Site      Allele1   AD-pop    ED-pop    Total-pop Allele2   AD-pop    ED-pop    Total-pop AD-hz     ED-hz     Total-hz  
000638    T         0.50      0.32      0.41      C         0.50      0.68      0.59      0.50      0.43      0.48      
002202    C         0.00      0.02      0.01      T         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
002288    G         0.02      0.00      0.01      T         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
003425    A         0.15      0.32      0.23      G         0.85      0.68      0.77      0.26      0.43      0.36      
003572    C         0.23      0.36      0.29      G         0.77      0.64      0.71      0.35      0.46      0.41      
003583    T         0.02      0.00      0.01      G         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
003714    G         0.02      0.00      0.01      A         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
004175    T         0.10      0.00      0.05      G         0.90      1.00      0.95      0.19      0.00      0.10      
004202    T         0.08      0.00      0.04      C         0.92      1.00      0.96      0.15      0.00      0.08      
004230    C         0.25      0.30      0.27      T         0.75      0.70      0.73      0.38      0.42      0.40      
004257    A         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
004418    T         0.00      0.02      0.01      C         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
004476    T         0.22      0.32      0.27      C         0.78      0.68      0.73      0.34      0.43      0.39      
004645    A         0.25      0.32      0.28      G         0.75      0.68      0.72      0.38      0.43      0.41      
007061    T         0.15      0.30      0.22      C         0.85      0.70      0.78      0.25      0.42      0.34      
007279    C         0.44      0.32      0.38      T         0.56      0.68      0.62      0.49      0.43      0.47      
007370    A         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
007388    C         0.23      0.33      0.28      T         0.77      0.67      0.72      0.35      0.44      0.40      
007476    G         0.23      0.33      0.28      A         0.77      0.67      0.72      0.35      0.44      0.40      
007484    C         0.00      0.15      0.07      T         1.00      0.85      0.93      0.00      0.26      0.14      
007497    T         0.23      0.30      0.27      C         0.77      0.70      0.73      0.35      0.42      0.39      
007960    C         0.02      0.00      0.01      T         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
012879    T         0.15      0.34      0.24      C         0.85      0.66      0.76      0.26      0.45      0.36      
013134    G         0.08      0.00      0.04      A         0.92      1.00      0.96      0.15      0.00      0.08      
015732    G         0.09      0.17      0.13      C         0.91      0.83      0.87      0.17      0.28      0.22      
016417    T         0.02      0.15      0.09      C         0.98      0.85      0.91      0.04      0.26      0.16      
016520    -         0.40      0.50      0.45      +         0.60      0.50      0.55      0.48      0.50      0.49      

Note:

AD: African_Descent
ED: European_Descent
Total: All_population
pop : population

Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as:

+ : insertion allele
- : deletion allele

The + (inserted) allele for each site is listed below:

016520: t