Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000098 A 0.48 0.52 0.50 C 0.52 0.48 0.50 0.50 0.50 0.50 000145 G 0.48 0.18 0.33 A 0.52 0.82 0.67 0.50 0.30 0.44 000176 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 000177 T 0.14 0.52 0.33 G 0.86 0.48 0.67 0.24 0.50 0.44 000282 T 0.45 0.34 0.40 G 0.55 0.66 0.60 0.50 0.45 0.48 000346 - 0.43 0.43 0.43 + 0.57 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 000369 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 000370 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 000416 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000437 T 0.36 0.29 0.33 C 0.64 0.71 0.67 0.46 0.41 0.44 000474 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000680 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000692 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 000760 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 000921 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001051 G 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001078 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001441 C 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 001491 T 0.23 0.17 0.20 C 0.77 0.83 0.80 0.35 0.28 0.32 001759 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 001826 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001925 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 001956 C 0.02 0.43 0.22 T 0.98 0.57 0.78 0.04 0.49 0.35 001991 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002292 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002668 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002795 C 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.33 0.00 0.18 002912 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003069 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003163 T 0.02 0.48 0.25 C 0.98 0.52 0.75 0.05 0.50 0.38 003279 A 0.02 0.48 0.25 C 0.98 0.52 0.75 0.05 0.50 0.38 003577 A 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 003626 A 0.40 0.00 0.20 G 0.60 1.00 0.80 0.48 0.00 0.32 004551 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 004774 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004893 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005183 - 0.12 0.00 0.06 + 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 005292 A 0.04 0.22 0.13 G 0.96 0.78 0.87 0.08 0.34 0.22 005493 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 005600 A 0.08 0.50 0.28 G 0.92 0.50 0.72 0.15 0.50 0.40 005636 T 0.08 0.50 0.28 C 0.92 0.50 0.72 0.15 0.50 0.40 006096 A 0.11 0.48 0.29 G 0.89 0.52 0.71 0.19 0.50 0.41 006213 T 0.10 0.48 0.29 G 0.90 0.52 0.71 0.19 0.50 0.41 006739 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006764 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006777 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 006801 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006896 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 007651 A 0.03 0.53 0.26 G 0.97 0.47 0.74 0.05 0.50 0.39 007825 T 0.07 0.22 0.14 C 0.93 0.78 0.86 0.14 0.35 0.25 007850 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 008136 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008458 A 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 008504 G 0.27 0.00 0.14 T 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 008506 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008517 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008647 C 0.06 0.22 0.14 T 0.94 0.78 0.86 0.12 0.34 0.24 008759 T 0.04 0.22 0.13 C 0.96 0.78 0.87 0.08 0.34 0.22 008923 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008929 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 008953 A 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 009057 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009112 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 009177 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009253 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009419 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009425 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009687 G 0.30 0.33 0.31 A 0.70 0.67 0.69 0.42 0.44 0.43 010438 + 0.03 0.00 0.01 - 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.02 010650 A 0.18 0.02 0.08 G 0.82 0.98 0.92 0.29 0.04 0.15 010978 T 0.21 0.17 0.19 A 0.79 0.83 0.81 0.33 0.29 0.31 011040 G 0.23 0.00 0.10 T 0.78 1.00 0.90 0.35 0.00 0.19 011077 A 0.23 0.41 0.33 T 0.78 0.59 0.67 0.35 0.48 0.44 011128 T 0.17 0.41 0.30 G 0.82 0.59 0.70 0.29 0.48 0.42 011141 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011835 G 0.21 0.43 0.32 A 0.79 0.57 0.68 0.33 0.49 0.43 011941 A 0.25 0.00 0.13 C 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000346: A 000921: T 005183: c 010438: a