Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000095 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 000223 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 000413 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000454 T 0.50 0.34 0.42 C 0.50 0.66 0.58 0.50 0.45 0.49 000475 T 0.33 0.02 0.18 C 0.67 0.98 0.82 0.44 0.04 0.30 000606 T 0.15 0.64 0.38 C 0.85 0.36 0.62 0.25 0.46 0.47 000645 G 0.12 0.00 0.07 A 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 000689 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000711 A 0.33 0.02 0.18 G 0.67 0.98 0.82 0.44 0.04 0.30 000868 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 000902 T 0.15 0.65 0.39 C 0.85 0.35 0.61 0.25 0.45 0.48 000987 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001063 G 0.52 0.33 0.43 A 0.48 0.67 0.57 0.50 0.44 0.49 001064 A 0.04 0.09 0.06 G 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 001279 C 0.52 0.33 0.43 T 0.48 0.67 0.57 0.50 0.44 0.49 001630 C 0.20 0.66 0.42 T 0.80 0.34 0.58 0.31 0.45 0.49 001662 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001789 G 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 002106 G 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 002250 T 0.07 0.02 0.04 A 0.93 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 002495 T 0.13 0.63 0.38 A 0.87 0.37 0.62 0.23 0.47 0.47 002508 A 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002588 T 0.33 0.67 0.50 C 0.67 0.33 0.50 0.44 0.44 0.50 002770 T 0.20 0.67 0.42 C 0.80 0.33 0.58 0.31 0.44 0.49 002777 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 002877 G 0.21 0.68 0.45 A 0.79 0.32 0.55 0.34 0.43 0.50 002883 C 0.07 0.32 0.20 A 0.93 0.68 0.80 0.13 0.43 0.32 003160 A 0.20 0.68 0.43 G 0.80 0.32 0.57 0.31 0.43 0.49 003245 A 0.33 0.68 0.50 G 0.67 0.32 0.50 0.44 0.43 0.50 003303 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003348 A 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 003366 T 0.20 0.68 0.43 A 0.80 0.32 0.57 0.31 0.43 0.49 003696 G 0.07 0.33 0.20 A 0.93 0.67 0.80 0.12 0.44 0.31 003742 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003917 G 0.22 0.67 0.45 C 0.78 0.33 0.55 0.34 0.44 0.49 003989 A 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 004009 A 0.63 0.33 0.48 C 0.37 0.67 0.52 0.47 0.44 0.50 004054 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004199 T 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 004347 T 0.22 0.67 0.45 A 0.78 0.33 0.55 0.34 0.44 0.49 004608 G 0.22 0.67 0.45 A 0.78 0.33 0.55 0.34 0.44 0.49 004637 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004689 C 0.07 0.33 0.20 T 0.93 0.67 0.80 0.12 0.44 0.31 004706 A 0.07 0.33 0.20 G 0.93 0.67 0.80 0.12 0.44 0.31 004711 C 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 004736 G 0.15 0.63 0.39 A 0.85 0.37 0.61 0.26 0.47 0.48 004748 G 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 004779 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005068 C 0.33 0.02 0.18 T 0.67 0.98 0.82 0.44 0.04 0.30 005197 G 0.33 0.02 0.18 A 0.67 0.98 0.82 0.44 0.04 0.30 005380 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006016 G 0.15 0.65 0.39 A 0.85 0.35 0.61 0.25 0.45 0.48 006475 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006516 A 0.15 0.66 0.39 G 0.85 0.34 0.61 0.25 0.45 0.48 006581 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006629 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006818 G 0.48 0.33 0.40 A 0.52 0.67 0.60 0.50 0.44 0.48 007027 C 0.15 0.65 0.39 A 0.85 0.35 0.61 0.25 0.45 0.48 007060 * 007085 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007219 T 0.52 0.34 0.43 C 0.48 0.66 0.57 0.50 0.45 0.49 007224 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007324 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007349 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 007435 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007503 G 0.12 0.64 0.37 A 0.88 0.36 0.63 0.22 0.46 0.47 007551 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007636 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007947 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008047 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008056 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008077 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008098 A 0.25 0.02 0.14 G 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 008107 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008151 C 0.29 0.33 0.31 T 0.71 0.67 0.69 0.41 0.44 0.43 008242 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008426 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008522 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008562 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008864 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009802 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 009855 G 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 010014 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010168 T 0.52 0.33 0.43 C 0.48 0.67 0.57 0.50 0.44 0.49 010328 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 010455 A 0.52 0.33 0.42 G 0.48 0.67 0.58 0.50 0.44 0.49 010684 G 0.03 0.00 0.02 C 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.04 010909 G 0.25 0.04 0.15 C 0.75 0.96 0.85 0.38 0.08 0.25 010942 A 0.08 0.79 0.44 G 0.92 0.21 0.56 0.15 0.33 0.49 010945 G 0.12 0.65 0.38 C 0.88 0.35 0.62 0.22 0.45 0.47 010961 + 0.54 0.33 0.44 - 0.46 0.67 0.56 0.50 0.44 0.49 011281 T 0.12 0.65 0.38 C 0.88 0.35 0.62 0.22 0.45 0.47 011287 G 0.12 0.65 0.38 A 0.88 0.35 0.62 0.22 0.45 0.47 011523 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011528 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011550 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011595 T 0.15 0.65 0.39 C 0.85 0.35 0.61 0.25 0.45 0.48 011680 C 0.15 0.33 0.23 G 0.85 0.67 0.77 0.25 0.44 0.36 011806 T 0.25 0.00 0.13 A 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 011916 C 0.08 0.33 0.20 T 0.92 0.67 0.80 0.15 0.44 0.32 011983 C 0.23 0.02 0.13 A 0.77 0.98 0.87 0.35 0.04 0.22 012007 C 0.15 0.65 0.39 T 0.85 0.35 0.61 0.25 0.45 0.48 012787 A 0.31 0.00 0.16 T 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 012864 A 0.15 0.33 0.23 C 0.85 0.67 0.77 0.25 0.44 0.36 012889 A 0.31 0.00 0.16 T 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 012940 C 0.31 0.00 0.16 T 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 013007 G 0.27 0.00 0.14 A 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 013071 C 0.31 0.00 0.16 T 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 013072 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013133 T 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 013172 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013224 + 0.23 0.02 0.13 - 0.77 0.98 0.87 0.35 0.04 0.22 013265 T 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 015017 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 015097 T 0.22 0.66 0.43 G 0.78 0.34 0.57 0.34 0.45 0.49 015127 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015210 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015248 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015249 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015402 G 0.22 0.66 0.43 A 0.78 0.34 0.57 0.34 0.45 0.49 015441 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015483 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015602 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015619 T 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015711 G 0.22 0.66 0.43 C 0.78 0.34 0.57 0.34 0.45 0.49 015738 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015763 A 0.35 0.00 0.18 G 0.65 1.00 0.82 0.45 0.00 0.29 015770 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015774 A 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 015821 C 0.33 0.00 0.17 T 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 016004 C 0.43 0.00 0.21 T 0.57 1.00 0.79 0.49 0.00 0.33 016079 G 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 016209 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 016232 A 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 016254 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 016304 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016305 A 0.37 0.00 0.18 C 0.63 1.00 0.82 0.47 0.00 0.30 016323 G 0.29 0.00 0.13 T 0.71 1.00 0.87 0.41 0.00 0.23 016414 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 016642 G 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 016701 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016707 T 0.35 0.04 0.20 G 0.65 0.96 0.80 0.45 0.08 0.31 016709 G 0.50 0.04 0.27 A 0.50 0.96 0.73 0.50 0.08 0.40 016803 A 0.40 0.02 0.21 G 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 016825 A 0.40 0.02 0.21 G 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 016869 G 0.40 0.02 0.21 T 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 016898 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016901 C 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 016947 T 0.50 0.02 0.27 C 0.50 0.98 0.73 0.50 0.04 0.39 016972 A 0.40 0.02 0.21 C 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017098 G 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 017115 C 0.40 0.02 0.21 T 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017148 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 017244 A 0.40 0.02 0.21 G 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017250 G 0.35 0.02 0.19 A 0.65 0.98 0.81 0.46 0.04 0.31 017352 T 0.40 0.02 0.21 C 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017361 G 0.35 0.04 0.20 A 0.65 0.96 0.80 0.46 0.08 0.32 017451 A 0.40 0.02 0.21 G 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017459 C 0.35 0.33 0.34 G 0.65 0.67 0.66 0.46 0.44 0.45 017478 C 0.40 0.02 0.21 T 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017525 C 0.40 0.02 0.21 T 0.60 0.98 0.79 0.48 0.04 0.33 017557 A 0.31 0.02 0.17 C 0.69 0.98 0.83 0.43 0.04 0.28 017572 C 0.36 0.05 0.20 T 0.64 0.95 0.80 0.46 0.09 0.33 017593 G 0.29 0.66 0.48 A 0.71 0.34 0.52 0.41 0.45 0.50 017754 C 0.05 0.02 0.03 T 0.95 0.98 0.97 0.09 0.04 0.07 017809 C 0.33 0.32 0.32 T 0.68 0.68 0.68 0.44 0.43 0.44 017871 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 017920 G 0.38 0.34 0.36 C 0.62 0.66 0.64 0.47 0.45 0.46 018002 C 0.32 0.32 0.32 A 0.68 0.68 0.68 0.43 0.43 0.43 018107 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 018168 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018220 T 0.25 0.17 0.21 C 0.75 0.83 0.79 0.38 0.28 0.33 019039 T 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 019083 A 0.15 0.64 0.39 G 0.85 0.36 0.61 0.26 0.46 0.47 019219 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019235 A 0.39 0.32 0.36 G 0.61 0.68 0.64 0.48 0.43 0.46 019371 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019949 G 0.39 0.33 0.36 T 0.61 0.67 0.64 0.47 0.44 0.46 020024 G 0.39 0.33 0.36 A 0.61 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 020112 A 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 020164 A 0.30 0.02 0.17 G 0.70 0.98 0.83 0.42 0.05 0.28 020175 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 020204 A 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 020387 T 0.15 0.66 0.39 G 0.85 0.34 0.61 0.25 0.45 0.48 020434 C 0.31 0.00 0.16 T 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 020615 G 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020703 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020743 T 0.35 0.34 0.35 A 0.65 0.66 0.65 0.46 0.45 0.45 020803 A 0.15 0.66 0.39 G 0.85 0.34 0.61 0.25 0.45 0.48 020936 A 0.08 0.34 0.21 T 0.92 0.66 0.79 0.15 0.45 0.33 020942 G 0.35 0.34 0.35 A 0.65 0.66 0.65 0.46 0.45 0.45 020984 T 0.31 0.00 0.16 C 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 021342 C 0.31 0.02 0.17 T 0.69 0.98 0.83 0.43 0.04 0.29 021368 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021410 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 021428 T 0.25 0.66 0.45 G 0.75 0.34 0.55 0.38 0.45 0.49 021475 A 0.31 0.02 0.17 G 0.69 0.98 0.83 0.43 0.04 0.29 021962 G 0.58 0.34 0.47 T 0.42 0.66 0.53 0.49 0.45 0.50 021963 G 0.23 0.03 0.10 A 0.77 0.97 0.90 0.35 0.05 0.17 021997 A 0.35 0.32 0.34 G 0.65 0.68 0.66 0.46 0.43 0.45 022184 T 0.29 0.66 0.47 C 0.71 0.34 0.53 0.41 0.45 0.50 022522 - 0.34 0.32 0.33 + 0.66 0.68 0.67 0.45 0.43 0.44 022579 C 0.31 0.04 0.18 T 0.69 0.96 0.82 0.43 0.08 0.30 022632 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 022717 G 0.39 0.32 0.35 C 0.61 0.68 0.65 0.47 0.43 0.46 022862 C 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 022881 C 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 022882 G 0.41 0.32 0.37 T 0.59 0.68 0.63 0.48 0.43 0.46 022883 C 0.39 0.32 0.35 G 0.61 0.68 0.65 0.47 0.43 0.46 022921 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 023006 T 0.26 0.02 0.14 C 0.74 0.98 0.86 0.39 0.04 0.25 023023 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 023053 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023356 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023495 - 0.33 0.00 0.15 + 0.68 1.00 0.85 0.44 0.00 0.26 023558 C 0.16 0.33 0.26 T 0.84 0.67 0.74 0.26 0.44 0.38 023643 C 0.47 0.33 0.38 T 0.53 0.67 0.62 0.50 0.44 0.47 023754 + 0.50 0.34 0.42 - 0.50 0.66 0.58 0.50 0.45 0.49 023789 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 024241 C 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 024344 C 0.33 0.36 0.34 G 0.67 0.64 0.66 0.44 0.46 0.45 024406 G 0.10 0.00 0.06 A 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 024451 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024568 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 024573 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024587 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 024629 G 0.13 0.62 0.36 A 0.87 0.38 0.64 0.23 0.47 0.46 024665 C 0.15 0.00 0.08 T 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.15 024908 T 0.46 0.33 0.39 C 0.54 0.67 0.61 0.50 0.44 0.48 024954 A 0.52 0.33 0.42 G 0.48 0.67 0.58 0.50 0.44 0.49 025002 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 025336 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 025513 T 0.57 0.33 0.44 C 0.43 0.67 0.56 0.49 0.44 0.49 025783 C 0.56 0.32 0.45 T 0.44 0.68 0.55 0.49 0.43 0.49 025785 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025825 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025912 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026254 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 026302 T 0.56 0.32 0.45 G 0.44 0.68 0.55 0.49 0.43 0.49 026352 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026523 - 0.35 0.33 0.34 + 0.65 0.67 0.66 0.45 0.44 0.45 026563 A 0.03 0.00 0.02 G 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.04 026804 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026821 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 026952 C 0.33 0.02 0.17 G 0.67 0.98 0.83 0.44 0.04 0.29 026965 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027034 C 0.35 0.33 0.34 T 0.65 0.67 0.66 0.45 0.44 0.45 027051 C 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 027438 T 0.13 0.66 0.39 C 0.87 0.34 0.61 0.23 0.45 0.48 027593 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 027674 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 027708 T 0.36 0.34 0.35 C 0.64 0.66 0.65 0.46 0.45 0.45 027855 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 027944 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027969 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028012 G 0.33 0.00 0.17 C 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 028025 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 028169 C 0.31 0.33 0.32 T 0.69 0.67 0.68 0.43 0.44 0.43 028201 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 028205 - 0.12 0.00 0.06 + 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 028590 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028987 C 0.17 0.65 0.40 T 0.83 0.35 0.60 0.28 0.45 0.48 029089 A 0.31 0.02 0.17 T 0.69 0.98 0.83 0.43 0.04 0.28 029143 G 0.15 0.33 0.23 T 0.85 0.67 0.77 0.25 0.44 0.36 029311 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 029354 A 0.55 0.33 0.43 G 0.45 0.67 0.57 0.50 0.44 0.49 029376 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 029501 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 029521 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 029583 C 0.16 0.33 0.24 T 0.84 0.67 0.76 0.27 0.44 0.37 029662 G 0.55 0.33 0.44 A 0.45 0.67 0.56 0.50 0.44 0.49 029847 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 029873 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 029966 G 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 029990 A 0.00 0.13 0.07 C 1.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.13 030111 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 030223 G 0.28 0.00 0.13 A 0.72 1.00 0.87 0.40 0.00 0.22 030238 C 0.33 0.00 0.15 T 0.68 1.00 0.85 0.44 0.00 0.26 030262 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 030281 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 030293 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 030311 T 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 030313 A 0.07 0.57 0.34 C 0.93 0.43 0.66 0.14 0.49 0.45 030323 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 030343 G 0.33 0.00 0.15 A 0.68 1.00 0.85 0.44 0.00 0.26 030347 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 030348 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 030369 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 030385 G 0.28 0.00 0.13 A 0.72 1.00 0.87 0.40 0.00 0.22 030699 C 0.12 0.33 0.23 G 0.88 0.67 0.77 0.21 0.44 0.35 030751 C 0.19 0.00 0.10 T 0.81 1.00 0.90 0.31 0.00 0.17 030864 G 0.33 0.00 0.17 A 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 030889 G 0.54 0.00 0.28 C 0.46 1.00 0.72 0.50 0.00 0.41 030945 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031009 G 0.14 0.00 0.07 A 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 031136 A 0.00 0.18 0.07 G 1.00 0.82 0.93 0.00 0.30 0.13 031142 - 0.13 0.33 0.23 + 0.87 0.67 0.77 0.23 0.44 0.35 031153 C 0.13 0.67 0.39 T 0.87 0.33 0.61 0.23 0.44 0.47 031170 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031247 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031284 G 0.00 0.14 0.07 A 1.00 0.86 0.93 0.00 0.24 0.13 031533 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031616 - 0.26 0.00 0.13 + 0.74 1.00 0.87 0.39 0.00 0.23 031757 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 031760 G 0.25 0.00 0.13 T 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.23 031912 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 032075 T 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.20 032093 C 0.26 0.00 0.13 A 0.74 1.00 0.87 0.39 0.00 0.23 032095 G 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 032140 G 0.13 0.64 0.38 C 0.87 0.36 0.62 0.23 0.46 0.47 032204 A 0.26 0.00 0.13 G 0.74 1.00 0.87 0.39 0.00 0.23 032392 T 0.18 0.34 0.26 G 0.82 0.66 0.74 0.30 0.45 0.39 032645 T 0.25 0.00 0.13 A 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.23 033120 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033148 T 0.42 0.00 0.21 C 0.58 1.00 0.79 0.49 0.00 0.33 033287 A 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 033356 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033359 T 0.12 0.78 0.45 C 0.88 0.22 0.55 0.22 0.34 0.49 033571 T 0.11 0.81 0.45 C 0.89 0.19 0.55 0.20 0.31 0.50 033631 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033735 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 033788 G 0.14 0.81 0.47 A 0.86 0.19 0.53 0.24 0.31 0.50 033861 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 033892 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 033914 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 034268 G 0.35 0.00 0.18 A 0.65 1.00 0.82 0.45 0.00 0.30 034544 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034600 G 0.17 0.20 0.18 T 0.83 0.80 0.82 0.28 0.31 0.30 034783 T 0.12 0.78 0.45 A 0.88 0.22 0.55 0.22 0.34 0.49 034791 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034826 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 034850 C 0.10 0.20 0.15 T 0.90 0.80 0.85 0.19 0.31 0.25 035010 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000987: t 010961: c 013224: gaga 022522: CAGGCGTGGTAGC 023495: t 023754: aa 026523: TGTCCTCTTCTGCTG 027855: c 028205: t 031142: c 031616: a Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 007060 G 0.33 0.02 0.18 T 0.48 0.33 0.40 C 0.19 0.65 0.41