Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000955 - 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 + 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.02 001729 G 0.02 0.04 0.00 0.00 0.02 A 0.98 0.96 1.00 1.00 0.98 0.04 0.08 0.00 0.00 0.03 001772 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 004492 C 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.96 1.00 1.00 0.99 0.00 0.08 0.00 0.00 0.02 004579 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 004589 T 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 005663 A 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.10 005773 A 0.02 0.00 0.05 0.00 0.02 G 0.98 1.00 0.95 1.00 0.98 0.04 0.00 0.10 0.00 0.04 013506 G 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.93 1.00 1.00 1.00 0.98 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 013727 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013740 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 013741 A 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 013758 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013865 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 013898 G 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 014204 C 0.26 0.05 0.43 0.06 0.20 T 0.74 0.95 0.57 0.94 0.80 0.39 0.09 0.49 0.12 0.32 014299 T 0.25 0.05 0.43 0.06 0.20 G 0.75 0.95 0.57 0.94 0.80 0.38 0.09 0.49 0.12 0.31 014465 T 0.02 0.04 0.27 0.04 0.09 C 0.98 0.96 0.73 0.96 0.91 0.04 0.08 0.40 0.08 0.17 014491 + 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 014630 G 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 014660 T 0.19 0.00 0.14 0.02 0.09 C 0.81 1.00 0.86 0.98 0.91 0.30 0.00 0.24 0.04 0.16 014719 G 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 014726 C 0.19 0.00 0.14 0.02 0.09 T 0.81 1.00 0.86 0.98 0.91 0.30 0.00 0.24 0.04 0.16 014796 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 014858 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 014920 G 0.00 0.00 0.00 0.17 0.04 A 1.00 1.00 1.00 0.83 0.96 0.00 0.00 0.00 0.28 0.08 014990 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 015044 A 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 015370 T 0.44 0.04 0.30 0.04 0.20 C 0.56 0.96 0.70 0.96 0.80 0.49 0.08 0.42 0.08 0.33 015624 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 016005 A 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 016099 C 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.96 1.00 1.00 0.99 0.00 0.08 0.00 0.00 0.02 016298 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 016397 T 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 016529 G 0.11 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.89 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 016647 C 0.17 0.05 0.32 0.04 0.14 T 0.83 0.95 0.68 0.96 0.86 0.29 0.09 0.43 0.08 0.24 016687 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 016705 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 016853 C 0.24 0.05 0.45 0.06 0.19 T 0.76 0.95 0.55 0.94 0.81 0.36 0.09 0.49 0.12 0.30 017104 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 017158 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017169 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017177 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 017206 T 0.26 0.05 0.48 0.06 0.21 G 0.74 0.95 0.52 0.94 0.79 0.39 0.09 0.50 0.12 0.33 017238 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017311 T 0.00 0.00 0.02 0.04 0.02 C 1.00 1.00 0.98 0.96 0.98 0.00 0.00 0.04 0.08 0.03 017620 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 017890 T 0.07 0.00 0.09 0.02 0.04 C 0.93 1.00 0.91 0.98 0.96 0.13 0.00 0.17 0.04 0.08 018034 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018148 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018155 A 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 018314 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 018452 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018514 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018635 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 018710 G 0.22 0.04 0.50 0.02 0.19 C 0.78 0.96 0.50 0.98 0.81 0.34 0.08 0.50 0.04 0.31 018829 A 0.21 0.04 0.50 0.02 0.19 G 0.79 0.96 0.50 0.98 0.81 0.33 0.08 0.50 0.04 0.31 019188 + 0.48 0.04 0.45 0.02 0.24 - 0.52 0.96 0.55 0.98 0.76 0.50 0.08 0.50 0.04 0.37 019372 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 019425 + 0.22 0.09 0.55 0.67 0.38 - 0.78 0.91 0.45 0.33 0.62 0.34 0.16 0.49 0.44 0.47 019481 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 019545 A 0.20 0.91 0.42 0.33 0.47 C 0.80 0.09 0.58 0.67 0.53 0.31 0.16 0.49 0.44 0.50 019661 C 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 G 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 019723 C 0.22 0.74 0.47 0.35 0.44 A 0.78 0.26 0.53 0.65 0.56 0.34 0.39 0.50 0.45 0.49 019725 C 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 T 0.91 1.00 1.00 1.00 0.98 0.16 0.00 0.00 0.00 0.04 019802 T 0.08 0.07 0.30 0.00 0.11 C 0.92 0.93 0.70 1.00 0.89 0.15 0.12 0.42 0.00 0.19 019821 C 0.29 0.13 0.59 0.60 0.40 G 0.71 0.87 0.41 0.40 0.60 0.41 0.23 0.48 0.48 0.48 019840 T 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 019869 C 0.44 0.00 0.07 0.00 0.13 T 0.56 1.00 0.93 1.00 0.87 0.49 0.00 0.13 0.00 0.23 019881 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 019908 C 0.33 0.02 0.11 0.00 0.12 G 0.67 0.98 0.89 1.00 0.88 0.44 0.04 0.20 0.00 0.21 019966 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 019977 T 0.17 0.66 0.36 0.23 0.35 C 0.83 0.34 0.64 0.77 0.65 0.28 0.45 0.46 0.35 0.45 019992 C 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 T 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 020070 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 020089 - 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020123 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 020180 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 020338 A 0.00 0.00 0.07 0.00 0.02 C 1.00 1.00 0.93 1.00 0.98 0.00 0.00 0.13 0.00 0.03 020360 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020519 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020653 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020654 A 0.52 0.26 0.43 0.46 0.42 G 0.48 0.74 0.57 0.54 0.58 0.50 0.39 0.49 0.50 0.49 020698 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 020702 A 0.02 0.09 0.27 0.00 0.09 G 0.98 0.91 0.73 1.00 0.91 0.04 0.16 0.40 0.00 0.17 020770 C 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.95 1.00 1.00 1.00 0.99 0.09 0.00 0.00 0.00 0.02 020778 A 0.14 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.86 1.00 1.00 1.00 0.97 0.24 0.00 0.00 0.00 0.06 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000955: caaag 014491: a 019188: cgtgtg 019425: C 019481: GTT 020089: c