Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000095 CC 15 22 37 CT 7 0 7 TT 2 0 2 0.730 0.000 3.535 000223 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 000413 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 000454 CC 6 9 15 CT 12 11 23 TT 6 2 8 0.000 0.279 0.026 000475 CC 11 21 32 CT 10 1 11 TT 3 0 3 0.094 0.012 1.957 000606 CC 17 2 19 CT 7 12 19 TT 0 8 8 0.700 0.702 0.705 000645 AA 18 22 40 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.224 000689 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 000711 AA 3 0 3 AG 10 1 11 GG 11 21 32 0.094 0.012 1.957 000868 CC 23 20 43 CT 1 3 4 TT 0 0 0 0.011 0.112 0.093 000902 CC 17 2 19 CT 7 12 19 TT 0 9 9 0.700 0.517 1.102 000987 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 22 46 0.000 0.011 0.005 001063 AA 5 10 15 AG 13 11 24 GG 6 2 8 0.174 0.179 0.093 001064 AA 0 0 0 AG 2 4 6 GG 22 19 41 0.045 0.209 0.218 001279 CC 6 2 8 CT 13 11 24 TT 5 10 15 0.174 0.179 0.093 001630 CC 2 9 11 CT 5 11 16 TT 16 2 18 2.200 0.279 3.311 001662 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 001789 CC 23 21 44 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 002106 CC 19 23 42 CG 2 0 2 GG 2 0 2 8.746 0.000 19.043 002250 AA 21 22 43 AT 1 1 2 TT 1 0 1 9.521 0.011 10.478 002495 AA 18 4 22 AT 4 9 13 TT 1 10 11 1.252 0.591 7.378 002508 AA 1 0 1 AT 1 0 1 TT 21 23 44 9.521 0.000 19.761 002588 CC 12 2 14 CT 7 11 18 TT 4 10 14 2.175 0.179 2.174 002770 CC 16 2 18 CT 5 10 15 TT 2 9 11 2.200 0.107 3.973 002777 AA 23 19 42 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.053 0.024 002877 AA 14 2 16 AG 5 10 15 GG 2 10 12 1.802 0.050 3.773 002883 AA 18 10 28 AC 3 10 13 CC 0 2 2 0.124 0.050 0.095 003160 AA 2 10 12 AG 5 10 15 GG 16 2 18 2.200 0.050 4.645 003245 AA 4 10 14 AG 7 10 17 GG 12 2 14 2.175 0.050 2.689 003303 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 1 0 1 9.521 0.000 19.316 003348 AA 1 0 1 AT 2 0 2 TT 20 22 42 4.707 0.000 10.228 003366 AA 16 2 18 AT 5 10 15 TT 2 10 12 2.200 0.050 4.645 003696 AA 20 10 30 AG 3 11 14 GG 0 2 2 0.112 0.179 0.050 003742 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 22 23 45 23.000 0.000 46.000 003917 CC 16 2 18 CG 4 11 15 GG 3 10 13 5.497 0.179 5.318 003989 AA 5 0 5 AG 0 0 0 GG 18 23 41 23.000 0.000 46.000 004009 AA 12 2 14 AC 5 11 16 CC 6 10 16 6.546 0.179 4.224 004054 AA 1 0 1 AG 1 0 1 GG 21 23 44 9.521 0.000 19.761 004199 GG 20 23 43 GT 1 0 1 TT 2 0 2 13.836 0.000 28.600 004347 AA 16 2 18 AT 4 11 15 TT 3 10 13 5.497 0.179 5.318 004608 AA 16 2 18 AG 4 11 15 GG 3 10 13 5.497 0.179 5.318 004637 AA 23 21 44 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 004689 CC 0 2 2 CT 3 11 14 TT 20 10 30 0.112 0.179 0.050 004706 AA 0 2 2 AG 3 11 14 GG 20 10 30 0.112 0.179 0.050 004711 CC 2 0 2 CG 2 0 2 GG 19 23 42 8.746 0.000 19.043 004736 AA 18 4 22 AG 3 9 12 GG 2 10 12 5.624 0.591 9.414 004748 CC 18 23 41 CG 3 0 3 GG 2 0 2 5.624 0.000 13.222 004779 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 22 23 45 23.000 0.000 46.000 005068 CC 3 0 3 CT 10 1 11 TT 11 22 33 0.094 0.011 2.074 005197 AA 11 22 33 AG 10 1 11 GG 3 0 3 0.094 0.011 2.074 005380 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 006016 AA 17 2 19 AG 7 12 19 GG 0 9 9 0.700 0.517 1.102 006475 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 22 44 0.045 0.000 0.023 006516 AA 0 9 9 AG 7 11 18 GG 17 2 19 0.700 0.279 1.467 006581 AA 21 23 44 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 006629 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 23 44 0.107 0.000 0.051 006818 AA 7 10 17 AG 11 11 22 GG 6 2 8 0.160 0.179 0.037 007027 AA 17 2 19 AC 7 12 19 CC 0 9 9 0.700 0.517 1.102 007060 * 007085 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 007219 CC 6 9 15 CT 11 11 22 TT 7 2 9 0.160 0.279 0.033 007224 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 007324 AA 21 22 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 007349 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 22 42 0.198 0.000 0.095 007435 AA 23 22 45 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 007503 AA 18 2 20 AG 6 12 18 GG 0 8 8 0.490 0.702 1.181 007551 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 007636 CC 22 22 44 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.023 007947 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 22 46 0.000 0.011 0.005 008047 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 008056 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 008077 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 008098 AA 1 0 1 AG 10 1 11 GG 13 22 35 0.296 0.011 0.015 008107 AA 22 23 45 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 008151 CC 2 2 4 CT 10 11 21 TT 12 10 22 0.002 0.179 0.105 008242 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 008426 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 008522 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 008562 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 008864 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 009802 CC 23 20 43 CT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.112 0.052 009855 CC 18 23 41 CG 5 0 5 GG 0 0 0 0.342 0.000 0.152 010014 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 010168 CC 5 10 15 CT 13 11 24 TT 6 2 8 0.174 0.179 0.093 010328 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 010455 AA 6 2 8 AG 12 11 23 GG 5 10 15 0.048 0.179 0.026 010684 CC 14 12 26 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.018 0.000 0.010 010909 CC 7 11 18 CG 4 1 5 GG 1 0 1 0.148 0.023 0.644 010942 AA 0 9 9 AG 2 1 3 GG 10 2 12 0.099 6.703 13.358 010945 CC 18 2 20 CG 6 12 18 GG 0 9 9 0.490 0.517 1.691 010961 -- 5 10 15 +- 12 11 23 ++ 7 2 9 0.001 0.179 0.001 011281 CC 18 2 20 CT 6 12 18 TT 0 9 9 0.490 0.517 1.691 011287 AA 18 2 20 AG 6 12 18 GG 0 9 9 0.490 0.517 1.691 011523 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 011528 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 011550 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 011595 CC 17 2 19 CT 7 12 19 TT 0 9 9 0.700 0.517 1.102 011680 CC 0 2 2 CG 7 11 18 GG 17 10 27 0.700 0.179 0.218 011806 AA 14 23 37 AT 8 0 8 TT 2 0 2 0.296 0.000 2.613 011916 CC 0 2 2 CT 4 11 15 TT 20 10 30 0.198 0.179 0.005 011983 AA 14 22 36 AC 9 1 10 CC 1 0 1 0.091 0.011 0.094 012007 CC 0 9 9 CT 7 12 19 TT 17 2 19 0.700 0.517 1.102 012787 AA 3 0 3 AT 9 0 9 TT 12 23 35 0.389 0.000 3.846 012864 AA 0 2 2 AC 7 11 18 CC 17 10 27 0.700 0.179 0.218 012889 AA 3 0 3 AT 9 0 9 TT 12 23 35 0.389 0.000 3.846 012940 CC 3 0 3 CT 9 0 9 TT 12 23 35 0.389 0.000 3.846 013007 AA 12 23 35 AG 11 0 11 GG 1 0 1 0.618 0.000 0.015 013071 CC 3 0 3 CT 9 0 9 TT 12 23 35 0.389 0.000 3.846 013072 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 013133 GG 14 23 37 GT 8 0 8 TT 2 0 2 0.296 0.000 2.613 013172 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 013224 -- 14 22 36 +- 9 1 10 ++ 1 0 1 0.091 0.011 0.094 013265 GG 14 22 36 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.018 0.000 0.007 015017 AA 23 20 43 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.050 0.023 015097 GG 14 2 16 GT 8 11 19 TT 1 9 10 0.011 0.279 0.885 015127 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 015210 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 015248 GG 21 22 43 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 015249 CC 20 22 42 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.054 015402 AA 14 2 16 AG 8 11 19 GG 1 9 10 0.011 0.279 0.885 015441 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 22 42 0.112 0.000 0.054 015483 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 22 42 0.112 0.000 0.054 015602 CC 20 22 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.054 015619 GG 20 22 42 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.054 015711 CC 14 2 16 CG 8 11 19 GG 1 9 10 0.011 0.279 0.885 015738 CC 23 21 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 015763 AA 4 0 4 AG 8 0 8 GG 11 22 33 1.252 0.000 6.911 015770 CC 21 22 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 015774 AA 2 0 2 AG 7 0 7 GG 14 22 36 0.616 0.000 3.404 015821 CC 3 0 3 CT 9 0 9 TT 11 22 33 0.277 0.000 3.528 016004 CC 4 0 4 CT 11 0 11 TT 7 23 30 0.008 0.000 3.187 016079 CC 19 23 42 CG 3 0 3 GG 1 0 1 2.457 0.000 6.146 016209 AA 1 0 1 AG 4 0 4 GG 19 23 42 1.361 0.000 3.895 016232 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 14 23 37 0.296 0.000 2.613 016254 CC 1 0 1 CG 3 0 3 GG 20 23 43 2.617 0.000 6.306 016304 CC 23 22 45 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 016305 AA 4 0 4 AC 9 0 9 CC 10 23 33 0.591 0.000 5.654 016323 GG 2 0 2 GT 7 0 7 TT 10 22 32 0.207 0.000 2.880 016414 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 016642 CC 18 23 41 CG 3 0 3 GG 1 0 1 2.296 0.000 5.985 016701 GG 22 23 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016707 GG 10 21 31 GT 10 2 12 TT 3 0 3 0.040 0.048 1.348 016709 AA 6 21 27 AG 11 2 13 GG 6 0 6 0.043 0.048 3.762 016803 AA 4 0 4 AG 11 1 12 GG 9 22 31 0.042 0.011 2.659 016825 AA 4 0 4 AG 11 1 12 GG 9 22 31 0.042 0.011 2.659 016869 GG 4 0 4 GT 11 1 12 TT 9 22 31 0.042 0.011 2.659 016898 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 016901 AA 20 23 43 AC 3 0 3 CC 1 0 1 2.617 0.000 6.306 016947 CC 6 22 28 CT 12 1 13 TT 6 0 6 0.000 0.011 3.996 016972 AA 4 0 4 AC 11 1 12 CC 9 22 31 0.042 0.011 2.659 017098 CC 20 23 43 CG 3 0 3 GG 1 0 1 2.617 0.000 6.306 017115 CC 4 0 4 CT 11 1 12 TT 9 22 31 0.042 0.011 2.659 017148 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 017244 AA 4 0 4 AG 11 1 12 GG 9 22 31 0.042 0.011 2.659 017250 AA 10 22 32 AG 11 1 12 GG 3 0 3 0.000 0.011 1.447 017352 CC 9 22 31 CT 11 1 12 TT 4 0 4 0.042 0.011 2.659 017361 AA 10 21 31 AG 11 2 13 GG 3 0 3 0.000 0.048 0.954 017451 AA 4 0 4 AG 11 1 12 GG 9 22 31 0.042 0.011 2.659 017459 CC 3 2 5 CG 11 11 22 GG 10 10 20 0.000 0.179 0.084 017478 CC 4 0 4 CT 11 1 12 TT 9 22 31 0.042 0.011 2.659 017525 CC 4 0 4 CT 11 1 12 TT 9 22 31 0.042 0.011 2.659 017557 AA 1 0 1 AC 13 1 14 CC 10 22 32 1.630 0.011 0.140 017572 CC 3 0 3 CT 10 2 12 TT 9 20 29 0.007 0.050 1.153 017593 AA 11 2 13 AG 8 11 19 GG 2 9 11 0.093 0.279 0.562 017754 CC 0 0 0 CT 2 1 3 TT 19 21 40 0.053 0.012 0.056 017809 CC 2 2 4 CT 9 10 19 TT 9 10 19 0.013 0.050 0.058 017871 CC 19 22 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.006 017920 CC 8 10 18 CG 9 9 18 GG 3 3 6 0.032 0.177 0.187 018002 AA 9 10 19 AC 8 10 18 CC 2 2 4 0.012 0.050 0.008 018107 CC 17 22 39 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.059 0.000 0.026 018168 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 11 12 23 0.023 0.000 0.011 018220 CC 9 10 19 CT 0 0 0 TT 3 2 5 12.000 12.000 24.000 019039 AA 20 21 41 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.055 019083 AA 0 8 8 AG 7 11 18 GG 16 2 18 0.741 0.416 0.829 019219 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 019235 AA 4 2 6 AG 10 10 20 GG 9 10 19 0.175 0.050 0.041 019371 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 019949 GG 4 2 6 GT 9 10 19 TT 9 9 18 0.414 0.107 0.075 020024 AA 9 9 18 AG 10 10 20 GG 4 2 6 0.175 0.107 0.014 020112 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 20 21 41 0.112 0.000 0.055 020164 AA 1 0 1 AG 12 1 13 GG 10 20 30 1.239 0.012 0.088 020175 CC 1 0 1 CT 3 0 3 TT 19 21 40 2.457 0.000 5.825 020204 AA 0 0 0 AT 3 0 3 TT 20 21 41 0.112 0.000 0.055 020387 GG 17 2 19 GT 7 11 18 TT 0 9 9 0.700 0.279 1.467 020434 CC 1 0 1 CT 13 0 13 TT 10 22 32 1.630 0.000 0.058 020615 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 020703 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 020743 AA 10 9 19 AT 11 11 22 TT 3 2 5 0.000 0.279 0.135 020803 AA 0 9 9 AG 7 11 18 GG 17 2 19 0.700 0.279 1.467 020936 AA 0 2 2 AT 4 11 15 TT 20 9 29 0.198 0.279 0.001 020942 AA 10 9 19 AG 11 11 22 GG 3 2 5 0.000 0.279 0.135 020984 CC 10 22 32 CT 13 0 13 TT 1 0 1 1.630 0.000 0.058 021342 CC 1 0 1 CT 13 1 14 TT 10 21 31 1.630 0.012 0.161 021368 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 24 21 45 0.000 0.012 0.006 021410 AA 21 22 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 021428 GG 14 2 16 GT 8 11 19 TT 2 9 11 0.296 0.279 1.238 021475 AA 1 0 1 AG 13 1 14 GG 10 21 31 1.630 0.012 0.161 021962 GG 7 2 9 GT 14 11 25 TT 3 9 12 0.960 0.279 0.386 021963 AA 7 19 26 AG 3 1 4 GG 1 0 1 0.550 0.013 2.126 021997 AA 3 2 5 AG 11 10 21 GG 10 10 20 0.000 0.050 0.022 022184 CC 12 2 14 CT 10 11 21 TT 2 9 11 0.002 0.279 0.317 022522 -- 3 2 5 +- 9 10 19 ++ 10 10 20 0.177 0.050 0.023 022579 CC 1 0 1 CT 6 1 7 TT 6 11 17 0.090 0.023 0.066 022632 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 22 41 0.053 0.000 0.024 022717 CC 9 10 19 CG 9 10 19 GG 4 2 6 0.414 0.050 0.127 022862 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 18 22 40 0.220 0.000 0.100 022881 CC 1 0 1 CG 3 0 3 GG 19 22 41 2.457 0.000 5.985 022882 GG 5 2 7 GT 9 10 19 TT 9 10 19 0.857 0.050 0.372 022883 CC 4 2 6 CG 9 10 19 GG 9 10 19 0.414 0.050 0.127 022921 CC 21 22 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 023006 CC 14 21 35 CT 6 1 7 TT 3 0 3 2.407 0.012 6.181 023023 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 22 43 0.048 0.000 0.023 023053 AA 22 22 44 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 023356 AA 20 22 42 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 023495 -- 2 0 2 +- 9 0 9 ++ 9 23 32 0.013 0.000 1.462 023558 CC 1 2 3 CT 3 11 14 TT 12 10 22 1.335 0.179 0.134 023643 CC 7 2 9 CT 1 11 12 TT 8 10 18 12.236 0.179 4.777 023754 -- 7 9 16 +- 6 11 17 ++ 7 2 9 3.200 0.279 1.176 023789 AA 16 22 38 AG 3 0 3 GG 1 0 1 1.976 0.000 5.505 024241 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 20 21 41 0.198 0.000 0.097 024344 CC 3 2 5 CG 10 11 21 GG 11 8 19 0.094 0.416 0.050 024406 AA 19 21 40 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.156 024451 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 024568 AA 20 21 41 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.055 024573 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 21 43 0.011 0.000 0.006 024587 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 21 41 0.112 0.000 0.055 024629 AA 17 2 19 AG 6 12 18 GG 0 7 7 0.517 0.940 0.593 024665 CC 0 0 0 CT 7 0 7 TT 16 21 37 0.741 0.000 0.329 024908 CC 11 10 21 CT 3 11 14 TT 9 2 11 12.498 0.179 5.998 024954 AA 10 2 12 AG 4 11 15 GG 9 10 19 9.763 0.179 5.081 025002 AA 1 0 1 AG 2 0 2 GG 20 23 43 4.707 0.000 10.478 025336 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 025513 CC 8 10 18 CT 3 11 14 TT 11 2 13 11.472 0.179 6.160 025783 CC 9 2 11 CT 9 10 19 TT 6 10 16 1.361 0.050 1.238 025785 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 025825 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 025912 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 026254 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 026302 GG 6 10 16 GT 9 10 19 TT 9 2 11 1.361 0.050 1.238 026352 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 22 45 0.011 0.000 0.006 026523 -- 4 2 6 +- 8 11 19 ++ 11 10 21 1.252 0.179 0.263 026563 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 14 12 26 0.018 0.000 0.010 026804 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 026821 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 026952 CC 3 0 3 CG 9 1 10 GG 11 22 33 0.277 0.011 2.726 026965 AA 22 23 45 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 027034 CC 4 2 6 CT 8 11 19 TT 11 10 21 1.252 0.179 0.263 027051 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 18 23 41 0.342 0.000 0.152 027438 CC 17 2 19 CT 6 11 17 TT 0 9 9 0.517 0.279 1.895 027593 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 027674 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 027708 CC 10 9 19 CT 7 11 18 TT 4 2 6 1.577 0.279 0.265 027855 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 21 22 43 0.048 0.000 0.023 027944 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 027969 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 028012 CC 11 22 33 CG 9 0 9 GG 3 0 3 0.277 0.000 3.528 028025 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 028169 CC 3 2 5 CT 9 11 20 TT 12 10 22 0.389 0.179 0.020 028201 CC 18 23 41 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.218 028205 -- 0 0 0 +- 6 0 6 ++ 18 23 41 0.490 0.000 0.218 028590 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 028987 CC 0 9 9 CT 8 12 20 TT 16 2 18 0.960 0.517 0.638 029089 AA 3 0 3 AT 9 1 10 TT 12 22 34 0.389 0.011 2.863 029143 GG 1 2 3 GT 5 11 16 TT 18 10 28 0.644 0.179 0.120 029311 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.023 029354 AA 8 2 10 AG 8 11 19 GG 6 10 16 1.564 0.179 0.885 029376 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 029501 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 029521 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 029583 CC 1 2 3 CT 5 11 16 TT 16 10 26 0.499 0.179 0.063 029662 AA 6 9 15 AG 8 10 18 GG 8 2 10 1.564 0.107 0.985 029847 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 17 23 40 0.059 0.000 0.025 029873 AA 19 23 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.013 0.000 0.006 029966 CC 16 23 39 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.247 0.000 0.102 029990 AA 0 1 1 AC 0 4 4 CC 20 18 38 0.000 1.252 3.452 030111 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 18 23 41 0.055 0.000 0.024 030223 AA 11 23 34 AG 7 0 7 GG 2 0 2 0.299 0.000 3.142 030238 CC 2 0 2 CT 9 0 9 TT 9 23 32 0.013 0.000 1.462 030262 CC 16 23 39 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.247 0.000 0.102 030281 GG 16 23 39 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.247 0.000 0.102 030293 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 20 22 42 0.000 0.011 0.006 030311 AA 15 23 38 AT 5 0 5 TT 0 0 0 0.408 0.000 0.164 030313 AA 0 9 9 AC 3 8 11 CC 17 6 23 0.131 1.965 7.866 030323 AA 20 22 42 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.006 030343 AA 9 23 32 AG 9 0 9 GG 2 0 2 0.013 0.000 1.462 030347 CC 18 23 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.055 0.000 0.024 030348 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 16 23 39 0.247 0.000 0.102 030369 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 18 23 41 0.055 0.000 0.024 030385 AA 11 23 34 AG 7 0 7 GG 2 0 2 0.299 0.000 3.142 030699 CC 0 2 2 CG 5 10 15 GG 16 9 25 0.383 0.107 0.017 030751 CC 0 0 0 CT 8 0 8 TT 13 21 34 1.163 0.000 0.465 030864 AA 11 21 32 AG 9 0 9 GG 3 0 3 0.277 0.000 3.369 030889 CC 4 21 25 CG 13 0 13 GG 6 0 6 0.445 0.000 3.295 030945 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 21 43 0.011 0.000 0.006 031009 AA 16 21 37 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.548 0.000 0.242 031136 AA 0 2 2 AG 0 0 0 GG 17 9 26 0.000 11.000 28.000 031142 -- 0 2 2 +- 6 10 16 ++ 17 9 26 0.517 0.107 0.055 031153 CC 0 9 9 CT 6 10 16 TT 17 2 19 0.517 0.107 2.391 031170 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031247 AA 22 21 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031284 AA 23 16 39 AG 0 4 4 GG 0 1 1 0.000 1.037 3.563 031533 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031616 -- 2 0 2 +- 8 0 8 ++ 13 22 35 0.221 0.000 2.396 031757 AA 19 22 41 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.152 031760 GG 2 0 2 GT 8 0 8 TT 14 22 36 0.296 0.000 2.504 031912 CC 24 21 45 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 032075 CC 14 22 36 CT 8 0 8 TT 1 0 1 0.011 0.000 0.450 032093 AA 13 22 35 AC 8 0 8 CC 2 0 2 0.221 0.000 2.396 032095 CC 18 22 40 CG 5 0 5 GG 0 0 0 0.342 0.000 0.156 032140 CC 17 2 19 CG 6 12 18 GG 0 8 8 0.517 0.702 1.001 032204 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 13 22 35 0.221 0.000 2.396 032392 GG 14 9 23 GT 8 11 19 TT 0 2 2 1.086 0.279 0.617 032645 AA 14 21 35 AT 8 0 8 TT 2 0 2 0.296 0.000 2.396 033120 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 033148 CC 7 23 30 CT 14 0 14 TT 3 0 3 0.960 0.000 0.577 033287 AA 2 0 2 AG 10 1 11 GG 12 22 34 0.002 0.011 0.763 033356 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 033359 CC 18 1 19 CT 6 8 14 TT 0 14 14 0.490 0.011 7.424 033571 CC 17 1 18 CT 5 6 11 TT 0 14 14 0.362 0.114 10.069 033631 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 033735 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 21 41 0.050 0.000 0.024 033788 AA 16 1 17 AG 6 6 12 GG 0 14 14 0.548 0.114 8.292 033861 CC 17 21 38 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.362 0.000 0.164 033892 CC 20 21 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 033914 AA 17 21 38 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.233 0.000 0.105 034268 AA 10 21 31 AG 10 0 10 GG 3 0 3 0.040 0.000 2.453 034544 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 034600 GG 0 1 1 GT 8 7 15 TT 16 15 31 0.960 0.025 0.280 034783 AA 18 1 19 AT 6 8 14 TT 0 14 14 0.490 0.011 7.424 034791 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 034826 GG 0 0 0 GT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 034850 CC 0 1 1 CT 5 7 12 TT 19 15 34 0.324 0.025 0.002 035010 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000987: t 010961: c 013224: gaga 022522: CAGGCGTGGTAGC 023495: t 023754: aa 026523: TGTCCTCTTCTGCTG 027855: c 028205: t 031142: c 031616: a Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 007060 CC 1 9 10 007060 CG 3 1 4 007060 CT 4 11 15 007060 GG 3 0 3 007060 GT 7 0 7 007060 TT 6 2 8