Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 chi2 000103 AA 0 0 0 AG 0 5 5 GG 23 18 41 0.000 0.342 0.152 000434 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 001568 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.022 002210 ++ 4 1 5 +- 11 8 19 -- 8 13 21 0.000 0.027 0.050 002730 AA 1 0 1 AG 9 4 13 GG 13 19 32 0.000 0.209 0.058 002815 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.000 0.000 0.022 005343 CC 4 1 5 CT 14 8 22 TT 6 14 20 0.000 0.011 0.084 005484 GG 23 8 31 GT 0 8 8 TT 0 7 7 0.000 2.112 12.538 005663 ++ 21 23 44 +- 2 0 2 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.023 006185 GG 24 18 42 GT 0 5 5 TT 0 0 0 0.000 0.342 0.148 006198 CC 24 21 45 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.022 006227 AA 4 1 5 AG 14 8 22 GG 6 14 20 0.000 0.011 0.084 006909 AA 20 22 42 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 007065 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 20 21 41 0.000 0.012 0.006 007222 AA 14 23 37 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.242 007388 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 19 23 42 0.000 0.000 0.006 007426 AA 18 23 41 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.055 007711 GG 1 0 1 GT 9 3 12 TT 12 20 32 0.000 0.112 0.010 007744 CC 22 21 43 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 007793 AA 20 23 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.023 007929 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.000 0.000 0.023 008899 AA 20 23 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 009671 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 20 44 0.000 0.112 0.051 013809 CC 24 19 43 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.023 013960 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 23 45 0.000 0.000 0.006 014047 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 014229 AA 1 0 1 AG 10 4 14 GG 11 18 29 0.000 0.220 0.212 014342 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 22 21 43 0.000 0.012 0.006 014353 AA 22 8 30 AT 0 8 8 TT 0 6 6 0.000 1.564 10.237 014615 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 19 22 41 0.000 0.000 0.024 014673 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 19 22 41 0.000 0.000 0.024 014683 AA 0 0 0 AC 2 1 3 CC 19 22 41 0.000 0.011 0.055 014729 ++ 4 12 16 +- 9 7 16 -- 7 3 10 0.000 1.223 2.074 014769 AA 0 2 2 AG 4 4 8 GG 9 15 24 0.000 3.070 1.234 014938 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 016132 AA 0 6 6 AG 0 7 7 GG 16 7 23 0.000 1.779 8.982 016741 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 21 23 44 0.000 0.000 0.023 016762 AA 8 13 21 AG 12 8 20 GG 3 1 4 0.000 0.027 0.061 016882 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 21 23 44 0.000 0.000 0.006 016910 AA 7 14 21 AG 12 8 20 GG 3 1 4 0.000 0.011 0.061 016977 ++ 21 21 42 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.006 017025 ++ 7 13 20 +- 13 8 21 -- 3 1 4 0.000 0.027 0.211 017130 AA 3 1 4 AT 11 9 20 TT 9 13 22 0.000 0.130 0.033 017232 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 18 22 40 0.000 0.000 0.025 017724 CC 16 21 37 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.168 018068 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 20 41 0.000 0.000 0.024 018106 CC 20 20 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 018270 ++ 8 13 21 +- 10 6 16 -- 5 2 7 0.000 0.948 1.602 018274 AA 22 21 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 018317 AA 24 19 43 AC 0 2 2 CC 0 0 0 0.000 0.053 0.023 018415 CC 19 18 37 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.000 0.124 0.428 018608 AA 24 21 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 018760 AA 3 1 4 AG 13 8 21 GG 8 13 21 0.000 0.027 0.152 019101 ++ 0 0 0 +- 6 0 6 -- 14 17 31 0.000 0.000 0.288 019251 CC 9 15 24 CG 8 4 12 GG 2 1 3 0.000 0.930 0.693 019633 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 019700 AA 23 21 44 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 020917 ++ 15 5 20 +- 7 9 16 -- 1 8 9 0.000 0.609 2.672 021467 CC 0 1 1 CT 0 5 5 TT 24 16 40 0.000 0.499 2.368 021550 CC 11 14 25 CT 12 6 18 TT 1 2 3 0.000 1.099 0.010 021987 AA 23 17 40 AG 0 5 5 GG 0 1 1 0.000 0.571 2.368 022451 AA 1 8 9 AC 5 9 14 CC 18 6 24 0.000 1.028 5.328 022520 GG 3 1 4 GT 13 8 21 TT 8 14 22 0.000 0.011 0.105 022537 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.000 0.000 0.218 023324 AA 3 1 4 AG 11 7 18 GG 7 14 21 0.000 0.011 0.003 023583 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 21 22 43 0.000 0.011 0.006 023657 AA 0 0 0 AT 3 0 3 TT 18 23 41 0.000 0.000 0.055 023835 WARNING: more than 2 alleles: C A G 024438 CC 17 20 37 CT 5 3 8 TT 0 0 0 0.000 0.112 0.428 024603 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 19 23 42 0.000 0.000 0.054 024754 AA 19 23 42 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.054 024822 AA 0 7 7 AG 0 8 8 GG 22 7 29 0.000 1.636 11.677 024838 AA 21 22 43 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 025893 AA 3 1 4 AG 12 7 19 GG 8 14 22 0.000 0.011 0.001 025920 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 22 43 0.000 0.000 0.023 026064 AA 3 1 4 AG 13 8 21 GG 8 14 22 0.000 0.011 0.105 026457 CC 22 19 41 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.024 026891 CC 1 7 8 CT 6 9 15 TT 15 6 21 0.000 0.714 2.816 026935 CC 21 22 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 027077 AA 17 23 40 AG 7 0 7 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.304 027366 AA 1 0 1 AG 8 4 12 GG 12 19 31 0.000 0.209 0.016 027402 GG 19 23 42 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.024 028912 CC 8 14 22 CT 13 7 20 TT 3 2 5 0.000 0.616 0.020 029879 ++ 3 3 6 +- 12 4 16 -- 7 12 19 0.000 3.971 0.717 029959 AA 1 7 8 AG 0 4 4 GG 23 8 31 0.000 6.343 23.508 030109 AA 14 16 30 AC 9 4 13 CC 1 1 2 0.000 1.037 0.147 030150 AA 19 21 40 AT 5 0 5 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.156 030230 AA 19 22 41 AT 5 0 5 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.152 030464 CC 5 2 7 CT 9 6 15 TT 8 14 22 0.000 1.099 2.298 030523 AA 9 14 23 AG 9 6 15 GG 5 2 7 0.000 1.099 2.525 031401 AA 5 6 11 AC 16 8 24 CC 3 9 12 0.000 1.965 0.022 031402 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 031935 AA 21 23 44 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 032042 AA 16 23 39 AG 7 0 7 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.312 032158 CC 18 17 35 CT 6 5 11 TT 0 1 1 0.000 0.571 0.015 032179 CC 18 23 41 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.218 032319 AA 8 13 21 AG 13 7 20 GG 3 3 6 0.000 1.431 0.129 032607 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.051 032687 CC 5 6 11 CT 15 8 23 TT 4 9 13 0.000 1.965 0.018 032694 CC 0 1 1 CG 6 5 11 GG 18 17 35 0.000 0.571 0.015 032773 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.000 0.000 0.005 032810 GG 0 1 1 GT 6 5 11 TT 18 17 35 0.000 0.571 0.015 033022 CC 5 6 11 CT 15 8 23 TT 4 9 13 0.000 1.965 0.018 033039 ++ 0 1 1 +- 6 5 11 -- 18 17 35 0.000 0.571 0.015 034453 CC 24 7 31 CT 0 8 8 TT 0 7 7 0.000 1.636 12.538 034556 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 034677 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 16 23 39 0.000 0.000 0.230 035338 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 17 22 39 0.000 0.000 0.230 035770 GG 0 1 1 GT 6 5 11 TT 17 16 33 0.000 0.499 0.005 036310 AA 4 9 13 AG 15 8 23 GG 5 6 11 0.000 1.965 0.018 036353 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.022 037543 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 19 23 42 0.000 0.000 0.148 038068 CC 17 17 34 CG 6 5 11 GG 0 1 1 0.000 0.571 0.010 038411 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 038451 ++ 0 1 1 +- 6 5 11 -- 17 16 33 0.000 0.499 0.005 038699 CC 3 2 5 CG 8 5 13 GG 6 10 16 0.000 1.016 0.724 038886 CC 21 22 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 038946 CC 17 16 33 CT 6 5 11 TT 0 1 1 0.000 0.499 0.005 038999 AA 21 22 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.023 039570 AA 24 17 41 AG 0 5 5 GG 0 1 1 0.000 0.571 2.448 042858 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 22 42 0.000 0.000 0.006 042932 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 22 42 0.000 0.000 0.006 042966 AA 16 16 32 AG 5 5 10 GG 0 1 1 0.000 0.499 0.043 043286 AA 1 0 1 AG 9 4 13 GG 11 18 29 0.000 0.220 0.106 043341 AA 21 17 38 AG 0 5 5 GG 0 0 0 0.000 0.362 0.164 043457 AA 16 16 32 AG 5 5 10 GG 0 1 1 0.000 0.499 0.043 044031 GG 5 11 16 GT 11 8 19 TT 4 2 6 0.000 0.093 0.009 044231 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 23 44 0.000 0.000 0.006 044473 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.000 0.000 0.023 044625 AA 6 4 10 AT 11 6 17 TT 5 13 18 0.000 3.390 2.174 045267 AA 0 6 6 AG 0 8 8 GG 22 8 30 0.000 1.564 10.237 045351 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 22 42 0.000 0.000 0.024 045802 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 21 45 0.000 0.012 0.006 047068 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.000 0.000 0.006 047206 ++ 14 16 30 +- 8 6 14 -- 1 1 2 0.000 0.195 0.050 047463 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.000 0.000 0.006 047469 CC 6 4 10 CG 12 6 18 GG 5 12 17 0.000 3.035 1.461 047664 AA 5 4 9 AG 13 6 19 GG 4 12 16 0.000 3.035 0.571 047679 AA 5 4 9 AG 9 6 15 GG 5 12 17 0.000 3.035 2.348 053992 CC 19 21 40 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.156 054145 AA 0 6 6 AG 0 10 10 GG 19 6 25 0.000 0.182 5.883 054295 AA 1 6 7 AG 4 10 14 GG 14 6 20 0.000 0.182 2.376 054361 CC 19 6 25 CG 0 10 10 GG 0 6 6 0.000 0.182 5.883 054381 ++ 14 6 20 +- 5 10 15 -- 0 6 6 0.000 0.182 1.209 054636 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.000 0.000 0.022 054711 ++ 24 22 46 +- 0 1 1 -- 0 0 0 0.000 0.011 0.005 055108 GG 21 23 44 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 055216 CC 10 5 15 CT 11 9 20 TT 2 9 11 0.000 0.857 0.705 055424 CC 13 7 20 CT 9 10 19 TT 0 6 6 0.000 0.381 0.190 055463 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 055598 AA 1 0 1 AC 4 0 4 CC 19 23 42 0.000 0.000 3.895 055651 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.000 0.000 0.304 055836 CC 0 1 1 CT 2 3 5 TT 22 19 41 0.000 2.457 2.448 055897 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 056043 AA 22 7 29 AG 0 9 9 GG 0 5 5 0.000 0.383 6.607 056117 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 21 43 0.000 0.012 0.006 056269 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 18 21 39 0.000 0.000 0.102 056848 CC 24 19 43 CG 0 3 3 GG 0 1 1 0.000 2.457 6.306 057056 CC 11 5 16 CT 11 9 20 TT 2 9 11 0.000 0.857 0.911 060254 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.000 0.000 0.023 060624 AA 0 0 0 AG 8 0 8 GG 16 22 38 0.000 0.000 0.417 060868 AA 0 1 1 AC 1 3 4 CC 23 19 42 0.000 2.457 3.895 060893 AA 16 23 39 AG 7 0 7 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.312 061192 CC 20 22 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.024 061215 AA 18 18 36 AG 4 3 7 GG 0 1 1 0.000 2.296 0.786 061607 AA 22 22 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.023 061611 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.000 0.000 0.006 061672 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.000 0.000 0.051 061827 CC 19 22 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 062566 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.000 0.000 0.022 062577 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 062594 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.000 0.000 0.093 062595 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 23 43 0.000 0.000 0.093 062668 CC 2 10 12 CT 3 7 10 TT 19 6 25 0.000 3.188 13.665 062752 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 23 43 0.000 0.000 0.093 062807 CC 1 1 2 CT 4 3 7 TT 19 19 38 0.000 2.457 3.666 062820 AA 0 1 1 AG 0 3 3 GG 24 19 43 0.000 2.457 6.306 063534 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.005 063546 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.000 0.000 0.005 063613 CC 19 23 42 CG 5 0 5 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.148 068652 AA 23 17 40 AG 1 2 3 GG 0 1 1 0.000 3.951 5.825 068778 AA 22 21 43 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 068852 AA 24 20 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 069751 AA 20 23 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.052 069934 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.000 0.000 0.006 069971 AA 1 1 2 AG 3 3 6 GG 19 19 38 0.000 2.457 4.914 070216 CC 0 1 1 CT 0 3 3 TT 23 17 40 0.000 2.136 5.825 070392 AA 22 19 41 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.013 0.006 070413 CC 22 19 41 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.013 0.006 070547 AA 1 1 2 AG 4 3 7 GG 18 19 37 0.000 2.457 3.535 070756 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 19 23 42 0.000 0.000 0.095 070788 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 071062 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 071129 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 22 19 41 0.000 0.053 0.024 071160 AA 20 21 41 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.055 071432 ++ 0 0 0 +- 1 0 1 -- 21 21 42 0.000 0.000 0.006 071450 CC 21 21 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.006 071532 AA 1 0 1 AG 9 6 15 GG 11 15 26 0.000 0.583 0.474 071606 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 22 44 0.000 0.000 0.006 071651 CC 3 5 8 CT 12 6 18 TT 8 11 19 0.000 3.711 1.001 071773 CC 21 23 44 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.023 071853 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 21 23 44 0.000 0.000 0.023 072647 AA 0 0 0 AC 0 3 3 CC 23 20 43 0.000 0.112 0.052 074476 AA 1 4 5 AG 8 11 19 GG 15 8 23 0.000 0.004 0.130 074909 AA 0 1 1 AG 0 3 3 GG 23 17 40 0.000 2.136 5.825 075132 AA 23 20 43 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 075661 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.022 075874 CC 18 22 40 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.224 076106 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 076157 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 076274 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.000 0.000 0.006 076354 AA 9 16 25 AG 13 6 19 GG 2 0 2 0.000 0.548 0.473 076367 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.000 0.000 0.006 076749 CC 13 17 30 CT 11 6 17 TT 0 0 0 0.000 0.517 2.291 077324 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.000 0.000 0.304 077429 CC 3 13 16 CG 12 9 21 GG 9 1 10 0.000 0.130 0.394 077451 AA 2 0 2 AG 13 6 19 GG 9 17 26 0.000 0.517 0.413 077732 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 17 23 40 0.000 0.000 0.304 078218 ++ 2 0 2 +- 13 6 19 -- 9 14 23 0.000 0.623 0.617 078340 CC 18 21 39 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.230 078385 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 20 44 0.000 0.012 0.006 078402 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 21 43 0.000 0.000 0.023 078767 CC 21 21 42 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.054 078915 AA 0 0 0 AT 6 0 6 TT 18 23 41 0.000 0.000 0.218 080151 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.000 0.000 0.023 080179 ++ 4 17 21 +- 12 5 17 -- 8 0 8 0.000 0.362 1.780 080466 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 17 22 39 0.000 0.000 0.058 080629 CC 21 22 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 080691 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.000 0.000 0.023 080830 AA 24 20 44 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.050 0.023 080840 AA 0 1 1 AG 0 3 3 GG 24 18 42 0.000 2.296 6.146 081045 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 22 44 0.000 0.000 0.006 081163 CC 1 1 2 CT 9 3 12 TT 14 18 32 0.000 2.296 0.390 081299 AA 14 18 32 AG 9 3 12 GG 1 1 2 0.000 2.296 0.390 081337 GG 8 1 9 GT 12 9 21 TT 4 12 16 0.000 0.182 0.196 081918 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.000 0.000 0.093 082642 ++ 22 22 44 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.006 082886 ++ 0 0 0 +- 9 4 13 -- 12 17 29 0.000 0.233 1.408 083092 CC 2 16 18 CT 18 4 22 TT 4 0 4 0.000 0.247 0.558 083262 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 20 43 0.000 0.000 0.006 083313 GG 16 23 39 GT 8 0 8 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.407 083755 ++ 19 22 41 +- 3 0 3 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.055 083811 AA 0 0 0 AG 7 2 9 GG 15 20 35 0.000 0.050 0.571 083866 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 18 22 40 0.000 0.000 0.100 083932 AA 13 22 35 AG 9 0 9 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.571 083946 CC 3 0 3 CT 17 6 23 TT 2 16 18 0.000 0.548 1.472 087747 ++ 0 0 0 +- 0 3 3 -- 24 20 44 0.000 0.112 0.051 087775 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.000 0.000 0.218 087824 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.022 087843 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.005 087916 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 088355 AA 17 21 38 AG 7 2 9 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.527 088471 CC 1 0 1 CT 3 4 7 TT 18 18 36 0.000 0.220 0.786 088529 AA 0 0 0 AG 5 2 7 GG 16 20 36 0.000 0.050 0.338 088574 AA 21 18 39 AC 0 4 4 CC 0 0 0 0.000 0.220 0.102 088724 AA 0 0 0 AG 4 4 8 GG 19 18 37 0.000 0.220 0.428 088872 ++ 0 0 0 +- 10 0 10 -- 12 22 34 0.000 0.000 0.723 088962 AA 13 22 35 AG 10 0 10 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.703 088977 CC 9 18 27 CT 13 4 17 TT 1 0 1 0.000 0.220 0.810 089993 CC 4 0 4 CT 18 6 24 TT 2 17 19 0.000 0.517 0.883 090122 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.051 090263 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.093 090487 ++ 22 23 45 +- 2 0 2 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.022 090890 CC 1 0 1 CG 10 0 10 GG 12 22 34 0.000 0.000 0.067 090967 CC 19 18 37 CT 3 4 7 TT 1 0 1 0.000 0.220 0.830 091022 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 21 22 43 0.000 0.000 0.023 091091 CC 9 19 28 CT 13 4 17 TT 2 0 2 0.000 0.209 0.084 091111 GG 2 17 19 GT 18 6 24 TT 4 0 4 0.000 0.517 0.883 091150 AA 24 5 29 AG 0 12 12 GG 0 6 6 0.000 0.048 5.074 091389 AA 15 23 38 AG 8 0 8 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.417 091451 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 24 19 43 0.000 0.209 0.093 091489 CC 0 0 0 CG 8 0 8 GG 16 23 39 0.000 0.000 0.407 091720 ++ 21 22 43 +- 2 0 2 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.023 092073 ++ 23 23 46 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.005 092142 ++ 4 0 4 +- 18 6 24 -- 2 17 19 0.000 0.517 0.883 092307 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 092354 CC 0 2 2 CT 6 8 14 TT 16 12 28 0.000 0.153 0.022 092775 CC 17 20 37 CT 5 2 7 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.329 092853 CC 22 18 40 CT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.220 0.100 092932 ++ 2 16 18 +- 15 6 21 -- 3 0 3 0.000 0.548 0.898 093614 AA 4 0 4 AT 18 6 24 TT 2 17 19 0.000 0.517 0.883 093657 ++ 1 0 1 +- 10 0 10 -- 13 23 36 0.000 0.000 0.094 093963 AA 13 23 36 AT 10 0 10 TT 1 0 1 0.000 0.000 0.094 094020 AA 13 23 36 AG 8 0 8 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.440 094188 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 094245 GG 20 22 42 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.024 094666 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.000 0.000 0.052 095168 CC 2 17 19 CT 18 6 24 TT 4 0 4 0.000 0.517 0.883 095180 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.022 095489 GG 9 18 27 GT 13 4 17 TT 2 0 2 0.000 0.220 0.110 095920 AA 11 23 34 AT 9 0 9 TT 1 0 1 0.000 0.000 0.186 095932 CC 1 0 1 CG 9 0 9 GG 11 23 34 0.000 0.000 0.186 095940 AA 1 0 1 AG 3 4 7 GG 17 19 36 0.000 0.209 0.786 096332 CC 22 22 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 096663 GG 2 17 19 GT 10 6 16 TT 12 0 12 0.000 0.517 4.335 097114 GG 2 17 19 GT 9 6 15 TT 12 0 12 0.000 0.517 5.081 097220 ++ 22 23 45 +- 1 0 1 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.006 097663 AA 2 16 18 AG 16 6 22 GG 3 0 3 0.000 0.548 1.171 097762 AA 15 22 37 AT 6 0 6 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.242 097822 AA 2 17 19 AG 18 6 24 GG 4 0 4 0.000 0.517 0.883 097954 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 098280 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.023 098346 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.000 0.000 0.006 098400 AA 19 19 38 AG 3 4 7 GG 1 0 1 0.000 0.209 0.875 098552 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 098597 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 098799 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 21 21 42 0.000 0.000 0.054 099007 AA 0 5 5 AG 0 11 11 GG 24 5 29 0.000 0.048 4.515 099016 AA 1 0 1 AG 10 0 10 GG 13 21 34 0.000 0.000 0.067 099065 CC 21 21 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.054 099167 CC 16 19 35 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.000 0.000 0.178 099213 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 17 37 0.000 0.000 0.007 099216 AA 2 15 17 AG 8 2 10 GG 11 0 11 0.000 0.066 8.049 099293 ++ 1 0 1 +- 3 4 7 -- 20 17 37 0.000 0.233 0.830 099337 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 100024 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.000 0.000 0.005 100064 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 100109 CC 0 0 0 CT 9 0 9 TT 10 21 31 0.000 0.000 0.643 100507 CC 7 18 25 CT 12 3 15 TT 2 0 2 0.000 0.124 0.017 101022 ++ 0 0 0 +- 0 2 2 -- 24 21 45 0.000 0.048 0.022 101173 CC 13 23 36 CG 10 0 10 GG 1 0 1 0.000 0.000 0.094 101324 AA 21 22 43 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.000 0.000 0.006 101344 CC 17 20 37 CG 5 2 7 GG 0 0 0 0.000 0.050 0.329 101596 ++ 20 22 42 +- 2 0 2 -- 0 0 0 0.000 0.000 0.024 101622 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 19 22 41 0.000 0.000 0.055 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002210: T 005663: C 014729: AGCTAC 016977: TGTT 017025: A 018270: GGAA 019101: GT 020917: GTAA 029879: AT 033039: T 038451: A 047206: T 054381: A 054711: G 071432: A 078218: T 080179: GTTT 082642: CCT 082886: TAATTATTTAAGTTAATTATTTAAAGACTT 083755: G 087747: TTTG 088872: T 090487: G 091720: A 092073: A 092142: T 092932: C 093657: A 097220: CT 099293: A 101022: G 101596: T