 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022877 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022920 G 0.04 0.14 0.09 A 0.96 0.86 0.91 0.08 0.24 0.16 022977 T 0.67 0.20 0.45 A 0.33 0.80 0.55 0.44 0.33 0.49 023001 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 023222 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023350 T 0.26 0.59 0.42 C 0.74 0.41 0.58 0.39 0.48 0.49 023519 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 023532 C 0.25 0.57 0.40 T 0.75 0.43 0.60 0.38 0.49 0.48 023539 + 0.06 0.00 0.03 - 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 023677 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 023863 T 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.07 023925 A 0.50 0.18 0.34 G 0.50 0.82 0.66 0.50 0.30 0.45 024026 - 0.12 0.00 0.06 + 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 024126 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 024180 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024213 T 0.07 0.10 0.08 C 0.93 0.90 0.92 0.13 0.18 0.15 024503 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 024655 T 0.19 0.46 0.32 G 0.81 0.54 0.68 0.30 0.50 0.43 024772 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 024916 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024932 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025075 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 025450 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025559 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 025599 T 0.56 0.23 0.40 G 0.44 0.77 0.60 0.49 0.35 0.48 025800 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026573 C 0.04 0.11 0.08 T 0.96 0.89 0.92 0.08 0.20 0.14 026625 A 0.26 0.36 0.31 G 0.74 0.64 0.69 0.39 0.46 0.43 026770 C 0.25 0.17 0.21 G 0.75 0.83 0.79 0.38 0.29 0.33 026909 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 026917 T 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 026933 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027145 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027279 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027338 T 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 027479 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027537 T 0.69 0.20 0.46 C 0.31 0.80 0.54 0.43 0.33 0.50 027682 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027847 G 0.00 0.13 0.07 A 1.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.13 027944 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 028020 A 0.03 0.20 0.12 G 0.97 0.80 0.88 0.05 0.31 0.21 028414 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028465 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 028725 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029019 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 029206 T 0.08 0.07 0.07 C 0.92 0.93 0.93 0.15 0.12 0.14 029410 + 0.09 0.00 0.04 - 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 029434 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 029506 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 029725 A 0.41 0.52 0.47 G 0.59 0.48 0.53 0.48 0.50 0.50 029831 T 0.35 0.36 0.36 C 0.65 0.64 0.64 0.45 0.46 0.46 029892 T 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 030341 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030350 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 030383 C 0.25 0.35 0.30 T 0.75 0.65 0.70 0.38 0.45 0.42 030479 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030500 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 030778 C 0.06 0.11 0.09 G 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 030986 A 0.39 0.33 0.36 G 0.61 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 031079 A 0.39 0.35 0.37 G 0.61 0.65 0.63 0.47 0.45 0.47 031404 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031460 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031587 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031685 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032153 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032290 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.05 032520 C 0.38 0.57 0.48 T 0.62 0.43 0.52 0.47 0.49 0.50 032819 T 0.04 0.14 0.09 C 0.96 0.86 0.91 0.08 0.24 0.16 032933 A 0.23 0.09 0.16 G 0.77 0.91 0.84 0.35 0.17 0.27 033036 T 0.23 0.09 0.16 C 0.77 0.91 0.84 0.35 0.17 0.27 033064 T 0.22 0.09 0.16 A 0.78 0.91 0.84 0.34 0.17 0.26 033085 G 0.23 0.09 0.16 C 0.77 0.91 0.84 0.35 0.17 0.27 033528 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033588 G 0.20 0.17 0.18 A 0.80 0.83 0.82 0.31 0.29 0.30 033631 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033750 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033800 T 0.20 0.22 0.21 G 0.80 0.78 0.79 0.31 0.34 0.33 033945 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033953 A 0.33 0.57 0.45 G 0.67 0.43 0.55 0.44 0.49 0.49 034023 T 0.39 0.35 0.37 G 0.61 0.65 0.63 0.48 0.45 0.47 034307 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034525 T 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.07 034954 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035035 T 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 035084 C 0.23 0.09 0.16 T 0.77 0.91 0.84 0.35 0.16 0.26 036029 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036034 A 0.17 0.07 0.12 G 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 036233 G 0.31 0.57 0.43 C 0.69 0.43 0.57 0.43 0.49 0.49 036281 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036502 - 0.44 0.24 0.34 + 0.56 0.76 0.66 0.49 0.36 0.45 036555 G 0.35 0.23 0.29 A 0.65 0.78 0.71 0.45 0.35 0.41 036593 C 0.43 0.24 0.34 T 0.57 0.76 0.66 0.49 0.36 0.45 036698 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036715 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036857 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036882 A 0.40 0.27 0.34 C 0.60 0.73 0.66 0.48 0.40 0.45 037122 A 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 037280 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 037961 - 0.42 0.26 0.34 + 0.58 0.74 0.66 0.49 0.39 0.45 037983 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038150 A 0.02 0.13 0.07 G 0.98 0.87 0.93 0.04 0.23 0.14 038522 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 038635 + 0.09 0.00 0.04 - 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 038658 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 038696 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038701 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 038925 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038969 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 039167 C 0.00 0.07 0.04 T 1.00 0.93 0.96 0.00 0.12 0.07 039281 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039334 G 0.21 0.17 0.19 A 0.79 0.83 0.81 0.33 0.28 0.31 039377 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039409 - 0.08 0.00 0.04 + 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 039498 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039600 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 039622 T 0.00 0.21 0.10 C 1.00 0.79 0.90 0.00 0.34 0.18 039822 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039828 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039831 A 0.42 0.26 0.34 G 0.58 0.74 0.66 0.49 0.39 0.45 040023 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 040034 T 0.31 0.58 0.43 C 0.69 0.42 0.57 0.43 0.49 0.49 040107 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040163 A 0.21 0.14 0.18 C 0.79 0.86 0.82 0.33 0.24 0.29 040258 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 040310 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 040339 C 0.21 0.17 0.19 T 0.79 0.83 0.81 0.33 0.28 0.31 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003093: ta 005032: c 012548: CCCAG 013811: AATA 013998: t 018212: a 023539: T 024026: AATAA 025559: aggactccta 029410: a 031460: tgg 033945: a 034307: tt 036502: CTAT 037961: a 037983: ctt 038635: G 039409: ggt