Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000463 G 0.00 0.11 0.05 A 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 000696 C 0.26 0.20 0.23 T 0.74 0.80 0.77 0.39 0.31 0.35 001427 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001431 C 0.12 0.00 0.06 T 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 001720 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001891 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002145 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002505 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002582 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 002714 - 0.00 0.14 0.07 + 1.00 0.86 0.93 0.00 0.24 0.14 003346 G 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 004307 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 005098 A 0.00 0.13 0.07 G 1.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.12 005400 G 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 005725 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006477 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006777 A 0.50 0.17 0.34 G 0.50 0.83 0.66 0.50 0.29 0.45 006789 T 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 006832 T 0.04 0.11 0.08 C 0.96 0.89 0.92 0.08 0.19 0.14 006854 T 0.00 0.17 0.09 C 1.00 0.83 0.91 0.00 0.29 0.16 007013 T 0.30 0.43 0.37 G 0.70 0.57 0.63 0.42 0.49 0.47 007231 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007741 G 0.00 0.21 0.10 T 1.00 0.79 0.90 0.00 0.34 0.19 008237 T 0.19 0.16 0.17 A 0.81 0.84 0.83 0.30 0.27 0.29 008324 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008438 C 0.10 0.13 0.12 T 0.90 0.87 0.88 0.19 0.23 0.21 008607 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008726 C 0.38 0.50 0.44 T 0.62 0.50 0.56 0.47 0.50 0.49 008735 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008790 G 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 008853 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008937 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009022 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009119 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009313 A 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 009467 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 009497 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 009530 T 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.14 0.12 0.13 010494 T 0.44 0.30 0.37 C 0.56 0.70 0.63 0.49 0.42 0.47 010612 - 0.17 0.00 0.09 + 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 010912 C 0.18 0.07 0.12 T 0.82 0.93 0.88 0.30 0.12 0.21 011245 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011252 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011322 T 0.43 0.22 0.33 C 0.57 0.78 0.67 0.49 0.34 0.44 011540 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011580 C 0.21 0.17 0.19 G 0.79 0.83 0.81 0.33 0.29 0.31 011584 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011681 + 0.54 0.39 0.47 - 0.46 0.61 0.53 0.50 0.48 0.50 012113 A 0.00 0.07 0.04 G 1.00 0.93 0.96 0.00 0.12 0.07 012152 - 0.05 0.00 0.02 + 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 012706 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012834 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 012908 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013050 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013174 T 0.07 0.18 0.12 A 0.93 0.82 0.88 0.12 0.30 0.21 013630 G 0.30 0.41 0.36 C 0.70 0.59 0.64 0.42 0.48 0.46 013775 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014024 C 0.04 0.15 0.10 G 0.96 0.85 0.90 0.08 0.26 0.18 014074 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014195 A 0.13 0.21 0.17 G 0.87 0.79 0.83 0.23 0.34 0.28 014239 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 014632 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 014700 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 014733 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 014746 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 014833 C 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 014895 C 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 014936 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015027 A 0.07 0.13 0.10 C 0.93 0.87 0.90 0.13 0.23 0.18 015284 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015300 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015580 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015660 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015679 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015805 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016069 - 0.04 0.20 0.12 + 0.96 0.80 0.88 0.08 0.31 0.21 016412 A 0.15 0.23 0.18 G 0.85 0.77 0.82 0.25 0.35 0.30 016787 A 0.14 0.18 0.16 G 0.86 0.82 0.84 0.24 0.30 0.27 017159 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017681 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017839 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018291 A 0.20 0.22 0.21 G 0.80 0.78 0.79 0.31 0.34 0.33 018483 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 018813 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 018909 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018922 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019022 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019826 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019868 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019890 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020026 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020043 - 0.42 0.35 0.38 + 0.58 0.65 0.62 0.49 0.45 0.47 020208 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020502 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020625 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020685 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020849 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020987 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 021089 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 021299 G 0.07 0.15 0.11 A 0.93 0.85 0.89 0.13 0.26 0.20 021443 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021639 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021642 C 0.15 0.24 0.19 T 0.85 0.76 0.81 0.25 0.36 0.31 021707 G 0.15 0.25 0.20 T 0.85 0.75 0.80 0.25 0.38 0.31 021757 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021825 G 0.08 0.14 0.11 A 0.92 0.86 0.89 0.15 0.24 0.19 022223 G 0.10 0.12 0.11 A 0.90 0.88 0.89 0.19 0.21 0.20 022225 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022254 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022454 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022586 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 022818 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022827 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 023168 C 0.04 0.18 0.11 G 0.96 0.82 0.89 0.08 0.30 0.19 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001427: attgt 001891: ag 002505: at 002714: T 010612: c 011681: cc 012152: C 016069: aaca 020043: t 021639: atata 022254: a