Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000173 G 0.48 0.06 0.57 0.93 0.49 A 0.52 0.94 0.43 0.07 0.51 0.50 0.12 0.49 0.14 0.50 000216 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 000272 C 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 T 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 000326 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000355 C 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 T 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 000368 - 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 + 0.94 1.00 1.00 1.00 0.98 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 000391 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 000399 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 000429 T 0.12 0.62 0.30 0.04 0.27 G 0.88 0.38 0.70 0.96 0.73 0.21 0.47 0.42 0.08 0.40 000669 T 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 000674 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 001145 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 001148 C 0.02 0.02 0.00 0.03 0.02 T 0.98 0.98 1.00 0.97 0.98 0.04 0.04 0.00 0.05 0.03 001152 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 001158 + 0.27 0.60 0.32 0.07 0.33 - 0.73 0.40 0.68 0.93 0.67 0.39 0.48 0.43 0.14 0.44 001663 C 0.54 0.94 0.41 0.04 0.49 T 0.46 0.06 0.59 0.96 0.51 0.50 0.12 0.48 0.08 0.50 001736 A 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 G 1.00 1.00 0.91 1.00 0.98 0.00 0.00 0.17 0.00 0.04 002112 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 002328 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 002425 A 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 002516 T 0.00 0.08 0.07 0.00 0.04 C 1.00 0.92 0.93 1.00 0.96 0.00 0.15 0.13 0.00 0.07 002531 A 0.54 0.94 0.43 0.06 0.49 G 0.46 0.06 0.57 0.94 0.51 0.50 0.12 0.49 0.12 0.50 002850 G 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 003219 A 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 003305 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 003310 A 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 059166 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 059276 G 0.09 0.02 0.00 0.00 0.03 A 0.91 0.98 1.00 1.00 0.97 0.17 0.04 0.00 0.00 0.05 059351 * 059557 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 059818 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 059833 T 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 C 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 059938 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 060002 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 060150 T 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.96 1.00 1.00 0.99 0.00 0.08 0.00 0.00 0.02 060202 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 060382 G 0.33 0.81 0.19 0.00 0.37 A 0.67 0.19 0.81 1.00 0.63 0.44 0.31 0.31 0.00 0.47 060597 T 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.09 060737 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 061326 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 061343 T 0.04 0.02 0.00 0.00 0.02 C 0.96 0.98 1.00 1.00 0.98 0.08 0.04 0.00 0.00 0.03 061357 G 0.07 0.02 0.00 0.00 0.02 C 0.93 0.98 1.00 1.00 0.98 0.12 0.04 0.00 0.00 0.04 061358 A 0.07 0.02 0.00 0.00 0.02 G 0.93 0.98 1.00 1.00 0.98 0.12 0.04 0.00 0.00 0.04 061462 G 0.07 0.02 0.00 0.00 0.02 C 0.93 0.98 1.00 1.00 0.98 0.12 0.04 0.00 0.00 0.04 061480 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 061535 A 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 G 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 061541 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 061739 G 0.00 0.00 0.00 0.18 0.05 A 1.00 1.00 1.00 0.82 0.95 0.00 0.00 0.00 0.30 0.09 061880 T 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 061971 T 0.00 0.03 0.03 0.00 0.01 C 1.00 0.97 0.97 1.00 0.99 0.00 0.05 0.05 0.00 0.03 062074 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 062138 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 062374 T 0.15 0.77 0.26 0.02 0.30 C 0.85 0.23 0.74 0.98 0.70 0.25 0.35 0.39 0.04 0.42 062384 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 067007 T 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 A 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.09 067146 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 067342 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 067394 C 0.52 0.02 0.02 0.00 0.14 G 0.48 0.98 0.98 1.00 0.86 0.50 0.04 0.05 0.00 0.24 067517 A 0.17 0.00 0.03 0.00 0.05 G 0.82 1.00 0.97 1.00 0.95 0.29 0.00 0.05 0.00 0.10 067656 T 0.17 0.02 0.03 0.00 0.06 C 0.82 0.98 0.97 1.00 0.94 0.29 0.05 0.05 0.00 0.11 067764 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 067776 G 0.46 0.04 0.03 0.00 0.14 A 0.54 0.96 0.97 1.00 0.86 0.50 0.08 0.06 0.00 0.24 067777 T 0.13 0.02 0.56 1.00 0.40 C 0.87 0.98 0.44 0.00 0.60 0.23 0.04 0.49 0.00 0.48 067882 A 0.02 0.04 0.00 0.00 0.02 C 0.98 0.96 1.00 1.00 0.98 0.04 0.08 0.00 0.00 0.03 068000 T 0.50 0.02 0.03 0.00 0.14 C 0.50 0.98 0.97 1.00 0.86 0.50 0.04 0.05 0.00 0.24 068048 C 0.25 0.04 0.03 0.00 0.08 T 0.75 0.96 0.97 1.00 0.92 0.38 0.08 0.05 0.00 0.15 068280 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 077067 T 0.00 0.03 0.06 0.00 0.02 C 1.00 0.97 0.94 1.00 0.98 0.00 0.05 0.10 0.00 0.04 077249 A 0.11 0.07 0.03 0.00 0.05 G 0.89 0.93 0.97 1.00 0.95 0.19 0.13 0.05 0.00 0.10 077675 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 077729 C 0.73 0.23 0.14 0.02 0.28 T 0.27 0.77 0.86 0.98 0.72 0.39 0.35 0.24 0.04 0.41 077821 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 077987 G 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 078131 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 078172 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 078574 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 078598 C 0.61 0.11 0.10 0.02 0.21 T 0.39 0.89 0.90 0.98 0.79 0.47 0.19 0.17 0.04 0.33 078715 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 078903 T 0.06 0.02 0.07 0.00 0.04 C 0.94 0.98 0.93 1.00 0.96 0.12 0.04 0.13 0.00 0.07 079140 G 0.27 0.09 0.09 0.02 0.12 A 0.73 0.91 0.91 0.98 0.88 0.39 0.16 0.17 0.04 0.21 079314 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 079376 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 079505 A 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 079558 C 0.06 0.02 0.07 0.00 0.04 A 0.94 0.98 0.93 1.00 0.96 0.12 0.04 0.13 0.00 0.07 079786 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 080057 T 0.06 0.02 0.07 0.00 0.04 C 0.94 0.98 0.93 1.00 0.96 0.12 0.04 0.13 0.00 0.07 080087 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 080191 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 080258 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 080289 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 080290 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 080343 C 0.60 0.10 0.09 0.02 0.21 T 0.40 0.90 0.91 0.98 0.79 0.48 0.19 0.17 0.04 0.33 080447 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 080461 C 0.08 0.02 0.07 0.00 0.04 T 0.92 0.98 0.93 1.00 0.96 0.15 0.04 0.13 0.00 0.08 080593 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082964 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 082973 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 083021 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 C 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 083239 G 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.95 1.00 0.99 0.00 0.00 0.10 0.00 0.03 083484 A 0.07 0.03 0.07 0.00 0.04 G 0.93 0.97 0.93 1.00 0.96 0.13 0.05 0.13 0.00 0.08 083855 C 0.17 0.07 0.03 0.00 0.06 G 0.83 0.93 0.97 1.00 0.94 0.28 0.13 0.05 0.00 0.12 083926 A 0.07 0.02 0.07 0.00 0.04 G 0.93 0.98 0.93 1.00 0.96 0.13 0.04 0.14 0.00 0.08 083942 T 0.07 0.05 0.03 0.00 0.04 C 0.93 0.95 0.97 1.00 0.96 0.13 0.09 0.05 0.00 0.07 083943 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 084015 - 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 084080 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 084209 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 084248 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 084259 A 0.41 0.04 0.03 0.00 0.12 C 0.59 0.96 0.97 1.00 0.88 0.48 0.08 0.05 0.00 0.21 084262 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 084392 C 0.27 0.06 0.10 0.02 0.11 A 0.73 0.94 0.90 0.98 0.89 0.39 0.12 0.18 0.04 0.20 084480 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 084659 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 084682 - 0.50 0.04 0.03 0.02 0.15 + 0.50 0.96 0.97 0.98 0.85 0.50 0.08 0.05 0.04 0.26 084710 C 0.58 0.08 0.09 0.02 0.20 T 0.42 0.92 0.91 0.98 0.80 0.49 0.15 0.17 0.04 0.32 084734 A 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 084771 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 084776 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 084784 C 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 084812 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 084813 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 085024 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 085047 + 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 - 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 085183 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 085291 C 0.17 0.06 0.09 0.00 0.08 T 0.83 0.94 0.91 1.00 0.92 0.28 0.12 0.17 0.00 0.15 085411 A 0.22 0.00 0.00 0.00 0.05 G 0.78 1.00 1.00 1.00 0.95 0.34 0.00 0.00 0.00 0.10 086027 C 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 092661 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 092737 A 0.04 0.02 0.03 0.00 0.02 G 0.96 0.98 0.97 1.00 0.98 0.08 0.04 0.05 0.00 0.04 092738 T 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 092744 T 0.04 0.02 0.03 0.00 0.02 G 0.96 0.98 0.97 1.00 0.98 0.08 0.04 0.05 0.00 0.04 092912 C 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 G 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.26 0.00 0.00 0.00 0.07 092985 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093027 A 0.46 0.07 0.09 0.00 0.15 G 0.54 0.93 0.91 1.00 0.85 0.50 0.12 0.17 0.00 0.26 093032 A 0.22 0.04 0.02 0.00 0.07 T 0.78 0.96 0.98 1.00 0.93 0.34 0.08 0.04 0.00 0.13 093267 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 T 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 093299 G 0.56 0.06 0.07 0.00 0.18 A 0.44 0.94 0.93 1.00 0.82 0.49 0.12 0.13 0.00 0.30 093386 T 0.42 0.04 0.02 0.00 0.12 C 0.58 0.96 0.98 1.00 0.88 0.49 0.08 0.04 0.00 0.22 093434 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093435 A 0.15 0.02 0.07 0.00 0.06 C 0.85 0.98 0.93 1.00 0.94 0.25 0.04 0.13 0.00 0.11 093453 T 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.04 0.00 0.00 0.02 093504 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093570 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093589 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093698 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 093706 T 0.60 0.12 0.11 0.02 0.22 A 0.40 0.88 0.89 0.98 0.78 0.48 0.22 0.20 0.04 0.34 093707 A 0.00 0.06 0.00 0.00 0.02 T 1.00 0.94 1.00 1.00 0.98 0.00 0.12 0.00 0.00 0.03 093838 C 0.56 0.08 0.09 0.00 0.19 T 0.44 0.92 0.91 1.00 0.81 0.49 0.15 0.17 0.00 0.31 093891 C 0.06 0.02 0.60 0.98 0.40 T 0.94 0.98 0.40 0.02 0.60 0.12 0.04 0.48 0.04 0.48 093920 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 094171 G 0.15 0.02 0.03 0.00 0.05 T 0.85 0.98 0.97 1.00 0.95 0.25 0.04 0.05 0.00 0.09 094457 A 0.14 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.86 1.00 1.00 1.00 0.97 0.24 0.00 0.00 0.00 0.07 094886 C 0.21 0.05 0.02 0.00 0.07 T 0.79 0.95 0.98 1.00 0.93 0.33 0.09 0.04 0.00 0.14 095024 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 095064 T 0.42 0.04 0.03 0.00 0.13 C 0.58 0.96 0.97 1.00 0.87 0.49 0.08 0.05 0.00 0.22 095128 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 095236 T 0.04 0.00 0.00 0.02 0.02 C 0.96 1.00 1.00 0.98 0.98 0.08 0.00 0.00 0.04 0.03 095258 A 0.56 0.06 0.10 0.00 0.18 G 0.44 0.94 0.90 1.00 0.82 0.49 0.12 0.17 0.00 0.30 095262 T 0.02 0.04 0.00 0.00 0.02 C 0.98 0.96 1.00 1.00 0.98 0.04 0.08 0.00 0.00 0.03 095377 T 0.12 0.04 0.02 0.00 0.05 G 0.88 0.96 0.98 1.00 0.95 0.22 0.08 0.05 0.00 0.09 095390 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 095495 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 095550 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 095727 T 0.60 0.08 0.07 0.02 0.20 C 0.40 0.92 0.93 0.98 0.80 0.48 0.15 0.14 0.04 0.32 096021 - 0.21 0.03 0.03 0.00 0.06 + 0.79 0.97 0.97 1.00 0.94 0.33 0.05 0.05 0.00 0.11 096029 T 0.27 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.73 1.00 1.00 1.00 0.96 0.40 0.00 0.00 0.00 0.08 096284 + 0.42 0.03 0.03 0.00 0.12 - 0.57 0.97 0.97 1.00 0.88 0.49 0.05 0.05 0.00 0.21 096377 - 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.97 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 096439 - 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.97 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 096563 C 0.88 0.24 0.20 0.00 0.34 T 0.12 0.76 0.80 1.00 0.66 0.21 0.36 0.32 0.00 0.45 096835 C 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.97 1.00 1.00 1.00 0.99 0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 097053 - 0.04 0.05 0.00 0.00 0.02 + 0.96 0.95 1.00 1.00 0.98 0.08 0.09 0.00 0.00 0.05 097099 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 097351 G 0.59 0.08 0.09 0.00 0.19 A 0.41 0.92 0.91 1.00 0.81 0.48 0.15 0.17 0.00 0.31 097449 G 0.59 0.08 0.07 0.00 0.19 T 0.41 0.92 0.93 1.00 0.81 0.48 0.15 0.13 0.00 0.30 097724 A 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 097831 - 0.17 0.02 0.07 0.00 0.07 + 0.83 0.98 0.93 1.00 0.93 0.28 0.04 0.13 0.00 0.12 097894 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000368: tttct 001158: C 084015: t 084682: a 085047: AGAGACCGTGTCCACACTGGCATCATCATCTGGGAAACATGATCAGTCATTTATCCTAGAC 093504: T 096021: gagt 096284: CTTA 096377: c 096439: aaca 097053: gat 097831: ACAG Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 059351 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.00 0.00 0.07 0.00 0.02 C 0.98 1.00 0.93 1.00 0.98