Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000101 - 0.02 0.11 0.07 + 0.98 0.89 0.93 0.04 0.19 0.12 000304 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 000366 G 0.14 0.00 0.08 T 0.86 1.00 0.92 0.24 0.00 0.14 000580 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 000612 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000616 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000636 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000640 G 0.02 0.22 0.12 A 0.98 0.78 0.88 0.04 0.34 0.21 000654 T 0.05 0.15 0.10 C 0.95 0.85 0.90 0.09 0.26 0.18 000658 C 0.16 0.00 0.08 G 0.84 1.00 0.92 0.27 0.00 0.14 000668 C 0.05 0.15 0.10 A 0.95 0.85 0.90 0.09 0.26 0.18 000754 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 000918 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 001098 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001174 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 001310 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001627 T 0.52 0.20 0.37 C 0.48 0.80 0.63 0.50 0.33 0.46 001733 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001736 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001857 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001875 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002235 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003001 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003458 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003477 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003814 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004690 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004707 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004714 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004744 T 0.17 0.70 0.43 C 0.83 0.30 0.57 0.28 0.42 0.49 004797 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004800 C 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004803 A 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004842 T 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 004853 C 0.33 0.22 0.28 T 0.67 0.78 0.72 0.44 0.34 0.40 004856 G 0.33 0.24 0.29 A 0.67 0.76 0.71 0.44 0.36 0.41 004873 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004903 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004941 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 004952 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006179 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006333 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 006570 T 0.00 0.12 0.07 C 1.00 0.88 0.93 0.00 0.21 0.12 007040 T 0.65 0.22 0.44 C 0.35 0.78 0.56 0.46 0.34 0.49 007532 C 0.70 0.20 0.35 T 0.30 0.80 0.65 0.42 0.31 0.45 007589 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.03 007708 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.03 008562 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008831 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009259 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010344 C 0.21 0.79 0.48 G 0.79 0.21 0.52 0.33 0.34 0.50 010406 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010451 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010513 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000101: at