Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000234 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 15 21 36 0.583 0.000 0.249 000352 AA 1 4 5 AG 14 12 26 GG 7 5 12 3.094 0.444 2.523 000636 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 22 46 0.000 0.011 0.005 000709 CC 23 22 45 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.022 001184 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 001219 AA 1 5 6 AG 15 12 27 GG 8 6 14 3.219 0.048 1.578 001631 -- 4 12 16 +- 10 6 16 ++ 4 2 6 0.222 0.800 0.345 002081 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002372 AA 1 0 1 AG 2 0 2 GG 19 21 40 4.455 0.000 9.727 002502 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002762 CC 24 17 41 CT 0 6 6 TT 0 0 0 0.000 0.517 0.218 002860 AA 1 5 6 AG 14 12 26 GG 9 6 15 2.344 0.048 1.036 002930 CC 0 1 1 CT 8 10 18 TT 15 12 27 1.019 0.374 1.035 002940 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 002952 GG 22 23 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 003252 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 20 19 39 0.000 0.013 0.006 003481 CC 5 2 7 CG 14 4 18 GG 5 11 16 0.667 2.037 0.246 003525 CC 17 18 35 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.240 0.000 1.229 003948 AA 16 12 28 AG 8 10 18 GG 0 1 1 0.960 0.374 0.964 004017 AA 13 12 25 AC 10 10 20 CC 0 1 1 1.775 0.374 1.746 004038 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 23 20 43 0.000 0.112 0.052 004087 CC 23 21 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 004107 AA 20 23 43 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.052 004336 AA 1 5 6 AG 13 10 23 GG 8 6 14 2.182 0.043 0.503 004393 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 004617 AA 17 23 40 AT 7 0 7 TT 0 0 0 0.700 0.000 0.304 004925 AA 22 22 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 005072 AA 23 22 45 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.006 005128 GG 0 1 1 GT 9 10 19 TT 15 12 27 1.278 0.374 1.280 005159 CC 20 23 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.023 005210 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 22 43 0.012 0.000 0.006 005276 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 19 23 42 0.118 0.000 0.054 005428 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 20 23 43 0.012 0.000 0.006 005472 AA 1 4 5 AG 14 9 23 GG 8 5 13 2.685 0.000 1.135 005480 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 18 41 0.000 0.014 0.006 005515 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 20 42 0.011 0.000 0.006 005580 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 005681 AA 19 12 31 AG 5 10 15 GG 0 1 1 0.324 0.374 0.280 005695 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 005708 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 23 44 0.107 0.000 0.051 005944 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 19 22 41 0.118 0.000 0.055 006090 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 006695 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 17 22 39 0.131 0.000 0.058 006708 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 20 21 41 0.000 0.012 0.006 006963 AA 12 13 25 AG 10 8 18 GG 2 2 4 0.002 0.221 0.087 006992 AA 1 6 7 AG 15 11 26 GG 8 6 14 3.219 0.043 0.813 007764 AA 20 22 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 007881 CC 0 0 0 CT 8 0 8 TT 13 23 36 1.163 0.000 0.440 007940 GG 12 20 32 GT 6 0 6 TT 0 0 0 0.720 0.000 0.279 007966 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 17 19 36 0.015 0.000 0.007 008076 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 18 21 39 0.014 0.000 0.006 008149 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 22 41 0.053 0.000 0.024 008470 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 19 41 0.011 0.000 0.006 008649 CC 20 19 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 009061 CC 23 20 43 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 009113 AA 6 2 8 AC 11 5 16 CC 5 16 21 0.000 2.200 2.261 009247 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 21 43 0.011 0.000 0.006 009918 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 010217 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 010635 AA 23 19 42 AT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.024 010709 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 20 43 0.000 0.012 0.006 011084 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 011471 -- 2 1 3 +- 3 6 9 ++ 17 12 29 5.290 0.048 2.894 011489 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 011498 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 22 43 0.012 0.000 0.006 012231 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 013127 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 013435 AA 23 21 44 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 013512 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 013520 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 014244 AA 15 7 22 AG 7 12 19 GG 0 3 3 0.787 0.362 0.167 014336 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 17 20 37 0.362 0.000 0.168 014572 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 014594 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 014836 AA 7 12 19 AG 11 8 19 GG 5 2 7 0.030 0.153 0.372 015261 CC 17 21 38 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.517 0.000 0.236 015865 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 20 40 0.012 0.000 0.006 016005 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 21 44 0.011 0.000 0.006 016351 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 016596 AA 20 23 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.052 017049 AA 14 22 36 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.623 0.000 0.249 017220 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 21 40 0.013 0.000 0.006 017272 CC 18 17 35 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.007 017702 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 017840 AA 0 1 1 AC 4 9 13 CC 20 13 33 0.198 0.130 0.046 018141 AA 20 20 40 AT 4 3 7 TT 0 0 0 0.198 0.112 0.304 018583 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 21 21 42 0.000 0.012 0.006 018836 GG 19 18 37 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.014 0.007 019302 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 21 21 42 0.012 0.000 0.006 019389 CC 0 0 0 CT 8 0 8 TT 16 23 39 0.960 0.000 0.407 020711 AA 21 23 44 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.107 0.000 0.051 020741 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 020813 CC 0 2 2 CT 8 11 19 TT 16 10 26 0.960 0.179 0.413 020871 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 021052 AA 17 15 32 AC 7 7 14 CC 0 1 1 0.700 0.025 0.140 021185 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 021252 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 021781 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 022157 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 022247 GG 0 0 0 GT 8 0 8 TT 16 23 39 0.960 0.000 0.407 022492 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 022688 AA 15 23 38 AG 7 0 7 GG 0 0 0 0.787 0.000 0.320 023029 AA 1 0 1 AG 3 3 6 GG 20 20 40 2.617 0.112 1.527 023094 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 023283 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 22 42 0.050 0.000 0.024 023319 AA 19 12 31 AT 3 9 12 TT 0 1 1 0.118 0.182 0.016 023528 AA 14 13 27 AT 7 7 14 TT 1 2 3 0.011 0.505 0.390 023685 CC 22 22 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 023765 CC 20 13 33 CT 2 8 10 TT 0 1 1 0.050 0.027 0.054 023859 AA 22 20 42 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.112 0.054 024372 AA 1 0 1 AG 6 3 9 GG 16 20 36 0.195 0.112 0.230 024408 AA 0 1 1 AG 4 9 13 GG 19 13 32 0.209 0.130 0.058 024509 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 16 23 39 0.741 0.000 0.312 024643 CC 0 1 1 CT 7 8 15 TT 16 14 30 0.741 0.011 0.312 024649 AA 0 1 1 AC 8 8 16 CC 15 14 29 1.019 0.011 0.508 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001631: GGCCGCGGGAAGC 005944: AT 011471: T 011498: T 016005: TCTT