Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000251 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 000366 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 000369 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 000825 CC 21 21 42 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.012 0.048 0.054 000881 CC 1 0 1 CT 4 2 6 TT 18 21 39 1.252 0.048 1.467 001065 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 001067 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 001113 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001119 GG 1 0 1 GT 6 0 6 TT 17 23 40 0.240 0.000 1.527 001191 CC 1 0 1 CT 4 0 4 TT 19 23 42 1.361 0.000 3.895 001330 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 001387 AA 18 23 41 AC 5 0 5 CC 1 0 1 0.644 0.000 2.448 001587 AA 8 0 8 AG 9 4 13 GG 7 19 26 1.484 0.209 5.814 001592 CC 1 0 1 CG 1 0 1 GG 22 23 45 9.967 0.000 20.206 001818 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 18 23 41 0.124 0.000 0.055 001846 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 002055 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 18 23 41 19.000 0.000 42.000 002407 AA 17 23 40 AG 4 0 4 GG 1 0 1 1.144 0.000 3.673 002845 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 22 42 0.112 0.000 0.054 003578 CC 14 8 22 CG 8 9 17 GG 2 6 8 0.296 1.028 1.998 003776 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 003830 CC 1 0 1 CT 0 0 0 TT 23 23 46 24.000 0.000 47.000 004070 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 23 23 46 24.000 0.000 47.000 004073 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 23 23 46 24.000 0.000 47.000 004096 CC 1 0 1 CG 1 2 3 GG 22 21 43 9.967 0.048 6.306 004247 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 004436 GG 1 0 1 GT 3 0 3 TT 18 21 39 2.296 0.000 5.665 004526 GG 1 0 1 GT 3 0 3 TT 18 21 39 2.296 0.000 5.665 004619 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 20 21 41 9.075 0.000 18.427 004853 CC 18 22 40 CT 3 0 3 TT 1 0 1 2.296 0.000 5.825 004974 CC 19 22 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.024 005353 AA 18 23 41 AG 4 0 4 GG 1 0 1 1.252 0.000 3.784 005391 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 21 23 44 0.048 0.000 0.023 006102 AA 24 20 44 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.112 0.051 006197 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 1 0 1 9.967 0.000 20.206 006543 GG 1 0 1 GT 0 0 0 TT 23 23 46 24.000 0.000 47.000 006560 -- 0 3 3 +- 3 13 16 ++ 19 7 26 0.118 0.631 0.063 006674 CC 18 21 39 CT 5 2 7 TT 1 0 1 0.644 0.048 0.919 007046 GG 1 0 1 GT 1 0 1 TT 22 22 44 9.967 0.000 19.761 007047 AA 1 0 1 AC 5 1 6 CC 18 21 39 0.644 0.012 1.467 007180 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 007211 -- 23 22 45 +- 1 1 2 ++ 0 0 0 0.011 0.011 0.022 007302 CC 2 0 2 CG 3 2 5 GG 18 21 39 5.624 0.048 6.790 011055 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 011306 GG 21 23 44 GT 1 0 1 TT 1 0 1 9.521 0.000 19.761 011307 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 21 23 44 9.521 0.000 19.761 011381 AA 1 0 1 AG 1 0 1 GG 21 23 44 9.521 0.000 19.761 011414 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 011792 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 011799 CC 21 7 28 CT 2 13 15 TT 1 3 4 4.959 0.631 0.876 011812 CC 21 7 28 CT 2 13 15 TT 1 3 4 4.959 0.631 0.876 014611 CC 18 22 40 CT 2 0 2 TT 1 0 1 4.203 0.000 9.727 014612 AA 1 3 4 AG 2 12 14 GG 18 7 25 4.203 0.362 0.903 014685 GG 22 20 42 GT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.024 014742 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 014835 GG 22 22 44 GT 0 0 0 TT 1 0 1 23.000 0.000 45.000 014917 AA 1 3 4 AC 2 13 15 CC 20 6 26 4.707 0.917 0.691 014934 CC 22 20 42 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.050 0.054 015028 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 21 22 43 9.521 0.000 19.316 015419 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 015444 -- 2 3 5 +- 4 13 17 ++ 18 6 24 3.840 0.917 0.545 015499 AA 3 3 6 AG 5 13 18 GG 16 6 22 4.041 0.917 0.553 015672 GG 20 23 43 GT 2 0 2 TT 1 0 1 4.707 0.000 10.478 015708 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 015784 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 015794 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 1 0 1 9.521 0.000 19.761 015831 CC 0 0 0 CG 1 3 4 GG 22 20 42 0.011 0.112 0.095 016121 CC 2 0 2 CG 11 1 12 GG 10 22 32 0.179 0.011 0.390 016469 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016534 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 21 23 44 9.521 0.000 19.761 016541 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 016639 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 016700 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 22 23 45 23.000 0.000 46.000 016738 GG 2 3 5 GT 3 13 16 TT 18 6 24 5.624 0.917 0.815 016906 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 20 22 42 9.075 0.000 18.871 017042 AA 13 7 20 AG 4 13 17 GG 3 3 6 4.356 0.631 0.574 017212 CC 1 3 4 CT 2 13 15 TT 19 7 26 4.455 0.631 0.691 017300 GG 19 7 26 GT 2 13 15 TT 1 3 4 4.455 0.631 0.691 017339 -- 2 3 5 +- 2 13 15 ++ 13 7 20 6.023 0.631 0.648 017357 -- 18 7 25 +- 3 13 16 ++ 2 3 5 5.624 0.631 0.930 017557 AA 1 2 3 AG 1 10 11 GG 22 11 33 9.967 0.017 2.074 017586 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 017683 -- 21 7 28 +- 2 13 15 ++ 1 3 4 4.959 0.631 0.876 017714 AA 2 3 5 AG 3 13 16 GG 19 7 26 5.958 0.631 1.048 017926 AA 23 23 46 AT 0 0 0 TT 1 0 1 24.000 0.000 47.000 017980 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 017991 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 018289 AA 11 22 33 AC 11 1 12 CC 2 0 2 0.107 0.011 0.435 018354 CC 16 7 23 CT 4 13 17 TT 1 3 4 1.037 0.631 0.111 018504 GG 0 0 0 GT 1 2 3 TT 21 21 42 0.012 0.048 0.054 018795 AA 2 3 5 AG 3 10 13 GG 18 10 28 5.624 0.040 2.792 019034 AA 5 19 24 AC 10 3 13 CC 8 1 9 0.306 2.457 6.214 019041 CC 2 3 5 CG 3 12 15 GG 18 8 26 5.624 0.209 1.427 019093 AA 6 1 7 AG 10 3 13 GG 7 19 26 0.381 2.457 4.667 019171 CC 8 22 30 CT 10 1 11 TT 5 0 5 0.306 0.011 4.748 019211 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 019292 CC 18 20 38 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.007 019389 CC 18 21 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 019390 AA 1 3 4 AG 2 12 14 GG 16 6 22 3.698 0.583 0.598 019463 CC 18 21 39 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.006 019868 -- 1 2 3 +- 2 13 15 ++ 17 7 24 3.951 1.333 0.095 019923 CC 19 20 39 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.013 0.012 0.026 019959 CC 11 8 19 CT 8 7 15 TT 1 6 7 0.089 2.249 1.636 020057 GG 19 21 40 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.006 020294 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 18 22 40 8.183 0.000 17.982 020335 CC 19 23 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.054 020601 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 020627 GG 20 8 28 GT 2 12 14 TT 0 3 3 0.050 0.209 0.450 020736 CC 19 7 26 CT 3 13 16 TT 0 3 3 0.118 0.631 0.063 020987 CC 1 6 7 CT 11 6 17 TT 10 5 15 0.889 1.446 0.315 021097 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 021135 AA 0 2 2 AC 1 11 12 CC 20 8 28 0.012 0.416 0.227 021152 * 021198 AA 0 3 3 AG 1 8 9 GG 19 9 28 0.013 0.292 2.736 026871 CC 21 20 41 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.055 027051 AA 4 19 23 AG 8 3 11 GG 12 0 12 1.500 0.118 11.168 027061 CC 24 21 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 027106 GG 4 19 23 GT 12 3 15 TT 8 0 8 0.020 0.118 3.359 027107 -- 4 5 9 +- 10 10 20 ++ 10 4 14 0.296 0.059 0.140 027277 CC 21 7 28 CG 3 13 16 GG 0 3 3 0.107 0.631 0.120 027330 AA 23 21 44 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.051 027462 CC 8 0 8 CG 12 4 16 GG 4 19 23 0.020 0.209 2.751 027545 AA 4 15 19 AG 16 3 19 GG 4 0 4 2.667 0.149 0.058 027561 AA 2 0 2 AC 11 1 12 CC 11 17 28 0.107 0.015 0.227 027568 GG 8 0 8 GT 12 3 15 TT 4 17 21 0.020 0.131 2.816 027602 CC 24 17 41 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.059 0.024 027665 AA 6 0 6 AG 11 4 15 GG 7 19 26 0.160 0.209 2.286 027812 GG 4 19 23 GT 12 4 16 TT 8 0 8 0.020 0.209 2.751 027824 CC 1 0 1 CG 1 0 1 GG 22 23 45 9.967 0.000 20.206 027883 CC 1 0 1 CT 1 0 1 TT 22 23 45 9.967 0.000 20.206 028166 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 028183 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 028441 AA 20 23 43 AG 1 0 1 GG 1 0 1 9.075 0.000 19.316 028495 CC 8 0 8 CT 10 4 14 TT 4 19 23 0.079 0.209 4.050 028499 -- 8 0 8 +- 10 4 14 ++ 4 19 23 0.079 0.209 4.050 028500 AA 3 6 9 AG 8 11 19 GG 3 6 9 0.286 0.043 0.027 028506 AA 8 0 8 AG 9 4 13 GG 5 19 24 0.609 0.209 5.160 028607 GG 8 0 8 GT 11 4 15 TT 4 19 23 0.004 0.209 3.359 028808 AA 11 8 19 AG 10 9 19 GG 1 6 7 0.468 1.028 0.372 028916 AA 8 0 8 AG 10 4 14 GG 4 19 23 0.079 0.209 4.050 029030 AA 0 0 0 AT 1 4 5 TT 21 16 37 0.012 0.247 0.168 029057 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 029058 AA 7 0 7 AG 11 4 15 GG 4 19 23 0.008 0.209 2.525 029254 CC 23 21 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 029381 -- 22 23 45 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 029460 GG 20 23 43 GT 1 0 1 TT 1 0 1 9.075 0.000 19.316 029467 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 029468 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 029565 CC 10 0 10 CG 10 4 14 GG 3 19 22 0.040 0.209 5.534 029652 AA 22 23 45 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 029658 AA 22 23 45 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 029695 AA 12 6 18 AG 9 11 20 GG 2 6 8 0.028 0.043 0.351 029784 AA 3 19 22 AG 11 4 15 GG 9 0 9 0.016 0.209 3.901 030011 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 030074 GG 0 0 0 GT 1 1 2 TT 21 22 43 0.012 0.011 0.023 030170 -- 6 0 6 +- 12 4 16 ++ 6 19 25 0.000 0.209 1.629 030414 CC 12 6 18 CT 10 11 21 TT 2 6 8 0.002 0.043 0.193 030539 AA 23 18 41 AG 1 4 5 GG 0 1 1 0.011 1.252 2.448 030690 CC 12 6 18 CG 10 11 21 GG 2 6 8 0.002 0.043 0.193 030994 CC 12 6 18 CT 10 11 21 TT 2 6 8 0.002 0.043 0.193 031039 CC 2 6 8 CG 10 11 21 GG 12 6 18 0.002 0.043 0.193 031215 AA 11 6 17 AC 11 11 22 CC 1 5 6 0.741 0.000 0.072 031273 CC 12 6 18 CT 10 11 21 TT 1 5 6 0.374 0.000 0.001 031280 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 22 44 0.011 0.000 0.006 031340 AA 12 6 18 AG 10 11 21 GG 1 5 6 0.374 0.000 0.001 031375 -- 4 5 9 +- 12 11 23 ++ 6 6 12 0.220 0.000 0.111 031621 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 031833 CC 16 7 23 CT 6 13 19 TT 2 3 5 1.407 0.631 0.130 032329 AA 3 0 3 AG 7 2 9 GG 6 19 25 0.139 0.053 2.266 032392 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 15 20 35 0.017 0.012 0.029 032470 AA 0 0 0 AC 1 1 2 CC 15 20 35 0.017 0.012 0.029 032494 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 16 20 36 0.000 0.012 0.007 035788 CC 0 0 0 CT 1 4 5 TT 18 18 36 0.014 0.220 0.173 035792 AA 16 18 34 AG 2 3 5 GG 1 1 2 3.698 2.296 5.795 035908 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 16 21 37 0.383 0.000 0.168 036088 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 19 20 39 0.013 0.012 0.026 036090 CC 1 3 4 CG 5 13 18 GG 14 5 19 0.360 1.307 0.008 036324 GG 0 0 0 GT 1 3 4 TT 19 18 37 0.013 0.124 0.108 036375 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 036404 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 20 23 43 0.050 0.000 0.023 036647 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 036648 AA 3 0 3 AT 6 14 20 TT 15 9 24 2.667 4.402 0.189 036953 CC 16 5 21 CT 5 15 20 TT 3 3 6 4.041 2.272 0.129 037049 CC 12 13 25 CT 4 10 14 TT 3 0 3 3.971 1.775 0.277 037092 CC 11 13 24 CT 6 10 16 TT 1 0 1 0.023 1.775 0.791 037181 AA 1 1 2 AC 1 4 5 CC 15 18 33 6.842 1.252 5.596 037182 CC 11 13 24 CG 3 10 13 GG 3 0 3 5.080 1.775 0.422 038092 CC 19 13 32 CT 2 10 12 TT 2 0 2 8.746 1.775 0.390 038104 CC 4 8 12 CG 4 9 13 GG 15 6 21 6.933 1.028 7.819 038133 AA 17 14 31 AG 3 7 10 GG 2 0 2 5.290 0.840 0.927 038224 CC 7 5 12 CT 11 14 25 TT 5 4 9 0.030 1.110 0.386 038337 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 038529 AA 3 0 3 AG 10 0 10 GG 10 23 33 0.040 0.000 2.726 038592 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 041915 AA 0 0 0 AG 1 4 5 GG 21 18 39 0.012 0.220 0.160 042105 AA 2 0 2 AG 3 10 13 GG 17 13 30 5.290 1.775 0.147 042112 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 042195 -- 15 13 28 +- 5 9 14 ++ 2 1 3 2.001 0.130 0.450 042262 AA 9 9 18 AG 6 13 19 GG 8 0 8 5.239 3.869 0.561 042336 CC 2 0 2 CT 5 10 15 TT 16 13 29 2.200 1.775 0.001 042347 CC 2 0 2 CG 5 10 15 GG 16 13 29 2.200 1.775 0.001 042439 AA 16 13 29 AG 5 10 15 GG 2 0 2 2.200 1.775 0.001 042460 GG 2 0 2 GT 5 10 15 TT 16 13 29 2.200 1.775 0.001 042713 CC 1 6 7 CT 7 9 16 TT 15 5 20 0.025 0.191 1.408 042853 CC 22 16 38 CT 2 2 4 TT 0 0 0 0.045 0.062 0.105 042864 CC 18 18 36 CT 4 0 4 TT 2 0 2 3.840 0.000 8.406 043095 CC 16 17 33 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.195 0.000 1.111 043135 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 043219 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 043288 CC 16 13 29 CG 5 10 15 GG 3 0 3 4.041 1.775 0.303 043306 CC 3 0 3 CT 6 15 21 TT 15 7 22 2.667 5.886 0.468 043620 AA 23 22 45 AC 1 1 2 CC 0 0 0 0.011 0.011 0.022 043637 CC 18 22 40 CT 6 1 7 TT 0 0 0 0.490 0.011 0.304 043703 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 044054 CC 18 23 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 044060 AA 0 0 0 AC 1 4 5 CC 18 19 37 0.014 0.209 0.168 044207 GG 11 13 24 GT 6 10 16 TT 1 0 1 0.023 1.775 0.791 044663 CC 12 9 21 CT 10 14 24 TT 1 0 1 0.374 4.402 3.781 044730 AA 1 0 1 AG 9 11 20 GG 13 12 25 0.130 2.272 1.746 044804 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 23 20 43 0.011 0.112 0.093 044961 -- 0 0 0 +- 1 3 4 ++ 23 19 42 0.011 0.118 0.095 044992 CC 21 19 40 CT 0 0 0 TT 2 0 2 23.000 0.000 42.000 045000 GG 6 0 6 GT 7 0 7 TT 10 19 29 3.188 0.000 11.527 045041 CC 22 19 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 045049 CC 21 19 40 CT 1 0 1 TT 1 0 1 9.521 0.000 17.982 045081 AA 21 19 40 AG 0 0 0 GG 2 0 2 23.000 0.000 42.000 045119 AA 4 0 4 AG 4 0 4 GG 14 19 33 6.455 0.000 15.232 045146 GG 20 19 39 GT 0 0 0 TT 2 0 2 22.000 0.000 41.000 045523 CC 21 23 44 CT 0 0 0 TT 1 0 1 22.000 0.000 45.000 045550 CC 1 0 1 CT 0 0 0 TT 21 23 44 22.000 0.000 45.000 045616 AA 19 23 42 AG 1 0 1 GG 1 0 1 8.629 0.000 18.871 045740 CC 16 23 39 CT 2 0 2 TT 3 0 3 10.032 0.000 23.128 045765 AA 21 20 41 AC 1 3 4 CC 0 0 0 0.012 0.112 0.097 045888 AA 13 12 25 AG 9 9 18 GG 2 0 2 0.061 1.562 0.309 045909 AA 13 12 25 AG 9 9 18 GG 2 0 2 0.061 1.562 0.309 046058 AA 24 19 43 AT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.118 0.052 046088 AA 13 12 25 AG 9 10 19 GG 2 0 2 0.061 1.903 0.473 046221 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 046254 GG 23 22 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 046753 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 047168 AA 2 1 3 AC 2 4 6 CC 19 13 32 8.746 0.720 7.037 047410 CC 19 5 24 CT 4 16 20 TT 1 1 2 1.361 5.594 0.747 047525 CC 20 21 41 CT 4 1 5 TT 0 0 0 0.198 0.012 0.152 047904 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 048160 AA 23 20 43 AC 1 3 4 CC 0 0 0 0.011 0.112 0.093 048178 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 048904 AA 3 0 3 AT 7 10 17 TT 13 13 26 1.431 1.775 0.010 048932 -- 1 2 3 +- 3 15 18 ++ 18 5 23 2.296 3.337 0.043 049067 GG 5 0 5 GT 11 14 25 TT 8 9 17 0.114 4.402 0.895 050927 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 22 43 0.012 0.000 0.006 051402 CC 2 0 2 CT 9 13 22 TT 10 9 19 0.000 3.869 1.948 052348 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 13 36 0.011 0.000 0.007 052485 AA 8 8 16 AG 10 13 23 GG 6 1 7 0.621 2.182 0.073 052814 AA 1 0 1 AG 10 11 21 GG 13 11 24 0.296 2.444 2.174 052903 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 053321 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 23 19 42 0.011 0.118 0.095 053322 AA 0 0 0 AC 1 3 4 CC 23 19 42 0.011 0.118 0.095 053508 AA 20 19 39 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.058 057160 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 17 23 40 0.059 0.000 0.025 057162 CC 16 19 35 CT 1 4 5 TT 0 0 0 0.016 0.209 0.178 057295 CC 10 12 22 CT 6 11 17 TT 1 0 1 0.006 2.272 1.203 057433 AA 18 22 40 AG 6 1 7 GG 0 0 0 0.490 0.011 0.304 057692 AA 1 0 1 AG 10 11 21 GG 13 12 25 0.296 2.272 2.049 057948 AA 21 20 41 AG 2 3 5 GG 0 0 0 0.048 0.112 0.152 057984 AA 8 9 17 AT 9 14 23 TT 6 0 6 1.028 4.402 0.169 058262 GG 1 0 1 GT 10 11 21 TT 13 12 25 0.296 2.272 2.049 058453 CC 6 0 6 CT 10 10 20 TT 8 9 17 0.621 2.423 0.001 058808 CC 16 23 39 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.195 0.000 1.467 058809 AA 0 0 0 AG 4 1 5 GG 19 22 41 0.209 0.011 0.152 058979 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 22 22 44 0.011 0.011 0.023 059210 CC 19 17 36 CT 4 1 5 TT 0 0 0 0.209 0.015 0.173 059283 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 19 18 37 0.209 0.000 0.108 059462 AA 1 0 1 AG 7 5 12 GG 14 10 24 0.011 0.600 0.121 059717 AA 16 23 39 AC 4 0 4 CC 1 0 1 1.037 0.000 3.563 059762 AA 0 0 0 AG 5 9 14 GG 15 10 25 0.408 1.830 1.866 059794 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 16 19 35 0.247 0.000 0.114 059823 CC 11 11 22 CT 7 8 15 TT 1 0 1 0.007 1.351 0.709 059912 AA 15 19 34 AC 4 0 4 CC 1 0 1 0.930 0.000 3.009 060029 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 19 19 38 0.013 0.118 0.105 061303 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 061346 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 061390 AA 1 4 5 AG 7 16 23 GG 15 2 17 0.025 4.791 0.454 061432 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 061458 AA 19 22 41 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.209 0.000 0.097 061859 GG 22 22 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 062074 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 062210 AA 13 11 24 AG 10 10 20 GG 1 0 1 0.296 2.051 1.858 062642 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 062647 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 062835 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 23 21 44 0.011 0.048 0.051 063047 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 20 22 42 0.198 0.000 0.095 063142 CC 23 21 44 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 063143 AA 0 0 0 AG 1 4 5 GG 23 19 42 0.011 0.209 0.148 063240 AA 17 23 40 AG 6 0 6 GG 1 0 1 0.240 0.000 1.527 063259 AA 23 21 44 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.048 0.051 063447 AA 6 0 6 AG 10 12 22 GG 8 10 18 0.621 3.094 0.032 063748 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 22 21 43 0.011 0.048 0.052 063917 CC 16 2 18 CG 6 13 19 GG 1 8 9 0.195 1.043 0.915 063930 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 064034 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 064967 AA 1 0 1 AG 10 11 21 GG 13 12 25 0.296 2.272 2.049 065028 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 065388 -- 1 0 1 +- 6 0 6 ++ 17 23 40 0.240 0.000 1.527 065520 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 065543 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 065669 GG 24 22 46 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 065844 AA 20 23 43 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.198 0.000 0.093 066464 GG 11 14 25 GT 4 3 7 TT 1 1 2 0.515 1.655 1.972 066473 -- 1 0 1 +- 5 3 8 ++ 12 18 30 0.231 0.124 0.264 066494 CC 13 12 25 CT 6 10 16 TT 1 0 1 0.078 1.903 0.724 066614 -- 12 12 24 +- 10 11 21 ++ 1 0 1 0.374 2.272 2.174 066872 CC 10 15 25 CT 9 6 15 TT 5 2 7 1.119 1.252 2.984 067043 AA 0 0 0 AC 1 2 3 CC 22 21 43 0.011 0.048 0.052 067052 CC 1 0 1 CT 10 11 21 TT 13 12 25 0.296 2.272 2.049 067243 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 19 21 40 0.053 0.012 0.056 067252 CC 0 0 0 CG 1 1 2 GG 21 21 42 0.012 0.012 0.024 067262 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 22 21 43 0.000 0.012 0.006 067698 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 068059 AA 13 12 25 AG 10 11 21 GG 1 0 1 0.296 2.272 2.049 068132 CC 1 0 1 CT 10 11 21 TT 13 12 25 0.296 2.272 2.049 068155 CC 0 0 0 CG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 068167 AA 23 22 45 AG 1 1 2 GG 0 0 0 0.011 0.011 0.022 068286 AA 13 12 25 AG 10 11 21 GG 1 0 1 0.296 2.272 2.049 068441 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 23 21 44 0.011 0.048 0.051 068621 AA 23 21 44 AT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 068717 AA 3 4 7 AG 10 16 26 GG 11 2 13 0.094 4.791 1.035 068859 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 068980 AA 20 21 41 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.097 069823 AA 0 0 0 AC 1 2 3 CC 20 18 38 0.012 0.055 0.059 070698 AA 22 22 44 AT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.023 070877 AA 12 10 22 AC 10 10 20 CC 1 0 1 0.374 2.222 2.111 071003 CC 0 0 0 CG 1 1 2 GG 21 21 42 0.012 0.012 0.024 071143 CC 10 12 22 CG 8 10 18 GG 1 0 1 0.140 1.903 1.485 071503 CC 0 0 0 CG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 071516 CC 16 18 34 CT 8 4 12 TT 0 0 0 0.960 0.220 1.035 071785 AA 11 1 12 AT 10 15 25 TT 3 3 6 0.094 6.764 1.486 072018 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 072160 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 072244 AA 3 5 8 AC 9 16 25 CC 11 2 13 0.277 3.969 0.460 072744 AA 20 22 42 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.050 0.000 0.024 072877 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 24 20 44 0.000 0.050 0.023 073092 AA 11 10 21 AC 12 13 25 CC 1 0 1 1.059 3.569 4.204 073193 -- 0 0 0 +- 1 2 3 ++ 22 21 43 0.011 0.048 0.052 073272 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 073399 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 073800 AA 2 0 2 AG 10 10 20 GG 12 10 22 0.002 2.222 0.936 074966 CC 23 19 42 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.053 0.054 074984 AA 21 21 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 075208 CC 13 2 15 CT 7 16 23 TT 2 5 7 0.505 3.969 0.139 075211 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 075339 CC 23 21 44 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.051 075383 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 075529 AA 1 0 1 AT 6 0 6 TT 16 19 35 0.195 0.000 1.229 075694 CC 12 11 23 CT 10 8 18 TT 1 0 1 0.374 1.351 1.380 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 006560: GTTT 007211: T 011055: T 015444: G 017339: ttta 017357: TCC 017683: A 019868: a 027107: g 028499: CG 029381: ct 030170: t 031280: ca 031375: t 036404: ATT 042195: AT 044961: C 048932: AAC 057160: a 063047: t 065388: aaag 066473: A 066614: A 073193: a Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 021152 CC 14 8 22 021152 CG 2 12 14 021152 CT 3 0 3 021152 GG 1 1 2 021152 GT 0 0 0 021152 TT 0 0 0