Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz hz 000507 C 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 000746 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 000811 A 0.00 0.00 0.05 G 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.10 000815 C 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000858 C 0.00 0.02 0.23 T 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.36 000953 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 001177 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 001243 A 0.00 0.02 0.23 G 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.35 001426 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 001485 G 0.00 0.14 0.40 A 0.00 0.86 0.60 0.00 0.24 0.48 001502 C 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 001548 T 0.00 0.14 0.38 C 0.00 0.86 0.62 0.00 0.24 0.47 002202 - 0.00 0.00 0.06 + 0.00 1.00 0.94 0.00 0.00 0.10 002227 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 002277 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002511 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 002595 A 0.00 0.02 0.24 C 0.00 0.98 0.76 0.00 0.04 0.36 002711 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 002740 T 0.00 0.02 0.23 C 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.36 002861 C 0.00 0.02 0.23 A 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.36 002953 + 0.00 0.00 0.01 - 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 003291 C 0.00 0.02 0.03 G 0.00 0.98 0.97 0.00 0.04 0.06 003376 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 003594 T 0.00 0.05 0.10 C 0.00 0.95 0.90 0.00 0.10 0.18 003597 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 003690 T 0.00 0.09 0.35 C 0.00 0.91 0.65 0.00 0.17 0.45 003718 T 0.00 0.14 0.08 C 0.00 0.86 0.92 0.00 0.24 0.15 003751 A 0.00 0.02 0.20 G 0.00 0.98 0.80 0.00 0.05 0.31 004982 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 005169 A 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 005225 C 0.00 0.02 0.21 G 0.00 0.98 0.79 0.00 0.04 0.33 005489 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 006291 A 0.00 0.02 0.09 G 0.00 0.98 0.91 0.00 0.04 0.17 006421 G 0.00 0.13 0.07 A 0.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.12 006922 G 0.00 0.02 0.25 C 0.00 0.98 0.75 0.00 0.05 0.38 007675 C 0.00 0.03 0.01 T 0.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 008178 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008317 T 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 008940 A 0.00 0.13 0.38 G 0.00 0.87 0.62 0.00 0.23 0.47 009221 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 010187 C 0.00 0.03 0.20 T 0.00 0.97 0.80 0.00 0.05 0.32 010891 G 0.00 0.00 0.02 A 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 011566 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.03 013099 G 0.00 0.15 0.37 C 0.00 0.85 0.63 0.00 0.25 0.46 016722 T 0.00 0.04 0.02 A 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 016954 A 0.00 0.02 0.23 G 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.35 018274 A 0.00 0.02 0.22 C 0.00 0.98 0.78 0.00 0.04 0.35 019629 C 0.00 0.09 0.37 T 0.00 0.91 0.63 0.00 0.16 0.47 020238 T 0.00 0.02 0.23 C 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.36 020241 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 020350 A 0.00 0.00 0.05 G 0.00 1.00 0.95 0.00 0.00 0.10 020716 C 0.00 0.15 0.39 T 0.00 0.85 0.61 0.00 0.26 0.48 020747 C 0.00 0.13 0.14 T 0.00 0.87 0.86 0.00 0.23 0.24 020940 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 022696 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 023267 G 0.00 0.15 0.39 A 0.00 0.85 0.61 0.00 0.26 0.48 024267 C 0.00 0.02 0.25 G 0.00 0.98 0.75 0.00 0.04 0.38 024273 T 0.00 0.16 0.09 C 0.00 0.84 0.91 0.00 0.27 0.16 024491 T 0.00 0.00 0.04 C 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 024547 G 0.00 0.02 0.23 A 0.00 0.98 0.77 0.00 0.04 0.35 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002202: ag 002511: aatgcataggtccca 002953: g