Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000128 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000270 + 0.06 0.00 0.03 - 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 000294 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000451 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 000459 G 0.02 0.13 0.08 A 0.98 0.87 0.92 0.05 0.23 0.15 000670 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001192 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001270 A 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002136 A 0.04 0.14 0.09 G 0.96 0.86 0.91 0.08 0.24 0.16 002231 T 0.04 0.14 0.09 C 0.96 0.86 0.91 0.08 0.24 0.16 002429 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002459 T 0.67 0.14 0.41 C 0.33 0.86 0.59 0.44 0.24 0.48 002813 C 0.17 0.07 0.12 A 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.22 002828 A 0.17 0.07 0.12 C 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.22 002839 G 0.17 0.07 0.12 A 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.21 002869 C 0.17 0.07 0.12 T 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.21 002870 A 0.17 0.07 0.12 G 0.83 0.93 0.88 0.29 0.13 0.21 002932 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002942 C 0.17 0.07 0.12 T 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 002947 C 0.21 0.07 0.14 T 0.79 0.93 0.86 0.33 0.13 0.24 002959 A 0.17 0.07 0.12 C 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 002961 G 0.17 0.07 0.12 A 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 002982 T 0.17 0.07 0.12 C 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 002990 T 0.17 0.07 0.12 G 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 003001 G 0.17 0.07 0.12 T 0.83 0.93 0.88 0.28 0.13 0.21 003543 T 0.06 0.00 0.02 C 0.94 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 003860 C 0.23 0.00 0.11 G 0.77 1.00 0.89 0.35 0.00 0.20 004223 G 0.17 0.07 0.12 A 0.83 0.93 0.88 0.29 0.12 0.21 004772 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004774 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004954 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005571 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005577 G 0.21 0.00 0.11 A 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 005752 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006025 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006943 A 0.67 0.20 0.43 G 0.33 0.80 0.57 0.44 0.31 0.49 006985 T 0.67 0.20 0.44 A 0.33 0.80 0.56 0.44 0.31 0.49 007327 A 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 007386 G 0.17 0.07 0.12 A 0.83 0.93 0.88 0.28 0.12 0.21 007781 G 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.20 007782 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008004 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008081 G 0.04 0.04 0.04 A 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 008139 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008350 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008442 T 0.60 0.20 0.40 C 0.40 0.80 0.60 0.48 0.31 0.48 008599 C 0.04 0.02 0.03 T 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 008912 G 0.19 0.07 0.13 A 0.81 0.93 0.87 0.30 0.12 0.22 008994 G 0.67 0.20 0.44 T 0.33 0.80 0.56 0.44 0.31 0.49 009322 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009346 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009375 A 0.06 0.11 0.09 G 0.94 0.89 0.91 0.12 0.20 0.16 009496 A 0.06 0.05 0.05 G 0.94 0.95 0.95 0.12 0.09 0.10 009514 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009666 C 0.67 0.18 0.43 G 0.33 0.82 0.57 0.44 0.30 0.49 009913 C 0.35 0.09 0.22 T 0.65 0.91 0.78 0.46 0.16 0.35 009926 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010181 T 0.17 0.07 0.12 C 0.83 0.93 0.88 0.28 0.12 0.21 010302 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010414 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010784 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011054 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 011199 G 0.10 0.00 0.06 T 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 011216 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011285 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011316 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 011320 A 0.17 0.05 0.11 G 0.83 0.95 0.89 0.28 0.09 0.20 011460 A 0.00 0.06 0.03 G 1.00 0.94 0.97 0.00 0.10 0.05 011479 A 0.67 0.23 0.45 G 0.33 0.78 0.55 0.44 0.35 0.50 011506 A 0.07 0.15 0.11 G 0.93 0.85 0.89 0.13 0.26 0.20 011630 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011908 G 0.17 0.05 0.11 C 0.83 0.95 0.89 0.29 0.09 0.20 011963 A 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 012111 C 0.66 0.21 0.45 G 0.34 0.79 0.55 0.45 0.33 0.50 012247 C 0.17 0.08 0.12 T 0.83 0.92 0.88 0.28 0.15 0.22 012268 T 0.05 0.13 0.09 C 0.95 0.87 0.91 0.09 0.23 0.16 012284 G 0.05 0.13 0.09 A 0.95 0.87 0.91 0.09 0.23 0.16 012292 C 0.23 0.00 0.12 T 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 012294 A 0.05 0.13 0.09 T 0.95 0.87 0.91 0.09 0.23 0.16 012383 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 012436 C 0.67 0.14 0.41 T 0.33 0.86 0.59 0.44 0.24 0.48 012523 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012683 T 0.21 0.00 0.11 A 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 012896 G 0.14 0.00 0.07 A 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 012999 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013062 A 0.54 0.07 0.32 G 0.46 0.93 0.68 0.50 0.13 0.43 013071 C 0.65 0.11 0.39 G 0.35 0.89 0.61 0.46 0.20 0.48 013077 C 0.65 0.11 0.39 T 0.35 0.89 0.61 0.46 0.20 0.48 013131 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013145 G 0.65 0.11 0.39 A 0.35 0.89 0.61 0.46 0.20 0.48 013179 C 0.65 0.11 0.39 T 0.35 0.89 0.61 0.46 0.20 0.48 013180 A 0.65 0.11 0.39 G 0.35 0.89 0.61 0.46 0.20 0.48 013205 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013211 - 0.45 0.11 0.28 + 0.55 0.89 0.72 0.50 0.20 0.41 013216 A 0.42 0.11 0.27 C 0.58 0.89 0.73 0.49 0.20 0.40 013281 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013309 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 013349 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013351 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013402 T 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013403 A 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013451 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014056 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000270: A 004954: CTTTTTTCTATT 013211: ACC