Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000167 AA 20 23 43 AT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 000543 -- 24 21 45 +- 0 2 2 ++ 0 0 0 0.000 0.048 0.022 000748 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 001059 AA 17 21 38 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.131 0.000 0.059 001150 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 21 19 40 0.000 0.053 0.025 001204 GG 0 0 0 GT 1 1 2 TT 20 21 41 0.012 0.012 0.024 002046 CC 18 20 38 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.007 002351 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 18 21 39 0.000 0.012 0.006 002377 AA 17 20 37 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.007 002817 -- 24 22 46 +- 0 1 1 ++ 0 0 0 0.000 0.011 0.005 002843 -- 8 5 13 +- 12 11 23 ++ 4 7 11 0.020 0.030 0.018 003959 AA 18 22 40 AC 6 0 6 CC 0 0 0 0.490 0.000 0.224 005181 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 22 41 0.324 0.000 0.152 005230 AA 8 23 31 AG 12 0 12 GG 4 0 4 0.020 0.000 2.659 005704 CC 10 23 33 CT 10 0 10 TT 4 0 4 0.296 0.000 4.601 005705 CC 4 0 4 CT 10 0 10 TT 10 23 33 0.296 0.000 4.601 006174 CC 3 0 3 CT 11 0 11 TT 10 23 33 0.000 0.000 2.074 006307 AA 10 22 32 AT 10 0 10 TT 3 0 3 0.040 0.000 2.589 006369 CC 3 0 3 CT 10 0 10 TT 10 22 32 0.040 0.000 2.589 006425 AA 10 23 33 AG 10 0 10 GG 3 0 3 0.040 0.000 2.726 006723 CC 19 22 41 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.097 007130 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 007687 CC 5 0 5 CT 12 0 12 TT 6 20 26 0.048 0.000 3.066 007785 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 20 41 0.012 0.000 0.006 007911 AA 10 21 31 AG 10 0 10 GG 4 0 4 0.296 0.000 4.201 007918 AA 4 0 4 AG 10 0 10 GG 10 21 31 0.296 0.000 4.201 007934 CC 10 20 30 CT 10 0 10 TT 4 0 4 0.296 0.000 4.002 007966 AA 6 21 27 AG 13 0 13 GG 5 0 5 0.174 0.000 2.608 008319 AA 4 0 4 AG 10 0 10 GG 10 23 33 0.296 0.000 4.601 008382 GG 10 23 33 GT 10 0 10 TT 4 0 4 0.296 0.000 4.601 008554 AA 4 0 4 AG 10 0 10 GG 10 23 33 0.296 0.000 4.601 008730 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 008767 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 008781 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 008867 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 008961 CC 10 23 33 CT 10 0 10 TT 4 0 4 0.296 0.000 4.601 009028 -- 10 23 33 +- 10 0 10 ++ 4 0 4 0.296 0.000 4.601 009224 AA 6 0 6 AG 12 0 12 GG 6 23 29 0.000 0.000 5.074 009341 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 009350 CC 19 23 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.095 009566 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 18 23 41 0.342 0.000 0.152 009634 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 009849 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 009890 AA 19 22 41 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.209 0.000 0.097 009972 CC 15 22 37 CT 8 0 8 TT 1 0 1 0.003 0.000 0.483 010120 AA 4 7 11 AG 12 11 23 GG 8 5 13 0.020 0.030 0.018 010177 AA 0 0 0 AG 5 1 6 GG 19 22 41 0.324 0.011 0.218 010266 CC 19 23 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.095 010408 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 010525 GG 0 0 0 GT 5 0 5 TT 19 23 42 0.324 0.000 0.148 010544 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 010674 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 010687 AA 19 23 42 AC 5 0 5 CC 0 0 0 0.324 0.000 0.148 010905 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 011328 GG 0 0 0 GT 4 0 4 TT 18 22 40 0.220 0.000 0.100 012061 AA 19 23 42 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.209 0.000 0.095 013013 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 013509 CC 1 0 1 CT 8 0 8 TT 15 21 36 0.003 0.000 0.450 013884 AA 10 21 31 AT 10 0 10 TT 4 0 4 0.296 0.000 4.201 014248 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 19 42 0.000 0.013 0.006 014408 CC 18 21 39 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.160 014829 AA 18 23 41 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 014839 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 014904 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 014960 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 015022 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 015932 AA 21 16 37 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.140 0.061 015952 CC 19 19 38 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.059 016049 CC 2 2 4 CG 8 12 20 GG 11 6 17 0.093 1.250 0.294 016286 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 17 20 37 0.362 0.000 0.168 016415 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 18 38 0.012 0.000 0.007 017179 CC 17 20 37 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.233 0.000 0.108 017406 CC 8 5 13 CG 12 11 23 GG 4 7 11 0.020 0.030 0.018 017480 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 017744 CC 24 22 46 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 017939 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 20 21 41 0.012 0.000 0.006 018280 -- 0 0 0 +- 5 0 5 ++ 18 23 41 0.342 0.000 0.152 018324 CC 2 0 2 CT 7 0 7 TT 14 23 37 0.616 0.000 3.535 018835 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 22 21 43 0.000 0.012 0.006 019350 CC 20 22 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.054 019822 GG 19 22 41 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.024 019996 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 17 22 39 0.233 0.000 0.102 020191 CC 20 21 41 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.012 0.012 0.024 020237 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 20 22 42 0.012 0.000 0.006 020346 CC 11 7 18 CT 8 11 19 TT 2 4 6 0.093 0.008 0.075 020479 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 16 22 38 0.383 0.000 0.164 020630 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 020733 -- 0 0 0 +- 5 0 5 ++ 19 23 42 0.324 0.000 0.148 021281 GG 13 23 36 GT 8 0 8 TT 2 0 2 0.221 0.000 2.504 021297 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 20 23 43 0.112 0.000 0.052 021788 GG 19 23 42 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 021983 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 021984 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 023040 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 023049 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 023306 CC 15 23 38 CT 8 0 8 TT 1 0 1 0.003 0.000 0.516 023384 GG 17 23 40 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.059 0.000 0.025 023438 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 23 42 0.209 0.000 0.095 023493 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 19 23 42 0.209 0.000 0.095 023530 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 023596 CC 20 17 37 CT 4 6 10 TT 0 0 0 0.198 0.517 0.666 023634 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 023980 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 024587 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 024728 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 21 43 0.045 0.000 0.023 024819 CC 15 20 35 CT 8 0 8 TT 1 0 1 0.003 0.000 0.418 024965 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 025017 AA 10 23 33 AG 10 0 10 GG 4 0 4 0.296 0.000 4.601 025582 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 025630 CC 16 23 39 CT 7 0 7 TT 1 0 1 0.044 0.000 0.919 025673 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 025787 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 025788 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 025868 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 026395 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 026449 CC 22 20 42 CT 2 3 5 TT 0 0 0 0.045 0.112 0.148 026749 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 026811 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 22 41 0.324 0.000 0.152 026823 CC 16 13 29 CG 8 8 16 GG 0 2 2 0.960 0.221 0.012 027779 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 027821 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 028030 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 028267 AA 7 3 10 AC 12 12 24 CC 4 8 12 0.087 0.209 0.095 028502 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 18 23 41 0.342 0.000 0.152 028794 CC 8 5 13 CT 10 10 20 TT 4 6 10 0.079 0.043 0.183 029039 GG 13 10 23 GT 8 9 17 TT 3 3 6 0.897 0.177 0.953 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000543: gccaccacgctcagctaatttttgtatttttagtagacggggtttcaccatattggccaggctggtcttcaactcccgacctcatgatccacccgcctcggcctca 002817: g 002843: CAA 009028: g 018280: ccc 020733: a 021297: tgatctctg 023493: tg