Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000419 AA 9 14 23 AG 7 7 14 GG 4 1 5 1.284 0.011 1.412 000483 CC 20 22 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 000506 AA 9 10 19 AG 12 10 22 GG 1 2 3 1.455 0.050 1.022 000507 CC 3 0 3 CT 8 8 16 TT 11 14 25 0.577 1.086 0.040 000512 AA 2 0 2 AG 9 8 17 GG 11 14 25 0.007 1.086 0.176 000535 CC 11 14 25 CT 9 8 17 TT 2 0 2 0.007 1.086 0.176 000937 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001007 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001156 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 001430 AA 20 18 38 AG 3 2 5 GG 0 0 0 0.112 0.055 0.164 002055 CC 22 22 44 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.045 0.011 0.051 002120 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 002136 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 002168 CC 23 23 46 CT 0 0 0 TT 1 0 1 24.000 0.000 47.000 002174 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 20 43 0.011 0.000 0.006 002448 CC 18 16 34 CT 5 6 11 TT 1 1 2 0.644 0.195 0.763 002535 CC 6 13 19 CT 11 9 20 TT 7 1 8 0.160 0.130 0.466 002800 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 002866 AA 6 13 19 AT 11 8 19 TT 5 1 6 0.000 0.027 0.127 003116 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 22 42 0.112 0.000 0.054 003135 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 20 43 0.000 0.050 0.023 003281 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 23 18 41 0.000 0.220 0.097 003386 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 003553 GG 19 21 40 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.025 003565 CC 18 17 35 CT 3 4 7 TT 0 0 0 0.124 0.233 0.347 003610 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 21 21 42 0.000 0.012 0.006 003694 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 16 23 39 0.548 0.000 0.230 003734 CC 13 7 20 CT 8 13 21 TT 1 3 4 0.027 0.631 0.211 003850 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 003976 -- 9 6 15 +- 12 13 25 ++ 2 4 6 0.517 0.445 0.780 004223 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 23 45 0.045 0.000 0.022 004264 CC 1 3 4 CG 9 13 22 GG 14 7 21 0.091 0.631 0.279 004305 CC 11 7 18 CG 12 13 25 GG 1 3 4 1.059 0.631 1.317 004464 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 21 21 42 0.012 0.000 0.006 004556 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 23 44 0.107 0.000 0.051 004580 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 004627 CC 1 3 4 CT 7 13 20 TT 16 7 23 0.044 0.631 0.014 004635 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 18 23 41 0.490 0.000 0.218 004747 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 004778 AA 0 0 0 AC 3 2 5 CC 20 21 41 0.112 0.048 0.152 004949 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 005091 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 005126 AA 0 0 0 AC 3 2 5 CC 21 21 42 0.107 0.048 0.148 005312 AA 13 4 17 AT 7 14 21 TT 1 4 5 0.002 1.636 0.151 005416 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 15 22 37 0.583 0.000 0.242 005439 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 18 20 38 0.124 0.050 0.164 006165 AA 24 21 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 006384 AA 21 20 41 AG 3 2 5 GG 0 0 0 0.107 0.050 0.152 006767 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 006802 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 006863 AA 7 6 13 AG 15 13 28 GG 2 4 6 2.258 0.445 2.244 006867 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 006896 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 007176 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 007228 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 007325 CC 1 6 7 CT 9 12 21 TT 13 4 17 0.130 0.220 0.015 007638 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 007728 CC 24 21 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 007767 CC 1 5 6 CT 10 12 22 TT 13 4 17 0.296 0.444 0.072 007792 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 008181 AA 13 4 17 AG 9 13 22 GG 1 6 7 0.130 0.445 0.001 008398 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 008437 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 21 42 0.012 0.000 0.006 008453 AA 1 4 5 AC 7 13 20 CC 13 4 17 0.002 1.190 0.058 008571 -- 0 4 4 +- 5 7 12 ++ 16 9 25 0.383 1.284 1.748 008704 GG 1 4 5 GT 6 12 18 TT 15 4 19 0.153 0.800 0.054 008769 AA 16 4 20 AG 7 15 22 GG 1 4 5 0.044 2.130 0.084 009117 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 23 45 0.045 0.000 0.022 009139 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002174: C 003610: C 003976: C 004223: TGAG 008437: A 008571: TTGTTATTAATACCCATTATATTCCTGTAA 009117: CA