Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000295 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.03 000331 A 0.00 0.13 0.08 G 1.00 0.87 0.92 0.00 0.23 0.15 000463 G 0.47 0.20 0.31 A 0.53 0.80 0.69 0.50 0.32 0.43 001086 A 0.27 0.32 0.29 G 0.73 0.68 0.71 0.40 0.43 0.41 001132 A 0.00 0.11 0.05 C 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.09 001591 A 0.12 0.10 0.11 G 0.88 0.90 0.89 0.21 0.17 0.19 001781 T 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.15 002034 C 0.31 0.28 0.30 T 0.69 0.72 0.70 0.43 0.41 0.42 002149 + 0.20 0.09 0.14 - 0.80 0.91 0.86 0.31 0.16 0.24 002221 G 0.33 0.28 0.30 T 0.67 0.72 0.70 0.44 0.41 0.42 002368 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002673 C 0.35 0.28 0.32 T 0.65 0.72 0.68 0.46 0.41 0.43 002867 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002939 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 003012 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003233 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003330 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003360 T 0.08 0.20 0.14 G 0.92 0.80 0.86 0.15 0.31 0.24 003369 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003434 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003676 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003852 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003894 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003995 C 0.12 0.00 0.07 T 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 004132 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006148 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006234 + 0.21 0.33 0.27 - 0.79 0.67 0.73 0.33 0.44 0.39 006296 T 0.31 0.00 0.16 G 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 006332 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 006353 A 0.25 0.28 0.27 G 0.75 0.72 0.73 0.38 0.41 0.39 006923 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006958 T 0.44 0.50 0.47 C 0.56 0.50 0.53 0.49 0.50 0.50 007154 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007173 A 0.33 0.26 0.30 G 0.67 0.74 0.70 0.44 0.39 0.42 007209 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007270 G 0.33 0.20 0.27 A 0.67 0.80 0.73 0.44 0.31 0.39 007323 T 0.25 0.17 0.21 C 0.75 0.83 0.79 0.38 0.29 0.33 007395 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007428 C 0.38 0.30 0.34 T 0.62 0.70 0.66 0.47 0.42 0.45 007429 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 007552 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007559 T 0.35 0.24 0.30 C 0.65 0.76 0.70 0.46 0.36 0.42 007574 C 0.02 0.09 0.05 T 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 007729 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007963 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 008421 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008528 G 0.27 0.28 0.28 C 0.73 0.72 0.72 0.39 0.41 0.40 008641 A 0.29 0.20 0.24 G 0.71 0.80 0.76 0.41 0.31 0.37 008678 G 0.31 0.28 0.30 C 0.69 0.72 0.70 0.43 0.41 0.42 008814 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009139 G 0.38 0.28 0.33 A 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 009214 - 0.40 0.48 0.44 + 0.60 0.52 0.56 0.48 0.50 0.49 009329 T 0.08 0.15 0.12 C 0.92 0.85 0.88 0.15 0.26 0.21 009428 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009470 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009667 C 0.38 0.28 0.33 T 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 009672 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009779 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009976 A 0.34 0.28 0.31 G 0.66 0.72 0.69 0.45 0.41 0.43 009981 C 0.34 0.28 0.31 T 0.66 0.72 0.69 0.45 0.41 0.43 010099 C 0.35 0.28 0.32 T 0.65 0.72 0.68 0.45 0.41 0.43 010176 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010191 C 0.33 0.24 0.29 G 0.67 0.76 0.71 0.44 0.36 0.41 010229 T 0.19 0.09 0.14 C 0.81 0.91 0.86 0.30 0.16 0.24 010279 C 0.31 0.17 0.24 T 0.69 0.83 0.76 0.43 0.29 0.37 010317 T 0.38 0.28 0.33 A 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 010399 C 0.54 0.41 0.48 G 0.46 0.59 0.52 0.50 0.48 0.50 010468 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010515 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010583 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010635 G 0.38 0.28 0.33 A 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 010650 G 0.38 0.28 0.33 C 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 010684 G 0.33 0.28 0.31 A 0.67 0.72 0.69 0.44 0.41 0.43 010712 G 0.38 0.28 0.33 A 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 010743 G 0.38 0.28 0.33 C 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 010926 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011089 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011186 A 0.35 0.25 0.30 G 0.65 0.75 0.70 0.45 0.38 0.42 011312 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 011582 T 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 011701 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011740 T 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 011783 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011810 C 0.02 0.09 0.05 G 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 011823 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011827 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011878 C 0.38 0.28 0.33 T 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 011922 T 0.41 0.59 0.50 C 0.59 0.41 0.50 0.48 0.48 0.50 012036 A 0.30 0.26 0.28 G 0.70 0.74 0.72 0.42 0.39 0.41 012138 + 0.29 0.28 0.28 - 0.71 0.72 0.72 0.41 0.40 0.40 012139 G 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 012163 C 0.30 0.29 0.30 G 0.70 0.71 0.70 0.42 0.41 0.42 012198 T 0.30 0.26 0.28 A 0.70 0.74 0.72 0.42 0.39 0.41 012582 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012843 C 0.08 0.15 0.12 G 0.92 0.85 0.88 0.15 0.26 0.21 013322 G 0.25 0.21 0.23 C 0.75 0.79 0.77 0.38 0.33 0.36 013518 A 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 013958 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014102 C 0.38 0.28 0.33 G 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 014119 + 0.07 0.00 0.03 - 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014187 T 0.35 0.28 0.32 C 0.65 0.72 0.68 0.46 0.41 0.43 014190 C 0.37 0.28 0.33 T 0.63 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 014213 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014242 A 0.38 0.28 0.33 G 0.62 0.72 0.67 0.47 0.41 0.44 014270 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014300 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014335 A 0.29 0.20 0.24 G 0.71 0.80 0.76 0.41 0.31 0.37 014460 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014491 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002149: ggtc 006234: ctg 007729: ACCCCC 009214: GGT 010515: a 012138: c 014119: c 014270: tgggcctgtgcgtcccggggctcc