Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000212 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001335 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 001959 T 0.06 0.07 0.06 C 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 002372 A 0.06 0.11 0.09 C 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 002713 C 0.06 0.11 0.09 T 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 002890 A 0.18 0.09 0.13 G 0.82 0.91 0.87 0.30 0.16 0.23 002953 G 0.07 0.10 0.08 A 0.93 0.90 0.92 0.12 0.17 0.15 003035 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003507 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003599 C 0.06 0.06 0.06 T 0.94 0.94 0.94 0.12 0.10 0.11 003605 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003696 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 003711 C 0.04 0.07 0.05 T 0.96 0.93 0.95 0.08 0.13 0.10 003783 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003798 C 0.06 0.11 0.09 T 0.94 0.89 0.91 0.12 0.20 0.16 003896 A 0.00 0.08 0.04 G 1.00 0.92 0.96 0.00 0.15 0.08 003905 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003926 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 004821 A 0.07 0.06 0.06 G 0.93 0.94 0.94 0.12 0.10 0.11 004832 C 0.17 0.17 0.17 T 0.83 0.83 0.83 0.29 0.28 0.28 004833 A 0.06 0.08 0.07 G 0.94 0.92 0.93 0.12 0.15 0.13 004934 A 0.04 0.06 0.05 G 0.96 0.94 0.95 0.08 0.12 0.10 004992 C 0.11 0.19 0.14 T 0.89 0.81 0.86 0.19 0.31 0.24 005080 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005389 C 0.25 0.74 0.49 G 0.75 0.26 0.51 0.38 0.39 0.50 005453 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 005467 T 0.04 0.07 0.05 C 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 005552 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006146 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 006325 A 0.06 0.09 0.08 C 0.94 0.91 0.92 0.12 0.17 0.14 006722 C 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 007081 A 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 007120 - 0.04 0.07 0.06 + 0.96 0.93 0.94 0.08 0.13 0.10 007530 G 0.04 0.07 0.06 C 0.96 0.93 0.94 0.08 0.13 0.10 007834 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008444 C 0.04 0.07 0.05 T 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 008494 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008660 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009117 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009389 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009602 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009707 A 0.06 0.12 0.09 G 0.94 0.88 0.91 0.12 0.21 0.16 009719 C 0.06 0.12 0.09 T 0.94 0.88 0.91 0.12 0.21 0.16 009807 A 0.06 0.11 0.09 T 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 010121 A 0.05 0.11 0.08 G 0.95 0.89 0.92 0.09 0.20 0.15 010297 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 010537 G 0.02 0.07 0.05 C 0.98 0.93 0.95 0.04 0.14 0.09 010998 A 0.00 0.09 0.05 G 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 011111 C 0.70 0.26 0.48 T 0.30 0.74 0.52 0.42 0.39 0.50 011292 C 0.29 0.09 0.19 T 0.71 0.91 0.81 0.41 0.16 0.31 011874 C 0.04 0.05 0.05 T 0.96 0.95 0.95 0.08 0.09 0.09 011975 + 0.43 0.20 0.32 - 0.57 0.80 0.68 0.49 0.33 0.44 011986 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012043 A 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.14 012232 - 0.05 0.11 0.08 + 0.95 0.89 0.92 0.09 0.20 0.15 012324 G 0.05 0.11 0.08 T 0.95 0.89 0.92 0.09 0.19 0.15 013135 T 0.06 0.10 0.08 G 0.94 0.90 0.92 0.12 0.18 0.15 013434 C 0.08 0.08 0.08 T 0.92 0.92 0.92 0.15 0.15 0.15 013799 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014168 C 0.23 0.00 0.12 T 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 014818 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015001 G 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 015124 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 015354 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015940 G 0.06 0.11 0.09 A 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 016061 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016129 A 0.06 0.11 0.09 T 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 016270 T 0.29 0.09 0.21 C 0.71 0.91 0.79 0.41 0.16 0.33 017668 A 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.12 017726 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017796 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 018247 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018288 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018390 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018403 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018520 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 018521 A 0.08 0.10 0.09 G 0.92 0.90 0.91 0.15 0.17 0.16 018650 C 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.10 018762 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 018774 A 0.04 0.04 0.04 G 0.96 0.96 0.96 0.08 0.07 0.08 018867 T 0.06 0.06 0.06 C 0.94 0.94 0.94 0.12 0.10 0.11 018984 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019215 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 019350 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 019366 T 0.07 0.12 0.10 C 0.93 0.88 0.90 0.13 0.21 0.17 019392 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 020054 G 0.54 0.26 0.41 A 0.46 0.74 0.59 0.50 0.39 0.48 020078 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 020117 G 0.13 0.00 0.07 A 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 020192 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 020274 T 0.04 0.00 0.03 C 0.96 1.00 0.97 0.08 0.00 0.05 020292 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020399 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020603 T 0.14 0.57 0.35 C 0.86 0.43 0.65 0.24 0.49 0.46 020745 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020946 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020949 G 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 020970 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021239 A 0.07 0.50 0.30 G 0.93 0.50 0.70 0.13 0.50 0.42 021396 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021629 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 021732 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 021988 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 007120: TG 008660: GAGGGGAT 011975: AGG 012232: AGG 018247: AATCAATC 018288: CTTTATC