************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /home/qyi/lib/phase/PHASE2 -d1 fac2r.phase.inp fac2r.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST fac2r.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates fac2r.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual fac2r.phase.out_recom : estimates of recombination parameters fac2r.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 47 Number of Loci: 60 Positions of loci: 234 352 1219 1631 2372 2762 2860 2930 3481 3525 3948 4017 4038 4107 4336 4393 4617 5128 5276 5472 5681 5708 5944 6695 6963 6992 7881 7940 9113 9918 10217 11084 11471 11489 14244 14336 14836 15261 16596 17049 17702 17840 18141 19389 20711 20813 21052 22247 22688 23029 23094 23319 23528 23765 23859 24372 24408 24509 24643 24649 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file fac2r.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 CGGIGCGTCTAAGAGGTTCGACIGGGCTAGATIGAAGTAGCCACATAGGGGAACAGGATC 6.000000 2 CGGIGCGTCTAAGAGGTTCGACIGGGCTAGATDGAAGTAGCCACATAGGGGAACAGGATC 1.000000 3 TAADGCATCCAAGAAGATCAAAIGAATGCGATIGGGGCAACCTTATATAAGATCAAGGTC 2.000000 4 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTA 8.000000 5 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 1.000000 6 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGCC 1.000000 7 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGGGACAACCATACATAGGAACAGGGTA 6.000000 8 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGGGGCAACCATACCTAGGATCAGGGCC 10.000000 9 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGGGGCAACCTTATATAAGATCAAGGTC 3.000000 10 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATDGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 1.000000 11 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATAGAGTC 1.000000 12 TAADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATGGAGTC 1.000000 13 TAADGCATGCAAGAAGATCAAAIGAATGCGATIGGGGCAACCTTATATAGGAACAGGGTA 1.000000 14 TAADGCATGTAAGAAGATCAACIGAATGCGATDGAGGCAACCATATATAGGAACAGGGTA 1.000000 15 TAADGCGTGCAAGAAGATCAACIGAGTGCGATIGAGGCAACCATATATAAGATCAAGGTC 1.000000 16 TAADACATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTA 1.000000 17 TGADGCATGCAAGAAGATCAACIGAATGCGATIGGGGCAACCTTATATAAGATCAAGGTC 1.000000 18 TGGDGCGCGCGCGAGGATCAACIGAATGCGATIGAGGCAACCATATATAAGATCAAGGTC 1.000000 19 TGGDGCGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATIGAGACAACCATATATAGGTACAGGGTC 1.000000 20 TGGDGCGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATIGAGACAACAATATATAGGTATGGAGTC 1.000000 21 TGGDGCGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATIGGGACAACCATACATAGGAACAGGGTA 1.000000 22 TGGDGCGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATAGAGTC 5.000000 23 TGGDGCGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATGGAGTC 1.000000 24 TGGDGTGCGCGCGAGGAGCGGCIGAATGCGATIGGGGCAACCATACCTAGGATCAGGGCC 1.000000 25 TGGDGTGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATIGAGACAACAATATATAGGTATAGAGTC 1.000000 26 TGGDGTGCGCGCGAGGAGCGGCIGGGTGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATAGAGTC 1.000000 27 TGGDGTGCGCGCAAGGAGCGGCIGGGTGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATAGAGTC 3.000000 28 TGGDACGCGCACGAGAAGAGGCIGGGTGAGATIGAGGCAACCATATATAGGAACAGGGTC 1.000000 29 TGGDACGCGCGCGAGAAGAGACDCAGTGAAACIAAGGCGATCATCTATAGGATCAAGGTC 3.000000 30 TGGIGCGTCCAAGAGGATCGACIGAGCGAGATIGAGGCAGCCACATAGGGGAACAGGATC 1.000000 31 TGGIGCGTCCAAGAGGATCGACIGAGTGAGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 11.000000 32 TGGIGCGTCCAAGAGGATCGACIGAGTGAGGTIGAGACAACCATACCTAGAAACAGGGCC 5.000000 33 TGGIGCGTCCAAGAGGATCGACIGAGTGCGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 3.000000 34 TGGIGCGTCCAAGAGGATCGACIGGGTGAGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 1.000000 35 TGGIGCGTCCAAGAGGATCGACIGGGTGCGATDGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 2.000000 36 TGGIGCGTCCAAGTGGATCGACIGAGTGAGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 3.000000 37 TGGIGCGTCCGCGAGGAGCGACIGAGTGAGATIGAGACAACCATATATAGGAACAGGGTC 1.000000 38 TGGIGCGTGCACGAGGAGCGGCIGGGTGCGATDGAGACAACAATATATAGGTATAGAGTC 1.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY D001: (1,4) D002: (16,29) D003: (3,38) D004: (31,36) D005: (1,4) D006: (15,18) D007: (9,32) D008: (1,28) D009: (32,36) D010: (3,31) D011: (1,19) D012: (13,32) D013: (1,29) D014: (4,8) D015: (11,37) D016: (29,30) D033: (10,35) D034: (2,14) D035: (4,22) D036: (8,22) D037: (1,36) D038: (7,34) D039: (32,33) D040: (5,32) E001: (6,27) E002: (4,17) E003: (4,33) E004: (8,26) E005: (31,31) E006: (9,33) E007: (31,31) E008: (12,31) E009: (8,31) E010: (4,8) E011: (20,35) E012: (21,31) E013: (22,27) E014: (4,8) E015: (8,9) E016: (7,22) E017: (8,24) E018: (7,31) E019: (8,27) E020: (7,22) E021: (8,23) E022: (25,31) E023: (7,7) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 D001 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T I G A A G T A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A 0 D002 T A A D A C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T G G D A C G C G C G C G A G A A G A G A C D C A G T G A A A C I A A G G C G A T C A T C T A T A G G A T C A A G G T C 0 D003 T (A) (A) (D) G C (A) T (C) C A A G A A G A T C A A A I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A A G A T C A A G G T C T (G) (G) (I) G C (G) T (G) C A C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 D004 T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C T G G I G C G T C C A A G T G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D005 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T I G A A G T A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A 0 D006 T A A D G C G T G C A A G A A G A T C A A C I G A (G) T G C G A T I G A G G C A A C C A T A T A T A A G A T C A A G G T C T G G D G C G C G C G C G A G G A T C A A C I G A (A) T G C G A T I G A G G C A A C C A T A T A T A A G A T C A A G G T C 0 D007 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A A G A T C A A G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G G T I G A G A C A A C C A T A C C T A G A A A C A G G G C C 0 D008 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T I G A A G T A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C T G G D A C G C G C A C G A G A A G A G G C I G G G T G A G A T I G A G G C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D009 T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G G T I G A G A C A A C C A T A C C T A G A A A C A G G G C C T G G I G C G T C C A A G T G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D010 T A A D G C A T C C A A G A A G A T C A A A I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A A G A T C A A G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D011 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T I G A A G T A G C C A C A T A G G G G (A) A C A G G A T C T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G (T) A C A G G G T C 0 D012 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A A I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A G G A A C A G G G T A T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G G T I G A G A C A A C C A T A C C T A G A A A C A G G G C C 0 D013 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T I G A A G T A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C T G G D A C G C G C G C G A G A A G A G A C D C A G T G A A A C I A A G G C G A T C A T C T A T A G G A T C A A G G T C 0 D014 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C 0 D015 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C T G G I G C G T C C G C G A G G A G C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D016 T G G D A C G C G C G C G A G A A G A G A C D C A G T G A A A C I A A G G C G A T C A T C T A T A G G A T C A A G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G C G A G A T I G A G G C A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C 0 D033 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T D G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G G G T G [C] G A T D G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D034 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T D G A A G T A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C T A A D G C A T G T A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T D G A G G C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A 0 D035 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T [D] G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T [A] G A G T C 0 D036 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 D037 C G G I G C G T C T A A G A G G T T C G A C I G G G C T A G A T I G A A G T A G C C A C A T A G G G G A A C A G G A T C T G G I G C G T C C A A G T G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D038 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G (A) A T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G (G) G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D039 T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G G T I G A G A C A A C C A T A C C T A G A A A C A G G G C C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 D040 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G G T I G A G A C A A C C A T A C C T A G A A A C A G G G C C 0 E001 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G (C) C T G G D G T G C G C G C A A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G (T) C 0 E002 T (A) A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T (G) A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A A G A T C A A G G T C 0 E003 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E004 T A A D G (C) A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T G G D G (T) G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 E005 T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E006 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A A G A T C A A G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E007 T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E008 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T (G) G A G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C (A) G G G T C 0 E009 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E010 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C 0 E011 T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T (I) G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T G G A G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G G G T G C G A T (D) G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E012 T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E013 T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C T G G D G T G C G C G C A A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 E014 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T A T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C 0 E015 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C T T A T A T A A G A T C A A G G T C 0 E016 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 E017 T A A D G (C) A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T G G D G (T) G C G C G C G A G G A G C G G C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C 0 E018 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E019 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T G G D G T G C G C G C A A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 E020 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T D G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C 0 E021 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G G C A A C C A T A C C T A G G A T C A G G G C C T G G D G C G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T [D] G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T G G A G T C 0 E022 T G G D G T G C G C G C G A G G A G C G G C I G G G T G C G A T I G A G A C A A C A A T A T A T A G G T A T A G A G T C T G G I G C G T C C A A G A G G A T C G A C I G A G T G A G A T I G A G A C A A C C A T A T A T A G G A A C A G G G T C 0 E023 T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A T A A D G C A T G C A A G A A G A T C A A C I G A A T G C G A T I G G G A C A A C C A T A C A T A G G A A C A G G G T A END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 D001 C G G I = = G = C T = = = = G = T = = G = = = = G G C T A = = = = = ? ? G T = ? = = = C = = = G G = = = = = = = = A = C T A A D = = A = G C = = = = A = A = = A = = = = A A T G C = = = = = ? ? A C = ? = = = T = = = T A = = = = = = = = G = A 0 D002 = A A = = = A T = = A A = = ? ? = T C A = = I G = A = = C G = T = G = = A = A = C = = = A = = = ? = = = A = = G = = = A = G G = = = G C = = G C = = ? ? = G A G = = D C = G = = A A = C = A = = G = G = T = = = C = = = ? = = = T = = A = = = C 0 D003 = (A) (A) (D) = = (A) = (C) = = A = = A = = T = A A A = = A A = = = = = = I = G = G = = = = C T = = = = = = A = A T C = A G = = = = (G) (G) (I) = = (G) = (G) = = C = = G = = G = G G C = = G G = = = = = = D = A = A = = = = A A = = = = = = G = T A T = G A = = = 0 D004 = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D005 C G G I = = G = C T = = = = G = T = = G = = = = G G C T A = = = = = = A G T = G = = = C = = = G G = = = = = = = = A = C T A A D = = A = G C = = = = A = A = = A = = = = A A T G C = = = = = = G A C = A = = = T = = = T A = = = = = = = = G = A 0 D006 ? A A = = = = T = = A A = = A = = = = = = = = = = (G) = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? G G = = = = C = = G C = = G = = = = = = = = = = (A) = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D007 = A A D = = A = G = = = = = ? = = = = A = = = ? = A = = C = A = = = G = G = = = = = T = = T A = = A G = T = = A = = T = = G G I = = G = C = = = = = ? = = = = G = = = ? = G = = A = G = = = A = A = = = = = A = = C C = = G A = A = = G = = C = 0 D008 C = = I G = = T C T = A = = = G T T C = A = = = = = C ? = = = = = = = A = ? ? G = = = C = = = G G = = = = = = = = A = = T = = D A = = C G C = C = = = A A G A = G = = = = = T ? = = = = = = = G = ? ? A = = = T = = = T A = = = = = = = = G = = 0 D009 = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = C C = = = A = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = T A = = = G = = = = = = = T = 0 D010 = A A ? = = A ? = = = = = = A = = = = A = A ? = = A = = C = = = = = G = G = = = = = T = = = = = = A = = T = = A = = = = = G G ? = = G ? = = = = = = G = = = = G = C ? = = G = = A = = = = = A = A = = = = = A = = = = = = G = = A = = G = = = = 0 D011 C = = I = = = T C T A A = = = = T T = = A = = = = = C T A = = = = = = A G T = G = = = C = = = G G = = (A) = = = = = A = = T = = D = = = C G C G C = = = = A G = = G = = = = = T G C = = = = = = G A C = A = = = T = = = T A = = (T) = = = = = G = = 0 D012 = A A ? = = A = G = = = = = A = = = = A = A = = = A ? = C = A = = = G = G = = = = = T = = T A = = = G = = = = = = = T A = G G ? = = G = C = = = = = G = = = = G = C = = = G ? = A = G = = = A = A = = = = = A = = C C = = = A = = = = = = = C C 0 D013 C = = ? G = = T C T A A = = = G T T ? = = = I G G = C T = G = T = G = A = T A G C = = C A = = G G = = = A = = G = A = = T = = ? A = = C G C G C = = = A A G ? = = = D C A = T G = A = C = A = G = C G A T = = T C = = T A = = = T = = A = G = = 0 D014 = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? = = = = = = = A = A = = = = = = = = T A = = = = = A = = = = = T A = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? = = = = = = = G = G = = = = = = = = C C = = = = = T = = = = = C C 0 D015 = A A D = = A = G = A A = = A = = T = A = = = ? = A = ? ? = = = D = = = = = = = = A = = = = = = = = = T = T = = A = = = = G G I = = G = C = G C = = G = = G = G = = = ? = G = ? ? = = = I = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = C = = G = = = 0 D016 = = = ? ? = = C G = G C = = = A = G A = = = D C = = T = = A = C = A = = = = G A T = = T C = = T A = = = T = = A = G = = = = = ? ? = = T C = A A = = = G = T C = = = I G = = C = = G = T = G = = = = A G C = = C A = = G G = = = A = = G = A = = 0 D033 ? ? A D = = A = G = = ? ? ? A = = = = A = = = = A A ? = ? = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? G I = = G = C = = ? ? ? G = = = = G = = = = G G ? = ? = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D034 C G G I = = G = C = = = = = G = T = = G = = = = G G C T A = = = = = = A = T = G = = = C = = = G G = = = = = = = = A = C T A A D = = A = G = = = = = A = A = = A = = = = A A T G C = = = = = = G = C = A = = = T = = = T A = = = = = = = = G = A 0 D035 = A A = = = A T = = A A = = A = = T = A A = = = A A = = = = = = ? = = = = = = = = C = = = = = = = = = ? ? ? ? = G = = A = G G = = = G C = = G C = = G = = G = G G = = = G G = = = = = = ? = = = = = = = = A = = = = = = = = = ? ? ? ? = A = = C 0 D036 = A A = = = A T = = A A = = A = = T = A A = = ? A A = ? = = = = I = G = G = = = = C = = = C C = = = = ? ? ? ? = G = C = = G G = = = G C = = G C = = G = = G = G G = = ? G G = ? = = = = D = A = A = = = = A = = = T A = = = = ? ? ? ? = A = T = 0 D037 ? ? = = = = = = = T = = = A = = T = ? = = = ? = G = C T = = = = ? = ? ? G T = ? = = = C = = = G ? = = = = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = C = = = T = = A = ? = = = ? = A = T G = = = = ? = ? ? A C = ? = = = T = = = T ? = = = = = = ? ? ? ? ? 0 D038 = A A D = = A = G = = = = = A = = = = A = = = = (A) A = = C = = = = = G = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = A = G G I = = G = C = = = = = G = = = = G = = = = (G) G = = A = = = = = A = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = C 0 D039 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? A = G = = = = = = = = ? = = = = = C C = = = A = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? C = A = = = = = = = = ? = = = = = T A = = = G = = = = = = = T = 0 D040 = A A ? ? = A = G = = = = = A = = = = A = = = = = A = = C = A = = = = = = = = = = = = = = T A = = = G = = = = = = = T = = G G ? ? = G = C = = = = = G = = = = G = = = = = G = = A = G = = = = = = = = = = = = = = C C = = = A = = = = = = = C = 0 E001 = A A = = C A T = = A A G = A = = T = ? A = = = A A = = = = = = I = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = C = = G = (C) = = G G = = T G C = = G C A = G = = G = ? G = = = G G = = = = = = D = = = = = = = = A = = = = = = = = = T = T = = A = (T) = 0 E002 = (A) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = A = A = = = = = A = = = = = = G = = A = = G = = = A = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = G = G = = = = = T = = = = = = A = = T = = A = = = C 0 E003 = A A D = = A = G = = = = = A = = = = A = = = = = A = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = G G I = = G = C = = = = = G = = = = G = = = = = G = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C 0 E004 = A A = = (C) A T = = A A = = A = = T = A A = = = A A = ? = = = = I = G = G ? = = = C = = = C C = = = = A T C = = G = C = = G G = = (T) G C = = G C = = G = = G = G G = = = G G = ? = = = = D = A = A ? = = = A = = = T A = = = = T A T = = A = T = 0 E005 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E006 ? A A D = = A = ? ? = = = = A = = = = A = = = = = A = ? = = = = = = G = G = = = = = T = = = = = = A = = T = = A = = = = ? G G I = = G = ? ? = = = = G = = = = G = = = = = G = ? = = = = = = A = A = = = = = A = = = = = = G = = A = = G = = = = 0 E007 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E008 = A A D ? = A = G = = = = = A = = = = A = = = = = A = = C = = = D = = = = ? = = = A = = = = = = = = = T = T (G) = A = = = = G G I ? = G = C = = = = = G = = = = G = = = = = G = = A = = = I = = = = ? = = = C = = = = = = = = = A = C (A) = G = = = 0 E009 = A A D = = A = G = = = = = A = = = = A = = = = = A = = C = = = = = G = G = = = = = = = = C C = = = = ? T = = = = = C = = G G I = = G = C = = = = = G = = = = G = = = = = G = = A = = = = = A = A = = = = = = = = T A = = = = ? A = = = = = T = 0 E010 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = A = = = = = = = = T A = = = = = A = = = = = T A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = G = = = = = = = = C C = = = = = T = = = = = C C 0 E011 = = = D = = = C ? ? G C = = = = = G = = G = = = = = = = = = = = (I) = = = = = = = = A = = = = = = = = = T = ? G = A = = = = = = I = = = T ? ? A A = = = = = T = = A = = = = = = = = = = = (D) = = = = = = = = C = = = = = = = = = A = ? A = G = = = 0 E012 = = = ? = = = C ? = G C = = = = = G = = G = = = G = = = C = = = = = G = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = A = = = ? = = = T ? = A A = = = = = T = = A = = = A = = = A = = = = = A = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = C 0 E013 = = = = = C = = ? ? = = G = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = ? ? = = A = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E014 = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = A = A = = = = = = = = T A = = = = = A = = = = = T A = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = G = G = = = = = = = = C C = = = = = T = = = = = C C 0 E015 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = C C = = G = = = = = G = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = T A = = A = = = = = A = = T = 0 E016 = A A ? = = A T = = A A = = A = = T = A A = = = A A = = = = = = I = G = = = = ? = C = = = C = = = = = A = C = = G = = A = G G ? = = G C = = G C = = G = = G = G G = = = G G = = = = = = D = A = = = = ? = A = = = T = = = = = T = T = = A = = C 0 E017 = A A = ? (C) A T = = A A = = A = = T = ? A = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G G = ? (T) G C = = G C = = G = = G = ? G = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E018 = A A D = = A = G = = = = = A = = = = A = = = = = A = = C = = ? = = G ? = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = A = G G I = = G = C = = = = = G = = = = G = = = = = G = = A = = ? = = A ? = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = C 0 E019 = A A = = C A T = = A A G = ? = = T = A A = = ? A A = = = = = = I = G = G = = = = C = = = C C = = = = A T C = = G = C = = G G = = T G C = = G C A = ? = = G = G G = = ? G G = = = = = = D = A = A = = = = A = = = T A = = = = T A T = = A = T = 0 E020 = A A = = = A T = = A A = = A = = T = A A = = = A A = = = = = = ? = G = = = = = = C = = = C = = = = = A = C = = G = = A = G G = = = G C = = G C = = G = = G = G G = = = G G = = = = = = ? = A = = = = = = A = = = T = = = = = T = T = = A = = C 0 E021 = ? A = = = A T = = A A = = ? = = T = ? A = = = A A = ? = = = = ? = G = G = = = = C = = = C C = = = = A ? C A = G = C = = ? G = = = G C = = G C = = ? = = G = ? G = = = G G = ? = = = = ? = A = A = = = = A = = = T A = = = = T ? T G = A = T = 0 E022 ? ? = ? = T = C ? ? G C = = = = = G = ? G = = = G = = = C = = = = = = = ? = = = = A = = = = = = = = = T = T = = A = = = ? ? = ? = C = T ? ? A A = = = = = T = ? A = = = A = = = A = = = = = = = ? = = = = C = = = = = = = = = A = C = = G = = = 0 E023 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = ? ? 1.00 1.00 = ? = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = ? ? = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = ? = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = 0.86 0.86 0.85 = = 0.86 = 0.53 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 ? 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = 0.55 = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = ? = = = = 1.00 = = = ? = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 0.96 = = = = = 1.00 ? = = = = = = = 1.00 = ? ? 0.96 = = = 0.96 = = = 0.96 0.96 = = = = = = = = 0.96 = = = = = = = = = = = = = = = 0.98 = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 0.93 0.93 ? = = 0.93 ? = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 ? = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 0.52 = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 ? = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 ? = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 ? = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 0.92 0.92 = = 1.00 = = 0.92 = 1.00 = = = ? = 1.00 = ? ? = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = ? ? = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = ? ? ? 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 ? = ? = = = = = = = ? = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.99 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = ? = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? ? ? ? = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 = ? = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = ? ? ? ? = 1.00 = 1.00 = ? ? = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = ? = = = ? = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = ? = ? ? 1.00 1.00 = ? = = = 1.00 = = = 1.00 ? = = = = = = ? ? ? ? ? = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 0.57 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = ? 0.99 = 1.00 = = = = = = = = ? = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 ? ? = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 0.95 = 0.90 = = = = = = = = = = = = = = 0.90 0.90 = = = 0.90 = = = = = = = 0.90 = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = ? 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 0.81 = = 0.50 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 0.58 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = ? = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = ? ? = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = ? = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 0.99 = = = = ? = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 0.82 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = ? 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 ? ? 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = 0.57 = = = = = = = = 0.94 = = = = = = = = = 0.94 = ? 0.94 = 0.94 = = = = = = ? = = = 1.00 ? = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = ? ? = = 1.00 = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 ? = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 0.91 = 0.91 = = = = ? = 0.91 = = = 0.91 = = = = = 0.91 = 0.91 = = 0.91 = = 0.91 = 1.00 1.00 = ? 0.74 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = ? 1.00 = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = ? = = 1.00 ? = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = ? = = 1.00 = 1.00 1.00 = = ? 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = ? = 0.92 = = = = = = 0.92 = = = 0.92 = = = = = 0.92 = 0.92 = = 0.92 = = 0.92 = ? 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = ? = = 1.00 = ? 1.00 = = = 1.00 1.00 = ? = = = = ? = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 ? 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? ? = ? = 1.00 = 1.00 ? ? 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = ? 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = END PHASEPROBS