Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000042 C 0.56 0.14 0.36 T 0.44 0.86 0.64 0.49 0.24 0.46 000462 A 0.58 0.16 0.38 T 0.42 0.84 0.62 0.49 0.27 0.47 000628 T 0.57 0.15 0.36 C 0.43 0.85 0.64 0.49 0.26 0.46 001143 T 0.48 0.23 0.36 G 0.52 0.77 0.64 0.50 0.35 0.46 001212 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001223 T 0.48 0.16 0.32 C 0.52 0.84 0.68 0.50 0.27 0.44 001307 T 0.48 0.13 0.31 C 0.52 0.87 0.69 0.50 0.23 0.43 001471 G 0.44 0.11 0.28 A 0.56 0.89 0.72 0.49 0.19 0.40 001511 T 0.06 0.09 0.07 C 0.94 0.91 0.93 0.12 0.16 0.14 001543 A 0.44 0.02 0.23 G 0.56 0.98 0.77 0.49 0.04 0.36 001555 T 0.48 0.11 0.30 C 0.52 0.89 0.70 0.50 0.19 0.42 001556 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001714 C 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 002005 C 0.17 0.70 0.43 T 0.83 0.30 0.57 0.28 0.42 0.49 002065 G 0.08 0.65 0.36 A 0.92 0.35 0.64 0.15 0.45 0.46 002293 G 0.58 0.35 0.47 A 0.42 0.65 0.53 0.49 0.45 0.50 002317 C 0.58 0.30 0.45 A 0.42 0.70 0.55 0.49 0.42 0.49 002334 G 0.58 0.30 0.45 C 0.42 0.70 0.55 0.49 0.42 0.49 002404 A 0.06 0.63 0.34 G 0.94 0.37 0.66 0.12 0.47 0.45 002414 T 0.56 0.30 0.44 G 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 002459 G 0.56 0.30 0.44 A 0.44 0.70 0.56 0.49 0.42 0.49 002538 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002622 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002948 A 0.42 0.30 0.36 G 0.58 0.70 0.64 0.49 0.42 0.46 003037 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003342 C 0.25 0.20 0.22 T 0.75 0.80 0.78 0.38 0.31 0.35 003407 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003538 T 0.60 0.13 0.37 G 0.40 0.87 0.63 0.48 0.23 0.47 003563 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003613 C 0.60 0.13 0.37 T 0.40 0.87 0.63 0.48 0.23 0.47 003650 C 0.00 0.09 0.04 G 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 003910 - 0.48 0.02 0.26 + 0.52 0.98 0.74 0.50 0.04 0.38 003933 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004056 C 0.60 0.13 0.37 T 0.40 0.87 0.63 0.48 0.23 0.47 004137 G 0.52 0.02 0.28 A 0.48 0.98 0.72 0.50 0.04 0.40 004232 - 0.63 0.13 0.38 + 0.37 0.87 0.62 0.47 0.23 0.47 004390 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004424 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004435 C 0.61 0.13 0.37 T 0.39 0.87 0.63 0.47 0.23 0.46 004448 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 004472 G 0.45 0.02 0.23 A 0.55 0.98 0.77 0.50 0.04 0.36 004536 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004559 - 0.58 0.13 0.36 + 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 004681 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004683 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004686 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004857 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004969 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014663 G 0.10 0.67 0.40 A 0.90 0.33 0.60 0.17 0.44 0.48 014666 T 0.60 0.13 0.35 C 0.40 0.87 0.65 0.48 0.23 0.46 014886 - 0.60 0.13 0.35 + 0.40 0.87 0.65 0.48 0.23 0.46 014991 G 0.10 0.67 0.40 A 0.90 0.33 0.60 0.17 0.44 0.48 015065 T 0.31 0.20 0.25 C 0.69 0.80 0.75 0.43 0.31 0.38 015196 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015329 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015502 G 0.12 0.67 0.39 C 0.88 0.33 0.61 0.22 0.44 0.48 015554 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015594 - 0.58 0.12 0.37 + 0.42 0.88 0.63 0.49 0.21 0.46 015746 T 0.29 0.20 0.24 C 0.71 0.80 0.76 0.41 0.31 0.37 015810 A 0.58 0.13 0.36 T 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 015820 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015852 G 0.12 0.67 0.39 A 0.88 0.33 0.61 0.22 0.44 0.48 016162 A 0.29 0.20 0.24 G 0.71 0.80 0.76 0.41 0.31 0.37 016229 + 0.57 0.11 0.34 - 0.43 0.89 0.66 0.49 0.20 0.45 016236 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016393 G 0.58 0.13 0.36 A 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 016578 G 0.40 0.02 0.21 A 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 016699 G 0.29 0.20 0.24 C 0.71 0.80 0.76 0.41 0.31 0.37 016843 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 016924 T 0.31 0.20 0.26 C 0.69 0.80 0.74 0.43 0.33 0.39 016985 A 0.29 0.20 0.25 G 0.71 0.80 0.75 0.41 0.33 0.38 017003 T 0.23 0.20 0.22 C 0.77 0.80 0.78 0.35 0.33 0.34 017077 T 0.29 0.20 0.25 G 0.71 0.80 0.75 0.41 0.33 0.38 017339 - 0.07 0.00 0.03 + 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 017402 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 017429 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 017511 G 0.56 0.14 0.37 T 0.44 0.86 0.63 0.49 0.24 0.46 017522 G 0.58 0.14 0.38 A 0.42 0.86 0.62 0.49 0.24 0.47 017570 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017612 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017618 T 0.10 0.11 0.11 C 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 017619 A 0.46 0.02 0.24 G 0.54 0.98 0.76 0.50 0.04 0.37 017672 A 0.58 0.13 0.36 G 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 017811 T 0.10 0.11 0.11 C 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 017890 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027064 G 0.47 0.17 0.30 A 0.53 0.83 0.70 0.50 0.29 0.42 027140 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.05 027488 G 0.30 0.07 0.19 C 0.70 0.93 0.81 0.42 0.13 0.31 027509 A 0.50 0.15 0.34 T 0.50 0.85 0.66 0.50 0.26 0.45 027579 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.12 0.00 0.07 027788 - 0.07 0.66 0.36 + 0.93 0.34 0.64 0.12 0.45 0.46 027850 C 0.48 0.02 0.26 T 0.52 0.98 0.74 0.50 0.04 0.38 027951 G 0.48 0.02 0.26 C 0.52 0.98 0.74 0.50 0.04 0.38 027975 C 0.46 0.02 0.24 T 0.54 0.98 0.76 0.50 0.04 0.37 028009 T 0.58 0.13 0.36 C 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 028047 C 0.12 0.11 0.12 A 0.88 0.89 0.88 0.22 0.19 0.21 028058 T 0.12 0.11 0.12 A 0.88 0.89 0.88 0.22 0.19 0.21 028481 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028664 G 0.10 0.11 0.11 C 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 029061 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029098 G 0.10 0.11 0.11 A 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 029201 - 0.45 0.02 0.23 + 0.55 0.98 0.77 0.50 0.04 0.36 029272 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 029273 A 0.23 0.17 0.20 G 0.77 0.83 0.80 0.35 0.29 0.32 029283 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029372 A 0.46 0.02 0.24 T 0.54 0.98 0.76 0.50 0.04 0.37 029411 A 0.23 0.17 0.20 T 0.77 0.83 0.80 0.35 0.29 0.32 029484 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029628 T 0.46 0.02 0.24 C 0.54 0.98 0.76 0.50 0.04 0.37 029629 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029724 A 0.10 0.11 0.11 G 0.90 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 029884 A 0.46 0.02 0.24 G 0.54 0.98 0.76 0.50 0.04 0.37 029889 + 0.46 0.02 0.24 - 0.54 0.98 0.76 0.50 0.04 0.37 030089 G 0.58 0.13 0.36 A 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 030285 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 044926 T 0.00 0.36 0.17 C 1.00 0.64 0.83 0.00 0.46 0.29 044984 G 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 045256 G 0.54 0.39 0.47 A 0.46 0.61 0.53 0.50 0.48 0.50 045414 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 045502 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 045721 C 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 045727 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 045737 G 0.08 0.11 0.10 C 0.92 0.89 0.90 0.15 0.19 0.17 045929 A 0.02 0.29 0.12 G 0.98 0.71 0.88 0.04 0.41 0.22 046040 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 046145 A 0.45 0.54 0.49 G 0.55 0.46 0.51 0.50 0.50 0.50 046450 C 0.04 0.02 0.03 T 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 046607 T 0.52 0.39 0.46 C 0.48 0.61 0.54 0.50 0.48 0.50 046627 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 046687 T 0.55 0.39 0.47 G 0.45 0.61 0.53 0.50 0.48 0.50 046780 A 0.59 0.39 0.49 G 0.41 0.61 0.51 0.48 0.48 0.50 046817 C 0.41 0.54 0.48 G 0.59 0.46 0.52 0.48 0.50 0.50 046939 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 046941 A 0.41 0.57 0.49 G 0.59 0.43 0.51 0.48 0.49 0.50 047034 A 0.02 0.25 0.14 G 0.98 0.75 0.86 0.04 0.38 0.24 047055 C 0.60 0.39 0.49 T 0.40 0.61 0.51 0.48 0.47 0.50 047085 - 0.48 0.36 0.42 + 0.52 0.64 0.58 0.50 0.46 0.49 047116 - 0.59 0.39 0.49 + 0.41 0.61 0.51 0.48 0.47 0.50 047380 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047420 A 0.42 0.13 0.28 C 0.58 0.87 0.72 0.49 0.23 0.40 047524 C 0.31 0.48 0.39 T 0.69 0.52 0.61 0.43 0.50 0.48 047535 - 0.54 0.39 0.47 + 0.46 0.61 0.53 0.50 0.48 0.50 047572 G 0.58 0.31 0.44 C 0.42 0.69 0.56 0.49 0.43 0.49 047791 T 0.54 0.39 0.47 C 0.46 0.61 0.53 0.50 0.48 0.50 047844 A 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 047845 A 0.02 0.26 0.14 G 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 052876 G 0.33 0.48 0.42 C 0.67 0.52 0.58 0.44 0.50 0.49 053264 A 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 053527 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 053564 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 053589 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054045 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 054082 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054092 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054173 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054799 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 055314 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 055426 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 055581 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 055972 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056009 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056014 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056057 G 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 056229 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056300 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056326 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056331 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056389 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056520 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056630 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065165 C 0.02 0.26 0.14 T 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 065241 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 065269 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065339 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065736 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065886 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 066224 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.06 066269 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.06 066295 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 066652 T 0.04 0.17 0.11 C 0.96 0.83 0.89 0.08 0.29 0.19 066759 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 066886 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 066971 G 0.04 0.17 0.10 A 0.96 0.83 0.90 0.08 0.28 0.18 067700 T 0.10 0.15 0.12 C 0.90 0.85 0.88 0.17 0.25 0.21 068179 A 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.08 071520 A 0.05 0.15 0.10 G 0.95 0.85 0.90 0.09 0.26 0.18 071587 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 071649 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 072206 A 0.27 0.45 0.36 G 0.73 0.55 0.64 0.39 0.50 0.46 072331 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 072481 C 0.05 0.16 0.10 T 0.95 0.84 0.90 0.09 0.27 0.18 072858 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 073272 C 0.02 0.25 0.13 T 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 073646 A 0.43 0.15 0.29 C 0.57 0.85 0.71 0.49 0.26 0.41 073771 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 073773 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 073909 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 073913 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 073947 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 073975 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 074095 A 0.42 0.14 0.29 G 0.58 0.86 0.71 0.49 0.24 0.41 087993 G 0.35 0.53 0.43 A 0.65 0.47 0.57 0.46 0.50 0.49 088395 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 088658 C 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 088747 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 088876 T 0.29 0.00 0.15 C 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 089226 G 0.04 0.15 0.10 C 0.96 0.85 0.90 0.08 0.26 0.18 089242 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 089252 G 0.24 0.43 0.34 A 0.76 0.57 0.66 0.36 0.49 0.45 089437 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 089626 C 0.23 0.43 0.33 G 0.77 0.57 0.67 0.35 0.49 0.44 089972 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 093333 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 093684 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 093878 T 0.31 0.00 0.16 C 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 093975 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 094100 T 0.02 0.13 0.07 C 0.98 0.87 0.93 0.04 0.23 0.14 094114 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 094191 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 094219 T 0.00 0.39 0.19 C 1.00 0.61 0.81 0.00 0.48 0.31 094220 A 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 094445 A 0.42 0.30 0.36 G 0.58 0.70 0.64 0.49 0.42 0.46 094635 A 0.31 0.00 0.16 G 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 094693 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 094938 C 0.42 0.30 0.36 G 0.58 0.70 0.64 0.49 0.42 0.46 095048 C 0.39 0.32 0.36 T 0.61 0.68 0.64 0.48 0.43 0.46 095175 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 095297 A 0.02 0.13 0.07 G 0.98 0.87 0.93 0.04 0.23 0.14 095431 A 0.02 0.26 0.14 G 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.25 095654 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 095704 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095759 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095760 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095871 G 0.11 0.17 0.14 A 0.89 0.83 0.86 0.19 0.29 0.24 095948 T 0.37 0.43 0.40 G 0.63 0.57 0.60 0.47 0.49 0.48 096317 A 0.35 0.48 0.41 G 0.65 0.52 0.59 0.45 0.50 0.49 105391 - 0.30 0.00 0.16 + 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.27 105468 A 0.30 0.40 0.35 G 0.70 0.60 0.65 0.42 0.48 0.46 105660 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 105906 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 106154 G 0.02 0.26 0.14 T 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 106461 T 0.50 0.30 0.40 C 0.50 0.70 0.60 0.50 0.42 0.48 106487 T 0.50 0.28 0.39 C 0.50 0.72 0.61 0.50 0.41 0.48 106570 G 0.29 0.00 0.15 A 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 106714 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 106823 T 0.02 0.26 0.14 C 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 107199 G 0.02 0.26 0.14 A 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 107476 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 107599 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 108026 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 108154 A 0.39 0.33 0.36 T 0.61 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 113294 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 113880 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 113946 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 113985 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 114066 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 114142 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 114610 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 114826 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 114932 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 115006 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 115152 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 115211 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 115412 A 0.11 0.18 0.14 G 0.89 0.82 0.86 0.19 0.30 0.25 115812 C 0.33 0.00 0.18 T 0.67 1.00 0.82 0.44 0.00 0.29 115980 G 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 121455 A 0.29 0.00 0.16 G 0.71 1.00 0.84 0.41 0.00 0.26 121613 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 121873 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 122017 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 122209 A 0.40 0.50 0.45 T 0.60 0.50 0.55 0.48 0.50 0.49 122234 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 122254 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 122344 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 122500 A 0.41 0.50 0.46 G 0.59 0.50 0.54 0.48 0.50 0.50 122556 G 0.13 0.00 0.07 T 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 122629 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 122771 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 123041 C 0.35 0.00 0.19 T 0.65 1.00 0.81 0.45 0.00 0.30 123079 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 123951 T 0.12 0.00 0.07 A 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.13 123960 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 124224 C 0.27 0.00 0.14 A 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.25 124276 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 124288 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 124397 G 0.02 0.25 0.14 C 0.98 0.75 0.86 0.04 0.38 0.24 124575 T 0.24 0.00 0.12 C 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 124627 C 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 124645 A 0.00 0.16 0.08 G 1.00 0.84 0.92 0.00 0.27 0.14 124693 C 0.30 0.52 0.41 A 0.70 0.48 0.59 0.42 0.50 0.48 136979 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 137160 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.14 0.07 137434 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 137472 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 138097 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 138122 C 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 138537 A 0.00 0.15 0.07 C 1.00 0.85 0.93 0.00 0.26 0.14 138680 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 138682 A 0.27 0.00 0.14 G 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 139156 G 0.00 0.25 0.13 A 1.00 0.75 0.87 0.00 0.38 0.23 139724 C 0.02 0.28 0.15 T 0.98 0.72 0.85 0.04 0.41 0.25 140421 A 0.00 0.21 0.09 G 1.00 0.79 0.91 0.00 0.33 0.16 140539 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 140889 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 140993 G 0.00 0.15 0.07 A 1.00 0.85 0.93 0.00 0.26 0.14 141128 T 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 141275 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 141329 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 141409 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 141684 A 0.02 0.07 0.05 C 0.98 0.93 0.95 0.04 0.14 0.09 141723 G 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 141873 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 141925 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 141991 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 142008 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 142135 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 142168 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 142239 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 142262 G 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 142332 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 142402 T 0.00 0.08 0.04 C 1.00 0.92 0.96 0.00 0.15 0.07 142473 G 0.00 0.06 0.02 A 1.00 0.94 0.98 0.00 0.10 0.05 142486 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 155006 G 0.33 0.00 0.18 C 0.67 1.00 0.82 0.44 0.00 0.29 155036 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 155180 A 0.00 0.16 0.08 G 1.00 0.84 0.92 0.00 0.27 0.14 155242 G 0.52 0.07 0.30 A 0.48 0.93 0.70 0.50 0.12 0.42 155489 G 0.02 0.26 0.14 C 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 155520 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 155879 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 155925 C 0.00 0.15 0.07 T 1.00 0.85 0.93 0.00 0.26 0.14 156285 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 156329 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 156377 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 156482 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 156747 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 156761 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 156812 A 0.00 0.15 0.08 G 1.00 0.85 0.92 0.00 0.26 0.14 156976 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 157201 A 0.27 0.00 0.14 G 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 157223 C 0.00 0.15 0.07 T 1.00 0.85 0.93 0.00 0.26 0.14 157573 A 0.00 0.15 0.09 T 1.00 0.85 0.91 0.00 0.26 0.16 158092 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 158227 A 0.00 0.06 0.03 G 1.00 0.94 0.97 0.00 0.12 0.05 158282 C 0.00 0.19 0.08 G 1.00 0.81 0.92 0.00 0.30 0.14 158363 T 0.27 0.00 0.16 C 0.73 1.00 0.84 0.40 0.00 0.27 165748 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 165974 C 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 166207 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 166576 A 0.00 0.17 0.09 G 1.00 0.83 0.91 0.00 0.29 0.16 166864 C 0.02 0.28 0.15 T 0.98 0.72 0.85 0.04 0.41 0.25 167431 C 0.27 0.00 0.14 T 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 167785 T 0.12 0.00 0.07 G 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.13 167792 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 167852 T 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.10 0.07 169811 A 0.02 0.07 0.05 G 0.98 0.93 0.95 0.04 0.13 0.09 169849 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 170006 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 170304 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 170383 A 0.26 0.43 0.35 T 0.74 0.57 0.65 0.39 0.49 0.45 170503 T 0.14 0.00 0.07 C 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 170720 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 170947 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 171220 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 171265 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 171278 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 171352 - 0.17 0.32 0.22 + 0.83 0.68 0.78 0.28 0.44 0.35 171437 A 0.12 0.75 0.36 G 0.88 0.25 0.64 0.22 0.38 0.46 171498 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 171654 T 0.08 0.41 0.24 C 0.92 0.59 0.76 0.15 0.48 0.37 171701 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 171741 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 172009 G 0.23 0.22 0.22 A 0.77 0.78 0.78 0.35 0.34 0.35 177417 T 0.25 0.11 0.18 C 0.75 0.89 0.82 0.38 0.19 0.29 177428 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 177654 T 0.00 0.13 0.07 G 1.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.12 177842 T 0.19 0.17 0.18 C 0.81 0.83 0.82 0.30 0.29 0.30 177873 A 0.31 0.30 0.31 G 0.69 0.70 0.69 0.43 0.42 0.43 177885 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 178135 G 0.27 0.11 0.19 C 0.73 0.89 0.81 0.39 0.19 0.31 178248 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 178306 G 0.06 0.30 0.18 C 0.94 0.70 0.82 0.12 0.42 0.30 178793 G 0.21 0.16 0.18 A 0.79 0.84 0.82 0.33 0.27 0.30 179143 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 187144 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 187507 C 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 187600 A 0.08 0.30 0.19 G 0.92 0.70 0.81 0.15 0.42 0.31 188226 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 188336 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 188536 A 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 189116 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 189229 T 0.05 0.05 0.05 C 0.95 0.95 0.95 0.09 0.09 0.09 189600 A 0.09 0.31 0.19 C 0.91 0.69 0.81 0.17 0.42 0.30 190216 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 190238 G 0.08 0.38 0.22 A 0.92 0.62 0.78 0.15 0.47 0.35 190331 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 190449 T 0.09 0.39 0.23 A 0.91 0.61 0.77 0.16 0.47 0.36 190471 A 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 190557 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 190655 C 0.09 0.34 0.19 G 0.91 0.66 0.81 0.16 0.45 0.31 191112 - 0.44 0.45 0.44 + 0.56 0.55 0.56 0.49 0.50 0.49 191115 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 191267 A 0.33 0.55 0.43 G 0.67 0.45 0.57 0.44 0.50 0.49 191275 T 0.44 0.45 0.44 G 0.56 0.55 0.56 0.49 0.50 0.49 191719 T 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 192107 C 0.41 0.39 0.40 T 0.59 0.61 0.60 0.48 0.48 0.48 192291 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 192614 G 0.06 0.07 0.07 C 0.94 0.93 0.93 0.12 0.13 0.12 192642 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 193279 G 0.43 0.46 0.45 A 0.57 0.54 0.55 0.49 0.50 0.49 193319 C 0.43 0.46 0.45 T 0.57 0.54 0.55 0.49 0.50 0.49 193448 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 193649 T 0.35 0.52 0.44 C 0.65 0.48 0.56 0.46 0.50 0.49 193772 T 0.44 0.43 0.44 C 0.56 0.57 0.56 0.49 0.49 0.49 195085 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 195434 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003910: g 004232: C 004559: CTCATCCCTCCCTGA 014886: taa 015594: t 016229: t 017339: t 027788: TTATA 029201: a 029889: ttcta 047085: taaa 047116: t 047535: actta 053564: a 055972: aatt 073975: a 105391: tct 140539: c 171352: a 191112: ag