Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000209 + 0.00 0.04 0.02 - 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 000275 G 0.07 0.21 0.14 C 0.93 0.79 0.86 0.12 0.34 0.24 000363 A 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 000757 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000944 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 000990 A 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 002190 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 002312 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 002512 T 0.25 0.61 0.42 A 0.75 0.39 0.58 0.38 0.47 0.49 002658 G 0.37 0.61 0.48 C 0.63 0.39 0.52 0.47 0.48 0.50 002724 A 0.04 0.28 0.15 T 0.96 0.72 0.85 0.08 0.40 0.26 002955 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 003118 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 003247 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 003543 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 003657 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003871 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 003920 T 0.62 0.32 0.47 C 0.38 0.68 0.53 0.47 0.43 0.50 003934 T 0.60 0.11 0.34 C 0.40 0.89 0.66 0.48 0.19 0.45 004074 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004457 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004475 T 0.27 0.59 0.43 C 0.73 0.41 0.57 0.39 0.48 0.49 004648 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004762 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004964 C 0.17 0.30 0.24 T 0.82 0.70 0.76 0.29 0.42 0.36 005132 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005418 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005437 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005446 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005643 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006091 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006140 A 0.03 0.04 0.03 G 0.97 0.96 0.97 0.05 0.08 0.07 006355 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006956 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007044 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007212 T 0.10 0.59 0.34 C 0.90 0.41 0.66 0.19 0.48 0.45 007531 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 007599 T 0.15 0.47 0.28 A 0.85 0.53 0.72 0.26 0.50 0.40 007901 C 0.02 0.16 0.08 G 0.98 0.84 0.92 0.04 0.26 0.14 007917 C 0.07 0.47 0.23 G 0.93 0.53 0.77 0.12 0.50 0.36 007975 A 0.00 0.09 0.04 G 1.00 0.91 0.96 0.00 0.17 0.07 007995 A 0.04 0.09 0.06 G 0.96 0.91 0.94 0.08 0.17 0.12 008013 C 0.13 0.38 0.23 T 0.87 0.62 0.77 0.23 0.47 0.36 008043 G 0.24 0.53 0.36 A 0.76 0.47 0.64 0.36 0.50 0.46 009304 C 0.24 0.63 0.44 T 0.76 0.37 0.56 0.36 0.47 0.49 009314 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009511 C 0.26 0.59 0.43 T 0.74 0.41 0.57 0.39 0.48 0.49 009558 T 0.05 0.04 0.05 C 0.95 0.96 0.95 0.09 0.08 0.09 009612 T 0.55 0.20 0.36 C 0.45 0.80 0.64 0.50 0.31 0.46 009613 T 0.45 0.15 0.30 C 0.55 0.85 0.70 0.50 0.26 0.42 011592 A 0.30 0.10 0.21 G 0.70 0.90 0.79 0.42 0.18 0.33 011610 C 0.07 0.05 0.06 T 0.93 0.95 0.94 0.12 0.10 0.11 011669 G 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 011687 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 012564 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 012891 A 0.26 0.59 0.41 G 0.74 0.41 0.59 0.39 0.48 0.48 013106 A 0.08 0.03 0.05 C 0.92 0.97 0.95 0.15 0.05 0.10 013192 A 0.11 0.02 0.06 G 0.89 0.98 0.94 0.19 0.05 0.12 013231 G 0.19 0.68 0.45 A 0.81 0.33 0.55 0.31 0.44 0.49 013275 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 013279 A 0.61 0.26 0.43 C 0.39 0.74 0.57 0.48 0.39 0.49 014170 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014216 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.10 014509 T 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 014510 G 0.02 0.05 0.03 A 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 015785 A 0.03 0.36 0.18 G 0.97 0.64 0.82 0.05 0.46 0.30 016001 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016038 A 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.05 0.04 016078 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016423 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016632 - 0.02 0.33 0.16 + 0.98 0.68 0.84 0.04 0.44 0.27 016834 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018104 T 0.27 0.30 0.29 C 0.73 0.70 0.71 0.39 0.42 0.41 018253 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018389 C 0.09 0.05 0.07 T 0.91 0.95 0.93 0.16 0.10 0.13 018795 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 018874 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 018931 G 0.57 0.31 0.45 A 0.43 0.69 0.55 0.49 0.42 0.49 019112 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 019346 G 0.08 0.04 0.06 A 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 019501 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019997 A 0.25 0.29 0.27 C 0.75 0.71 0.73 0.38 0.41 0.39 020194 T 0.02 0.31 0.16 C 0.98 0.69 0.84 0.04 0.43 0.27 020208 G 0.50 0.29 0.40 A 0.50 0.71 0.60 0.50 0.41 0.48 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000209: CCA 000757: AAG 004762: TGAG 016078: A 016632: C