Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000152 C 0.00 0.10 0.04 G 1.00 0.90 0.96 0.00 0.17 0.08 000167 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000370 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000577 T 0.10 0.57 0.33 C 0.90 0.43 0.67 0.19 0.49 0.44 000671 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000713 C 0.19 0.04 0.12 T 0.81 0.96 0.88 0.30 0.08 0.21 000851 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000866 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 000880 C 0.00 0.10 0.05 G 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 001116 + 0.20 0.23 0.21 - 0.80 0.77 0.79 0.31 0.36 0.33 001169 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.03 001319 + 0.27 0.59 0.43 - 0.73 0.41 0.57 0.39 0.48 0.49 001449 C 0.38 0.59 0.48 T 0.62 0.41 0.52 0.47 0.48 0.50 001451 A 0.12 0.54 0.33 C 0.88 0.46 0.67 0.22 0.50 0.44 001612 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001632 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001731 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002011 G 0.21 0.24 0.22 A 0.79 0.76 0.78 0.33 0.36 0.35 002456 A 0.06 0.00 0.04 C 0.94 1.00 0.96 0.10 0.00 0.08 002527 C 0.17 0.00 0.12 T 0.83 1.00 0.88 0.28 0.00 0.22 002757 G 0.05 0.00 0.04 C 0.95 1.00 0.96 0.09 0.00 0.07 003715 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 003740 G 0.46 0.33 0.39 A 0.54 0.67 0.61 0.50 0.44 0.48 003977 C 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 004100 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 004544 C 0.30 0.05 0.19 T 0.70 0.95 0.81 0.42 0.10 0.31 005128 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005300 C 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 005413 C 0.15 0.11 0.13 T 0.85 0.89 0.87 0.25 0.20 0.23 005521 A 0.04 0.19 0.11 G 0.96 0.81 0.89 0.08 0.31 0.20 005997 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 006098 A 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 006110 C 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 006445 C 0.05 0.07 0.06 A 0.95 0.93 0.94 0.09 0.13 0.11 006638 + 0.03 0.00 0.01 - 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 007437 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007742 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007884 A 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007885 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008095 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008493 T 0.27 0.26 0.27 C 0.73 0.74 0.73 0.40 0.39 0.39 008518 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008724 G 0.11 0.11 0.11 T 0.89 0.89 0.89 0.19 0.19 0.19 008910 T 0.27 0.22 0.24 G 0.73 0.78 0.76 0.39 0.34 0.37 008946 G 0.46 0.41 0.44 C 0.54 0.59 0.56 0.50 0.48 0.49 009043 C 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 009091 G 0.17 0.11 0.14 A 0.83 0.89 0.86 0.28 0.19 0.24 009147 T 0.08 0.13 0.11 C 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 009223 G 0.12 0.11 0.12 A 0.88 0.89 0.88 0.22 0.20 0.21 009501 T 0.08 0.13 0.11 G 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 009608 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009709 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010628 A 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.13 0.13 0.13 010709 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011176 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011450 C 0.37 0.12 0.26 G 0.63 0.88 0.74 0.47 0.21 0.39 011468 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 011631 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011962 G 0.43 0.24 0.34 A 0.57 0.76 0.66 0.49 0.36 0.45 012324 G 0.38 0.24 0.32 A 0.62 0.76 0.68 0.47 0.36 0.43 013457 G 0.35 0.23 0.29 A 0.65 0.77 0.71 0.46 0.35 0.41 013732 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 013785 T 0.10 0.10 0.10 C 0.90 0.90 0.90 0.19 0.18 0.18 014036 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014772 T 0.52 0.45 0.49 C 0.48 0.55 0.51 0.50 0.50 0.50 014881 T 0.33 0.20 0.27 C 0.67 0.80 0.73 0.44 0.33 0.40 015123 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015848 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 016047 A 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 016673 T 0.53 0.46 0.49 A 0.47 0.54 0.51 0.50 0.50 0.50 016711 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 016893 C 0.27 0.43 0.36 G 0.73 0.57 0.64 0.40 0.49 0.46 016970 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 017257 T 0.33 0.25 0.29 C 0.68 0.75 0.71 0.44 0.38 0.41 017396 C 0.37 0.33 0.35 A 0.63 0.68 0.65 0.47 0.44 0.45 018086 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018133 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018352 A 0.12 0.09 0.10 G 0.88 0.91 0.90 0.21 0.16 0.18 019072 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019819 A 0.02 0.05 0.03 G 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.07 020155 G 0.02 0.05 0.03 A 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 020174 T 0.34 0.23 0.28 C 0.66 0.77 0.72 0.45 0.35 0.41 020477 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 020641 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 021849 A 0.19 0.09 0.14 G 0.81 0.91 0.86 0.30 0.16 0.24 022067 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022158 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022192 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022476 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 022501 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022607 A 0.10 0.02 0.07 T 0.90 0.98 0.93 0.19 0.05 0.12 022739 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 023104 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 023305 A 0.00 0.11 0.05 G 1.00 0.89 0.95 0.00 0.20 0.10 023345 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023665 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 023676 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 023781 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 023841 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023890 A 0.17 0.17 0.17 G 0.83 0.82 0.83 0.28 0.29 0.28 024331 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024465 A 0.29 0.50 0.39 G 0.71 0.50 0.61 0.41 0.50 0.48 024504 T 0.03 0.03 0.03 C 0.97 0.97 0.97 0.05 0.05 0.05 024536 A 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.20 025262 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 025549 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025694 A 0.50 0.15 0.33 G 0.50 0.85 0.67 0.50 0.26 0.44 025763 T 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 026110 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026242 C 0.50 0.12 0.32 T 0.50 0.88 0.68 0.50 0.21 0.43 026348 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 026405 C 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 026547 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026578 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 027633 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028696 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 029136 G 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001116: C 001319: TGTGAT 006638: AAAG 008095: GA 015123: A 019072: A