************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /usr/local/genome/lib/phase/PHASE2 -d1 ikbka.phase.inp ikbka.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST ikbka.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates ikbka.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual ikbka.phase.out_recom : estimates of recombination parameters ikbka.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 47 Number of Loci: 101 Positions of loci: 251 957 1029 1501 1738 1866 1927 2999 3029 3434 3743 3912 4319 4324 5428 5744 6174 6292 7966 8542 8882 9320 10226 10465 10657 10672 10808 10921 11244 11459 11898 11962 12127 12184 12694 13009 13179 13497 14018 14635 14883 15498 15958 15994 16008 19006 19096 20381 20387 20563 21350 21573 21734 22395 22427 23463 23975 23992 24173 24561 24616 24895 25434 25785 25827 27073 27591 27667 28086 28134 28699 28715 28856 29161 29173 29995 30214 30419 31243 32152 32588 32615 33153 33460 34363 34389 35486 35773 35827 36137 36184 36383 37038 37680 38983 39399 41277 41954 43648 44940 44953 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file ikbka.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 AAAAIGCTDGGAGATACGCCATGGGTDCIAAAACTCAAGGCCTCCAGICCGCGCAGCCCGIGTCTCTGCATATTA 1 CACCTGAATG 1 CIGATGTAACAGGT 2.000000 2 AAAAIGCTDGGAGATACGCCATGGGTDCIAAAACTCAGGGCCTCCAAICCGCGCACCCGGIGTCTCTGCATATCA 1 CGCCTGAATG 1 CIGTTGTAACAGGT 3.000000 3 AAAAIGCTDGGAGATACGCCATGGGTDCIAAAACTCAGGGCCTCCAAITCGCGCACCCGGIGTCTCTGCATATCA 1 CGCCTGAATG 1 CIGATGTAACAGGT 20.000000 4 AAAAIGCTDGGAGATACGCCATGGGTDCIAAAACTCAGGGCCTCCAAITCGCGCACCCGGIGTCTCTGCATATCA 1 TGCCTGAATG 1 CIGATGTAACAGGT 3.000000 5 AAAAIGCTDGGAGATACGCCATGGGTDTIAAAACTCAGGGCCTCCAAITCGCGCACCCGGIGTCTCTGCATATCA 1 CGCCTGAATG 1 CIGATGTAACAGGT 6.000000 6 AAAAIGCTDGGAGATACGCCATAGGTDCIAAAACTCAGGGCCTCCAGICCGCGCAGCCCGIGTCTCTGCATATTA 1 CACCTGAATG 1 CIGATGTAACAGGT 2.000000 7 AAAAIGCTDGGAGATACGTCATAGGTDCIAAAACTCAAGGGCTCCGAICCGCGCACCCCGIGTCTCTGAATATCA 1 CACCTGAATG 1 CIGATGGAACAGGT 1.000000 8 AAAAIGCTDGGAACTACACCACGGAGICIAAAACTTAAGGCCTTCGADCCGCTCACCTCGIGTCCCTGAATGTCA 1 CACCTGAACG 1 TIAAAGTAATAAGT 7.000000 9 AAAAIGCTDGGAACTACACCACGGAGICIAAAACTTAAGGCCTTCGADCCGCTCACCTCGIGTCCCTGAATGTCA 1 CACCTGAGCG 1 TIAAAGTAATAAGT 3.000000 10 AAAAIGCTDGGGGATACGTCATGGGTDCIAAAACTCAAGGGCTCCGAITCGCGCACTCCGIGTCTTTGCATATCA 1 CGCCTGAATG 1 CIGATGGAACAGGT 1.000000 11 AAAAIGCTDGGGGATACGTCATAGGTDCIAAAACTCAAGGGCTCCGAICCGCGCACTCCGIGTCTCTGAATATCA 1 CACCTGAATG 1 CIGATGGAACAGGT 15.000000 12 AAAAIGCTDGGGGATACGTCATAGGTDCIAAAACTCAAGGGCTCCGAICCGCGCACTCCGIGTCTCTGAATATCA 1 CACCTGAATG 3 CIGATGGAACAGGT 1.000000 13 AAAAIGCTDGGGGATACGTCATAGGTDCIAAAACTCAAGGGCTCCGAICCGCGCACTCCGIGTCTTTGAATATCA 1 CACCTGAATG 1 CIGATGGAACAGGT 5.000000 14 AAAAIGCTDGGGGATACGTCATAGGTDCIAAGACTCAAGGGCTCCGAICCGCGCACTCCGIGTCTCTGAATATCA 1 CACCTGAATG 1 CIGATGGAACAGGT 4.000000 15 AAAAIACTDGGAGCTATACCATGTGTICDAAAACTCAAAGCCTCTGAICCGTGCACCCCGIGTCCCTAAATATCA 1 CATCCGAATA 3 TIGAAATAATAAGC 1.000000 16 AAAAIACTDGGAGCTATACCATGTGTICDAAAACTCAAAGCCTCTGAICCGTGCACCCCAIGTCCCTAAATATCA 1 CATCCGAATA 3 TIGAAATAGTAAGC 2.000000 17 AAAAIACTDGGAGCTATACCATGTGTICDAGAACTCAAAGCCTCTGAICCGTGCACCCCAIGTCCCTAAATATCA 1 CATCCAAATA 3 TIGAAATAGTAAGC 4.000000 18 AATGIGATDGGAGAGGCGCTCTGGGTICIAAAACTCGAGACCTCCGAICCGCGTACCCCGIGTTCCTGAATATCA 1 CACCTGAATG 1 TDGATGTGACAAGT 3.000000 19 TAAGIGACICGAGCTACACCATGGGTICIGAAGTGCAAGGCACCCGAITTACGCGCCCCGDAACCCTGAGTAACG 4 CACTTGGATG 1 TIGAAGTAATCAAT 2.000000 20 TAAGIGACIGGAGCTACACCATGGGTICIAAAGCGCAAGGCCCCCGAICTGCGCACCCCGDGACCCTGAGTAACG 3 CACCTGGATG 1 TIGAAGTAATCAAT 2.000000 21 TAAGIGACIGGAGCTACACCATGGGTICIAAAGCTCAAGGCCCCCGAICTGCGCACCCCGDGACCCTGAGTAACG 1 CACCTGGATG 1 TIGAAGTAATCAAT 1.000000 22 TAAGDGACIGGAGCTACACCATGGGTICIGAAGCGCAAGGCCCCCGAICTGCGCACCCCGDGACCCAGAGTAACG 1 CACCTGGATG 1 TIGAAGTAATCAAT 2.000000 23 TAAGDGACIGGAGCTACACCATGGGTICIGAAGCGCAAGGCCCCCGAICTGCGCACCCCGDGACCCAGAGTAACG 1 CACCTGGATG 2 TIGAAGTAATCAAT 1.000000 24 TGAGIGACICAAGCTACACCATGGGTICIGAAGTGCAAGGCACCCGAITTACGCGCCCCGDAACCCTGAGGAACG 4 CACTTGGATG 1 TIGAAGTAATCAAT 3.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY D001: (18,19) D002: (9,18) D003: (9,10) D004: (5,5) D005: (5,20) D006: (5,16) D007: (3,8) D008: (6,19) D009: (2,8) D010: (8,24) D011: (1,15) D012: (8,11) D013: (3,23) D014: (1,3) D015: (7,8) D016: (16,22) D033: (5,5) D034: (9,21) D035: (8,24) D036: (3,18) D037: (2,20) D038: (22,24) D039: (3,6) D040: (2,8) E001: (11,11) E002: (3,11) E003: (3,14) E004: (11,13) E005: (4,13) E006: (3,14) E007: (3,11) E008: (3,13) E009: (4,14) E010: (11,14) E011: (3,11) E012: (11,11) E013: (4,11) E014: (3,11) E015: (17,17) E016: (12,17) E017: (3,13) E018: (3,3) E019: (3,11) E020: (3,17) E021: (11,13) E022: (3,11) E023: (3,3) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 D001 A A T G I G A T D G G A G A G G C G C T C T G G G T I C I A A A A C T C G A G A C C T C C G A I C C G C G T A C C C C G I G T T C C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 T D G A T G T G A C A A G T T A A G I G A C I C G A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G T G C A A G G C A C C C G A I T T A C G C G C C C C G D A A C C C T G A G T A A C G 4 C A C T T G G A T G 1 T I G A A G T A A [T] C A A T 0 D002 A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A G C G 1 T I A A A G T A A T A A G T A A T G I G A T D G G A G A G G C G C T C T G G G T I C I A A A A C T C G A G A C C T C C G A I C C G C G T A C C C C G I G T T C C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 T D G A T G T G A C A A G T 0 D003 A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D (C) C G C T C A C C T C G I G T C C C T G (A) A T G T C A 1 C (A) C C T G A G C G 1 T I A A A G T A A T A A G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T G G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I (T) C G C G C A C T C C G I G T C T T T G (C) A T A T C A 1 C (G) C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 D004 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D T I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D T I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T 0 D005 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D T I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T T A A G I G A C I G G A G C T A C A C C A T G G G T I C I A A A G C G C A A G G C C C C C G A I C T G C G C A C C C C G D G A C C C T G A G T A A C G 3 C A C C T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D006 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D T I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A A A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C A I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C G A A T A 3 T I G A A A T A G T A A G C 0 D007 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T 0 D008 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T A G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A G I C C G C G C A G C C C G I G T C T C T G C A T A T T A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T T A A G I G A C I C G A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G T G C A A G G C A C C C G A I T T A C G C G C C C C G D A A C C C T G A G T A A C G 4 C A C T T G G A T G 1 T I G A A G T A A [T] C A A T 0 D009 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I C C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G T T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T 0 D010 A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T T G A G I G A C I C A A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G T G C A A G G C A C C C G A I T T A C G C G C C C C G D A A C C C T G A G G A A C G 4 C A C T T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D011 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A A G G C C T C C A G I C C G C G C A G C C C G I G T C T C T G C A T A T T A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A A A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C G I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C G A A T A 3 T I G A A A T A A T A A G C 0 D012 A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 D013 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T T A A G D G A C I G G A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G C G C A A G G C C C C C G A I C T G C G C A C C C C G D G A C C C A G A G T A A C G 1 C A C C T G G A T G 2 T I G A A G T A A T C A A T 0 D014 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A A G G C C T C C A G I C C G C G C A G C C C G I G T C T C T G C A T A T T A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T 0 D015 A A A A I G C T D G G A G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C C C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T 0 D016 A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A A A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C A I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C G A A T A 3 T I G A A A T A G T A A G C T A A G D G A C I G G A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G C G C A A G G C C C C C G A I C T G C G C A C C C C G D G A C C C A G A G T A A C G 1 C A C C T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D033 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D T I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D T I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T 0 D034 A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A G C G 1 T I A A A G T A A T A A G T T A A G I G A C I G G A G C T A C A C C A T G G G T I C I A A A G C T C A A G G C C C C C G A I C T G C G C A C C C C G D G A C C C T G A G T A A C G 1 C A C C T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D035 A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T T G A G I G A C I C A A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G T G C A A G G C A C C C G A I T T A C G C G C C C C G D A A C C C T G A G G A A C G 4 C A C T T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D036 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A T G I G A T D G G A G A G G C G C T C T G G G T I C I A A A A C T C G A G A C C T C C G A I C C G C G T A C C C C G I G T T C C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 T D G A T G T G A C A A G T 0 D037 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I C C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G T T G T A A C A G G T T A A G I G A C I G G A G C T A C A C C A T G G G T I C I A A A G C G C A A G G C C C C C G A I C T G C G C A C C C C G D G A C C C T G A G T A A C G 3 C A C C T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D038 T A A G D G A C I G G A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G C G C A A G G C C C C C G A I C T G C G C A C C C C G D G A C C C A G A G T A A C G 1 C A C C T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T T G A G I G A C I C A A G C T A C A C C A T G G G T I C I G A A G T G C A A G G C A C C C G A I T T A C G C G C C C C G D A A C C C T G A G G A A C G 4 C A C T T G G A T G 1 T I G A A G T A A T C A A T 0 D039 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T A G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A G I C C G C G C A G C C C G I G T C T C T G C A T A T T A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T 0 D040 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I C C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G T T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A A C T A C A C C A C G G A G I C I A A A A C T T A A G G C C T T C G A D C C G C T C A C C T C G I G T C C C T G A A T G T C A 1 C A C C T G A A C G 1 T I A A A G T A A T A A G T 0 E001 A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E002 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E003 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A G A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E004 A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T T T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E005 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 T G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T T T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E006 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A G A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E007 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E008 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T T T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E009 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 T G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A G A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E010 A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A G A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E011 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E012 A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E013 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 T G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E014 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E015 A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A G A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C A I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C A A A T A 3 T I G A A A T A G T A A G C A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A G A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C A I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C A A A T A 3 T I G A A A T A G T A A G C 0 E016 A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 3 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A G A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C A I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C A A A T A 3 T I G A A A T A G T A A G C 0 E017 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T T T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E018 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D [C] I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T 0 E019 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E020 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I A C T D G G A G C T A T A C C A T G T G T I C D A G A A C T C A A A G C C T C T G A I C C G T G C A C C C C A I G T C C C T A A A T A T C A 1 C A T C C A A A T A 3 T I G A A A T A G T A A G C 0 E021 A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T T T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E022 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G G G A T A C G T C A T A G G T D C I A A A A C T C A A G G G C T C C G A I C C G C G C A C T C C G I G T C T C T G A A T A T C A 1 C A C C T G A A T G 1 C I G A T G G A A C A G G T 0 E023 A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T A A A A I G C T D G G A G A T A C G C C A T G G G T D C I A A A A C T C A G G G C C T C C A A I T C G C G C A C C C G G I G T C T C T G C A T A T C A 1 C G C C T G A A T G 1 C I G A T G T A A C A G G T END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 D001 A = T = = = = T D G = = = A G G = G = T C = = = = = = = = A = = A C T = G = = A = C T = = = = = C C G = = T A = = = = = I G T T = = = = = A = = T = A 1 = = = C = = A = ? ? = = D = = T ? = G = ? ? = G = T = A = = = = C I C = = = C T A = A = C A = = = = = = = = G = = G T G = A = = G = A C = = = = = T T A = = C G = = = = = D A A C = = = = = G = = A = G 4 = = = T = = G = ? ? = = I = = A ? = A = ? ? = A = 0 D002 = = A A = = C = = = = = A C T A = A = C A C = = A G = = = = = = = = = T A = = G = = = T = = = D = = = = T C = = = T = = = = = C = = = = = = = G = = = = = = ? = = = = G C = = = I A = A = = A = T = = ? ? = = T G = = A = = = = = G A G G = G = T C T = = G T = = = = = = = = = C G = = A = = = C = = = I = = = = G T = = = C = = = = = T = = = = = = = A = = = = = = ? = = = = A T = = = D G = T = = G = C = = ? ? 0 D003 = = = = = = = = = = = A A C = = = A C = = C = = A G I = = = = = = = = T = = = = C = = T = = = D (C) = = = T = = = C T = = = = = = C C = = (A) = = G = = = = = (A) = = = = = G C = = ? = A = A = T = = T = A = = = = = = = = = = = = = G G A = = = G T = = T = = G T D = = = = = = = = C = = = = G = = C = = = I (T) = = = G = = = T C = = = = = = T T = = (C) = = A = = = = = (G) = = = = = A T = = ? = G = T = G = = C = G = = 0 D004 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D005 A = = A = = C T D = = = = A = = = G = = = = = = = = D T = = = = A = T = = G = = = = T = = A = = T C = = = = = = = = G = I = T = T ? = = C A = = T = A 1 = G = = = = A = = = = C = = = T = = = = C A G G = T = = G = = A C I = = = = C = = = A = = = = = = = = I C = = = = G = G = = A = = = = C = = G = = C T = = = = = = = = C = D = A = C ? = = A G = = A = G 3 = A = = = = G = = = = T = = = A = = = = T C A A = 0 D006 = = = = = G = = = = = = = A = = C G = = = = = G = = D T I = = = = = = = = ? G = = = = = C A = = T = = C = = = = = = G G = = = = T = = G C = = = = = = = = G C = T = = = = G 1 C = = = T G = = A C = G = T = = = = = A = = = = = = = C = = T A = = = = = T = = I C D = = = = = = = = ? A = = = = = T G = = C = = T = = = = = = C A = = = = C = = A A = = = = = = = = A T = C = = = = A 3 T = = = A A = = G T = A = C 0 D007 = = = = = = = = = = = = G A = = = G = = = T = = G T D = = = = = = = = C = ? = = = = = C = A = I T = = = G = = = = C G = = = ? = T = = = C = = A = = = = = G = = = = = = T = = ? = G = T = = = = C = G = = = = = = = = = = = = = = A C = = = A = = = C = = A G I = = = = = = = = T = ? = = = = = T = G = D C = = = T = = = = T C = = = ? = C = = = A = = G = = = = = A = = = = = = C = = ? = A = A = = = = T = A = = 0 D008 ? = = A = = C T D G = = = A = = = G = = = = A = = = D = = A = = A C T = = G = = = C T = = A G = C C G = = = A G = = = = I ? ? = T = = = ? ? ? ? ? T A 1 = = = C = = A = = = = C = = = T = ? = ? ? ? ? ? ? ? = = G = = A C I C = = = C = = = A = = = = G = = = I = = G = = G T G = = A = = = A C = = G A = T T A = = = G C = = = = D ? ? = C = = = ? ? ? ? ? C G 4 = = = T = = G = = = = T = = = A = ? = ? ? ? ? ? ? 0 D009 = = = = = = = = = = = = G A = = = G = = = T = = G T D = = = = = = = = C = G = = = = = C = A = I = = = = G = = = = C G = = = = = T = = = C = = A = = = = = G = = = = = = T = = C = G T T = = = = C = G = = = = = = = = = = = = = = A C = = = A = = = C = = A G I = = = = = = = = T = A = = = = = T = G = D = = = = T = = = = T C = = = = = C = = = A = = G = = = = = A = = = = = = C = = T = A A A = = = = T = A = = 0 D010 A A = A = = C T D G G = A = = = = = = = = C = = A G = = = A = = A C T T = = = = = C T T = = = D C C G = T = A = = T = = I G T = = = = = = A T G T = A 1 = = = C = = A = C = = = = A = = = = = = = A = G = T G = G = = A C I C A = G = = = = = = = = T = = G T = = = G = = G T G C = = = = = A C C = = = I T T A = G = G = = C = = D A A = = = = = = G G A A = G 4 = = = T = = G = T = = = = G = = = = = = = C = A = 0 D011 ? = = = = G = = = = = = = A = = ? ? = = = = = G = = D = I = ? ? ? ? = = = = G = = = = = C A G = = = = C = = = G = = = = = = = = T = = G C = = = = T = = = = C = T = = = = G 1 C = = = T G = = = C = G = T ? = = = = A = = = = = = = C = = ? ? = = = = = T = = I = D = ? ? ? ? = = = = A = = = = = T G A = = = = T = = = C = = = = = = = = C = = A A = = = = C = = = = T = C = = = = A 3 T = = = A A = = = T = A = C 0 D012 = = = = = = = = = = = A A C = = = A C = = C G = A G I = = = = = = = = T = = = = C = = T = = = D = = = = T = = = C T = = = = = = C = = = = = = G = = = = = = = = = = = = C = = T = A = A = T = = T = A = = = = = = = = = = = = = G G A = = = G T = = T A = G T D = = = = = = = = C = = = = G = = C = = = I = = = = G = = = T C = = = = = = T = = = = = = A = = = = = = = = = = = = T = = C = G = T = G = = C = G = = 0 D013 A = = A I = C T D = = = = A = = = G = = = = = = = = D = = A = = A = T = = G = = = = T = = A = = T C = = = = = = = = G = I = T = T = T = ? ? ? ? ? = A = = G = = = = A = = = 1 C = = = T = = = = C A G G = T = = G D = A C I = = = = C = = = A = = = = = = = = I = = G = = G = G = = A = = = = C = = G = = C T = = = = = = = = C = D = A = C = A = ? ? ? ? ? = G = = A = = = = G = = = 2 T = = = A = = = = T C A A = 0 D014 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = G = C = = = = = = G = = C = = = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = A = T = = = = = = C = = G = = = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D015 = = ? = = = = = = = = = G A = = = G T = = T A = G T D = = = = = = = = C = = = = G = = C = = = I = = = = G = = = = C = = = = = = T = = = = = = A = = = = = = = = = = = = T = = C = G = T = ? = = C = G = = = = ? = = = = = = = = = A C = = = A C = = C G = A G I = = = = = = = = T = = = = C = = T = = = D = = = = T = = = = T = = = = = = C = = = = = = G = = = = = = = = = = = = C = = T = A = A = ? = = T = A = = 0 D016 A = = A I A C T D = = = = = = = T = = = = = = T = = = = D A = = A = T = = = A = = = T = T = = = = C = T = = = = = = = A ? = T = = = T A = A = = T = A = = = T = C = A = = A 3 = = = = = A ? = G = A ? ? ? T = = G D G A C I = = = = = = = C = = = = = = G = = = = I G = = G = G = = = G = = = C = C = = = = T = C = = = = = = = G ? = A = = = A G = G = = A = G = = = C = T = G = = G 1 = = = = = G ? = A = C ? ? ? 0 D033 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D034 A = = A = = C T D = = = A = = = = = = = = C = = A G = = = = = = A = = T = = = = = = T T = = = D = C = = T = = = = T = = I = T = = = = = = A = G T = A = = = = = = = A G C = = = = A = = = = = = = A = G = T = = G = = A C I = = = G = = = = = = = = T = = G T = = = = = = G = = C = = = = = = C C = = = I = T = = G = = = = C = = D = A = = = = = = G = A A = G = = = = = = = G A T = = = = G = = = = = = = C = A = 0 D035 A A = A = = C T D G G = A = = = = = = = = C = = A G = = = A = = A C T T = = = = = C T T = = = D C C G = T = A = = T = = I G T = = = = = = A T G T = A 1 = = = C = = A = C = = = = A = = = = = = = A = G = T G = G = = A C I C A = G = = = = = = = = T = = G T = = = G = = G T G C = = = = = A C C = = = I T T A = G = G = = C = = D A A = = = = = = G G A A = G 4 = = = T = = G = T = = = = G = = = = = = = C = A = 0 D036 = = A A = = C = = = = = = = T A = = = C A = = = = = D = = = = = = = = = A G = G = = = = = A = = T = = = = C = = = = G = = = = C T = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = C I = = = = = A = = = G = = = = T G = = A = = = = = = = G G = = = T C = = = = = I = = = = = = = = = G A = A = = = = = G = = C = = = = T = = = = C = = = = T C = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = T D = = = = = G = = = A = = 0 D037 ? = = A = = C T D = = = = A = = = G = = = = = = = = D = = = = = A = T = = G = = = = T = = A = = = C = = = = = = = = G = I = T = T = = = C A = = T = A 1 = G = = = = A = = = = C = = T T = = = = C A G G = ? = = G = = A C I = = = = C = = = A = = = = = = = = I = = = = = G = G = = A = = = = C = = G = = = T = = = = = = = = C = D = A = C = = = A G = = A = G 3 = A = = = = G = = = = T = = A A = = = = T C A A = 0 D038 = A = = D = = = = G G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = C = = = = = = C = G = = = A = = = = = = G = = = = A = = = T = = = = 1 = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = I = = = = C A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = A = = = = = = T = A = = = G = = = = = = A = = = = T = = = G = = = = 4 = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D039 = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = T = = = = = = C = = G = = = = = = = = = = = = = = C = = = G = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = C = = = = = = G = = C = = = = = = = = = = = = = = T = = = A = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = 0 D040 = = = = = = = = = = = = G A = = = G = = = T = = G T D = = = = = = = = C = G = = = = = C = A = I = = = = G = = = = C G = ? = = = T = = = C = = A = = = = = G = = = = = = T = = C = G T T = = = = C = ? ? ? = = = = = = = = = = = = A C = = = A = = = C = = A G I = = = = = = = = T = A = = = = = T = G = D = = = = T = = = = T C = ? = = = C = = = A = = G = = = = = A = = = = = = C = = T = A A A = = = = T = ? ? ? 0 E001 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E002 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E003 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = A = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = G = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E004 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E005 = = = = = = ? = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = ? ? = C = G = = = = = = C = = C = = = = = = = T G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = ? = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = ? ? = T = C = = = = = = T = = A = = = = = = = C A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E006 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = A = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = G = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E007 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = ? ? = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = ? ? = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E008 = = = = = = = ? ? ? = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = ? ? ? = = = = C = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = ? ? ? = = = = T = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = ? = = 0 E009 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = A = = = = = ? = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = T G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = G = = = = = ? = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = C A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E010 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E011 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E012 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E013 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = T G ? = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = C A ? = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E014 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E015 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E016 = = = = = G = = = = = G = A = = C G T = = = A G = = D = I = A = = = = = = = G = G = = = C = = = = = = C = = = = T = = G = = = = T = = G = = = = = ? ? = = = C = T G = = = G = C = = = T G G = A C = ? ? ? = = = = = A = = = = = A = C = = T A C = = = G T = = I = D = G = = = = = = = A = C = = = T = = = = = = T = = = = C = = A = = = = C = = A = = = = = ? ? = = = T = C A = = = A = T = = = A A T = G T = ? ? ? 0 E017 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = ? ? ? ? = = = G = = C = = = = A = = T = ? ? = = = = C = G = = = = = = C = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = ? = = = ? = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = ? ? ? ? = = = A = = G = = = = G = = C = ? ? = = = = T = C = = = = = = T = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = ? = = = ? = G = = = = = = = 0 E018 = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? ? = = ? ? = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = ? ? = = = = = ? ? = = ? ? = = ? ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = ? = = = ? ? = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? ? = = ? ? = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = ? ? = = = = = ? ? = = ? ? = = ? ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = ? = = = ? ? = = ? = ? = = = = = = = 0 E019 = = = = = = = = = = = A = = = = = = C = = = G = = = = = = = = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = T = = = A = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E020 = = = = = G ? = = = = = = A = = ? ? = = = = = G = = D = I = A = = = = = = G G = = = = = C A = = T = = C = = = = = = G G = = = = T = = G C = = = = = = = = G ? = T G = = = G 1 C = = = T G = = A C = G = T = = = = = A ? = = = = = = C = = ? ? = = = = = T = = I = D = G = = = = = = A A = = = = = T G = = C = = T = = = = = = C A = = = = C = = A A = = = = = = = = A ? = C A = = = A 3 T = = = A A = = G T = A = C 0 E021 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E022 = = = = = = ? = = = = A = = = = = = C = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = G = = C = = = = A = = T = = = = = = = C = G = = = = = = = = = C = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = ? = = = = G = = = = = = T = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = A = = G = = = = G = = C = = = = = = = T = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = 0 E023 = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = ? ? = = 1.00 = = 1.00 ? = 1.00 = ? ? = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = ? ? = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 0.68 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = 0.68 = = 1.00 = = = = = 0.68 = = = = = 1.00 1.00 = = ? = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 ? = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = ? 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = ? = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = ? = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = ? = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = ? = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 ? ? = 1.00 = = = ? ? ? ? ? 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = ? = ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = ? = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? = = = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? ? ? ? ? = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = ? = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 ? = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 ? = 1.00 = 1.00 ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = ? = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 = ? = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 0.98 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = ? ? = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 0.98 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 0.99 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = ? ? = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = ? ? ? = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = ? = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = 0.99 = = = = = ? = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 1.00 ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = ? ? = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? ? = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = ? ? ? ? = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = ? ? = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = ? = = = ? = 1.00 = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = ? ? ? ? = = ? ? = = = ? ? ? ? ? ? ? = = = = = ? ? ? = = = = ? ? = = = = = ? ? = = ? ? = = ? ? ? ? = ? ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = = ? = = = ? ? = = ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = 1.00 ? = = = = = = 1.00 = = ? ? = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 ? = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = ? ? ? ? ? ? ? ? = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = END PHASEPROBS