Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000141 T 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 000148 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000381 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000449 A 0.27 0.00 0.13 T 0.73 1.00 0.87 0.40 0.00 0.23 000891 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000999 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001272 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001850 G 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 002270 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002420 A 0.33 0.00 0.16 G 0.67 1.00 0.84 0.44 0.00 0.27 002741 + 0.64 0.07 0.35 - 0.36 0.93 0.65 0.46 0.13 0.46 003010 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 003784 A 0.02 0.04 0.03 T 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 003800 A 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004094 + 0.00 0.05 0.02 - 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 004374 G 0.09 0.00 0.05 A 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 004443 T 0.17 0.34 0.26 C 0.83 0.66 0.74 0.29 0.45 0.38 004514 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 004858 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005113 C 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 005513 A 0.04 0.24 0.13 G 0.96 0.76 0.87 0.08 0.36 0.23 006245 G 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 006556 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006638 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006982 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007403 G 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 008542 G 0.24 0.03 0.14 T 0.76 0.97 0.86 0.36 0.05 0.24 008553 A 0.26 0.03 0.15 G 0.74 0.97 0.85 0.39 0.05 0.26 008741 C 0.09 0.00 0.05 G 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 009239 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009466 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 009512 - 0.09 0.00 0.05 + 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 010856 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011516 A 0.63 0.09 0.36 G 0.37 0.91 0.64 0.47 0.16 0.46 011665 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011914 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 012317 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 012490 T 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 012610 + 0.28 0.14 0.21 - 0.72 0.86 0.79 0.41 0.24 0.33 012818 T 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 013355 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013408 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013678 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013788 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014085 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 014186 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 014198 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 014258 C 0.64 0.10 0.37 A 0.36 0.90 0.63 0.46 0.17 0.47 014605 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014614 + 0.22 0.00 0.11 - 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 015149 T 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 015386 A 0.11 0.12 0.12 G 0.89 0.88 0.88 0.20 0.21 0.21 015449 G 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 015467 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 015638 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 015971 A 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 016120 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 016155 A 0.57 0.07 0.31 G 0.43 0.93 0.69 0.49 0.12 0.43 016749 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000148: T 002741: CAAAAACAAAA 004094: A 006638: T 009512: t 012610: T 014614: A