Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 001690 A 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 001788 - 0.06 0.00 0.03 + 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001807 T 0.04 0.11 0.07 C 0.96 0.89 0.93 0.08 0.19 0.14 002146 G 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002235 G 0.20 0.10 0.15 A 0.80 0.90 0.85 0.33 0.17 0.26 002982 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002988 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 003029 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 003039 - 0.04 0.10 0.07 + 0.96 0.90 0.93 0.08 0.18 0.13 003064 C 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 003087 C 0.00 0.12 0.06 T 1.00 0.88 0.94 0.00 0.21 0.10 003741 C 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 003879 G 0.05 0.03 0.04 C 0.95 0.97 0.96 0.09 0.05 0.07 004706 A 0.08 0.12 0.09 C 0.92 0.88 0.91 0.14 0.22 0.16 004762 C 0.42 0.50 0.44 G 0.58 0.50 0.56 0.49 0.50 0.49 005089 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005205 + 0.09 0.07 0.08 - 0.91 0.93 0.92 0.17 0.13 0.15 005207 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005208 - 0.27 0.15 0.21 + 0.73 0.85 0.79 0.40 0.26 0.33 005269 T 0.09 0.07 0.08 C 0.91 0.93 0.92 0.17 0.13 0.15 005700 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005723 A 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 005832 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005895 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005905 G 0.23 0.19 0.21 A 0.77 0.81 0.79 0.35 0.31 0.33 006854 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007133 C 0.25 0.78 0.48 A 0.75 0.22 0.52 0.38 0.35 0.50 007254 + 0.08 0.00 0.05 - 0.92 1.00 0.95 0.15 0.00 0.09 007668 A 0.10 0.02 0.06 C 0.90 0.98 0.94 0.19 0.04 0.12 007792 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 009983 T 0.10 0.24 0.16 C 0.90 0.76 0.84 0.18 0.36 0.27 010070 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 010182 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 010516 A 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 010755 - 0.05 0.00 0.02 + 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 011335 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011445 C 0.50 0.24 0.36 A 0.50 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 011493 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 011494 T 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.05 0.04 0.05 011749 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012113 G 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 012322 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 012494 G 0.04 0.03 0.04 T 0.96 0.97 0.96 0.08 0.05 0.07 012572 T 0.07 0.34 0.20 A 0.93 0.66 0.80 0.12 0.45 0.32 012736 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012905 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013165 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 013265 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 013294 G 0.07 0.61 0.33 C 0.93 0.39 0.68 0.13 0.48 0.44 013443 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 013734 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 013752 + 0.10 0.00 0.05 - 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.10 014300 G 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014305 G 0.37 0.26 0.31 T 0.63 0.74 0.69 0.47 0.39 0.43 014365 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 014706 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014889 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 015191 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015234 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 015303 C 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015416 C 0.07 0.26 0.17 T 0.93 0.74 0.83 0.13 0.39 0.28 015930 + 0.16 0.59 0.38 - 0.84 0.41 0.62 0.26 0.48 0.47 016084 T 0.82 0.18 0.50 C 0.18 0.82 0.50 0.30 0.30 0.50 016577 C 0.03 0.10 0.06 T 0.97 0.90 0.94 0.06 0.18 0.12 016729 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 016796 A 0.58 0.30 0.45 C 0.42 0.70 0.55 0.49 0.42 0.49 016802 C 0.31 0.00 0.16 T 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 016821 + 0.15 0.00 0.07 - 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 016947 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016959 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017228 T 0.19 0.37 0.28 A 0.81 0.63 0.72 0.30 0.47 0.40 017608 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 017685 - 0.15 0.00 0.07 + 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 017914 - 0.15 0.00 0.07 + 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 018051 T 0.34 0.41 0.38 A 0.66 0.59 0.62 0.45 0.48 0.47 018063 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018485 C 0.33 0.15 0.24 T 0.67 0.85 0.76 0.44 0.26 0.36 018647 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 018648 A 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 018649 G 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 018650 A 0.04 0.02 0.03 T 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 019056 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 019516 - 0.00 0.35 0.17 + 1.00 0.65 0.83 0.00 0.45 0.28 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001788: g 003039: AG 005205: C 005208: T 007254: ca 010070: CT 010755: CTT 013752: a 015191: ga 015930: T 016821: AGtt 017685: aat 017914: aaagt 019516: attt