Site Genotype1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 HD-chi2 XD-chi2 Total-chi2 000173 AA 5 22 4 0 31 AG 13 1 10 3 27 GG 4 1 7 17 29 0.747 9.967 0.016 0.131 12.496 000216 CC 23 23 22 21 89 CG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 000272 CC 0 0 0 0 0 CT 1 1 0 0 2 TT 22 23 22 20 87 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 000326 CC 23 24 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 000355 CC 0 0 0 0 0 CT 1 1 0 0 2 TT 23 23 22 24 92 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 000368 -- 0 0 0 0 0 +- 3 0 0 0 3 ++ 21 24 20 24 89 0.107 0.000 0.000 0.000 0.025 000391 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 20 24 22 24 90 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 000399 GG 21 24 22 23 90 GT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 000429 GG 16 3 12 22 53 GT 5 12 7 2 26 TT 0 9 3 0 12 0.383 0.107 1.223 0.045 7.290 000669 CC 21 19 21 16 77 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 000674 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 21 20 21 16 78 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 001145 AA 0 0 0 0 0 AT 0 0 1 0 1 TT 24 24 21 20 89 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 001148 CC 0 0 0 0 0 CT 1 1 0 1 3 TT 23 23 22 19 87 0.011 0.011 0.000 0.013 0.026 001152 CC 24 23 22 20 89 CG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 001158 -- 12 3 11 17 43 +- 11 13 8 3 35 ++ 1 8 3 0 12 0.618 0.421 0.577 0.131 1.243 001663 CC 6 22 4 0 32 CT 14 1 10 2 27 TT 4 1 8 21 34 0.734 9.967 0.079 0.048 16.334 001736 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 4 0 4 GG 23 24 18 23 88 0.000 0.000 0.220 0.000 0.045 002112 AA 24 24 21 22 91 AG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 002328 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 23 24 21 23 91 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 002425 AA 0 0 0 0 0 AC 1 1 0 0 2 CC 23 23 21 23 90 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 002516 CC 24 20 19 24 87 CT 0 4 3 0 7 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.198 0.118 0.000 0.141 002531 AA 6 22 4 0 32 AG 14 1 11 3 29 GG 4 1 7 21 33 0.734 9.967 0.008 0.107 13.782 002850 CC 23 23 18 23 87 CG 1 1 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 003219 AA 0 0 0 0 0 AC 1 1 0 0 2 CC 23 23 22 24 92 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 003305 AA 0 0 0 0 0 AC 1 0 0 0 1 CC 20 18 21 15 74 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 003310 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 19 15 18 15 67 0.013 0.000 0.000 0.000 0.004 059166 CC 22 24 22 23 91 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 059276 AA 18 23 22 24 87 AG 4 1 0 0 5 GG 0 0 0 0 0 0.220 0.011 0.000 0.000 0.072 059351 * 059557 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 22 22 21 24 89 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 059818 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 23 24 21 23 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 059833 CC 23 23 21 23 90 CT 0 1 1 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.012 0.000 0.011 059938 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 23 24 22 24 93 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 060002 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 24 22 24 93 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 060150 CC 24 22 21 24 91 CT 0 2 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.045 0.000 0.000 0.011 060202 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 21 24 22 24 91 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 060382 AA 3 2 9 14 28 AG 6 3 3 0 12 GG 0 13 1 0 14 2.250 3.942 0.860 0.000 14.800 060597 CC 16 24 22 23 85 CT 7 0 0 0 7 TT 1 0 0 0 1 0.044 0.000 0.000 0.000 3.103 060737 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 23 24 22 24 93 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 061326 CC 0 0 0 0 0 CT 0 0 0 1 1 TT 23 24 21 22 90 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 061343 CC 21 23 21 23 88 CT 2 1 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.048 0.011 0.000 0.000 0.026 061357 CC 20 23 21 23 87 CG 3 1 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.112 0.011 0.000 0.000 0.046 061358 AA 0 0 0 0 0 AG 3 1 0 0 4 GG 20 23 21 23 87 0.112 0.011 0.000 0.000 0.046 061462 CC 20 23 21 23 87 CG 3 1 0 0 4 GG 0 0 0 0 0 0.112 0.011 0.000 0.000 0.046 061480 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 22 24 21 23 90 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 061535 AA 0 0 0 0 0 AG 1 1 0 0 2 GG 22 23 21 24 90 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 061541 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 23 24 20 24 91 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 061739 AA 21 20 19 15 75 AG 0 0 0 6 6 GG 0 0 0 1 1 0.000 0.000 0.000 0.153 3.669 061880 CC 18 19 19 20 76 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.014 0.000 0.000 0.000 0.003 061971 CC 18 18 18 19 73 CT 0 1 1 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.014 0.014 0.000 0.014 062074 CC 23 24 21 24 92 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 062138 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 24 24 21 23 92 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 062374 CC 17 2 12 23 54 CT 7 7 7 1 22 TT 0 15 2 0 17 0.700 0.730 0.399 0.011 17.834 062384 CC 24 23 21 24 92 CG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 067007 AA 15 24 21 24 84 AT 9 0 0 0 9 TT 0 0 0 0 0 1.278 0.000 0.000 0.000 0.240 067146 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 24 24 20 24 92 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 067342 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 24 23 21 24 92 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 067394 CC 4 0 0 0 4 CG 16 1 1 0 18 GG 3 22 20 24 69 3.569 0.011 0.012 0.000 3.365 067517 AA 0 0 0 0 0 AG 7 0 1 0 8 GG 13 21 19 17 70 0.900 0.000 0.013 0.000 0.228 067656 CC 13 20 19 18 70 CT 7 1 1 0 9 TT 0 0 0 0 0 0.900 0.012 0.013 0.000 0.288 067764 AA 21 22 14 21 78 AG 0 1 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 067776 AA 6 22 15 21 64 AG 13 2 1 0 16 GG 4 0 0 0 4 0.445 0.045 0.017 0.000 4.148 067777 CC 17 23 3 0 43 CT 6 1 8 0 15 TT 0 0 5 21 26 0.517 0.011 0.004 0.000 33.087 067882 AA 0 0 0 0 0 AC 1 2 0 0 3 CC 23 22 20 24 89 0.011 0.045 0.000 0.000 0.025 068000 CC 4 23 19 24 70 CT 16 1 1 0 18 TT 4 0 0 0 4 2.667 0.011 0.013 0.000 3.454 068048 CC 1 0 0 0 1 CT 10 2 1 0 13 TT 13 22 19 24 78 0.296 0.045 0.013 0.000 0.293 068280 CC 0 0 0 0 0 CG 1 0 0 0 1 GG 22 24 20 24 90 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 077067 CC 19 19 16 17 71 CT 0 1 2 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.013 0.062 0.000 0.032 077249 AA 0 0 0 0 0 AG 4 3 1 0 8 GG 15 18 18 17 68 0.263 0.124 0.014 0.000 0.235 077675 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 24 23 22 23 92 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 077729 CC 13 1 0 0 14 CT 9 9 6 1 25 TT 2 14 16 22 54 0.061 0.091 0.548 0.011 10.772 077821 CC 24 24 22 22 92 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 077987 AA 18 22 17 20 77 AG 0 0 1 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.015 0.000 0.003 078131 CC 24 23 21 21 89 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 078172 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 24 22 22 21 89 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 078574 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 21 23 21 22 87 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 078598 CC 9 0 0 0 9 CT 9 5 4 1 19 TT 4 18 17 21 60 0.414 0.342 0.233 0.012 10.767 078715 AA 22 24 22 24 92 AT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 078903 CC 21 23 19 24 87 CT 3 1 3 0 7 TT 0 0 0 0 0 0.107 0.011 0.118 0.000 0.141 079140 AA 12 19 18 23 72 AG 11 4 4 1 20 GG 1 0 0 0 1 0.618 0.209 0.220 0.011 0.090 079314 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 24 22 22 24 92 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 079376 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 24 22 24 93 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 079505 AA 0 0 0 0 0 AG 4 0 0 0 4 GG 20 24 22 24 90 0.198 0.000 0.000 0.000 0.044 079558 AA 21 23 19 24 87 AC 3 1 3 0 7 CC 0 0 0 0 0 0.107 0.011 0.118 0.000 0.141 079786 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 24 21 22 24 91 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 080057 CC 21 23 18 24 86 CT 3 1 3 0 7 TT 0 0 0 0 0 0.107 0.011 0.124 0.000 0.142 080087 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 22 24 21 23 90 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 080191 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 24 23 21 24 92 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 080258 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 24 22 24 93 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 080289 CC 24 24 21 24 93 CT 0 0 1 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 080290 GG 0 0 0 0 0 GT 0 0 1 0 1 TT 24 24 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 080343 CC 9 0 0 0 9 CT 11 5 4 1 21 TT 4 19 18 23 64 0.042 0.324 0.220 0.011 9.662 080447 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 24 22 24 93 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 080461 CC 0 0 0 0 0 CT 4 1 3 0 8 TT 20 23 19 24 86 0.198 0.011 0.118 0.000 0.186 080593 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 23 24 22 23 92 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 082964 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 23 23 22 24 92 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 082973 AA 0 0 0 0 0 AC 2 0 0 0 2 CC 21 24 22 24 91 0.048 0.000 0.000 0.000 0.011 083021 CC 23 23 22 24 92 CT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 083239 AA 16 18 17 19 70 AG 0 0 2 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.059 0.000 0.014 083484 AA 0 0 0 0 0 AG 3 1 3 0 7 GG 19 19 19 18 75 0.118 0.013 0.118 0.000 0.163 083855 CC 0 0 0 0 0 CG 7 3 1 0 11 GG 14 19 19 22 74 0.840 0.118 0.013 0.000 0.407 083926 AA 0 0 0 0 0 AG 3 1 3 0 7 GG 18 21 17 22 78 0.124 0.012 0.131 0.000 0.157 083942 CC 18 20 19 22 79 CT 3 2 1 0 6 TT 0 0 0 0 0 0.124 0.050 0.013 0.000 0.114 083943 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 20 22 20 22 84 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 084015 -- 0 0 0 0 0 +- 0 1 0 0 1 ++ 21 21 20 22 84 0.000 0.012 0.000 0.000 0.003 084080 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 20 21 20 22 83 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 084209 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 21 23 19 23 86 0.012 0.000 0.000 0.000 0.003 084248 CC 23 24 19 22 88 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 084259 AA 3 0 0 0 3 AC 12 2 1 0 15 CC 7 22 18 23 70 0.362 0.045 0.014 0.000 3.141 084262 CC 21 24 19 23 87 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.048 0.000 0.000 0.000 0.011 084392 AA 13 21 16 23 73 AC 9 3 4 1 17 CC 2 0 0 0 2 0.061 0.107 0.247 0.011 0.683 084480 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 22 24 20 24 90 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 084659 CC 24 24 22 23 93 CT 0 0 0 1 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 084682 -- 7 0 0 0 7 +- 10 2 1 1 14 ++ 7 22 19 23 71 0.667 0.045 0.013 0.011 15.485 084710 CC 8 0 0 0 8 CT 12 4 4 1 21 TT 4 20 18 23 65 0.020 0.198 0.220 0.011 8.090 084734 AA 0 0 0 0 0 AC 7 0 0 0 7 CC 17 24 22 24 87 0.700 0.000 0.000 0.000 0.141 084771 AA 0 0 0 0 0 AC 0 0 0 1 1 CC 24 24 22 23 93 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 084776 CC 23 24 22 24 93 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 084784 CC 0 0 0 0 0 CG 0 0 1 0 1 GG 24 24 21 24 93 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 084812 CC 22 24 22 24 92 CG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 084813 CC 0 0 0 0 0 CT 2 0 0 0 2 TT 22 24 22 24 92 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 085024 AA 0 0 0 0 0 AG 0 1 0 0 1 GG 24 23 22 24 93 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 085047 -- 17 24 22 24 87 +- 7 0 0 0 7 ++ 0 0 0 0 0 0.700 0.000 0.000 0.000 0.141 085183 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 22 24 22 24 92 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 085291 CC 0 0 0 0 0 CT 8 3 4 0 15 TT 16 21 18 24 79 0.960 0.107 0.220 0.000 0.707 085411 AA 1 0 0 0 1 AG 8 0 0 0 8 GG 14 24 21 24 83 0.011 0.000 0.000 0.000 2.183 086027 CC 0 0 0 0 0 CT 4 0 0 0 4 TT 20 23 21 22 86 0.198 0.000 0.000 0.000 0.046 092661 CC 23 23 20 21 87 CG 0 0 0 1 1 GG 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.012 0.003 092737 AA 0 0 0 0 0 AG 2 1 1 0 4 GG 21 22 19 21 83 0.048 0.011 0.013 0.000 0.048 092738 GG 23 22 20 21 86 GT 0 1 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 092744 GG 21 22 19 21 83 GT 2 1 1 0 4 TT 0 0 0 0 0 0.048 0.011 0.013 0.000 0.048 092912 CC 0 0 0 0 0 CG 7 0 0 0 7 GG 16 23 22 23 84 0.741 0.000 0.000 0.000 0.146 092985 CC 22 23 22 23 90 CT 1 0 0 0 1 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 093027 AA 3 0 0 0 3 AG 15 3 4 0 22 GG 5 20 18 23 66 2.272 0.112 0.220 0.000 0.464 093032 AA 0 0 0 0 0 AT 10 2 1 0 13 TT 13 21 21 23 78 1.775 0.048 0.012 0.000 0.538 093267 CC 0 0 0 0 0 CT 0 1 0 0 1 TT 23 22 22 23 90 0.000 0.011 0.000 0.000 0.003 093299 AA 4 21 18 22 65 AG 13 3 3 0 19 GG 7 0 0 0 7 0.243 0.107 0.124 0.000 8.012 093386 CC 7 22 21 23 73 CT 14 2 1 0 17 TT 3 0 0 0 3 0.960 0.045 0.012 0.000 2.280 093434 AA 23 24 22 23 92 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 093435 AA 2 0 0 0 2 AC 3 1 3 0 7 CC 19 23 19 23 84 5.958 0.011 0.118 0.000 9.741 093453 CC 23 23 22 23 91 CT 1 1 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.011 0.000 0.000 0.011 093504 -- 23 24 22 23 92 +- 1 0 0 0 1 ++ 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 093570 GG 0 0 0 0 0 GT 1 0 0 0 1 TT 22 24 22 23 91 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 093589 AA 0 0 0 0 0 AG 1 0 0 0 1 GG 22 24 22 23 91 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 093698 AA 0 0 0 0 0 AT 1 0 0 0 1 TT 23 24 22 23 92 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 093706 AA 4 18 17 22 61 AT 11 6 5 1 23 TT 9 0 0 0 9 0.042 0.490 0.362 0.011 7.312 093707 AA 0 0 0 0 0 AT 0 3 0 0 3 TT 24 21 22 23 90 0.000 0.107 0.000 0.000 0.025 093838 CC 7 0 0 0 7 CT 13 4 4 0 21 TT 4 20 18 22 64 0.243 0.198 0.220 0.000 6.174 093891 CC 0 0 7 22 29 CT 3 1 10 1 15 TT 21 23 3 0 47 0.107 0.011 0.035 0.011 39.269 093920 AA 24 24 20 22 90 AC 0 0 0 1 1 CC 0 0 0 0 0 0.000 0.000 0.000 0.011 0.003 094171 GG 2 0 0 0 2 GT 3 1 1 0 5 TT 19 23 19 23 84 5.958 0.011 0.013 0.000 15.713 094457 AA 0 0 0 0 0 AG 6 0 0 0 6 GG 15 22 22 22 81 0.583 0.000 0.000 0.000 0.111 094886 CC 0 0 0 0 0 CT 10 2 1 0 13 TT 14 20 21 21 76 1.662 0.050 0.012 0.000 0.552 095024 CC 22 24 19 24 89 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 095064 CC 7 22 18 24 71 CT 14 2 1 0 17 TT 3 0 0 0 3 0.960 0.045 0.014 0.000 2.157 095128 CC 22 24 19 24 89 CT 2 0 0 0 2 TT 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 095236 CC 22 24 21 23 90 CT 2 0 0 1 3 TT 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.011 0.025 095258 AA 7 0 0 0 7 AG 13 3 4 0 20 GG 4 21 17 24 66 0.243 0.107 0.233 0.000 7.301 095262 CC 23 22 21 24 90 CT 1 2 0 0 3 TT 0 0 0 0 0 0.011 0.045 0.000 0.000 0.025 095377 GG 18 22 20 24 84 GT 6 2 1 0 9 TT 0 0 0 0 0 0.490 0.045 0.012 0.000 0.240 095390 AA 23 24 21 24 92 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 095495 AA 23 24 21 24 92 AG 1 0 0 0 1 GG 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 095550 AA 23 24 21 24 92 AC 1 0 0 0 1 CC 0 0 0 0 0 0.011 0.000 0.000 0.000 0.003 095727 CC 4 20 17 23 64 CT 11 4 3 1 19 TT 9 0 0 0 9 0.042 0.198 0.131 0.011 11.741 096021 -- 0 0 0 0 0 +- 7 1 1 0 9 ++ 10 19 17 20 66 1.143 0.013 0.015 0.000 0.306 096029 CC 6 20 18 22 66 CT 4 0 0 0 4 TT 1 0 0 0 1 0.076 0.000 0.000 0.000 6.558 096284 -- 6 19 18 19 62 +- 11 1 1 0 13 ++ 3 0 0 0 3 0.314 0.013 0.014 0.000 3.806 096377 -- 0 0 0 0 0 +- 0 0 0 1 1 ++ 21 20 19 19 79 0.000 0.000 0.000 0.013 0.003 096439 -- 0 0 0 0 0 +- 0 1 0 0 1 ++ 21 19 18 20 78 0.000 0.013 0.000 0.000 0.003 096563 CC 13 2 0 0 15 CT 4 5 6 0 15 TT 0 12 9 16 37 0.302 1.406 0.937 0.000 16.625 096835 CC 0 0 0 0 0 CT 1 0 0 0 1 TT 16 15 17 11 59 0.016 0.000 0.000 0.000 0.004 097053 -- 0 0 0 0 0 +- 2 2 0 0 4 ++ 22 19 20 16 77 0.045 0.053 0.000 0.000 0.052 097099 AA 0 0 0 0 0 AG 0 0 1 0 1 GG 24 21 20 16 81 0.000 0.000 0.012 0.000 0.003 097351 AA 4 20 18 23 65 AG 11 4 4 0 19 GG 8 0 0 0 8 0.004 0.198 0.220 0.000 9.996 097449 GG 8 0 0 0 8 GT 11 4 3 0 18 TT 4 20 18 23 65 0.004 0.198 0.124 0.000 11.082 097724 AA 0 0 0 0 0 AG 2 0 0 0 2 GG 19 23 19 22 83 0.053 0.000 0.000 0.000 0.012 097831 -- 2 0 0 0 2 +- 4 1 3 0 8 ++ 18 23 19 21 81 3.840 0.011 0.118 0.000 7.458 097894 AA 22 23 22 21 88 AG 2 0 0 0 2 GG 0 0 0 0 0 0.045 0.000 0.000 0.000 0.011 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000368: tttct 001158: C 084015: t 084682: a 085047: AGAGACCGTGTCCACACTGGCATCATCATCTGGGAAACATGATCAGTCATTTATCCTAGAC 093504: T 096021: gagt 096284: CTTA 096377: c 096439: aaca 097053: gat 097831: ACAG Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 059351 AA 0 0 0 0 0 059351 AC 1 0 0 0 1 059351 AT 0 0 0 0 0 059351 CC 22 23 19 24 88 059351 CT 0 0 3 0 3 059351 TT 0 0 0 0 0