Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000938 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000954 T 0.14 0.31 0.22 C 0.86 0.69 0.78 0.24 0.43 0.34 001047 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001152 A 0.29 0.11 0.19 G 0.71 0.89 0.81 0.41 0.19 0.31 001258 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001555 A 0.11 0.11 0.11 G 0.89 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 001690 C 0.37 0.43 0.40 G 0.63 0.57 0.60 0.47 0.49 0.48 001888 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001974 G 0.12 0.09 0.11 C 0.88 0.91 0.89 0.22 0.16 0.19 002154 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002157 G 0.21 0.07 0.14 A 0.79 0.93 0.86 0.33 0.12 0.24 002328 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 002425 C 0.18 0.05 0.11 G 0.82 0.95 0.89 0.30 0.09 0.20 002570 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 003058 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003068 C 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 003117 G 0.24 0.07 0.15 A 0.76 0.93 0.85 0.36 0.12 0.26 003150 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 003233 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 003243 G 0.11 0.04 0.07 A 0.89 0.96 0.93 0.19 0.08 0.13 003346 T 0.17 0.05 0.11 C 0.83 0.95 0.89 0.28 0.09 0.19 003349 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 003374 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003927 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004136 A 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004152 T 0.06 0.02 0.04 C 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 004160 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004781 C 0.16 0.05 0.11 G 0.84 0.95 0.89 0.27 0.10 0.19 004973 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.05 005391 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 006317 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 006406 G 0.17 0.35 0.27 A 0.82 0.65 0.73 0.29 0.45 0.39 006656 G 0.07 0.02 0.05 A 0.93 0.98 0.95 0.14 0.04 0.09 006750 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006795 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006865 T 0.09 0.02 0.05 C 0.91 0.98 0.95 0.16 0.04 0.10 008008 A 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 008012 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 008308 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 008367 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008390 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 008417 T 0.21 0.09 0.15 A 0.79 0.91 0.85 0.33 0.16 0.25 008486 G 0.10 0.33 0.21 A 0.90 0.67 0.79 0.19 0.44 0.33 008501 A 0.35 0.15 0.26 G 0.65 0.85 0.74 0.46 0.26 0.38 008588 C 0.15 0.33 0.23 T 0.85 0.67 0.77 0.25 0.44 0.36 008659 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009116 A 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009170 T 0.09 0.30 0.20 C 0.91 0.70 0.80 0.16 0.42 0.31 009172 T 0.18 0.09 0.13 C 0.82 0.91 0.87 0.30 0.16 0.23 009180 T 0.23 0.54 0.39 C 0.77 0.46 0.61 0.35 0.50 0.48 009271 G 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 009274 A 0.27 0.09 0.18 C 0.73 0.91 0.82 0.40 0.16 0.29 009299 A 0.30 0.09 0.19 G 0.70 0.91 0.81 0.42 0.16 0.31 009337 C 0.23 0.54 0.39 A 0.77 0.46 0.61 0.35 0.50 0.48 009517 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 009538 A 0.11 0.05 0.07 T 0.89 0.95 0.93 0.20 0.09 0.14 009586 - 0.05 0.00 0.02 + 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 009718 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 009742 T 0.22 0.54 0.38 C 0.78 0.46 0.62 0.34 0.50 0.47 010142 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010168 C 0.12 0.00 0.06 T 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 010205 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 010400 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 010515 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 010544 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010592 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010630 G 0.18 0.05 0.11 A 0.82 0.95 0.89 0.30 0.09 0.20 010781 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011443 A 0.08 0.11 0.10 C 0.92 0.89 0.90 0.15 0.20 0.18 011567 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011614 A 0.27 0.00 0.14 G 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 011678 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011776 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 011793 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011823 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011950 T 0.03 0.11 0.08 C 0.97 0.89 0.92 0.06 0.20 0.14 011951 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 012218 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012329 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012383 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012632 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012636 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013115 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.21 0.00 0.12 013221 G 0.07 0.00 0.04 A 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 013243 C 0.13 0.00 0.07 A 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 013326 A 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 013666 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.10 013775 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 004160: t 009586: tc 012218: T