Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000094 AA 0 0 0 AG 9 0 9 GG 14 23 37 1.361 0.000 0.541 000275 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 21 22 43 0.048 0.011 0.052 000462 CC 21 14 35 CT 0 7 7 TT 0 1 1 0.000 0.011 0.741 000666 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 000694 CC 0 0 0 CT 2 1 3 TT 21 21 42 0.048 0.012 0.054 000848 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 18 22 40 0.342 0.000 0.156 001358 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001964 AA 0 0 0 AG 8 0 8 GG 15 23 38 1.019 0.000 0.417 001978 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 002010 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 1 0 1 9.967 0.000 20.206 002013 CC 15 23 38 CT 8 0 8 TT 1 0 1 0.003 0.000 0.516 002088 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002705 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 002890 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 002997 CC 20 23 43 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 003037 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 003172 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 003309 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 003512 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 003917 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 18 22 40 0.220 0.000 0.100 004106 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 004188 AA 0 0 0 AG 9 0 9 GG 13 22 35 1.455 0.000 0.571 004220 GG 20 22 42 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 004248 CC 16 8 24 CT 5 11 16 TT 1 3 4 0.499 0.065 0.306 004342 CC 15 8 23 CT 6 11 17 TT 1 3 4 0.153 0.065 0.111 004593 -- 0 3 3 +- 5 11 16 ++ 17 7 24 0.362 0.159 0.022 005119 CC 22 22 44 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 005120 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 19 23 42 0.118 0.000 0.054 005439 CC 0 1 1 CT 0 7 7 TT 22 15 37 0.000 0.025 0.830 005600 GG 1 5 6 GT 5 9 14 TT 18 9 27 0.644 0.857 3.072 005603 GG 1 5 6 GT 6 9 15 TT 17 9 26 0.240 0.857 2.286 005840 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 18 21 39 0.055 0.048 0.102 005847 AA 1 3 4 AG 5 11 16 GG 14 9 23 0.360 0.016 0.244 005985 CC 4 8 12 CG 13 10 23 GG 3 5 8 1.839 0.306 0.269 006246 CC 15 9 24 CT 6 11 17 TT 1 3 4 0.153 0.016 0.154 006417 AA 0 0 0 AG 3 1 4 GG 19 22 41 0.118 0.011 0.097 006593 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 23 44 0.012 0.000 0.006 006679 AA 19 23 42 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.054 006760 CC 17 9 26 CT 5 9 14 TT 1 5 6 0.571 0.857 2.862 006761 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 21 22 43 0.048 0.011 0.052 006837 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 19 23 42 0.209 0.000 0.095 006914 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 19 23 42 0.209 0.000 0.095 006959 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 23 42 0.209 0.000 0.095 007019 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 21 43 0.045 0.000 0.023 007133 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 007166 AA 19 23 42 AC 5 0 5 CC 0 0 0 0.324 0.000 0.148 007668 AA 3 5 8 AC 15 10 25 CC 6 8 14 1.748 0.306 0.312 007686 GG 19 23 42 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 007834 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 007916 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 007971 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 008150 CC 0 1 1 CT 2 9 11 TT 21 13 34 0.048 0.130 0.010 008238 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 23 45 0.011 0.000 0.006 008362 -- 13 9 22 +- 9 11 20 ++ 1 2 3 0.130 0.279 0.301 008369 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 008668 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 23 43 0.198 0.000 0.093 008671 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 008985 GG 22 23 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 009091 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 009172 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 009182 CC 0 1 1 CG 1 6 7 GG 22 16 38 0.011 0.195 0.875 009287 AA 11 21 32 AG 5 0 5 GG 4 0 4 3.701 0.000 12.085 009328 CC 12 14 26 CG 7 5 12 GG 2 2 4 0.399 1.802 1.897 009694 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 009843 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 009959 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 21 21 42 0.000 0.012 0.006 009999 AA 19 21 40 AC 2 1 3 CC 0 0 0 0.053 0.012 0.056 010062 CC 12 22 34 CG 8 0 8 GG 1 0 1 0.053 0.000 0.386 010159 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 22 41 0.053 0.000 0.024 010225 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 010286 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 010343 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011045 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011081 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 011148 CC 2 0 2 CG 8 0 8 GG 12 23 35 0.153 0.000 2.396 011201 AA 19 23 42 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.118 0.000 0.054 011238 GG 14 9 23 GT 7 11 18 TT 1 3 4 0.011 0.016 0.031 011293 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 21 22 43 0.000 0.011 0.006 011300 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 18 23 41 0.124 0.000 0.055 011530 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 21 22 43 0.000 0.011 0.006 011633 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 011667 CC 24 21 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 012024 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 012201 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 012267 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 012288 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 012406 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 012488 AA 0 0 0 AC 5 1 6 CC 19 22 41 0.324 0.011 0.218 012510 AA 12 14 26 AG 7 9 16 GG 5 0 5 3.153 1.361 1.048 012796 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 012837 CC 1 3 4 CT 8 11 19 TT 15 9 24 0.003 0.016 0.008 012843 CC 14 8 22 CT 9 11 20 TT 1 4 5 0.091 0.004 0.020 012963 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 14 23 37 0.296 0.000 2.613 013240 AA 18 21 39 AG 3 1 4 GG 0 0 0 0.124 0.012 0.102 013301 CC 0 3 3 CT 4 11 15 TT 18 9 27 0.220 0.016 0.210 013874 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 13 21 34 0.221 0.000 2.289 014001 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 014183 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 14 23 37 0.296 0.000 2.613 014494 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 014585 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 23 22 45 0.011 0.011 0.022 014774 CC 15 9 24 CT 7 11 18 TT 2 3 5 0.730 0.016 0.335 014926 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 21 43 0.045 0.048 0.093 015097 CC 2 0 2 CG 8 0 8 GG 14 23 37 0.296 0.000 2.613 015235 AA 22 21 43 AG 2 1 3 GG 0 0 0 0.045 0.012 0.052 015569 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 015573 CC 4 0 4 CT 7 9 16 TT 12 13 25 2.175 1.455 0.372 015778 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 015790 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 016187 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 016362 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 016409 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 016585 AA 1 0 1 AG 1 0 1 GG 22 23 45 9.967 0.000 20.206 016806 AA 9 20 29 AG 10 2 12 GG 3 0 3 0.007 0.050 1.153 017399 AA 2 0 2 AG 7 0 7 GG 14 23 37 0.616 0.000 3.535 017444 CC 23 21 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 017972 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 018529 AA 0 0 0 AG 3 2 5 GG 21 21 42 0.107 0.048 0.148 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 004593: c 008238: aca 008362: A