Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000419 G 0.38 0.20 0.29 A 0.62 0.80 0.71 0.47 0.33 0.41 000483 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 000506 G 0.32 0.32 0.32 A 0.68 0.68 0.68 0.43 0.43 0.43 000507 C 0.32 0.18 0.25 T 0.68 0.82 0.75 0.43 0.30 0.38 000512 A 0.30 0.18 0.24 G 0.70 0.82 0.76 0.42 0.30 0.36 000535 T 0.30 0.18 0.24 C 0.70 0.82 0.76 0.42 0.30 0.36 000937 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001007 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001156 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001430 G 0.07 0.05 0.06 A 0.93 0.95 0.94 0.12 0.10 0.11 002055 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 002120 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002136 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002168 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002174 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002448 T 0.15 0.17 0.16 C 0.85 0.83 0.84 0.25 0.29 0.27 002535 T 0.52 0.24 0.38 C 0.48 0.76 0.62 0.50 0.36 0.47 002800 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 002866 T 0.48 0.23 0.35 A 0.52 0.77 0.65 0.50 0.35 0.46 003116 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003135 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 003281 A 0.00 0.09 0.04 G 1.00 0.91 0.96 0.00 0.17 0.08 003386 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003553 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 003565 T 0.07 0.10 0.08 C 0.93 0.90 0.92 0.13 0.17 0.15 003610 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003694 C 0.14 0.00 0.07 T 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.12 003734 T 0.23 0.41 0.32 C 0.77 0.59 0.68 0.35 0.48 0.44 003850 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003976 + 0.35 0.46 0.40 - 0.65 0.54 0.60 0.45 0.50 0.48 004223 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004264 C 0.23 0.41 0.32 G 0.77 0.59 0.68 0.35 0.48 0.43 004305 G 0.29 0.41 0.35 C 0.71 0.59 0.65 0.41 0.48 0.46 004464 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004556 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004580 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 004627 C 0.19 0.41 0.30 T 0.81 0.59 0.70 0.30 0.48 0.42 004635 C 0.12 0.00 0.06 T 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 004747 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004778 A 0.07 0.04 0.05 C 0.93 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 004949 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005091 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005126 A 0.06 0.04 0.05 C 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 005312 T 0.21 0.50 0.36 A 0.79 0.50 0.64 0.34 0.50 0.46 005416 C 0.14 0.00 0.07 T 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 005439 A 0.07 0.05 0.06 G 0.93 0.95 0.94 0.13 0.09 0.11 006165 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006384 G 0.06 0.05 0.05 A 0.94 0.95 0.95 0.12 0.09 0.10 006767 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006802 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006863 G 0.40 0.46 0.43 A 0.60 0.54 0.57 0.48 0.50 0.49 006867 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006896 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007176 C 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 007228 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007325 C 0.24 0.55 0.39 T 0.76 0.45 0.61 0.36 0.50 0.48 007638 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007728 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007767 C 0.25 0.52 0.38 T 0.75 0.48 0.62 0.38 0.50 0.47 007792 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008181 G 0.24 0.54 0.39 A 0.76 0.46 0.61 0.36 0.50 0.48 008398 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008437 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008453 A 0.21 0.50 0.36 C 0.79 0.50 0.64 0.34 0.50 0.46 008571 - 0.12 0.38 0.24 + 0.88 0.62 0.76 0.21 0.47 0.37 008704 G 0.18 0.50 0.33 T 0.82 0.50 0.67 0.30 0.50 0.44 008769 G 0.19 0.50 0.34 A 0.81 0.50 0.66 0.30 0.50 0.45 009117 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009139 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002174: C 003610: C 003976: C 004223: TGAG 008437: A 008571: TTGTTATTAATACCCATTATATTCCTGTAA 009117: CA