Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000042 CC 6 0 6 CT 15 6 21 TT 3 16 19 1.748 0.548 0.003 000462 AA 6 0 6 AT 16 7 23 TT 2 15 17 3.311 0.787 0.169 000628 CC 2 16 18 CT 16 7 23 TT 5 0 5 3.969 0.741 0.347 001143 GG 4 12 16 GT 16 10 26 TT 3 0 3 3.569 1.903 3.060 001212 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 001223 CC 4 15 19 CT 16 7 23 TT 3 0 3 3.569 0.787 1.303 001307 CC 4 17 21 CT 17 6 23 TT 3 0 3 4.216 0.517 1.015 001471 AA 5 18 23 AG 17 5 22 GG 2 0 2 4.629 0.342 1.353 001511 CC 21 19 40 CT 3 4 7 TT 0 0 0 0.107 0.209 0.304 001543 AA 2 0 2 AG 17 1 18 GG 5 22 27 4.629 0.011 0.218 001555 CC 5 18 23 CT 15 5 20 TT 4 0 4 1.526 0.342 0.014 001556 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 001714 CC 1 0 1 CG 7 0 7 GG 16 23 39 0.044 0.000 0.919 002005 CC 0 11 11 CT 8 10 18 TT 16 2 18 0.960 0.017 2.206 002065 AA 20 3 23 AG 4 10 14 GG 0 10 10 0.198 0.040 5.920 002293 AA 1 9 10 AG 18 12 30 GG 5 2 7 7.073 0.517 3.733 002317 AA 1 11 12 AC 18 10 28 CC 5 2 7 7.073 0.017 1.978 002334 CC 1 11 12 CG 18 10 28 GG 5 2 7 7.073 0.017 1.978 002404 AA 0 9 9 AG 3 11 14 GG 21 3 24 0.107 0.016 5.328 002414 GG 2 11 13 GT 17 10 27 TT 5 2 7 4.629 0.017 1.326 002459 AA 2 11 13 AG 17 10 27 GG 5 2 7 4.629 0.017 1.326 002538 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002622 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 002948 AA 4 2 6 AG 12 10 22 GG 8 11 19 0.020 0.017 0.009 003037 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 003342 CC 1 2 3 CT 10 5 15 TT 13 16 29 0.296 2.200 0.303 003407 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 003538 GG 3 18 21 GT 13 4 17 TT 8 1 9 0.421 1.252 2.404 003563 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 003613 CC 8 1 9 CT 13 4 17 TT 3 18 21 0.421 1.252 2.404 003650 CC 0 0 0 CG 0 4 4 GG 24 19 43 0.000 0.209 0.093 003910 -- 6 0 6 +- 11 1 12 ++ 7 22 29 0.160 0.011 5.074 003933 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 004056 CC 8 1 9 CT 13 4 17 TT 3 18 21 0.421 1.252 2.404 004137 AA 6 22 28 AG 11 1 12 GG 7 0 7 0.160 0.011 6.159 004232 -- 8 1 9 +- 13 4 17 ++ 2 18 20 1.043 1.252 2.147 004390 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 004424 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 004435 CC 8 1 9 CT 11 4 15 TT 3 18 21 0.065 1.252 3.586 004448 CC 20 23 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 004472 AA 8 22 30 AG 8 1 9 GG 6 0 6 1.564 0.011 8.751 004536 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 004559 -- 8 1 9 +- 12 4 16 ++ 4 18 22 0.020 1.252 3.245 004681 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 004683 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 22 45 0.011 0.000 0.006 004686 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 004857 GG 22 22 44 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 004969 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 014663 AA 17 3 20 AG 4 9 13 GG 0 11 11 0.233 0.277 6.464 014666 CC 3 18 21 CT 11 4 15 TT 7 1 8 0.159 1.252 2.816 014886 -- 7 1 8 +- 11 4 15 ++ 3 18 21 0.159 1.252 2.816 014991 AA 17 3 20 AG 4 9 13 GG 0 11 11 0.233 0.277 6.464 015065 CC 9 16 25 CT 11 5 16 TT 1 2 3 1.068 2.200 0.040 015196 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 015329 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 015502 CC 18 3 21 CG 6 9 15 GG 0 11 11 0.490 0.277 5.163 015554 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 015594 -- 8 1 9 +- 12 3 15 ++ 4 17 21 0.020 2.136 3.586 015746 CC 11 16 27 CT 12 5 17 TT 1 2 3 1.059 2.200 0.022 015810 AA 8 1 9 AT 12 4 16 TT 4 18 22 0.020 1.252 3.245 015820 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 015852 AA 18 3 21 AG 6 9 15 GG 0 11 11 0.490 0.277 5.163 016162 AA 1 2 3 AG 12 5 17 GG 11 16 27 1.059 2.200 0.022 016229 -- 4 18 22 +- 12 3 15 ++ 7 1 8 0.087 2.296 3.086 016236 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 016393 AA 4 18 22 AG 12 4 16 GG 8 1 9 0.020 1.252 3.245 016578 AA 10 22 32 AG 9 1 10 GG 5 0 5 1.119 0.011 6.257 016699 CC 11 16 27 CG 12 5 17 GG 1 2 3 1.059 2.200 0.022 016843 CC 21 22 43 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.052 016924 CC 10 15 25 CT 13 5 18 TT 1 2 3 1.630 2.001 0.010 016985 AA 1 2 3 AG 12 5 17 GG 11 15 26 1.059 2.001 0.010 017003 CC 13 15 28 CT 11 5 16 TT 0 2 2 2.121 2.001 0.023 017077 GG 11 15 26 GT 12 5 17 TT 1 2 3 1.059 2.001 0.010 017339 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 20 20 40 0.112 0.000 0.056 017402 AA 21 21 42 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.054 017429 CC 24 20 44 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 017511 GG 7 1 8 GT 13 4 17 TT 4 16 20 0.243 1.037 1.567 017522 AA 4 16 20 AG 12 4 16 GG 8 1 9 0.020 1.037 2.672 017570 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 017612 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 017618 CC 20 18 38 CT 3 5 8 TT 1 0 1 2.617 0.342 0.516 017619 AA 5 0 5 AG 12 1 13 GG 7 22 29 0.001 0.011 2.977 017672 AA 8 1 9 AG 12 4 16 GG 4 18 22 0.020 1.252 3.245 017811 CC 20 18 38 CT 3 5 8 TT 1 0 1 2.617 0.342 0.516 017890 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 027064 AA 7 17 24 AG 5 4 9 GG 6 2 8 3.528 3.584 9.529 027140 CC 18 21 39 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.026 027488 CC 9 13 22 CG 3 0 3 GG 3 1 4 4.116 14.000 12.765 027509 AA 6 2 8 AT 3 0 3 TT 6 11 17 5.400 13.000 16.216 027579 CC 14 13 27 CT 0 0 0 TT 1 0 1 15.000 0.000 28.000 027788 -- 0 10 10 +- 3 9 12 ++ 20 3 23 0.112 0.177 7.866 027850 CC 6 0 6 CT 11 1 12 TT 7 22 29 0.160 0.011 5.074 027951 CC 7 22 29 CG 11 1 12 GG 6 0 6 0.160 0.011 5.074 027975 CC 5 0 5 CT 12 1 13 TT 7 22 29 0.001 0.011 2.977 028009 CC 4 18 22 CT 12 4 16 TT 8 1 9 0.020 1.252 3.245 028047 AA 19 18 37 AC 4 5 9 CC 1 0 1 1.361 0.342 0.253 028058 AA 19 18 37 AT 4 5 9 TT 1 0 1 1.361 0.342 0.253 028481 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 028664 CC 20 18 38 CG 3 5 8 GG 1 0 1 2.617 0.342 0.516 029061 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 029098 AA 20 18 38 AG 3 5 8 GG 1 0 1 2.617 0.342 0.516 029201 -- 5 0 5 +- 10 1 11 ++ 7 22 29 0.153 0.011 4.515 029272 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 029273 AA 0 2 2 AG 11 4 15 GG 13 17 30 2.121 3.584 0.005 029283 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 029372 AA 5 0 5 AT 12 1 13 TT 7 22 29 0.001 0.011 2.977 029411 AA 0 2 2 AT 11 4 15 TT 13 17 30 2.121 3.584 0.005 029484 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 029628 CC 7 22 29 CT 12 1 13 TT 5 0 5 0.001 0.011 2.977 029629 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 029724 AA 1 0 1 AG 3 5 8 GG 20 18 38 2.617 0.342 0.516 029884 AA 5 0 5 AG 12 1 13 GG 7 22 29 0.001 0.011 2.977 029889 -- 7 22 29 +- 12 1 13 ++ 5 0 5 0.001 0.011 2.977 030089 AA 3 18 21 AG 14 4 18 GG 7 1 8 0.960 1.252 1.368 030285 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 044926 CC 24 11 35 CT 0 6 6 TT 0 5 5 0.000 3.711 13.716 044984 CC 24 19 43 CG 0 4 4 GG 0 0 0 0.000 0.209 0.093 045256 AA 5 9 14 AG 12 10 22 GG 7 4 11 0.001 0.175 0.169 045414 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 045502 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 045721 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 24 21 45 0.000 0.048 0.022 045727 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 045737 CC 21 18 39 CG 2 5 7 GG 1 0 1 4.959 0.342 0.919 045929 AA 0 4 4 AG 1 0 1 GG 21 10 31 0.012 14.000 27.438 046040 CC 21 13 34 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.007 046145 AA 4 5 9 AG 12 4 16 GG 6 4 10 0.220 1.887 0.253 046450 CC 0 0 0 CT 2 1 3 TT 22 22 44 0.045 0.011 0.051 046607 CC 5 9 14 CT 13 10 23 TT 6 4 10 0.174 0.175 0.009 046627 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 046687 GG 4 9 13 GT 12 10 22 TT 6 4 10 0.220 0.175 0.014 046780 AA 7 4 11 AG 12 10 22 GG 3 9 12 0.362 0.175 0.021 046817 CC 3 7 10 CG 12 11 23 GG 7 5 12 0.362 0.030 0.026 046939 CC 22 22 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 046941 AA 3 8 11 AG 12 10 22 GG 7 5 12 0.362 0.306 0.021 047034 AA 0 3 3 AG 1 5 6 GG 21 14 35 0.012 3.414 7.801 047055 CC 7 4 11 CT 10 9 19 TT 3 9 12 0.035 0.414 0.377 047085 -- 7 5 12 +- 7 5 12 ++ 8 11 19 2.888 4.868 7.828 047116 -- 7 4 11 +- 12 9 21 ++ 3 9 12 0.362 0.414 0.089 047380 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 047420 AA 5 1 6 AC 10 4 14 CC 9 18 27 0.490 1.252 3.072 047524 CC 2 7 9 CT 11 8 19 TT 11 8 19 0.107 2.112 1.102 047535 -- 7 4 11 +- 12 10 22 ++ 5 9 14 0.001 0.175 0.169 047572 CC 5 9 14 CG 0 0 0 GG 7 4 11 12.000 13.000 25.000 047791 CC 5 9 14 CT 12 10 22 TT 7 4 11 0.001 0.175 0.169 047844 AA 0 0 0 AC 0 2 2 CC 23 19 42 0.000 0.053 0.024 047845 AA 0 3 3 AG 1 5 6 GG 21 13 34 0.012 3.099 7.546 052876 CC 6 7 13 CG 8 9 17 GG 1 6 7 0.600 0.714 0.117 053264 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 14 22 36 0.018 0.000 0.007 053527 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 053564 -- 22 22 44 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 053589 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 054045 AA 21 23 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 054082 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 054092 GG 22 22 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 054173 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 054799 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 055314 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 055426 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 055581 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 055972 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 056009 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 056014 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 056057 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 056229 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 056300 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 056326 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 056331 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 056389 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 056520 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 056630 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 065165 CC 0 3 3 CT 1 6 7 TT 23 14 37 0.011 2.407 6.614 065241 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 065269 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 065339 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 065736 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 065886 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 066224 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 16 14 30 0.062 0.000 0.033 066269 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 16 14 30 0.062 0.000 0.033 066295 AA 2 0 2 AG 3 0 3 GG 18 22 40 5.624 0.000 12.894 066652 CC 22 15 37 CT 2 8 10 TT 0 0 0 0.045 1.019 0.666 066759 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 066886 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 20 43 0.000 0.012 0.006 066971 AA 21 14 35 AG 2 7 9 GG 0 0 0 0.048 0.840 0.571 067700 CC 17 13 30 CT 4 3 7 TT 0 1 1 0.233 1.495 0.527 068179 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 18 17 35 0.124 0.000 0.064 071520 AA 0 0 0 AG 2 6 8 GG 19 14 33 0.053 0.623 0.479 071587 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 071649 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 072206 AA 1 7 8 AG 11 6 17 GG 12 9 21 0.618 4.455 1.780 072331 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 072481 CC 0 0 0 CT 2 7 9 TT 20 15 35 0.050 0.787 0.571 072858 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 073272 CC 0 3 3 CT 1 5 6 TT 22 14 36 0.011 3.414 8.055 073646 AA 4 1 5 AC 11 5 16 CC 7 17 24 0.008 0.571 0.815 073771 GG 20 23 43 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 073773 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 20 23 43 0.012 0.000 0.006 073909 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 21 43 0.045 0.000 0.023 073913 AA 0 1 1 AG 0 1 1 GG 24 19 43 0.000 8.629 19.316 073947 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 21 44 0.011 0.000 0.006 073975 -- 22 21 43 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.045 0.000 0.023 074095 AA 4 1 5 AG 12 4 16 GG 8 16 24 0.020 1.037 0.815 087993 AA 9 7 16 AG 13 5 18 GG 2 8 10 0.813 4.975 1.217 088395 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 088658 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 088747 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 088876 CC 13 23 36 CT 8 0 8 TT 3 0 3 0.897 0.000 5.074 089226 CC 21 16 37 CG 2 7 9 GG 0 0 0 0.048 0.741 0.541 089242 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 089252 AA 13 10 23 AG 9 6 15 GG 1 7 8 0.130 5.064 3.359 089437 GG 23 22 45 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 089626 CC 1 7 8 CG 9 6 15 GG 14 10 24 0.091 5.064 3.633 089972 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 093333 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 093684 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 093878 CC 13 22 35 CT 7 0 7 TT 4 0 4 2.476 0.000 9.004 093975 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 094100 CC 23 18 41 CT 1 4 5 TT 0 1 1 0.011 1.252 2.448 094114 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 094191 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 094219 CC 24 11 35 CT 0 6 6 TT 0 6 6 0.000 4.707 16.234 094220 AA 3 0 3 AG 6 0 6 GG 15 23 38 2.667 0.000 8.563 094445 AA 4 3 7 AG 12 8 20 GG 8 12 20 0.020 0.733 0.289 094635 AA 4 0 4 AG 7 0 7 GG 13 22 35 2.476 0.000 9.004 094693 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 094938 CC 4 3 7 CG 12 8 20 GG 8 12 20 0.020 0.733 0.289 095048 CC 3 3 6 CT 12 8 20 TT 8 11 19 0.209 0.577 0.041 095175 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 22 42 0.112 0.000 0.054 095297 AA 0 1 1 AG 1 4 5 GG 23 18 41 0.011 1.252 2.448 095431 AA 0 3 3 AG 1 6 7 GG 21 14 35 0.012 2.407 6.181 095654 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 22 44 0.000 0.011 0.006 095704 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 095759 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 095760 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 095871 AA 19 15 34 AG 3 8 11 GG 1 0 1 2.457 1.019 0.010 095948 GG 7 10 17 GT 15 6 21 TT 1 7 8 3.673 5.064 0.118 096317 AA 2 7 9 AG 10 6 16 GG 8 8 16 0.196 3.834 1.576 105391 -- 4 0 4 +- 6 0 6 ++ 13 21 34 3.390 0.000 10.579 105468 AA 2 6 8 AG 10 5 15 GG 11 10 21 0.017 5.374 2.816 105660 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 105906 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 23 44 0.107 0.000 0.051 106154 GG 0 3 3 GT 1 6 7 TT 23 14 37 0.011 2.407 6.614 106461 CC 6 12 18 CT 12 8 20 TT 6 3 9 0.000 0.733 0.638 106487 CC 6 12 18 CT 12 9 21 TT 6 2 8 0.000 0.028 0.193 106570 AA 14 23 37 AG 6 0 6 GG 4 0 4 3.744 0.000 11.583 106714 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 106823 CC 23 14 37 CT 1 6 7 TT 0 3 3 0.011 2.407 6.614 107199 AA 23 14 37 AG 1 6 7 GG 0 3 3 0.011 2.407 6.614 107476 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 107599 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 108026 AA 22 23 45 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 108154 AA 6 4 10 AT 6 7 13 TT 11 12 23 4.707 2.175 6.844 113294 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 21 42 0.048 0.000 0.024 113880 CC 20 22 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.054 113946 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 113985 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 114066 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 114142 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 114610 CC 22 21 43 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.052 114826 CC 19 22 41 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.013 0.000 0.006 114932 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 115006 CC 21 22 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 115152 CC 21 21 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 115211 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 21 21 42 0.048 0.000 0.024 115412 AA 0 0 0 AG 5 8 13 GG 18 14 32 0.342 1.086 1.283 115812 CC 4 0 4 CT 8 0 8 TT 12 21 33 1.500 0.000 6.911 115980 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 22 21 43 0.045 0.000 0.023 121455 AA 2 0 2 AG 10 0 10 GG 12 21 33 0.002 0.000 1.069 121613 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 121873 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 122017 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 21 23 44 0.012 0.000 0.006 122209 AA 4 8 12 AT 11 7 18 TT 9 8 17 0.042 3.522 2.385 122234 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 122254 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 122344 AA 21 23 44 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 122500 AA 4 8 12 AG 11 6 17 GG 8 8 16 0.004 4.545 2.558 122556 GG 0 0 0 GT 6 0 6 TT 17 22 39 0.517 0.000 0.230 122629 CC 23 21 44 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 122771 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 21 20 41 0.048 0.000 0.024 123041 CC 4 0 4 CT 8 0 8 TT 11 20 31 1.252 0.000 6.397 123079 AA 20 20 40 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 123951 AA 18 19 37 AT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.242 123960 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 21 43 0.045 0.000 0.023 124224 AA 14 21 35 AC 7 0 7 CC 3 0 3 1.642 0.000 6.181 124276 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 21 43 0.045 0.000 0.023 124288 AA 24 20 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 124397 CC 21 14 35 CG 1 5 6 GG 0 3 3 0.012 3.414 7.801 124575 CC 14 22 36 CT 7 0 7 TT 2 0 2 0.616 0.000 3.404 124627 CC 0 0 0 CG 1 3 4 GG 22 19 41 0.011 0.118 0.097 124645 AA 0 0 0 AG 0 7 7 GG 23 15 38 0.000 0.787 0.320 124693 AA 11 7 18 AC 10 6 16 CC 2 8 10 0.017 3.834 2.703 136979 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 20 40 0.112 0.000 0.056 137160 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 23 17 40 0.000 0.131 0.056 137434 CC 24 21 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 137472 GG 23 22 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 138097 CC 23 21 44 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 138122 AA 20 23 43 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.112 0.000 0.052 138537 AA 0 0 0 AC 0 7 7 CC 24 16 40 0.000 0.741 0.304 138680 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 138682 AA 3 0 3 AG 7 0 7 GG 14 23 37 1.642 0.000 6.614 139156 AA 18 12 30 AG 0 6 6 GG 0 2 2 0.000 0.800 3.630 139724 CC 0 3 3 CT 1 7 8 TT 23 13 36 0.011 1.431 5.074 140421 AA 0 0 0 AG 0 7 7 GG 23 10 33 0.000 1.143 0.368 140539 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 140889 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 140993 AA 24 16 40 AG 0 7 7 GG 0 0 0 0.000 0.741 0.304 141128 AA 23 20 43 AT 1 3 4 TT 0 0 0 0.011 0.112 0.093 141275 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 141329 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 141409 AA 21 20 41 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.024 141684 AA 0 0 0 AC 1 3 4 CC 22 17 39 0.011 0.131 0.102 141723 AA 23 20 43 AG 1 3 4 GG 0 0 0 0.011 0.112 0.093 141873 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 141925 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 141991 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 142008 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 142135 CC 24 20 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 142168 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 142239 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 142262 GG 0 0 0 GT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 142332 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 142402 CC 24 15 39 CT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.149 0.058 142473 AA 24 16 40 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.062 0.025 142486 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 18 40 0.045 0.000 0.025 155006 CC 12 21 33 CG 8 0 8 GG 4 0 4 1.500 0.000 6.911 155036 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 155180 AA 0 1 1 AG 0 5 5 GG 24 16 40 0.000 0.499 2.368 155242 AA 5 20 25 AG 13 3 16 GG 6 0 6 0.174 0.112 1.629 155489 CC 23 14 37 CG 1 6 7 GG 0 3 3 0.011 2.407 6.614 155520 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 155879 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 155925 CC 0 0 0 CT 0 7 7 TT 24 16 40 0.000 0.741 0.304 156285 CC 21 22 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 156329 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 156377 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 156482 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 18 23 41 0.014 0.000 0.006 156747 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 156761 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 23 20 43 0.011 0.112 0.093 156812 AA 0 0 0 AG 0 7 7 GG 23 16 39 0.000 0.741 0.312 156976 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 157201 AA 3 0 3 AG 7 0 7 GG 14 23 37 1.642 0.000 6.614 157223 CC 0 0 0 CT 0 7 7 TT 24 16 40 0.000 0.741 0.304 157573 AA 0 0 0 AT 0 7 7 TT 18 16 34 0.000 0.741 0.357 158092 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 158227 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 14 37 0.000 0.071 0.027 158282 CC 0 0 0 CG 0 6 6 GG 23 10 33 0.000 0.852 0.271 158363 CC 13 16 29 CT 6 0 6 TT 3 0 3 2.148 0.000 6.271 165748 CC 23 20 43 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 165974 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 166207 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 166576 AA 0 0 0 AG 0 8 8 GG 24 15 39 0.000 1.019 0.407 166864 CC 0 3 3 CT 1 7 8 TT 23 13 36 0.011 1.431 5.074 167431 CC 3 0 3 CT 7 0 7 TT 14 23 37 1.642 0.000 6.614 167785 GG 18 20 38 GT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.236 167792 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 20 43 0.011 0.000 0.006 167852 CC 23 18 41 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.055 0.055 169811 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 22 18 40 0.011 0.124 0.100 169849 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 170006 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 170304 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 22 42 0.050 0.000 0.024 170383 AA 1 6 7 AT 9 6 15 TT 11 9 20 0.247 3.646 1.853 170503 CC 15 21 36 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.583 0.000 0.249 170720 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 20 20 40 0.012 0.000 0.006 170947 AA 20 16 36 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.016 0.007 171220 GG 21 20 41 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 171265 CC 22 16 38 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.007 171278 CC 22 12 34 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.083 0.066 171352 -- 0 3 3 +- 8 3 11 ++ 16 8 24 0.960 3.624 1.053 171437 AA 0 10 10 AG 6 1 7 GG 18 3 21 0.490 9.175 13.584 171498 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 14 37 0.011 0.000 0.007 171654 CC 20 11 31 CT 4 5 9 TT 0 7 7 0.198 6.999 10.916 171701 AA 21 23 44 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 171741 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 172009 AA 13 13 26 AG 11 10 21 GG 0 0 0 2.121 1.775 3.889 177417 CC 12 19 31 CT 9 3 12 TT 1 1 2 0.182 2.457 0.347 177428 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 177654 GG 22 17 39 GT 0 6 6 TT 0 0 0 0.000 0.517 0.230 177842 CC 16 15 31 CT 7 8 15 TT 1 0 1 0.044 1.019 0.280 177873 AA 4 3 7 AG 7 8 15 GG 13 12 25 2.476 0.733 2.984 177885 CC 1 0 1 CT 5 0 5 TT 18 23 41 0.644 0.000 2.448 178135 CC 13 19 32 CG 9 3 12 GG 2 1 3 0.061 2.457 1.447 178248 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 178306 CC 21 12 33 CG 3 8 11 GG 0 3 3 0.107 0.733 2.074 178793 AA 15 15 30 AG 8 7 15 GG 1 0 1 0.003 0.787 0.312 179143 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 187144 GG 23 21 44 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 187507 CC 1 0 1 CG 5 0 5 GG 18 23 41 0.644 0.000 2.448 187600 AA 0 1 1 AG 4 12 16 GG 20 10 30 0.198 1.239 0.465 188226 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 188336 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 188536 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 19 21 40 0.209 0.000 0.100 189116 CC 23 22 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 189229 CC 20 19 39 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.050 0.053 0.102 189600 AA 0 0 0 AC 4 11 15 CC 18 7 25 0.220 3.485 2.130 190216 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 190238 AA 20 6 26 AG 4 14 18 GG 0 1 1 0.198 3.590 1.111 190331 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 190449 AA 19 6 25 AT 4 15 19 TT 0 1 1 0.209 4.219 1.460 190471 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 20 22 42 0.112 0.000 0.054 190557 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 21 43 0.011 0.000 0.006 190655 CC 0 0 0 CG 4 11 15 GG 19 5 24 0.209 4.390 2.211 191112 -- 7 4 11 +- 7 11 18 ++ 10 6 16 3.984 0.069 1.624 191115 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 18 42 0.000 0.124 0.054 191267 AA 4 6 10 AG 8 11 19 GG 12 4 16 1.500 0.069 0.885 191275 GG 10 6 16 GT 7 11 18 TT 7 4 11 3.984 0.069 1.624 191719 GG 24 20 44 GT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.112 0.051 192107 CC 6 3 9 CT 6 9 15 TT 10 7 17 4.180 0.001 2.348 192291 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 192614 CC 21 19 40 CG 3 3 6 GG 0 0 0 0.107 0.118 0.224 192642 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 193279 AA 9 7 16 AG 8 11 19 GG 6 5 11 1.965 0.030 1.238 193319 CC 6 5 11 CT 8 11 19 TT 9 7 16 1.965 0.030 1.238 193448 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 193649 CC 12 6 18 CT 7 10 17 TT 5 7 12 3.153 0.381 3.291 193772 CC 10 8 18 CT 7 10 17 TT 7 5 12 3.984 0.306 3.291 195085 AA 22 19 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 195434 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003910: g 004232: C 004559: CTCATCCCTCCCTGA 014886: taa 015594: t 016229: t 017339: t 027788: TTATA 029201: a 029889: ttcta 047085: taaa 047116: t 047535: actta 053564: a 055972: aatt 073975: a 105391: tct 140539: c 171352: a 191112: ag