Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz hz 000171 G 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 000205 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 000666 A 0.00 0.07 0.17 C 0.00 0.93 0.83 0.00 0.13 0.28 001159 A 0.00 0.00 0.05 G 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.09 001350 G 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001738 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 001812 G 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 001914 T 0.00 0.00 0.05 C 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.10 002104 G 0.00 0.00 0.10 C 0.00 1.00 0.90 0.00 0.00 0.18 002375 A 0.00 0.07 0.24 G 0.00 0.93 0.76 0.00 0.12 0.37 005728 T 0.00 0.00 0.08 C 0.00 1.00 0.92 0.00 0.00 0.14 005977 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 006421 A 0.00 0.00 0.03 T 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 006628 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006871 A 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 006983 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 007053 C 0.00 0.02 0.16 G 0.00 0.98 0.84 0.00 0.05 0.27 007479 A 0.00 0.00 0.10 G 0.00 1.00 0.90 0.00 0.00 0.18 007497 C 0.00 0.24 0.12 T 0.00 0.76 0.88 0.00 0.36 0.21 007628 A 0.00 0.05 0.02 C 0.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 008149 A 0.00 0.00 0.06 G 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.12 008350 T 0.00 0.04 0.02 G 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 008362 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008371 C 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008376 A 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 009119 A 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 010919 C 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 011484 T 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 011669 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011721 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011762 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012059 A 0.00 0.00 0.04 G 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 012072 A 0.00 0.07 0.17 G 0.00 0.93 0.83 0.00 0.13 0.28 012485 A 0.00 0.02 0.15 T 0.00 0.98 0.85 0.00 0.04 0.25 012554 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 012645 T 0.00 0.04 0.02 C 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 012937 C 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 013058 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 013081 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 013268 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 013433 C 0.00 0.09 0.49 T 0.00 0.91 0.51 0.00 0.16 0.50 013587 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 013598 A 0.00 0.02 0.15 C 0.00 0.98 0.85 0.00 0.04 0.25 013681 T 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.07 013758 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 013887 T 0.00 0.91 0.48 C 0.00 0.09 0.52 0.00 0.16 0.50 014078 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014116 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014553 T 0.00 0.07 0.24 C 0.00 0.93 0.76 0.00 0.12 0.37 014619 C 0.00 0.02 0.16 G 0.00 0.98 0.84 0.00 0.04 0.27 014644 T 0.00 0.02 0.05 C 0.00 0.98 0.95 0.00 0.04 0.10 014769 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014844 A 0.00 0.02 0.05 G 0.00 0.98 0.95 0.00 0.04 0.10 014858 A 0.00 0.93 0.46 G 0.00 0.07 0.54 0.00 0.13 0.50 014949 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 015137 T 0.00 0.00 0.07 C 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.12 015331 T 0.00 0.00 0.09 C 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 015494 A 0.00 0.02 0.16 G 0.00 0.98 0.84 0.00 0.04 0.27 015708 G 0.00 0.02 0.01 T 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015778 A 0.00 0.00 0.11 G 0.00 1.00 0.89 0.00 0.00 0.19 016307 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 016442 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017311 C 0.00 0.00 0.10 A 0.00 1.00 0.90 0.00 0.00 0.17 017540 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 017883 C 0.00 0.02 0.28 T 0.00 0.98 0.72 0.00 0.04 0.41 018005 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 018165 G 0.00 0.02 0.16 A 0.00 0.98 0.84 0.00 0.04 0.26 018630 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 018769 C 0.00 0.07 0.16 G 0.00 0.93 0.84 0.00 0.12 0.27 018832 A 0.00 0.00 0.09 G 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 018851 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 018867 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019026 G 0.00 0.00 0.03 A 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 019264 T 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 019271 A 0.00 0.07 0.04 G 0.00 0.93 0.96 0.00 0.12 0.08 019718 A 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019744 T 0.00 0.91 0.47 G 0.00 0.09 0.53 0.00 0.16 0.50 019829 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 020118 T 0.00 0.07 0.03 A 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 020859 A 0.00 0.00 0.07 G 0.00 1.00 0.93 0.00 0.00 0.14 021353 A 0.00 0.00 0.09 G 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 021382 T 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 021395 C 0.00 0.02 0.16 T 0.00 0.98 0.84 0.00 0.04 0.27 021554 T 0.00 0.91 0.46 C 0.00 0.09 0.54 0.00 0.16 0.50 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population