FOXA2 Color FASTA
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*Display courtesy of GeneSNPs

GAGTGATGAA GTTGCTCCCA TCCACGCGCT AGGTGGGACC CCGTGGGAAA 50
TGCTGGGGAT CTAGCCCCTC TGACTCCGCT GCGCACACCT CCACGTTCAC 100
TACGTAGCCG TACACACCAT CAAGCTCCTT CCCTGGCGCA CCGGGCTGGC 150
CTGCCCCTCG TGGGAGCCTT CAGCACTCGG GGGACCGATA GGCACGGCTT 200
CCGCGGAGAT ACAGACCTTG AATTTGTGGG AGAATCCCGC CCTGGCGCTC 250
ACTCGGCGGG CTTATTAATG CCCTCTTTAT GAAGTGTCCA AACCATCTGC 300 | var(260):[A:0.03]
ATTTCAGCAG CAAAAGATGC TGCCGGCGGC TTCCTTCTGT GTCCCAAACC 350
GTGCAGACCT GAGAGTCCTG GGGTTAGGGA AGTGGTTCCC CTGTGCCTAC 400
TGCTACCTCC TCGCTTGCCT TCCAGCCTCA CCCTTACTCA AGCTTCAATG 450
CGAAGCTCCG TGTCTGCCAT CTCGCCTGTC TTCTGCCACC ATCGCCCCCA 500 | var(494):[T:0.01]
ATTTTGGACA GGTGGGCTGG ATGCCCACTA GTTCCTATGC ATTCTCTGTG 550
TCTGAGGGGG TGGGTACAGG GCTGGATCCC CAAGGTCCAG CCAGGTTTTC 600
AGAACCAAGA AAGAGCCTCC ACATCCAAAC ACCTGCAATA TCCCCCCCAC 650 | var(648):[:0.98]
TCCAAATCTG GGCTCACAGG CTAACCCAGA ACAGAAGACA ATTTTTGAAC 700
CCAAGAGCTG CTGGGGAAAT AAAAGTATAC GATTGCTGGA GTTTCTAATT 750
TCTATTAAGC AGTCCCTCTG GAAGACAGAG AGGACAGAGA CGCTCTTGAA 800
GTCAACTCCA TATGCCCCAT CATTGATTCC TGGATTCTTC TCTCCTCACC 850
CCTCCCTCCC CACCTCCTGC CCTGTTTGTT TTAGTTACGA AATGCTGTGG 900
GCACCTCGGT TGTGACTGAA AAGTAACCTT GAAACACGCC GGCCTGAATA 950
TCAGAGACAA ATCTCAGCCT CCCAACCGTC GGCCGCTGCT AGAGGGGCTG 1000 | var(957):[G:0.20] | var(984):[T:0.01]
CTTGCGCCAG GCGCCGGCCG CCCCACTGCG GGTCCCTGGC GGCCGGTGTC 1050 | var(1016):[T:0.01] | var(1044):[T:0.01]
TGAGGAGTCG GAGAGCCGAG GCGGCCAGAC CGTGCGCCCC GCGCTTCTCC 1100
CGAGGCCGTT CCGGGTCTGA ACTGTAACAG GGAGGGGCCT CGCAGGAGCA 1150 | var(1107):[T:0.01]
GCAGCGGGCG AGTTAAAGGT GTGTACGTAG TTTTTCTAAA TAGGACAGCG 1200
CTTTGCAAAT TGGCTGTCAT GGACTTGCTG TTTTGACAGA GAATGAGCAC 1250
TGAGAGCGAA GAAACCCGGC ATAAATAAAT CCGGCTTTCA TAGGGATCTG 1300
CCGGGCACTG AGGCTGGACG CGCCCTCCGA CAGGCGCACC GGGCGCCCGG 1350
CGCGATGAGA CGGGGCGGGG GCTGGAGGCC GGAGCCGCCC CAGAGGGTGG 1400
TTTCCTCCCA GGTCCCTCCT TCCTCAGGGG ACTCGCTGTG GACCCGGGAG 1450 | NOT SCANNED
GAAAGGGGGC TCGACCAGGG ATCCCGCGTG CCCGATCGCC CGCCCAGCCC 1500
GCTCCCCTGG CCCGCCCAGG AGTGCGGGGC GCCGCGGCGG TGGGGCGGAC 1550
GGCAGGCGCT GAGGGGCAGG TGCGGAGCGC CGGCTGCGGC TACCTCTCAC 1600
CTAGGTGTGA GCTGATTATT CAAATGGGCT GCCCCGGGTC TGGGGATTGG 1650
AGGCCCGCGC CAGCGCGCCG CGCTATATCA CCAGCCTCCC ACGTCACTGC 1700
GGCACTTGTC CGCTCCGCGG TCCACACCTC CTCCTCCTCC TCCTCCTCCT 1750
CCTCCTCCTC CTCCTCCTCC ACCACCACCA CCGCCTCCTC CTCCTCCTTC 1800
CTCCTCCTCC TCCCCACCCC CCCACTAGCC CCCGCGCCGC GCGCTTCCCG 1850
CCGCCTCGGG GCAGCTCGGC ACTGCCAACC TCAGCCGCCA CCCGGCAGCC 1900
CGTGAGCGCG GCGGCGGCGG GTGCTCCCTA CCGCGGGGCG CTGGCCTGGG 1950
CCTCCTCCGC TCCTCGCCCC CCCCCACCTC CCGCCCACTT CCAACTACCG 2000 | Exon 1 | UTR
CCTCCGGCCT GCCCAGGGAG AGAGAGGGAG TGGAGCCCAG GGAGAGGGAG 2050
CGCGAGAGAG GGAGGGAGGA GGGGACGGTG CTTTGGCTGA CTTTTTTTTA 2100
AAAGAGGGTG GGGGTGGGGG GTGATTGCTG GTCGTTTGTT GTGGCTGTTA 2150
AATTTTAAAC TGCCA
TGCAC TCGGCTTCCA GTATGCTGGG AGCGGTGAAG 2200
                M  H   S  A  S   S  M  L  G   A  V  K  12
ATGGAAGGGC ACGAGCCGTC CGACTGGAGC AGCTACTATG CAGAGCCCGA 2250
 M  E  G   H  E  P  S   D  W  S   S  Y  Y   A  E  P  E 29
GGTAAGCGCT CGTCTTTTCC AGGGGGAAGT GGAGCGGCGG CGCTCGCTCC 2300
                                                       29
TTCCCCAACC TCAGGACCGC TTCCCTCGCT GGCACCCCCC CACCCCGCCC 2350
CACAACCCCA GCCTTTCTGG GCAGCCGCCT TTTCCGCCCT CCTTGGAATC 2400
AAATGGGTCT CTTTTTTATA CGACACACTG TTAGCCTTGA GATAATATTA 2450
ACTTTGTGAT CAAATATTGA CTTGCGGCGC CTCCAAATCC TCTTCGTGGC 2500
CGAGCCACGC ACTATCCTAA CAGAGTTATG TTTGGCAGCG CGCGGCTGGG 2550
GAGGGGTGGG AGGTCGGCCG GCGAGGGGGT GGGGAGCTGA GGAGGAGAAG 2600
ATGGGTAGGA GTTGGGGGCT GAAGTGGAGG CAGAGTCAAA GACTAGTGGA 2650
CAAAGAGAAA GAAAGTTTTT GCCTGCAAAG CTCAGCCGCG TGTGGTTCAG 2700 | var(2660):[G:0.02] | var(2695):[A:0.01]
GTCTCGGTTC TTTCCCTATT GCCCCGTTCA GTGCCTCCAG CCGCCCCCGC 2750 | var(2748):[T:0.07]
ACTCCGCACA GGCACTGCCT TGCAGTTTCC CTGGGACAAG GGAGGGGGTC 2800
CCTGGAGGGA GACCGGACAG AGGGGGCCCG GGACAGTCTT CGCTGGAGGC 2850
AGCCCGAGGC GCCCCGCGCG TTGTCCCGCA GGTTGCTTGC TGCGACCGGA 2900
GGTGGCGTCC GGGGACTTCG GGCCTCGGCG CCAGCTCAGT ATGCTGGTGG 2950
GAGAGTTTGG GGAGACTCTG GGGTAGGGGA ATGTATTTGG GGTGCTGGCT 3000
TGGGAGTACT CCATGGGACC CCTGTTCTAG AATCTGGGCG AGGTGGAGAA 3050
GGGCTAGGAA CGGGCCACAT GCCCAAGCAG CAATCCGCTC GCCACCTTCC 3100
CAAGGGCGAT CGATCATGAC TCTCCCTGAA TGAAACAGAC TCGGAGTCCG 3150
GAGACTGGGC CATCGGGGAC GAAAGGGCTC CCCGGAGGCC TCCCCGGACG 3200
CGGAGGCCTG GGCGGTGGGT GGGAGGTCTG GGCACCCTCC AGCCGCGGTG 3250
CTAACGCTGT CGCCTCCCTC CCGGGGCTCT GTCCGCAGGG CTACTCCTCC 3300 | Exon 2
                                          G   Y  S  S  33
GTGAGCAACA TGAACGCCGG CCTGGGGATG AACGGCATGA ACACGTACAT 3350
 V  S  N   M  N  A  G   L  G  M   N  G  M   N  T  Y  M 50
GAGCATGTCG GCGGCCGCCA TGGGCAGCGG CTCGGGCAAC ATGAGCGCGG 3400
  S  M  S   A  A  A   M  G  S  G   S  G  N   M  S  A   66
GCTCCATGAA CATGTCGTCG TACGTGGGCG CTGGCATGAG CCCGTCCCTG 3450
G  S  M  N   M  S  S   Y  V  G   A  G  M  S   P  S  L  83
GCGGGGATGT CCCCCGGCGC GGGCGCCATG GCGGGCATGG GCGGCTCGGC 3500
 A  G  M   S  P  G  A   G  A  M   A  G  M   G  G  S  A 100
CGGGGCGGCC GGCGTGGCGG GCATGGGGCC GCACTTGAGT CCCAGCCTGA 3550 | var(3510):[T:0.13]
  G  A  A   G  V  A   G  M  G  P   H  L  S   P  S  L   116
GCCCGCTCGG GGGGCAGGCG GCCGGGGCCA TGGGCGGCCT GGCCCCCTAC 3600
S  P  L  G   G  Q  A   A  G  A   M  G  G  L   A  P  Y  133
GCCAACATGA ACTCCATGAG CCCCATGTAC GGGCAGGCGG GCCTGAGCCG 3650 | var(3626):[C:0.02]
 A  N  M   N  S  M  S   P  M  Y   G  Q  A   G  L  S  R 150
CGCCCGCGAC CCCAAGACCT ACAGGCGCAG CTACACGCAC GCAAAGCCGC 3700
  A  R  D   P  K  T   Y  R  R  S   Y  T  H   A  K  P   166
CCTACTCGTA CATCTCGCTC ATCACCATGG CCATCCAGCA GAGCCCCAAC 3750
P  Y  S  Y   I  S  L   I  T  M   A  I  Q  Q   S  P  N  183
AAGATGCTGA CGCTGAGCGA GATCTACCAG TGGATCATGG ACCTCTTCCC 3800
 K  M  L   T  L  S  E   I  Y  Q   W  I  M   D  L  F  P 200
CTTCTACCGG CAGAACCAGC AGCGCTGGCA GAACTCCATC CGCCACTCGC 3850
  F  Y  R   Q  N  Q   Q  R  W  Q   N  S  I   R  H  S   216
TCTCCTTCAA CGACTGTTTC CTGAAGGTGC CCCGCTCGCC CGACAAGCCC 3900
L  S  F  N   D  C  F   L  K  V   P  R  S  P   D  K  P  233
GGCAAGGGCT CCTTCTGGAC CCTGCACCCT GACTCGGGCA ACATGTTCGA 3950
 G  K  G   S  F  W  T   L  H  P   D  S  G   N  M  F  E 250
GAACGGCTGC TACCTGCGCC GCCAGAAGCG CTTCAAGTGC GAGAAGCAGC 4000
  N  G  C   Y  L  R   R  Q  K  R   F  K  C   E  K  Q   266
TGGCGCTGAA GGAGGCCGCA GGCGCCGCCG GCAGCGGCAA GAAGGCGGCC 4050
L  A  L  K   E  A  A   G  A  A   G  S  G  K   K  A  A  283
GCCGGAGCCC AGGCCTCACA GGCTCAACTC GGGGAGGCCG CCGGGCCGGC 4100 | var(4056):[G:0.35]
 A  G  A   Q  A  S  Q   A  Q  L   G  E  A   A  G  P  A 300
CTCCGAGACT CCGGCGGGCA CCGAGTCGCC TCACTCGAGC GCCTCCCCGT 4150
  S  E  T   P  A  G   T  E  S  P   H  S  S   A  S  P   316
GCCAGGAGCA CAAGCGAGGG GGCCTGGGAG AGCTGAAGGG GACGCCGGCT 4200
C  Q  E  H   K  R  G   G  L  G   E  L  K  G   T  P  A  333
GCGGCGCTGA GCCCCCCAGA GCCGGCGCCC TCTCCCGGGC AGCAGCAGCA 4250
 A  A  L   S  P  P  E   P  A  P   S  P  G   Q  Q  Q  Q 350
GGCCGCGGCC CACCTGCTGG GCCCGCCCCA CCACCCGGGC CTGCCGCCTG 4300
  A  A  A   H  L  L   G  P  P  H   H  P  G   L  P  P   366
AGGCCCACCT GAAGCCGGAA CACCACTACG CCTTCAACCA CCCGTTCTCC 4350
E  A  H  L   K  P  E   H  H  Y   A  F  N  H   P  F  S  383
ATCAACAACC TCATGTCCTC GGAGCAGCAG CACCACCACA GCCACCACCA 4400
 I  N  N   L  M  S  S   E  Q  Q   H  H  H   S  H  H  H 400
CCACCAGCCC CACAAAATGG ACCTCAAGGC CTACGAACAG GTGATGCACT 4450 | var(4407):[A:0.01]
  H  Q  P   H  K  M   D  L  K  A   Y  E  Q   V  M  H   416
ACCCCGGCTA CGGTTCCCCC ATGCCTGGCA GCTTGGCCAT GGGCCCGGTC 4500
Y  P  G  Y   G  S  P   M  P  G   S  L  A  M   G  P  V  433
ACGAACAAAA CGGGCCTGGA CGCCTCGCCC CTGGCCGCAG ATACCTCCTA 4550
 T  N  K   T  G  L  D   A  S  P   L  A  A   D  T  S  Y 450
CTACCAGGGG GTGTACTCCC GGCCCATTAT GAACTCCTCT TAAGAAGACG 4600 | UTR
  Y  Q  G   V  Y  S   R  P  I  M   N  S  S             463
ACGGCTTCAG GCCCGGCTAA CTCTGGCACC CCGGATCGAG GACAAGTGAG 4650 | var(4643):[T:0.39]
AGAGCAAGTG GGGGTCGAGA CTTTGGGGAG ACGGTGTTGC AGAGACGCAA 4700
GGGAGAAGAA ATCCATAACA CCCCCACCCC AACACCCCCA AGACAGCAGT 4750 | var(4703):[A:0.01] | var(4739):[A:0.01]
CTTCTTCACC CGCTGCAGCC GTTCCGTCCC AAACAGAGGG CCACACAGAT 4800 | var(4770):[T:0.27]
ACCCCACGTT CTATATAAGG AGGAAAACGG GAAAGAATAT AAAGTTAAAA 4850
AAAAGCCTCC GGTTTCCACT ACTGTGTAGA CTCCTGCTTC TTCAAGCACC 4900
TGCAGATTCT GATTTTTTTG TTGTTGTTGT TCTCCTCCAT TGCTGTTGTT 4950
GCAGGGAAGT CTTACTTAAA AAAAAAAAAA AATTTTGTGA GTGACTCGGT 5000
GTAAAACCAT GTAGTTTTAA CAGAACCAGA GGGTTGTACT ATTGTTTAAA 5050
AACAGGAAAA AAAATAATGT AAGGGTCTGT TGTAAATGAC CAAGAAAAAG 5100
AAAAAAAAAG CATTCCCAAT CTTGACACGG TGAAATCCAG GTCTCGGGTC 5150 | var(5121):[A:0.03] | var(5128):[T:0.04]
CGATTAATTT ATGGTTTCTG CGTGCTTTAT TTATGGCTTA TAAATGTGTA 5200
TTCTGGCTGC AAGGGCCAGA GTTCCACAAA TCTATATTAA AGTGTTATAC 5250 | var(5216):[T:0.02]
CCGGTTTT
AT CCCTTGAATC TTTTCTTCCA GATTTTTCTT TTCTTTACTT 5300
GGCTTACAAA ATATACAGGC TTGGAAATTA TTTCAAGAAG GAGGGAGGGA 5350
TACCCTGTCT GGTTGCAGGT TGTATTTTAT TTTGGCCCAG GGAGTGTTGC 5400
TGTTTTCCCA ACATTTTATT AATAAAATTT TCAGACATAC CAAAATTGAA 5450
TGAATTTTAC AGTAGGCACA CAGGGACCTG CTCCCGAGAT TCTGCAATTA 5500 | var(5493):[C:0.01]
ACATTTCATT ATACTTGCTT TATCACATAC TTGTCCATCT ATCTTCACCT 5550
CCACTGGTCA ATCCATCTTA TTTCTCTAAA TCCACTTCAA ATTTGCAGAT 5600
ACCAGTACAC ATCCCCCTAA ACACTAAAGC AAGCACATTA TTAAATGGAA 5650 | var(5602):[A:0.04]
CTTGTATGGT TTATGGTTAC TTTTTGAATT TGGGGGTTAA CTTTACACAC 5700 | var(5684):[T:0.03] | var(5699):[G:0.25]
AATGAAATAC ACAGATCCCA GGAAGACCAT TCCAGCAGGT TTATTTTTAA 5750
AGCCAGTAGA AGATCACTCT CCACATATCA CAATTTTCCA CCTTGGCTGT 5800
TTGAATGTGC CCTGTTGTTG TGGTCTCTTG GGCCCCACAG CTTGCTTCTC 5850
TTGGGGGAAG CCTCAATTTC ACATGTTTTT GCTGTACTTC TGATCTTGGG 5900
CCTCCCTTCA GGTCAATGAG CCTGGATCAA ACTTGCAAAT TTGTGGTGCA 5950
GCACTTTGCC TGTTCACCAC TGTGAACAGT GGTGGAATTG GGACTCTGCC 6000 | var(5954):[T:0.01] | var(5988):[C:0.02]
TGGATCTTCC AGCCTCCTCT GTACACAGGG TGCCACCCTT TCCCACCCTT 6050
CTCCCTGGAG CAGGTATTGT GCACAACCAT GGCAGACCTT TCTAACCCAG 6100
AAAGACCTTA CTAACCCAGA AATGGCGAGA CACTTGGTGT AGGGAAACAT 6150 | var(6110):[G:0.37] | var(6149):[T:0.19]
TTAGAAGATC TTCTCCTGGA ATTGGTTTGA AAGGGTAAGT CAGGGTAACA 6200 | var(6160):[A:0.07]
ATCCAAGTCT GTTTTTTAAA AATAGGGTAT ATTTGGGAGT GAGGAGGAGG 6250
TAAGGGGTGT CTGGCCAATG GACCATGACA GTAGTGAAGA TGCCACTGTC 6300
GGCAAATTTG CTCCCCATCT CCCTCCAAAA CTCAAGGCTC TTGCAAATCT 6350
TCTTGTAAGT TAGGTGAGGT TGGCAATCCA GGTTTGCAGG GTCCAGGGGT 6400 | var(6392):[C:0.34]
TATGCAGGTA TTTTGTGAGC CTTCAAGGAC TCTAAAAGTA TAACGAAAAA 6450
TCCCAGAGTG AATTCTTATA CACCATGCTG CCTCTCCCCC CAGACGACCT 6500
CGCTGGCCTA AAAGGACGGC CAACGGCAGT GAAAACCAAG GCCGACAGCG 6550 | var(6546):[G:0.08]
CAAAGGGGAG TCTGGTGTTG GTTTTGCCCA GGACATCTGC TGGCTGGGCG 6600
AGGGCAGGAT CAGTGTCGTC GCGGGTCAGG CAGACTTGGG AGCCACTCCC 6650
GCGCGCAGTG GCTTGCGGTG GGTAAAAACA CTCCGAAAGC CTGGAGGCTA 6700 | var(6652):[A:0.08]
GGACTTTTTG CCTCAGGTTT CTAAGCTCAG GCTCCTTTTT TCAAGATTAG 6750
ATCTTTGGGC TTCTTGACCA TCCTAACCTG GAGTGTTCCA GCTACGCCCC 6800
AGACCTGGAG ACTGTCTTTG AGTGCTACCT TGCTGGGGTC TCTGCCACCC 6850
CATCCCCCAC CCCGCCGCCT TCCCCAACAA GCCTGGCCTT CCCACGCGCT 6900
TGAGGGGGGT TTGGCATCGC CTCCGCCTCC CACCCGCCAC TGCCCCCCTC 6950
CCGCCACCAA ATCCCTTTCT TAACATGCCA CATTGTCCCG AAGAACACAA 7000
GGAAGAGAAA TTGGGGAGGG GGGGATCCGG AGGCCACAGC CAGCAATCAG 7050
GCCGTCTCTC CTCCTAGCAA GGACACACAC GTCGTGAGCC CGGCCTGAAA 7100
TGTGTTTCAT TATCACATAA AAGGCTCCCG TGGCGAAGGA GCCGAGAGGC 7150
AGGGCCGGGG GCCGAGTGGG GGACAATGGA GGCTGAAAGC GCTGCCCTAA 7200
CCTGCTATGT TTCGTATGG