Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 002049 T 0.05 0.22 0.13 C 0.95 0.78 0.87 0.09 0.34 0.23 002124 - 0.18 0.22 0.20 + 0.82 0.78 0.80 0.30 0.34 0.32 002333 G 0.33 0.43 0.38 A 0.67 0.57 0.62 0.44 0.49 0.47 002462 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002522 + 0.17 0.00 0.09 - 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 002568 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002879 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003082 T 0.43 0.36 0.40 G 0.57 0.64 0.60 0.49 0.46 0.48 003436 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003685 + 0.02 0.02 0.02 - 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 003739 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003782 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003786 T 0.16 0.39 0.27 C 0.84 0.61 0.73 0.27 0.47 0.40 004007 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004141 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 004256 T 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 004348 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004367 G 0.06 0.02 0.04 A 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 004402 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004553 T 0.17 0.39 0.27 G 0.83 0.61 0.73 0.28 0.47 0.40 004646 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 004656 T 0.08 0.22 0.15 G 0.92 0.78 0.85 0.15 0.34 0.25 004731 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 004964 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005468 G 0.05 0.02 0.03 A 0.95 0.98 0.97 0.09 0.04 0.07 005487 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005568 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006456 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 006932 G 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 007024 - 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0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031525 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031865 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032169 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032214 C 0.19 0.00 0.10 T 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 033043 A 0.27 0.43 0.35 G 0.73 0.57 0.65 0.39 0.49 0.46 033229 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033371 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 033664 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033687 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034266 A 0.14 0.24 0.19 G 0.86 0.76 0.81 0.24 0.36 0.31 034418 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 034688 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 034727 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034958 A 0.28 0.43 0.36 G 0.72 0.57 0.64 0.41 0.49 0.46 035714 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.21 0.00 0.11 035901 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 036132 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 036134 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036140 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036241 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 036412 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036695 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036900 T 0.26 0.43 0.35 C 0.74 0.57 0.65 0.39 0.49 0.45 037249 G 0.27 0.43 0.35 T 0.73 0.57 0.65 0.39 0.49 0.46 037401 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 038451 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 038491 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038496 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 038600 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 038713 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038879 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038950 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039720 T 0.04 0.02 0.03 A 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 039959 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 040091 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 040720 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040829 C 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 041043 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 041132 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 041597 A 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 041937 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042135 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 042353 A 0.29 0.61 0.45 G 0.71 0.39 0.55 0.41 0.47 0.50 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002124: cttcccctccttccctagtta 002522: a 003685: ta 007024: aatt 007460: tataaa 011053: c 012489: CA 015767: aa 015921: tctttac 016198: tagtt 023059: t 025302: TTTCT 031357: TT 034727: AA 038491: ta Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 020710 T 0.06 0.00 0.03 A 0.10 0.00 0.05 C 0.83 1.00 0.91